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关键词： 海藻-昆布   乳腺癌   网络药理学   分子对接   信号通路   岩藻甾醇  

摘要： 目的通过网络药理学方法分析海藻-昆布治疗乳腺癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库检索海藻-昆布的活性成分及其靶点。通过GeneCards和OMIM数据库获取乳腺癌的相关靶标,并通过Cytoscape软件构建“药物-疾病靶点”网络图。利用String平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析。采用R语言进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用分子对接技术验证关键化合物与靶点的结合能力,并通过体外实验进行功能验证。结果本研究共获得海藻-昆布的有效化合物11个。海藻-昆布与乳腺癌高度相关的交集靶标为150个,筛选出丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、p53肿瘤蛋白(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、JUN、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素1B(IL1B)、MYC和人表皮生长因子受体(EGFR)共10个核心基因。GO分析表明,这些化合物可能参与信号转导、细胞凋亡、细胞增殖、炎症反应等生物过程。KEGG通路分析表明,主要富集信号通路为PI3K/Akt、MAPK和TNF等信号通路。分子对接和体外实验结果表明,海藻-昆布的主要化学成分岩藻甾醇对乳腺癌三阴型细胞BT-549具有抗增殖作用。结论海藻-昆布可能通过多靶点、多通路来治疗乳腺癌,其主要化学成分岩藻甾醇可有效抑制BT-549细胞增殖活性。

关键词： 脑梗死   通脑饮   网络药理学   炎症   分子对接  

摘要： 背景脑梗死是由各种原因引起的局部脑组织区域供血障碍,通脑饮为江苏省中医院治疗脑梗死的协定方,但具体作用机制尚不清楚。目的本研究旨在通过网络药理学和临床试验,解释通脑饮治疗脑梗死的机制。方法选取2019年1月—2020年6月江苏省中医院收治的199例脑梗死患者。根据随机数字表法,将患者分为对照组(97例)和试验组(102例)。两组均接受稳定型脑梗死的标准化治疗,试验组加用通脑饮治疗。治疗前和治疗2周时,两组均采用美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评估卒中引起的功能损害程度,采用改良Rankin量表(mRS)评估神经功能的恢复情况。从TCMSP和文献中筛选通脑饮的化学成分,选择生物利用度(OB)≥30%和药物相似性(DL)≥0.18要求的成分寻找该处方的有效成分。利用OMIM和GeneCards数据库分析通脑饮治疗脑梗死的分子靶点。在筛选出共同靶点后,用Cytoscape软件、String数据库分别绘制化合物和靶蛋白的网络图、构建蛋白相互作用(PPI)网络和基因本体论(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后,进行分子对接实验,确定通脑饮治疗脑梗死的主要活性成分。结果治疗后,试验组NIHSS、mRS评分均低于对照组(P<0.05)。最终得到通脑饮活性成分60个,潜在靶点147个,疾病相关靶点5167个,药物与疾病的交集靶点121个。KEGG信号通路富集分析获得前列腺癌症、神经活性配体-受体相互作用、白介素(IL)-17信号通路、催乳素信号通路、PI3K-Akt信号通路、钙信号通路等。分子对接显示,通脑饮治疗脑卒中的主要活性成分β谷甾醇、山柰酚和胡萝卜素与核心蛋白雄激素受体(AR)有较好的结合性。结论通脑饮可能通过激活AR来治疗脑梗死。IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路和催乳素信号通路也是潜在的机制。

关键词： 巴戟天   阿尔茨海默病   整合药理学   分子对接   基因表达数据分析  

摘要： 目的:基于网络药理学、分子对接和GEO数据分析巴戟天治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的潜在靶点和作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取巴戟天的主要活性成分,用SwissTargetPrediction获取巴戟天全部作用靶点。从DrugBank、PathCard、Chemogenomic Database和PubChem数据库获得AD相关靶点。使用韦恩图取交集,得到巴戟天治疗AD的共同作用靶点。利用Cytoscape3.8.0构建靶点的“成分-靶点”网络图,并分析靶点的相互作用PPI网络图、基因本体论(GO)和KEGG信号通路等。使用Autodock对关键成分和靶点进行分子对接,并用Pymol和Discovery Studio展示对接结果。最后利用GEO数据库Alzdata分析关键靶点基因在AD中的表达。结果:预测得到巴戟天的50种主要活性成分,636个作用靶点,674个AD相关靶点,其中巴戟天治疗AD共同靶点124个。GO富集分析得到蛋白质磷酸化、磷酸化的正调控、细胞对氮化合物的反应、水解酶活性的调节、细胞对化学刺激的反应。KEGG富集分析显示阿尔茨海默病为最显著的通路。分子对接显示,巴戟天的5个核心成分2-羟基-1,5-二甲氧基-6-(甲氧基甲基)-9,10-蒽醌、1-羟基-3-甲氧基-9,10-蒽醌、大黄素-A、甲基异茜草素、甲基异茜草素-1-甲醚和3个核心靶点EGFR、PARP1、FTO的结合较好,并且Egfr在AD病人中显著(P<0.05)上调表达,Parp1和Fto在AD病人中显著(P<0.05)下调表达。结论:巴戟天可能通过多个成分、多个靶点、多个通路,参与调控AD疾病进程。

