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关键词： 大黄   膝关节炎   网络药理学   分子对接   大黄素   β-谷甾醇   大黄酸  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接研究大黄治疗膝关节炎的分子机制。方法通过TCMSP、PubChem、Swiss数据库收集到大黄的活性成分和潜在作用靶点。利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索得到膝关节炎的相关靶点。利用Venny 2.1绘制韦恩图,得到大黄治疗膝关节炎的交集靶点。基于STRING数据库,运用Cytoscape 3.10软件制作“药物–活性成分–潜在靶点–疾病”网络图,用拓扑分析筛选出核心靶点。利用DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过Discovery Studio软件进行分子对接。结果共筛选出16个大黄活性成分,包括大黄素、β-谷甾醇、大黄酸、大黄素甲醚等,筛选出蛋白激酶B1(Akt1)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、表皮生长因子受体(EGFR)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、胱天蛋白酶3(CASP3)等核心靶点。大黄治疗膝关节炎的信号通路主要富集于癌症中的蛋白多糖通路、癌症通路、内分泌抵抗通路、前列腺癌通路、表皮生长因子受体信号通路、焦点黏附通路、人类巨细胞感染通路等。分子对接显示核心成分大黄素、β-谷甾醇、大黄酸、大黄素甲醚等与核心靶点Akt1、MMP9、EGFR、SRC、CASP3等对接程度良好。结论大黄中大黄素、大黄酸等有效成分可能通过作用于Akt1、MMP9、EGFR等靶点调节多条信号通路,达到治疗膝关节骨性关节炎的作用。

关键词： 人参-白术-干姜角药   冠心病   网络药理学   分子对接  

摘要： 利用网络药理学和分子对接方法,探究"人参-白术-干姜"角药在防治冠心病中的潜在作用机制。方法 使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)查找人参、白术和干姜的活性成分,并利用GeneCards数据库和OMIM进行相关数据分析。本研究采用VennDiagramR包对药物靶点和疾病靶点进行交集分析,利用Cytoscape3.6.0软件构建了化合物-靶点网络,并利用STRING在线软件建立了蛋白质相互作用(PPI)网络。此外,在该研究中,采用ClusterprofileR软件包进行了基于基因本体(GO)和KEGG通路的功能富集分析。最后,使用Schrodinger Maestro11.9软件和在线工具对核心成分和主要靶点进行了分子对接验证。结果 人参-白术-干姜角药在冠心病治疗中作用于24个关键化合物,涉及48个关键靶点。GO分析结果显示人参-白术-干姜角药防治冠心病关键靶点在生物功能上主要与炎症反应、凋亡调控等生物学过程相关,而KEGG通路富集分析显示其涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、TNF信号通路、AGEs-RAGE介导信号通路、脂肪细胞因子信号通路、核转录因子-κB(NF-κB)信号通路等。分子对接验证了苏奇洛酮(suchilactone (?https:?/??/?***?/?***?qn=5384?))与CASP3(PDBID:3SRC)有较强的结合力。结论 运用网络药理学与分子对接方法分析了人参-白术-干姜对冠心病进行防治的潜在机制,并验证了人参、白术、干姜多成分、多靶点、多通路的作用特点,为进一步相关研究提供了基础。

