课程文献中心 更多>>

关键词： 胃癌   生物信息学   关键基因   网络药理学   中药活性成分  

摘要： 目的:本研究旨在利用生物信息学方法探索驱动胃癌进展的关键基因,并结合网络药理学分析筛选潜在的中药活性成分,以期为预防和治疗胃癌提供依据。方法:从NCBI的GEO数据库下载基因表达谱芯片(GSE191275),利用GEO2R筛选出胃癌实验组VS肠上皮化生组,肠上皮化生VS非萎缩性胃炎的差异表达基因(Differentially Exprsssed Gense,DEGs),并使用维恩图搜索“非萎缩性胃炎-肠上皮化生-胃癌”进程中变化规律一致的基因。通过STRING数据库构建蛋白质的相互作用网络,用CytoScape来筛选出关键基因。采用ROC曲线分析进一步筛选胃癌治疗的潜在靶点。从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘潜在中药活性成分。临床纳入厦门市中医院脾胃科门诊收治的40例胃癌前病变患者作为研究对象,按随机数字表法将患者分为常规对照组和槲皮素补充组各20例。观察两组患者治疗效果、血清学指标、靶点抑制以及不良反应情况。结果:在胃癌病程中共鉴定出49个持续上调和39个持续下调的基因。通过双重筛选和鉴别确定了前蛋白转化酶枯草溶菌素1(Recombinant Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 1,PCSK1)、前列腺素氧化环化酶(Prostaglandin-endoperoxide Synthase,PTGS)2、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)3和C-C基序趋化因子(C-C Motif Chemokine,CCL)20作为预防和治疗胃癌的潜在基因靶点。从TCMSP挖掘靶向基因靶点的潜在中药活性成分,经过多项筛选规则鉴别出槲皮素为PTGS2/MMP3双重抑制剂。通过临床观察证实槲皮素补充显著提高了常规治疗的总有效率,差异有统计学意义(P<0.05)。同时槲皮素补充还显著下调了血清胃黏膜环氧合酶(Cyclooxygenase,COX)-2、p53水平和胃黏膜的PTGS2和MMP3 mRNA表达(P<0.05)。两组不良反应发生率的差异无统计学意义(P>0.05)。结论:本研究认为PCSK1、PTGS2、MMP3和CCL20是“非萎缩性胃炎-肠上皮化生-胃癌”进程中的关键基因,而槲皮素靶向抑制PTGS2/MMP3有望应用于临床预防和治疗胃癌。

关键词： 早临床问题导学   药理学新教学模式  

摘要： 目的本研究旨在探索并建构一种新型的药理学实践教学模式,即早临床问题导学,以提升学生的临床思维和实践能力。方法通过设计早临床问题导学实践案例,学生小组讨论药物应用分析等医疗问题。针对教学效果,进行及时的反馈和评估。结果实践案例表明,早临床问题导学有效激发了学生对于医学问题的深入思考,促使其更好地理解和运用所学知识,且学生反馈新模式教学各维度满意度评分均优于传统教学模式,差异有统计学意义(P<0.01)。结论早临床问题导学模式为药理学实践教学提供了一种新途径,突出对实际问题的解决,培养了学生的临床思维,为其将理论知识应用于实践打下了坚实基础。

