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关键词： 养血清脑颗粒   四物汤   高血压   网络药理学   分子对接   作用机制   抗炎作用  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接探讨养血清脑颗粒(四物汤加味)治疗高血压的作用机制。方法以课题组前期对养血清脑颗粒的化学成分分析结果作为活性化合物筛选的基础,以口服生物利用度≥30%及类药性≥0.18为筛选条件,结合文献补充入血成分。利用TCMSP平台、化学专业数据库和SWISS数据库预测养血清脑颗粒潜在活性化合物的作用靶点。通过GeneCards及DiGSeE数据库获得高血压疾病相关靶点。将高血压疾病相关靶点与养血清脑颗粒潜在活性化合物的作用靶点取交集(共同靶点),即为养血清脑颗粒治疗高血压的潜在作用靶点。将潜在作用靶点与养血清脑颗粒的潜在活性化合物进行匹配,得养血清脑颗粒的降压活性化合物。通过STRING数据库对养血清脑颗粒治疗高血压的潜在作用靶点进行PPI分析,并根据度值筛选出核心靶点。采用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。选择度值排前6位的核心靶点作为对接靶蛋白,分别与降压活性化合物进行分子对接验证。结果得到养血清脑颗粒32个潜在活性化合物,161个活性化合物作用靶点,1539个高血压疾病相关靶点,取交集后得到88个养血清脑颗粒治疗高血压的潜在作用靶点(共有靶点),涉及29个降压活性化合物。PPI分析筛选出14个核心靶点:PPARG、ACHE、IL4、CCL2、JUN、NOS3、APP、IL1B、CAT、PTGS2、CASP3、TP53、TNF、IL6,涉及158个GO条目、13条信号通路。通过分子对接得到绿原酸、迷迭香酸、芍药苷、儿茶酸、芦荟大黄素等5个关键活性成分,分别与PTGS2、CASP3、TNF、CAT、TP53、IL6结合稳定。结论养血清脑颗粒可能通过绿原酸、迷迭香酸等关键活性成分,作用于PTGS2、CASP3等核心靶点,调控TNF信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路等关键通路,通过抗炎作用发挥治疗高血压的作用。

关键词： 芝麻林素   肝细胞癌   网络药理学   细胞凋亡   细胞周期   细胞迁移  

摘要： 为了探究芝麻林素对肝细胞癌的抗肿瘤作用及其分子机制,通过网络药理学分析,预测芝麻林素与肝细胞癌的交集靶点,以及交集靶点富集的通路和生物学过程,然后检索SwissADME数据库分析芝麻林素的药代动力学。采用CCK8法检测细胞活性,采用Annexin V-FITC/PI双染法、流式细胞术、蛋白免疫印迹法、细胞迁移法分析芝麻林素处理后Huh-7细胞凋亡、周期阻滞及迁移抑制的作用与机制。结果表明,网络药理学分析可得交集靶点共64个,基因本体论功能共352个,京都基因与基因组百科全书信号通路共136个。体外细胞实验表明芝麻林素可以通过调控活性氧(reactive oxygen species,ROS)介导的丝裂原活化蛋白激酶/信号转导与转录激活因子3/核因子κB和磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol 3-kinases,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)信号通路,诱导Huh-7细胞线粒体依赖性凋亡与G2/M期阻滞。同时,芝麻林素通过ROS介导的PI3K/AKT/糖原合成酶激酶-3β(glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β)/β-连环蛋白信号通路抑制细胞迁移。最后,SwissADME分析结果表明芝麻林素具有良好的类药性。综上,芝麻林素可以通过ROS介导的信号通路诱导Huh-7细胞发生细胞凋亡、周期阻滞与抑制迁移作用。

关键词： 黄芪-茯苓   肾病综合征   作用机制   分子对接   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学探究黄芪-茯苓治疗肾病综合征的作用机制,并进行分子对接验证。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、UniProt、Herb数据库收集黄芪-茯苓活性成分及其作用靶点,在OMIM、GeneCards数据库中搜集与肾病综合征相关的作用靶点,绘制黄芪-茯苓与肾病综合征交集靶点的韦恩图,在Cytoscape软件中构建“黄芪-茯苓活性成分-交集靶点”网络。在STRING中构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用R软件对靶点进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutoDock软件进行分子对接,利用Pymol进行可视化处理。结果:初筛出黄芪-茯苓34个活性成分,得到交集靶点96个,共涉及生物过程2140个、分子功能134个及细胞组分71种。黄芪-茯苓可能通过调控血脂与动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路、乙型肝炎、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等发挥治疗肾病综合征作用。分子对接结果显示:黄芪-茯苓核心成分槲皮素、山柰酚、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、芒柄花黄素、异鼠李素、常春藤皂苷元与腺苷酸激酶同工酶1、肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、重组人环氧合酶2、白细胞介素-1β等核心靶蛋白结合程度良好。结论:黄芪-茯苓具有多成分、多靶点、多通路的优点,主要通过介导炎症反应、免疫反应、氧化应激反应发挥治疗肾病综合征的作用。此结论为临床提供理论支持,但后期仍需更多相关实验进行验证。