关键词： 绞股蓝皂苷   高脂饮食   肥胖   网络药理学   分子对接   肠道菌群  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术并结合体内实验探讨绞股蓝皂苷(Gyp)对高脂饮食小鼠肠道黏膜菌群及体重的影响,探析Gyp干预肥胖小鼠的微生态机制。方法18只SPF级小鼠按照随机数表法分为6只正常组(C组)和12只造模组,造模组给与高脂饲料喂养,C组给与普通饲料喂养,持续12周。造模结束后,按照随机数表法将造模组分为6只模型组(M组)和6只Gyp组。Gyp组小鼠每日灌胃Gyp溶液,300 g/kg,2次/天,连续4周,同期灌胃C组和M组等量无菌水。收集小鼠小肠黏膜,利用16S rRNA高通量测序技术分析小鼠小肠黏膜菌群特征。同时结合网络药理学和分子对接技术预测绞股蓝治疗肥胖的潜在机制。结果网络药理学结果显示,绞股蓝可以调节90个与肥胖生成相关的靶点。这些靶点的PPI网络分析、GO和KEGG富集分析结果主要与代谢和炎症反应相关。分子对接验证结果显示,gypenosideⅩⅩⅤⅢ_qt作为绞股蓝的主要活性成分,与核心靶点蛋白TP53、TNF、AKT1的结合具有较强的亲和力。体重变化率结果显示,Gyp干预后,与M组相比,Gyp组小鼠体重增长趋缓。测序结果显示,造模改变了小肠黏膜菌群的α多样性和β多样性;Gyp干预后,与M组相比,Gyp组弧菌属相对丰度升高(t=6.662,P<0.001),uncultured bacterium f Lachnospiraceae相对丰度下降(t=2.850,P=0.017)。LEfSe分析结果显示,葡萄球菌属和弧菌属为Gyp组的优势菌属。相关性分析结果显示,uncultured bacterium f Muribaculaceae(r=0.733,P=0.020)、乳杆菌属(r=0.746,P=0.017)、韦荣球菌属(r=0.709,P=0.027)、脱硫弧菌属(r=0.758,P=0.015)、Candidatus Saccharimonas(r=0.721,P=0.023)、Lachnospiraceae NK4A136 group(r=0.794,P=0.008)、Ruminococcaceae UCG 014(r=0.733,P=0.020)、uncultured bacterium f Lachnospiraceae(r=0.830,P=0.005)与小鼠体重变化率呈显著正相关;葡萄球菌属(r=-0.721,P=0.023)和弧菌属(r=-0.649,P=0.049)与Gyp干预后的小鼠体重变化率呈显著负相关。结论绞股蓝通过多靶点、多通路作用于肥胖,其中TP53、AKT1、TNF、JUN为核心靶点。Gyp改变了肠道菌群的群落结构,增加了黏膜菌群的丰富度和多样性,减缓了肥胖小鼠体重的增长。

关键词： 三白草   网络药理学   抗炎   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学及分子对接技术分析三白草抗炎作用机制。方法 依托TCMSP数据库和相关文献筛选三白草主要活性成分,利用Swiss Target Prediction平台预测其作用靶点,用Cytoscape3.9.1软件构建“三白草—活性成分—靶点基因”网络图;将三白草主要成分作用靶点与抗炎靶点进行交集,绘制韦恩图,上传至String平台,进行蛋白互作(PPI)分析;通过Metascape数据库,对相应靶点开展基因本体(GO)富集分析及生物代谢通路(KEGG)富集分析并进行分子对接验证。结果 三白草的主要活性成分为马纳萨亭A、马纳萨亭B、三白脂素-7、三白脂素-8、三白草酮等,可作用于肿瘤坏死因子(TNF)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等161个抗炎靶点;生物过程涉及条目主要包括激素反应、肽反应等共计1 774项,分子功能涉及条目包括蛋白激酶活性、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性等共计191项,细胞组分涉及条目包括受体复合物、神经元细胞体、树突等共计129项;三白草中主要有癌症、趋化因子、钙离子、Apelin、Notch等信号通路参与抗炎。结论 三白草可能通过槲皮素、三白草酮、马纳萨亭A、马纳萨亭B等关键成分影响TNF、AKT1、ESR1等抗炎靶点,参与趋化因子等相关信号通路,发挥其抗炎作用。