关键词： 丹楂通脉丸   高效液相色谱   指纹图谱   网络药理学   分子对接   药效物质  

摘要： 目的建立丹楂通脉丸的指纹图谱,利用化学计量学分析色谱峰贡献率,结合网络药理学方法预测其药效物质基础。方法采用Agilent C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),检测波长280 nm,流动相0.1%磷酸水-乙腈,流速1.0 mL·min^(-1),梯度洗脱,建立丹楂通脉丸甲醇提取物指纹图谱。利用网络药理学筛选相关成分的靶点和通路,构建“成分-靶点-通路”网络,对丹楂通脉丸潜在的药效物质与关键靶点进行分子对接验证。通过体外实验验证潜在的药效物质的抗炎活性。结果10批样品指纹图谱中有15个共有峰,2个特征峰被指认,分别为丹酚酸B和丹酚酸A。网络药理学分析表明,丹酚酸B和丹酚酸A是丹楂通脉丸发挥活性作用的有效成分,预测其可作为丹楂通脉丸的主要药效物质。体外细胞实验证明,与模型组比较,丹酚酸B高、中、低剂量组NO释放量均明显降低(P<0.01),丹酚酸A高剂量组NO释放量显著下降(P<0.01),具有一定的抗炎活性。结论通过指纹图谱和网络药理学预测丹楂通脉丸药效物质,为丹楂通脉丸质量的全面控制和评价提供了科学依据。

关键词： 先兆子痫   滋养细胞   治疗结果   中药   药理学  

摘要： 子痫前期是一种妊娠特异性疾病,临床以妊娠20周后出现高血压、蛋白尿等症状为主要特征,子痫前期严重危害母婴生命健康,是导致孕产妇和围产儿死亡率增高的重要因素之一。近年来,采用中药汤剂、活血化瘀类中药注射液等治疗子痫前期的研究增多,取得了良好的临床疗效。现代药理学研究发现,葛根素、天麻素、钩藤碱、人参皂苷、白术内酯、丹参素、川芎嗪、黄芪甲苷等成分能够促进滋养细胞增殖和侵袭,改善实验动物妊娠过程,对子痫前期的治疗起到积极作用。梳理相关文献,通过结合临床疗效与机制研究,分析中药临床用药合理性,为中药防治子痫前期的临床应用与开发提供参考。

关键词： 网络药理学   分子对接   保和丸   小儿厌食症   功能性消化不良  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接探讨保和丸“异病同治”小儿厌食症(infantile anorexia, IA)和功能性消化不良(functional dyspepsia, FD)的潜在分子机制。方法:通过TCMSP数据库及PubMed与中国知网收集保和丸活性成分及靶点;利用DisGeNET、DrugBank、GeneCards等数据库检索与IA和FD相关的疾病靶点;并得到保和丸与IA和FD的交集靶点;使用Cytoscape 3.9.0软件构建“药物-成分-靶点”网络图;基于STRING平台建立蛋白质互作网络;应用R语言进行GO功能及KEGG通路富集分析;采用CB-Dock2平台对关键成分与有效靶点进行分子对接研究。结果:共得到保和丸与IA和FD交集靶点161个,筛选出木犀草素、槲皮素、汉黄芩素、β-谷甾醇、山奈酚、柚皮素6种核心成分,以及TP53、MAPK1、AKT1、MAPK3、BCL2、ESR1 6个核心靶点。GO和KEGG结果显示,通过调控脂质与动脉粥样硬化、PI3K/AKT、内分泌抵抗、IL-17、TNF等信号通路,发挥治疗IA和FD的药理作用。在分子对接验证中,所有结合能均小于-5.0kcal·mol-1,结合能小于-7.0kcal·mol-1的有68组,占66.67%。结论:保和丸核心成分在治疗IA和FD的过程中发挥出“异病同治”作用,体现保和丸具有“多成分、多靶点、多通路、多途径”的作用特点,为进一步研究保和丸的临床应用提供理论基础。

