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关键词： 特发性中枢性性早熟   网络药理学   知柏地黄汤化裁方   信号通路   分子机制  

摘要： 目的 目的 采用网络药理学探讨知柏地黄汤化裁方防治特发性中枢性性早熟(idiopathic central precocious puberty,ICPP)的分子机制。方法 使用中药系统平台搜集知柏地黄汤化裁方单味药活性成分;PubChem数据库和Uniprot数据库获取知柏地黄汤化裁方的主要活性成分靶基因;DisGeNET数据库获取ICPP的靶点;STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络模型及KEGG代谢通路分析;PyMOL软件绘图。结果 获得活性成分61个,与疾病的交集基因靶点13个,涉及的重要信号通路3条。结论 知柏地黄汤化裁方主要通过多成分、多靶点、多通路发挥对ICPP的治疗作用,为临床治疗提供一定的理论依据。

关键词： 瓜蒌   HPLC-Q-TOF-MS/MS   祛痰止咳   网络药理   质量标志物  

摘要： 目的:基于HPLC-Q-TOF-MS/MS技术和网络药理学方法,分析预测瓜蒌祛痰止咳的质量标志物(Q-Marker)。方法:采用HPLC-Q-TOF-MS/MS技术鉴定瓜蒌水提液的入血原型成分,利用Swiss Target Prediction、SEA平台预测成分的作用靶点,并与CooLGeN数据库中止咳化痰药物靶点比对筛选,获得瓜蒌祛痰止咳的作用靶点。利用String数据库获得各蛋白之间的相互关系。使用DAVID数据库对瓜蒌祛痰止咳的作用靶点进行GO和KEGG通路富集分析。利用Cytoscape 3.6.0软件构建成分-靶点、蛋白-蛋白相互作用、成分-靶点-通路网络。结果:该研究共从大鼠血浆中鉴定出17个入血原型成分。经网络药理学分析,筛选得到15个与瓜蒌祛痰止咳相关的活性成分,涉及61个潜在作用靶点和23条作用通路。初步预测葫芦素D、葫芦素R、栝楼酯碱3个成分可作为瓜蒌潜在的Q-Marker。结论:该研究为瓜蒌质量标志物的筛选提供参考,同时也为瓜蒌祛痰止咳药效物质基础和作用机制研究提供参考。

关键词： 肉桂醛   姜黄素   网络药理学   肝癌   作用机制  

摘要： [目的]基于网络药理学、分子对接和实验研究探讨肉桂醛联合姜黄素抗肝细胞癌的作用机制。[方法]利用PharmMapper、SwissTarget、Target Net数据库筛选肉桂醛、姜黄素的相关作用靶点;TTD、Gene cards、OMIM筛选肝癌作用靶点;Venny软件筛选共同靶点;STRING数据库、Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白相互作用网络(PPI);通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并进行分子对接。通过噻唑蓝(MTT)法、Hoechst 33258染色法、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)法检测进行体外细胞实验验证。[结果]经过筛选获取肉桂醛-姜黄素抗肝癌关键靶点,主要是RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)、肿瘤坏死因子(TNF)等,可能涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、白细胞介素(IL)-17、血管内皮生长因子(VEGF)等197条信号通路。分子对接表明,两药合用对AKT1具有较好的亲和性。选取PI3K/Akt信号通路上关键靶点进行体外实验验证,结果表明,与空白对照组比较,肉桂醛联合姜黄素能显著抑制SMMC-7721肝癌细胞存活率(P<0.01),显著升高凋亡率(P<0.05),并显著降低PI3K、AKT1、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、核因子-κB1(NF-κB1)mRNA的表达(P<0.01)。[结论]肉桂醛联合姜黄素能有效抑制SMMC-7721肝癌细胞活性,诱导其凋亡,其抗肝癌作用机制可能与抑制PI3K/Akt信号通路有关。