关键词： 胃糜舒   NF-κB信号通路   JAK/STAT信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学分析探讨胃糜舒治疗慢性萎缩性胃炎肝胃不和型的相关作用机制,为后续实验提供参考。方法:通过中药系统药理数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)和Herb (http://***/)进行药物的活性成分的筛选,根据药代动力学特征ADME,将化合物SMLIE号导入SwissTargetPrediction数据库筛选药物的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库,得到目标靶点基因,利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络互作图。采用DAVID数据库平台分析“药物–成分–靶点”及其参与的生物过程及通路。结果:胃糜舒的核心活性成分为豆甾醇、异鼠李素、山萘酚、槲皮素、β-谷甾醇,主要作用于IL-17信号通路、TNF信号通路、p53信号通路、NF-κB信号通路和JAK/STAT信号通路。结论:本研究对胃糜舒治疗慢性萎缩性胃炎肝胃不和型的作用机制进行了初步网络验证,为后续实验研究提供参考。Objective: This paper aims to investigate the mechanism of action of Weimishu in the treatment of chronic atrophic gastritis with hepatogastric disharmony based on network pharmacological analysis, so as to provide reference for follow-up experiments. Methods: The active ingredients of the drugs were screened through the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP) and Herb (http://***/), and the compounds SMLIE were selected according to the pharmacokinetic characteristics of ADME The target of action of the drug was screened into the SwissTargetPrediction database. Through the GeneCards and OMIM databases, the target genes were obtained, and the String platform was used for protein-protein interaction analysis to construct the PPI network interaction map. The DAVID database platform was used to analyze the “drug-component-target” and the biological processes and pathways involved in it. Results: The core active components of Gastric Misot were stigmasterol, isorhamnetin, kaemphanol, quercetin and β-sitosterol, which mainly acted on IL-17 signaling pathway, TNF signaling pathway, p53 signaling pathway, NF-κB signaling pathway and JAK/STAT signaling pathway. Conclusion: This study preliminarily validated the mechanism of action of chylosol in the treatment of chronic atrophic gastritis with hepatogastric disharmony, and provided a reference for follow-up experimental research.

关键词： 益气活血汤   缺血性脑卒中   UPLC-ESI-LTQ-Orbitrap-MS   网络药理学   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的基于超高效液相色谱-离子阱-静电场轨道阱质谱(UPLC-ESI-LTQ-Orbitrap-MS)、网络药理学和动物实验探讨益气活血汤对缺血性脑卒中(IS)的作用。方法采用UPLC-ESI-LTQ-Orbitrap-MS技术分析益气活血汤潜在活性化合物,并基于TCMSP和SwissTargetPrediction数据库对化合物靶点进行预测;从GeneCards等数据库检索IS疾病相关靶点,与化合物靶点取交集获得关键靶点,建立潜在活性化合物-靶点调控网络和蛋白互作网络(PPI),并对关键靶点进行GO和KEGG分析。建立大脑中动脉栓塞(MCAO)大鼠模型,观察大鼠神经功能缺损、血清IL-6、IL-1β、TNF-α、VEGF和MMP-9水平及脑梗死率情况,采用HE染色法观察大鼠脑组织病理变化,并通过蛋白免疫印迹法分析大鼠脑组织中相关蛋白的表达。结果共筛选出益气活血汤潜在活性化合物37个,作用靶点598个,与8953个IS疾病靶点取交集后获得关键靶点499个。KEGG分析表明,关键靶点主要富集于PI3K/Akt等信号通路。动物实验表明,益气活血汤可改善MCAO大鼠神经功能缺损症状,减少脑梗死率,抑制炎性反应,改善脑组织病理形态,同时上调p-PI3K/PI3K和p-Akt/Akt的相对表达。结论益气活血汤可通过多成分、多途径、多靶点抑制炎性反应,调节PI3K/Akt信号通路中关键蛋白表达发挥治疗IS的作用。

关键词： 趣味引导   融合重构   兽医药理学教学   “5Q”教学法   “5M”课程内容体系  

摘要： 兽医药理学传统教学过程中,如何克服知识点繁复枯燥、思政元素孤立生硬、过程性评价参与度不高等挑战,是提高教学效果必须面对的一个问题。通过利用现代化信息平台,授课教师秉持“趣味引导,融合重构”的教学理念,通过多元化知识体系融合和探究式的课程设计,围绕学生的需求和兴趣切入教学,开展兽医药理学课程的教学改革。教师采用“5Q”教学法进行授课,引导学生主动探究和发现问题;加强课程思政建设,使学生在潜移默化中接受思想政治教育;通过对知识点进行模块化设计,形成“5M”课程内容体系;并通过构建四元教学评价体系,建立及时、精准的教学反馈机制。兽医药理学作为兽医学科的重要分支,其教学创新理念和实践具有较强的辐射推广价值。