关键词： 牙周炎   地骨皮   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学及实验验证探讨地骨皮治疗牙周炎的作用机制。方法查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选地骨皮的药物成分, 使用SwissTargetPrediction预测药物成分的作用靶点;运用GeneCards获取牙周炎的疾病靶点, 利用Venny 2.1获取交集靶点。使用STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析并使用Cytoscape构建网络图, 利用Metascape进行基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。使用Cytoscape软件构建"药物-靶点-通路"网络图。将大鼠随机分为模型组和治疗组, 每组5只。建模后8周, 治疗组局部注射1 ml地骨皮药液(将150 mg地骨皮颗粒溶于1 ml水中), 模型组组局部注射等量生理盐水, 治疗4周。结果地骨皮的10个有效成分通过多条通路直接作用于55个疾病靶点治疗牙周炎, 其中β-谷甾醇、豆甾醇、莨菪碱、金合欢素、阿托品、常春藤素等是核心成分, V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、JUN、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、肿瘤蛋白53(TP53)、核受体共激活因子2(NCOA2)是重要的靶点。GO分析显示交集基因最可能相关的生物过程(BP)主要涉及对类固醇激素的反应、细胞对有机环化合物的反应、程序性细胞死亡的正调控、对激素的反应、凋亡信号通路、白细胞凋亡过程、正调控神经元凋亡过程、对氧气水平的反应、凋亡过程的正向调节等, 细胞组分(CC)主要涉及细胞器外膜、外膜、转录调控复合体、线粒体外膜、RNA聚合酶Ⅱ转录调控复合物、线粒体膜、膜筏、膜微区、细胞质核周区等, 分子功能(MF)主要涉及蛋白质结构域特异性结合、转录因子结合、半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路、DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡过程、一般转录起始因子结合、泛素蛋白连接酶结合、泛素样蛋白连接酶结合等。KEGG分析结果提示地骨皮主要通过p53、细胞凋亡、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、白细胞介素-17(IL-17)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、核因子-κB(NF-κB)等信号通路治疗牙周炎。动物实验显示, 地骨皮能够明显改善牙周炎, 同时也能改善RELA、Bcl-2、PTGS2、JUN、CASP3、TP53、NCOA2表达水平。结论地骨皮主要通过调节p53、细胞凋亡、AGE-RAGE、PI3K-Akt、IL-17、HIF-1、TNF、MAPK、NF-κB等信号通路的RELA、Bcl-2、PTGS2、JUN、CASP3、TP53、NCOA2等疾病靶点, 调节酶类活性、抗炎等生物过程治疗牙周炎。

关键词： 辣椒风湿膏   关节痛   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 目的探讨辣椒风湿膏治疗关节痛的作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),并结合PubMed数据库获得制剂组方药材的活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测其靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库预测关节痛疾病靶点,利用Venn在线绘图软件筛选活性成分与疾病的共有靶点;将共有靶点上传至STRING数据库进行蛋白相互作用(PPI)分析;基于Metascape平台对共有靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;借助Cytoscape 3.9.0软件构建疾病-活性成分-共有靶点-通路网络,利用该软件的Network Analyzer工具筛选辣椒风湿膏治疗关节痛的主要活性成分和核心靶点,并进行分子对接验证。结果共获得活性成分28个及其靶点440个,疾病靶点1296个,共有靶点105个。GO功能富集分析共获得生物功能条目1374条,其中生物过程1184条,细胞组分61条,分子功能129条;KEGG通路富集分共获得135条信号通路,主要涉及钙信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、瞬时受体电位(TRP)通道的炎性介质调节信号通路等。共获得主要活性成分6个(齐墩果酸、辣椒素、二氢辣椒素、辣椒素酯、左旋龙脑、薄荷醇)与核心靶点15个(mTOR、ESR1、TP53等)。分子对接结果显示,TRPV1、ESR1、PTGS2、mTOR和MMP-9靶点蛋白与除辣椒素酯外的上述其余5个主要活性成分结合活性良好(结合能<-1.2 kcal/mol)。结论辣椒风湿膏可能通过辣椒素、二氢辣椒素、齐墩果酸、左旋龙脑、薄荷醇等化学成分调控mTOR、ESR1、PTGS2、TP53、TRPV1等基因的表达,进而调控钙信号通路、cAMP信号通路等治疗关节痛。

