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关键词： 大黄   柴胡   网络药理学   酒精性肝病  

摘要： 目的:探讨大黄-柴胡药对治疗酒精性肝病(alcoholic liver disease,ALD)的作用及机制。方法:通过网络药理学方法预测大黄-柴胡药对治疗ALD的靶点和通路。灌胃56°白酒复制大鼠ALD模型,各药物组灌胃给予中药煎煮液干预7 d后,检测各组药物对大鼠血清中乙醇浓度,及乙醇脱氢酶(alcohol dehydrogenase,ADH)、乙醛脱氢酶(acetaldehyde dehydrogenase,ALDH)活性的影响,采用HE和油红O染色方法考察各组药物对大鼠肝脏病理形态的影响,检测大鼠血清或肝匀浆中ALT、AST、TG、TC、VLDL、SOD、MDA水平。结果:网络药理学分析共得到大黄-柴胡药对活性成分36个,治疗ALD的靶点218个,核心靶点涉及TP53、MAPK1、AKT1、TNF、CYP2E1、PPARα、ADH、ALDH等。其作用可能与lipid and atherosclerosis、PI3K-Akt signaling pathway、MAPK signaling pathway、TNF signaling pathway、ALD等信号通路相关。与模型组比较,大黄-柴胡药对能明显改善大鼠肝脏病理变化,显著降低大鼠血乙醇浓度(P<0.05),增强血清ADH和ALDH活性(P<0.05),减弱血清AST和ALT活性(P<0.05,P<0.01),降低血清TG和VLDL含量(P<0.05),降低肝脏中TC、TG、VLDL含量(P<0.05,P<0.01),降低MDA含量(P<0.05),升高SOD含量(P<0.01)。结论:大黄-柴胡药对具有治疗大鼠ALD的作用,其机制可能是通过调控PI3K-Akt、MAPK、ALD等信号通路,作用于ADH、ALDH等靶点,进而加速乙醇、乙醛代谢,减少脂肪堆积、减轻氧化损伤等。

关键词： 胰腺神经内分泌瘤   西黄丸   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:采用网络药理学方法和分子对接技术研究西黄丸治疗胰腺神经内分泌瘤(pNET)的作用机制。方法:应用TCMSP、HERB等数据库及相关文献获取西黄丸的活性成分和作用靶点,通过GEO、GeneCards、OMIM等数据库获取pNET的疾病靶点,筛选出与西黄丸的共同靶点,通过R 4.1.2软件对共同靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用STRING 11.5构建共同靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),应用Cytoscape 3.9.0软件构建西黄丸活性成分-pNET疾病靶点交集网络及筛选核心靶点,通过分子对接对核心靶点与活性成分进行验证。结果:获得西黄丸治疗pNET的活性成分66种,主要有槲皮素、β-谷甾醇、鞣花酸、雌二醇、桑色素等;筛选得到西黄丸作用于pNET的靶点148个,核心靶点有转录因子AP-1(JUN)、肿瘤抑制蛋白53(TP53)、骨髓细胞瘤病毒癌(MYC)、雌激素受体1(ESR1)、缺氧诱导因子-1α(HIF1A)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。GO功能主要富集在对外来刺激的反应、膜筏、DNA-结合转录因子结合等方面;KEGG通路主要富集在脂质与化学致癌-受体激活、肿瘤蛋白53(p53)等信号通路。分子对接结果显示,JUN与β-谷甾醇和槲皮素,TP53与槲皮素,MYC与槲皮素,ESR1与鞣花酸、雌二醇、桑色素和phellamurin_qt, HIF1A与槲皮素,MAPK1与槲皮素、muscol和胆固醇结合效果良好。结论:西黄丸治疗pNET通过多成分、多靶点、多通路的复杂网络起效,为后续相关实验研究提供了思路和理论依据。