关键词： 参与式教学法   药理学   高职   效果分析教学改革  

摘要： 目的探讨参与式教学法在高职药理学教学中的应用效果。方法选取江苏省徐州医药高等职业学校药学技术系2021级高职药学班的学生为研究对象,随机选取101名作为对照组,采用传统教学法,103名作为实验组,采用参与式教学法,通过考试成绩、教学满意度和课程思政三项指标对教学效果进行评价。结果实验组学生考试成绩、对参与式教学法的满意度及课程思政的考核得分均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论参与式教学法效果优于传统教学法,值得在高职药理学教学中进一步推广。

关键词： 网络药理学   分子对接   分子动力学   杜仲   淫羊藿   骨质疏松  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接和分子动力学方法研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制。方法查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和相关文献筛选杜仲-淫羊藿药对的活性成分, 应用TargetNet、SwissTargetPrediction、STITCH数据库筛选活性成分的作用靶点, 应用GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选骨质疏松的相关靶点, 利用Venny 2.1.0在线工具获取交集靶点。应用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。使用Cytoscape 3.8.2软件构建网络图并进行网络特征分析以确定核心成分和关键靶点。使用R 3.6.3软件进行基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。使用SYBYL-X 2.1.1软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。使用GROMACS 2021.6软件进行分子动力学模拟。结果筛选出杜仲-淫羊藿药对的活性成分47个, 作用靶点329个, 骨质疏松的相关靶点4 604个, 交集靶点210个。网络特征分析表明木犀草素、槲皮素、山柰酚、咖啡酸、金圣草黄素、松脂素是核心成分, 蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、类固醇受体辅激活因子(Src)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)、转录因子JUN是关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)主要涉及细胞激素代谢过程、细胞内受体信号通路、对氧化应激的反应、激素代谢过程等, 细胞组分(CC)主要涉及膜筏、膜微结构域、膜区、转录因子复合体等, 分子功能(MF)主要涉及核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、激素结合等。KEGG分析表明"杜仲-淫羊藿"药对治疗骨质疏松的信号通路主要有破骨细胞分化相关通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路和MAPK信号通路等。分子对接显示核心成分能够准确结合在关键靶点蛋白的活性位点上, 分子动力学分析进一步验证了核心成分与关键靶点蛋白的结合稳定性。结论杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松具有多成分、多靶点、多通路的特点, 为其临床用药奠定了理论基础。

关键词： 肉豆蔻   网络药理学   肿瘤  

摘要： 目的:基于网络药理学的方法,筛选肉豆蔻的有效活性成分,并预测其潜在的抗肿瘤靶点及筛选潜在抗肿瘤靶点的相关通路,探讨其抗肿瘤的作用机制。方法:通过查阅大量国内外文献,整理并获得肉豆蔻活性成分,利用多种数据库预测成分相关靶点,并与肿瘤靶点进行映射,得到活性成分的潜在抗肿瘤靶点,运用Cystoscope 3.6.1软件构建“化合物-基因”网络图筛选关键化合物和关键靶点,最后进行通路富集分析。结果:从肉豆蔻中一共筛选出有效活性成分19种,通过网络建模共筛选出与肿瘤相关的70个高频作用靶点和13条信号通路。富集分析结果显示,这些作用通路可能是肉豆蔻抗肿瘤的活性依据。结论:通过这次虚拟网络筛选,肉豆蔻通过多成分、多靶点和多途径的抗肿瘤方式发挥其抗肿瘤作用,这可为后续深入研究肉豆蔻抗肿瘤机制提供新的思路和线索。