关键词： 网络药理学   巴马汀   分子对接   分子动力学模拟   抑菌实验  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接及分子动力学研究巴马汀的抗菌作用机制。方法通过Swiss Target Prediction网站预测巴马汀的药物靶点,并与GeneCards和OMIM数据库检索的抗菌靶点相映射得到巴马汀抗菌潜在作用靶点;利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并筛选关键靶点;使用DAVID数据库对潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并做可视化处理,构建出巴马汀“成分-靶点-通路”网络;经分子对接和分子动力学模拟对巴马汀与关键靶点的结合进行验证;体外抑菌实验验证巴马汀的抗菌活性。结果共筛选出28个巴马汀关键抗菌靶点,富集到199个GO条目和105条相关通路,“成分-靶点-通路”网络分析表明MAPK8、RAC1、STAT3为巴马汀关键抗菌靶点;分子对接结果表明,巴马汀与关键靶点MAPK8和RAC1有很好的结合作用;分子动力学研究发现巴马汀与蛋白之间存在氢键及疏水作用,使巴马汀能够稳定地与靶点蛋白结合;体外抑菌实验证明巴马汀对金黄色葡萄球菌和白色念珠菌均有较强的抑制活性,且与阳性药联用有协同作用。结论巴马汀可能通过内分泌抵抗和PI3K-Akt、FoxO等信号通路抑制MAPK8和RAC1的基因表达发挥抗菌作用。

关键词： 儿童哮喘   过敏煎   网络药理   分子对接  

摘要： 目的:探究过敏煎治疗儿童哮喘的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台数据库检索过敏煎中的药物活性成分及相关靶点,整理中药活性成分-疾病有效靶点,获取蛋白-蛋白互作网络,进行拓扑分析,进一步进行基因本体论及京都基因与基因组百科全书富集分析。将处理后的活性成分作为小分子配体,蛋白靶点作为受体进行分子对接,将分子对接结果进行可视化分析。结果:共得到过敏煎54个有效活性成分,137个潜在靶点,157条信号通路。结论:过敏煎中槲皮素、山柰酚、汉黄芩素等有效成分可能通过神经营养的酪氨酸激酶1型受体、淀粉样前体蛋白、表皮生长因子受体等核心靶点作用于PI3K/Akt,AGE/RAGE、肿瘤坏死因子、白细胞介素17等信号通路,形成多成分、多靶点、多通路的治疗特点,从而发挥治疗哮喘的作用。

关键词： 中药   网络药理学   肝癌   HepG2细胞  

摘要： 目的基于网络药理学预测并通过细胞实验验证探究郁金—水红花子对肝癌的作用机制。方法通过TCMSP筛选郁金—水红花子的药效活性成分,整理并校正其相应作用靶点。通过Ctdbase数据库收集肝癌相关基因靶点,运用Venny筛选郁金—水红花子治疗肝癌的关键靶点,利用STRING数据库对关键靶点进行蛋白相互作用(PPI)网络分析及GO和KEGG通路富集分析,采用Cytoscape构建成分—靶点—疾病网络。检测不同浓度郁金—水红花子提取物对HepG2细胞存活率的影响,采用Western blot检测HepG2细胞Akt、p-Akt、PI3K及p-PI3K蛋白表达。结果筛选郁金—水红花子活性成分28个,作用靶点278个,肝癌靶点35317个。PPI网络拓扑分析获得45个核心基因,通过GO及KEGG富集分析得到郁金—水红花子干预肝癌的关键信号通路。体外实验表明,郁金—水红花子对HepG2细胞增殖具有显著抑制作用,可下调Akt、p-Akt、PI3K及p-PI3K蛋白表达。结论郁金—水红花子对HepG2细胞增殖具有显著抑制作用,调控PI3K/Akt信号通路抑制肝癌细胞增殖可能是其部分作用机制。