关键词： 网络药理学   分子对接   温阳化瘀解毒方   结直肠癌  

摘要： 目的 通过网络药理学及分子对接探讨温阳化瘀解毒方治疗结直肠癌作用机制。方法 通过HERB数据库检索温阳化瘀解毒方活性成分及相关靶点,利用DisGeNET数据库检索结直肠癌相关疾病靶点,将药物活性成分与疾病靶点取交集,上传至STRING平台构建蛋白相互作用网络;利用Cytoscape3.7.2软件构建中药-活性成分-靶点网络;利用OmicShare平台对核心靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,利用CB-Dock2数据库进行分子对接。结果 温阳化瘀解毒方治疗结直肠癌交集靶点共142个,核心靶点包括TP53、AKT1、TNF,涉及黄芩素、大黄素、没食子酸等活性成分;GO功能富集分析结果显示,温阳化瘀解毒方可能参与细胞增殖、免疫系统过程、生物过程的负调控等方面;KEGG通路富集分析结果显示,温阳化瘀解毒方可能涉及AGE-RAGE、MAPK及TNF等信号通路。分子对接结果表明,芹菜素、粉防己碱、芦荟大黄素、大黄素、黄芩素和β-榄香烯与TP53之间结构稳定,结合活性良好。结论 温阳化瘀解毒方治疗直肠癌作用靶点与TP53密切相关,可能通过败酱草、大黄、赤芍和细辛中多种活性成分作用于TP53,从而抑制结直肠癌进展。

关键词： 课程思政   临床药理学   探索与实践  

摘要： 为了更好地落实立德树人的根本任务,将思政元素贯穿于临床药理学教学的各个环节。教学团队根据育人目标,建立课程思政案例库,讲好思政故事,设计课外教学活动,将思政内容自然和谐地融入药学专业人才的培养,以期实现思政教育“内化于心、外化于行”。

关键词： 食物过敏   迷迭香酸   抗过敏   网络药理学   脂质组学  

摘要： 为研究迷迭香酸缓解食物过敏的效应机制,利用网络药理学和分子对接以及脂质组学探究迷迭香酸(Rosmarinic acid,RA)缓解食物过敏的效应机制。利用数据库分析平台(TCMSP)、Swiss Target Prediction、Pharm Mapper、Super Pred和Gene Cards等获得RA的潜在效应靶点。通过软件Cytoscape和String数据库构建“活性成分-靶点”蛋白互作(PPI)网络,并采用AutoDockTools软件进行分子对接验证。进一步通过建立卵清蛋白(Ovalbumin,OVA)食物过敏小鼠模型验证RA缓解食物过敏的效应,并基于高分辨质谱对小鼠血清进行脂质代谢分析。结果表明,网络药理分析共筛选到关联靶点46个。基因本体(Geno ontology,GO)富集分析表明RA主要通过对蛋白质磷酸化、鞘糖脂、磷脂和类固醇等的结合发挥作用。京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析表明关联靶点主要富集在Th1和Th2细胞分化通路、脂代谢和炎症性肠病通路等。动物实验结果显示RA干预可以显著(P<0.05,P<0.01,P<0.001)抑制OVA致敏引起的小鼠血清过敏反应介质上升,且RA干预组小鼠血清总胆固醇(Total Cholesterol,T-CHO)和甘油三酯(Triglyceride,TG)水平下降。脂质组学分析中,在正/负离子模式下分别筛选出25/36种潜在差异脂质代谢物。对脂质差异代谢物的富集分析表明,小鼠的血清脂质代谢影响甘油磷脂代谢和鞘脂代谢通路。因此,本研究表明RA主要通过调节脂质代谢和机体炎症反应发挥缓解食物过敏的作用。

关键词： 右美托咪定   脑缺血再灌注损伤   核心基因   多巴胺受体D2   糖原合成酶激酶3β   核受体亚家族3C组成员1  

摘要： 目的基于生物信息学分析右美托咪定治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制,结合分子对接和基因表达综合库(GEO)芯片验证明确核心基因。方法采用PubChem和GeneCards筛选右美托咪定和脑缺血再灌注损伤交集靶点,建立蛋白相互作用(PPI)网络确定Hub基因,进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最终采用分子对接和GEO芯片数据验证Hub基因。结果右美托咪定和脑缺血再灌注损伤有43个交集靶点,PPI筛选得到41个节点和103条边的拓扑网络,Hub基因为5-羟色胺受体2A(HTR2A)、阿片受体mu 1(OPRM1)、多巴胺受体D2(DRD2)、溶质载体家族6成员4(SLC6A4)、谷氨酸代谢型受体5(GRM5)、细胞色素P450家族2亚家族C成员19(CYP2C19)、溶质载体家族6成员3(SLC6A3)、核受体亚家族3C组成员1(NR3C1)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)。GO和KEGG分析显示右美托咪定干预脑缺血再灌注损伤涉及254种生物学功能和58条信号通路。分子对接验证Hub基因均具有良好的亲和力,GSE23160芯片验证预测DRD2、GSK3β和NR3C1具有差异性(P<0.05)。结论基于网络药理学及分子对接和基因芯片验证了右美托咪定通过多靶点、多生物学功能、多通路干预脑缺血再灌注损伤,并验证DRD2、GSK3β、NR3C1可能是核心基因,预测关键诊断基因和潜在治疗基因,为进一步研究奠定坚实基础。