关键词： 大果木姜子   抑菌   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:旨在以网络药理学方法和分子对接技术为基础,对大果木姜子挥发油抑菌的主要有效成分和潜在作用机制进行探究。方法:通过TCMSP、CNKI等数据库检索大果木姜子挥发油的化学成分,并预测大果木姜子挥发油和抑菌有关靶点;构建“有效成分-目标靶点”网络;共有靶点被用于GO和KEGG富集分析以及分子对接,预测有效成分与重点目标靶点的结合度。结果:获得大果木姜子挥发油化学成分9个、相关靶点151个,与抑菌的共有靶点54个,参与癌症的途径、IL-17信号通路等信号通路;分子对接结果显示核心成分7,8-环氧-α-紫罗兰酮与PTGS2、Thymol与ALB有较高的结合活性。结论:大果木姜子挥发油可能通过7,8-环氧-α-紫罗兰酮、百里香酚等成分与靶点结合,参与癌症、炎症等相关信号通路起到抑菌作用。

关键词： 花椒   网络药理学   分子对接   结直肠癌  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接探究花椒治疗结直肠癌(CRC)的作用机制。方法在TCMSP、PubChem、SwissTargetPridiction数据库中获取花椒的有效成分和作用靶点;在GeneCards、OMIM、TTD数据库获取疾病靶点;利用STRING数据库进行蛋白质相互作用(PPI)分析;利用Cytoscape软件进行拓扑分析,筛选出关键靶点;使用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)和基因组京都百科全书(KEGG)富集分析;最后通过AutoDock Vina 1.2.0软件对花椒主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果花椒抗CRC有5个核心成分,即香草木宁、茵芋碱、香叶木素、槲皮素、异鼠李素;关键靶点涉及AKT1、PIK3R1、EGFR等;主要通路有癌症、PI3K-Akt等;分子对接结果显示花椒抗CRC的主要核心成分和核心靶点之间有较好的结合活性。结论花椒抗CRC的作用机制可能是其有效成分作用于AKT1、PIK3R1等关键靶点及癌症相关信号通路,从而抑制肿瘤细胞的增殖并促进其凋亡。

关键词： 当归鸡血藤汤   再生障碍性贫血   液相色谱-质谱联用   网络药理学   质量标志物   隐丹参酮   白芍苷R1   染料木苷   芍药内酯苷  

摘要： 目的基于液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析当归鸡血藤汤(DJD)的化学成分,通过网络药理学探讨DJD治疗再生障碍性贫血(AA)的作用机制,并预测其潜在的质量标志物(Q-Marker)。方法通过LC-MS分析DJD化学成分,利用Swiss Target Prediction预测化学成分对应靶点,再通过GeneCards、OMIM、PharmGKB和TTD等数据库查询AA靶点,利用Cytoscape 3.9.1绘制“成分-靶点”及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。基于R语言与微生信得到基因本体(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析可视化图,最后使用分子对接对网络药理学预测结果进行初步验证。结果经LC-MS鉴定出DJD中38个化合物,通过Swiss Target Prediction预测得到536个成分靶点,药物与疾病共有靶点196个,运用Cytoscape 3.9.1筛选出主要活性成分为白芍苷R1、芍药内酯苷、striatisporolide A、紫铆花素、黄芩素、高车前素、柚皮素、染料木苷、东莨菪内酯和隐丹参酮;经PPI分析得出前10名核心蛋白分别为磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、蛋白激酶B(Akt1)、白细胞介素-6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、Caspase-3、表皮生长因子受体(EGFR)、信号传导子及转录激活子3(STAT3)、热休克蛋白90A(HSP90AA1)、非受体酪氨酸激酶(SRC)和B细胞淋巴瘤/白血病-2蛋白(BCL2);经GO富集分析得2718条目,KEGG富集分析得到包含磷脂酰肌醇-3/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等161条通路;分子对接结果显示关键靶点与活性成分结合效能较低,具较好的亲和力。结论基于DJD化学成分识别,结合网络药理学与分子对接验证,预测隐丹参酮、白芍苷R1、染料木苷及芍药内酯苷可以作为DJD治疗AA的候选Q-Markers。