关键词： 生理学   药理学   课程思政   实践  

摘要： 课程思政是高校落实立德树人根本任务的需要,生理学和药理学是基础医学与临床医学衔接的桥梁课程,神经系统又是其中的重要组成部分。神经系统生理学与药理学课程思政的探索和实践,对基础医学教育和拔尖创新人才培养具有重要意义。本研究在神经系统生理学与药理学课程中潜移默化地融入课程思政案例,针对课程思政教育教学进行了初步实践与总结思考,为今后相关课程开展课程思政研究提供借鉴。

关键词： 雪菊   高脂血症   超高效液相色谱串联四极杆静电场轨道阱质谱   入血成分   网络药理学  

摘要： 目的探讨雪菊防治高脂血症的潜在活性成分及作用机制。方法利用超高效液相色谱串联四极杆静电场轨道阱质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS)对雪菊黄酮部位及其入血成分进行定性分析;筛选雪菊黄酮入血成分与高脂血症的交集靶点,并采用STRING 12.0数据库对蛋白质-蛋白质相互作用网络进行构建与分析;最后通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行富集分析。结果雪菊黄酮部位共检测到25个化合物,并完成结构鉴定,其中包括10个查尔酮类、9个二氢黄酮类、4个黄酮醇类、1个橙酮类及1个双黄酮类化合物。经入血成分分析,发现马里苷、二氢马里苷、奥卡宁、异奥卡宁和5,7,3′,5′-四羟基黄酮-7-O-β-D-吡喃葡萄糖苷5个雪菊黄酮部位入血成分。经网络药理学GO和KEGG富集分析,发现雪菊黄酮类成分可能通过调控磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B、肿瘤坏死因子、缺氧诱导因子-1等信号通路发挥对高脂血症的防治作用。结论雪菊可防治高脂血症,其机制可能与马里苷、二氢马里苷、奥卡宁、异奥卡宁和5,7,3′,5′-四羟基黄酮-7-O-β-D-吡喃葡萄糖苷这5个雪菊黄酮入血成分有关。

关键词： 癫痫   芬氟拉明   网络药理学   分子对接   多巴胺能突触   蛋白相互作用  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨芬氟拉明治疗癫痫的潜在作用机制。方法从GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库中对癫痫的相应疾病靶点进行筛查,利用drugbank、pharmmapper、swisstarget等数据库筛选芬氟拉明的药物靶点。取癫痫和芬氟拉明的交集靶点,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络,将其导入Cytoscape 3.9.1软件作网络拓扑分析筛选核心靶点并处理可视化。通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用分子对接技术验证芬氟拉明与关键靶点的相互作用。结果获得139个癫痫与芬氟拉明的交集靶点基因,并根据网络拓扑分析筛选出33个核心靶点。GO分析结果显示,核心靶点主要涉及化学突触传递及信号转导等生物过程(BP);离子体膜、细胞质及质膜等细胞成分(CC);蛋白结合、神经递质受体活性等分子功能(MF)。KEGG富集分析结果显示,芬氟拉明可能通过调控多巴胺能神经突触、神经活性配体-受体相互作用及PI3K-Akt等多个信号通路治疗癫痫。分子对接结果显示,芬氟拉明与DRD2、EGFR、HSP90AA1、SLC6A4、GSK3β及GRIN2B等关键靶点稳定结合。结论本文利用网络药理学和分子对接技术分析得到芬氟拉明可能通过作用于DRD2,从而调控多巴胺能突触信号通路抑制癫痫发作,为进一步研究其治疗癫痫的具体机制提供了新的线索,亦为后续临床和实验研究提供理论基础,从而有助于开发治疗癫痫的有效新药。

关键词： 诃子   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   鞣花酸  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨诃子治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索诃子的化学成分,Swiss Target Prediction数据库获取诃子的作用靶点。采用OMIM、GeneCards、DisGeNET数据库预测COPD作用靶点,借助微生信平台获取诃子与COPD的交集靶点。将交集靶点导入STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。基于Centispace插件进行拓扑分析,从而筛选诃子治疗COPD的核心靶点。采用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。结果:诃子活性成分8种,作用靶点333个,活性成分包括鞣花酸、番泻苷E、7-脱氢豆甾醇等。COPD作用靶点8805个,其与诃子的交集靶点253个。通过筛选得到10个核心靶点,包括信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)等。GO功能分析主要富集于细胞凋亡、G蛋白偶联血清素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性等,KEGG通路主要包括PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、ErbB信号通路等。结论:诃子通过多成分、多通路、多靶点发挥治疗COPD的作用。