关键词： 网络药理学   分子对接   黄芪   早发性卵巢功能不全   信号通路   细胞凋亡  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨黄芪对早发性卵巢功能不全治疗作用的分子机制。方法:在中药系统药理学数据库TCMSP中筛选黄芪有效成分及药物作用靶点;在Genecards数据库中筛选早发性卵巢功能不全疾病靶点;运用Venny在线工具筛选两者的交互基因;通过Cytoscape3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络关系图;采用String数据库获得蛋白互作(PPI)信息,进一步通过CytoNCA插件构建蛋白质相互作用网络,筛核心靶点蛋白;利用DAVID数据库对交互基因进行GO富集和KEGG通路富集;使用分子对接技术进一步明确其发挥治疗作用的分子;最后,采用血清饥饿法建立POI细胞模型,给予黄芪中的有效化合物槲皮素进行干预,通过Tunel染色、蛋白质印迹实验(western blotting,WB)对网络药理学预测结果进行实验验证。结果:通过TCMSP数据库筛选出黄芪的32个有效化合物及552个基因靶点,从疾病数据库中筛选出730个早发性卵巢功能不全的疾病靶点,两者共62个交集基因,其中黄芪中的主要活性成分包括槲皮素(quercetin)、异鼠李素(isorhamnetin)、山奈酚(kaempferol)、丁子香萜(Mairin)、芒柄花黄素(formononetin)和芒柄花黄素(astragaloside IV),10个POI的潜在核心靶基因为ALB、INS、AKT1、ACTB、TP53、TNF、ESR1、CASP3、STAT3和PTEN;潜在靶点基因主要参与调控JAK2/STAT3、PI3K/Akt信号通路;分子对接验证了黄芪主要活性化合物与核心蛋白STAT3和Akt1存在较强的结合作用;细胞实验结果发现,黄芪中的重要活性化合物槲皮素能促进JAK2/STAT3信号通路关键分子JAK2及STAT3的磷酸化水平,改变卵巢颗粒细胞凋亡相关蛋白表达水平。结论:网络药理学和分子对接分析表明中药黄芪能通过调节对雌二醇的反应、抑制凋亡过程以及调控JAK-STAT和PI3K-Akt信号通路治疗早发性卵巢功能不全,其机制可能与激活JAK2/STAT3信号通路,抑制卵巢颗粒细胞凋亡相关。

关键词： 黑芸香   质量标志物   萜类化合物  

摘要： 黑芸香具有活血化瘀、舒筋活络的作用,在临床实践中被广泛用于治疗类风湿关节炎、骨关节疼痛等。为阐明黑芸香抗炎作用的质量标志物,利用网络药理学挖掘了黑芸香的有效成分及抗炎靶点并筛选核心成分,构建候选靶点的蛋白互作网络得到核心靶点;对候选靶点进行KEGG信号通路富集分析,最后将核心成分和核心靶点进行分子对接。结果表明:(Z)-guggulsterone、proximadiol、α-gurjunene、(E)-α-santalal、curzerenone、curcumenone、2-meth-oxyfuranoguaia-9-ene-8-one可与蛋白靶点MAPK1、MAPK3和EGFR作用,调节癌症中PD-L1的表达和PD-1检查点通路、神经活性配体受体相互作用、JAK-STAT信号通路等发挥抗炎作用,为其整体质量控制提供参考依据。

关键词： 陶瓷材料   药物载体设计   药理学研究  

摘要： 本文分析了陶瓷材料在药物载体设计中的应用及药理学研究。通过分析陶瓷材料的特性及其在药物递送系统中的应用优势,探讨了其在提升药物稳定性、实现控制释放以及提高生物相容性等方面的应用。陶瓷材料在药物载体设计中具有独特潜力,但仍需要深入研究以充分发挥其药理学性能。

关键词： 桂枝   冠心病   网络药理学   靶点   信号通路  

摘要： 文章旨在运用网络药理学方法,对桂枝的主要化学成分及其治疗冠心病的作用机制展开探讨。首先通过TCMSP数据库,筛选出桂枝的有效活性成分;然后通过Genecards数据库得到疾病基因靶点,在Venny中取交集,得到共同的交集靶点;再利用STRING数据库构建靶蛋白互作网络图(PPI);最后使用DAVID数据库和微生信对核心靶点进行GO/KEGG富集分析。结果显示,7个主要化学成分,对应靶点51个,与治疗冠心病疾病靶点有27个共同靶点,对应化学成分有5个。通过GO功能富集分析得到7个生物过程、3条细胞组分以及1条分子功能,包括对雌二醇的反应、肌肉收缩的负调节、细胞膜筏等。而通过KEGG富集分析得到15条信号通路,包括癌症通路,脂质和动脉粥样硬化通路等。文章采用网络药理学的方法建立起桂枝的活性成分与冠心病治疗之间的联系,并探讨了其复杂的药理机制,对靶点、生物学过程及信号通路的分析为其开发、研究与应用打下了坚实的基础。