关键词： 车前草   肝癌   网络药理学   木犀草素   体外试验  

摘要： 目的采用网络药理学结合分子对接及体外试验验证,探究车前草治疗肝癌的活性成分、关键作用靶点及潜在的分子机制。方法通过TCMSP和SwissTarget Prediction数据库获取车前草主要活性成分及潜在靶点,构建“成分-靶点”网络。检索DisGeNET和GeneCards数据库获取肝癌相关的疾病靶点,运用String数据库结合Cytoscape软件对交集靶点进行PPI网络分析,选取车前草主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。进一步通过体外肝癌Hep3B细胞试验验证车前草活性成分抗肿瘤活性,采用CCK-8试验、平板克隆形成试验及软琼脂克隆形成试验检测增殖抑制作用,采用K-LISAAKT活性试剂盒检测AKT活性水平,采用qRT-PCR检测mRNA的表达。结果车前草的活性成分有山萝花苷、6羟基木犀草素、豆甾醇、黄芩苷、豆甾醇棕榈酸酯、谷甾醇、木犀草素、黄芩素、高车前素和β-谷醇棕榈酸酯;获得车前草和肝癌交集基因168个,PPI网络图表明交集基因之间关系密切,其中潜在靶标为AKT1、TNF、ESR1、EGFR等;富集分析得到GO功能316个,以及相关通路94条,相关的通路主要有PI3K-AKT信号通路等;分子对接结果显示,主要活性成分木犀草素与核心靶点(AKT1、EGFR、TNF、ESR1、SRC、MAPK3)结合稳定。体外试验结果显示,木犀草素对肝癌细胞具有抑制增殖作用,干预肝癌细胞克隆形成以及降低AKT信号通路的活性,且BCL2、FASL等凋亡相关基因mRNA表达升高。结论车前草能够通过多靶点、多通路治疗肝癌,其主要活性成分为木犀草素。木犀草素可能通过抑制AKT1等关键靶点从而抑制PI3K-AKT信号通路,进而达到抑制肝癌细胞增殖、促进凋亡的作用,具有潜在的抗肝癌活性。

关键词： 特发性肺间质纤维化   人参   虎杖   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法,对人参-虎杖药对治疗特发性肺间质纤维化的有效成分及关键靶点进行系统性探索。方法:在TCMSP数据库中对人参、虎杖的活性成分与作用靶点进行挖掘与筛选;利用Uniprot、Pubchem及Swiss Target Prediction简化基因全称;查找GeneCards、OMIM、Therapeutic Target Database和DrugBank疾病数据库得到特发性肺间质纤维化相关靶点;基于STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络模型,筛选出核心靶点;利用Cytoscape3.9.0软件,构建中药-成分-疾病相关靶点网络图;利用微生信数据库对药物-疾病交集靶点进行GO和KEGG的富集分析。结果:通过筛选得到AKT1、TNF、CASP3、BCL2等20个核心靶点。富集的通路有肿瘤通路、钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路等178条。结论:人参-虎杖药对中人参皂苷、山柰酚、大黄酸、槲皮素等活性成分可能通过肿瘤通路、钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路等信号通路发挥抗炎、抗氧化、抑制自噬等作用治疗特发性肺间质纤维化。

关键词： 复方菖蒲益智汤   轻度认知功能障碍   网络药理学   分子对接   富集分析  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探究复方菖蒲益智汤治疗轻度认知功能障碍(MCI)的药理学作用机制。方法:通过TCMSP平台和PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取复方菖蒲益智汤主要的6味中药的活性成分和作用靶点,从GeneCards、DisGeNet、OMIM、TTD数据库获取MCI的相关基因。利用Venny 2.1.0平台将药物的成分靶点与MCI相关的靶基因取交集,利用Cytoscape 3.7.2进行“药物-成分-靶点-疾病”网络图的构建,并利用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,然后利用Metascape平台进行KEGG通路富集分析与GO功能富集分析。最后利用Autodock vina V1.2.0对核心作用靶点及主要药效成分进行分子对接,验证它们之间的紧密联系程度。结果:复方菖蒲益智汤治疗MCI的潜在靶基因共178种。PPI网络图筛选出AKT1、TNF、EGFR、CASP3、IL1B、VEGFA 6个关键核心靶点,涉及7NH5、6Q00、8A27等关键核心靶蛋白;KEGG通路富集分析结果表明,AKT1、TNF、IL1B、VEGFA 4个关键核心靶点在AGE-RAGE信号通路中。分子对接结果显示,复方菖蒲益智汤的有效成分与上述6个关键核心靶点的结合活性良好。结论:复方菖蒲益智汤中主要的6味中药的活性成分可作用于AKT1、TNF、IL1B等多个靶点,通过调控AGE-RAGE通路发挥治疗MCI的作用。