关键词： 陈皮   非挥发性成分   挥发油   网络药理学   止咳   平喘   祛痰  

摘要： 目的通过超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UHPLC-Q-TOF/MS)和气相色谱-质谱(GC-MS)鉴定陈皮中的化学成分,结合网络药理学分析其治疗“痰、咳、喘”的药效物质基础及作用机制。方法建立UHPLC-Q-TOF/MS和GC-MS结合诊断特征滤过和标准谱库比较的分析方法,表征陈皮的化学成分。利用Swiss Target Prediction数据库获取陈皮主要成分的作用靶点信息;通过GeneCards数据库获取“痰、咳、喘”相关的靶点;将陈皮主要成分对应靶点与“痰、咳、喘”相关靶点取交集,借助String平台和Cytoscape 3.10.0软件绘制交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化。结果共鉴定了108个非挥发性成分和28个挥发性成分;陈皮的主要活性成分可能为乙酸香茅酯、乙酸香叶酯、(-)-紫苏醛、(1R,5S)-香芹醇、癸醛、(+)-α-松油醇、(-)-4-萜品醇、芳樟醇、壬醛、桔皮素、甜橙黄酮、异橙黄酮、香叶木素、枸橘苷、日当药黄素;陈皮可能通过热休克蛋白(HSP90AA1)、表皮生长因子受体(EGFR)、SCR蛋白激酶(SRC)、磷酸化蛋白激酶(AKT1)、磷酸肌醇激酶(PIK3CA)、信号传导转录激活因子(STAT1)等关键靶点,协同调控磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、Janus激酶-信号传导和转录激活蛋白(JAK-STAT)等信号通路发挥止咳平喘祛痰的治疗作用。结论分析获得了陈皮发挥止咳平喘祛痰功效可能的药效物质基础及作用机制,可为其质量标志物和质量标准的提升研究奠定基础。

关键词： 四逆散   重度抑郁症   广泛性焦虑症   乳腺纤维囊性疾病   网络药理学   槲皮素   木犀草素   川陈皮素  

摘要： 目的探讨四逆散对重度抑郁症、广泛性焦虑症和乳腺纤维囊性疾病“异病同治”的作用机制。方法筛选四逆散活性成分,并与治疗抑郁症、焦虑症和乳腺纤维囊性疾病的药物进行主成分分析判断类药性;利用多个数据库综合分析四逆散和3种疾病的作用靶点,使用DAVID数据库对共有靶点进行基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,运用BioGPS数据库对关键靶点进行定位分析。采用皮质酮(CORT)诱导PC12细胞制备抑郁症、焦虑症模型,6.2500、3.1250、1.5625 mg·mL^(-1)四逆散干预处理,MTT检测细胞存活率,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)mRNA表达。结果四逆散主要活性成分具有较好的类药性,四逆散“异病同治”共有靶点32个,关键靶点为IL6、肿瘤坏死因子(TNF)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)和IL1B等,关键活性成分包括槲皮素、木犀草素和川陈皮素等。四逆散主要通过调控HIF-1、癌症和PI3K-Akt等多条信号通路发挥“异病同治”功能,推测肝、胸腺是药物发挥作用的关键部位。实验结果显示四逆散可逆转CORT对PC12的细胞毒性,影响不同时间点IL-1β、IL-6 mRNA表达。结论四逆散具有“多成分、多靶点、多通路”协同作用的特点,通过调节炎症反应等发挥“异病同治”作用。