关键词： 黄芪四妙汤   2型糖尿病   网络药理学   分子对接   代谢组学  

摘要： 为探析黄芪四妙汤(Huangqi Simiao Decoction,HSD)治疗2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制。通过网络药理学筛选HSD的成分靶点及T2DM相关疾病靶点,构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络、药物-成分-交集靶点网络,并筛选出潜在活性成分及靶点;使用AutoDock Vina软件进行分子对接验证潜在成分与核心靶点的相互作用;通过超高效液相色谱-串联质谱代谢组学技术检测血清,采用主成分分析(PCA)及偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)等多元统计分析,结合MetaboAnalyst数据库寻找各组差异代谢物与相关代谢通路,并将筛选的差异代谢物结合网络药理学筛选的交集靶点联合分析相同代谢通路。网络药理学显示,HSD治疗T2DM的9个核心成分为槲皮素、山柰酚、豆甾醇、汉黄芩素、β-谷甾醇、黄藤素、黄连素、黄连碱、小檗红碱;5个核心靶点为AKT1、TP53、TNF、IL6、VEGFA。分子对接显示,核心成分和靶点基因结合较好。代谢组学显示,共鉴定出112个共同差异代谢物,经HSD治疗后,其中88个代谢物浓度上升,24个代谢物下降。富集分析表明,HSD调节T2DM患者机体代谢主要与氨基酸代谢、三羧酸循环等7条代谢通路有关。代谢组学与网络药理学联合分析显示,二者均涉及组氨酸代谢通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路。结果表明,HSD对T2DM具有较好的治疗作用,基于代谢组学和网络药理学分析发现其作用机制可能是HSD中槲皮素、山柰酚、豆甾醇等药效基础通过调控多种代谢物,加强对组氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢通路的影响,为进一步防治T2DM提供了依据。

关键词： 小续命汤   超高效液相色谱   高分辨质谱   网络药理学   中风   血管生成   磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B   血管生成因子  

摘要： 目的:探讨小续命汤治疗中风的药效物质及作用机制。方法:基于UHPLC-Q Exactive Plus HRMS鉴定小续命汤中的成分,网络药理学预测小续命汤治疗中风的活性成分及潜在机制,鹌鹑胚绒毛尿囊膜(qCAM)实验可视化小续命汤的促血管生成作用。结果:从小续命汤中鉴别出麻黄碱、升麻素苷和黄芩苷等68个成分,包括氨基酸类、生物碱类、黄酮类、香豆素类、萜类、丁基苯肽类等化合物;成分与中风的交集靶点建立了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,共筛选出IL-6、TNF、EGFR、PDGFRB和PIK3CA等33个核心靶点;麻黄碱、黄芩苷和人参皂苷Rg1等57种活性成分;核心靶点的富集分析表明小续命汤治疗中风可能主要通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)和血管生成因子(VEGF)信号通路等与血管生成相关的通路。qCAM实验中阳性对照组(Gas,0.02 mg)和小续命汤高剂量组(XXMD-H,2 mg,折合生药量16.69 mg)的血管相对面积比空白组显著增加(P<0.05),较好地可视化了小续命汤促进血管生成。结论:本研究通过结合UHPLC-Q Exactive Plus HRMS和网络药理学的方法阐明了小续命汤治疗中风的药效物质,得出潜在作用机制可能与作用于PI3K-AKT、VEGF等信号通路促进血管生成有关,并通过qCAM实验评价其促进血管生成活性,RT-qPCR进一步验证相关靶点,为小续命汤的质量研究与进一步开发提供参考。

关键词： 网络药理学   分子对接   竹沥-生姜药对   中风病   机制  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接技术预测竹沥-生姜配伍治疗中风病的作用靶点,探讨其治疗中风病的潜在分子作用机制和有效物质。方法:利用PubChem、SwissTargetPrediction和UniProt数据库挖掘竹沥-生姜药对的潜在活性成分及药物靶点,通过GeneCards数据库筛选疾病靶点。将药物靶点与疾病靶点匹配所得交集靶点导入STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助Cytoscape软件筛选关键靶点,将关键靶点与对应成分联系起来绘制网络图,筛选关键成分;对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过AutoDock软件对关键活性成分与潜在作用靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到药组活性成分41个,相关靶点291个,中风病相关靶基因729个,以及竹沥-生姜药对治疗中风病的交集靶点67个。这些交集靶点主要参与细胞炎症反应、细胞活化、细胞免疫反应等过程,并与癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation EndProduct,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor for Advanced Glycation End Products,RAGE)信号通路等相关。分子对接结果显示,竹沥、生姜的主要活性成分与中风病的潜在作用靶点间具有一定的结合活性。结论:竹沥-生姜可通过多成分、多靶点、多通路发挥对中风病的治疗作用。本研究为后续药理机制探索提供方向,为该药对临床应用提供了理论依据。

关键词： 柴胡   系统药理学   非酒精性脂肪肝   分子对接   PI3K-AKT信号通路  

摘要： 【目的】探究柴胡对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的防治作用及机制。【方法】借助TCMSP数据库及查阅文献获取柴胡化学成分及其作用靶点,并利用Gene Cards、OMIM等数据库获取NAFLD疾病靶点。筛选二者间共有靶点进行蛋白质互作、KEGG、GO富集与分子对接分析,以挖掘柴胡防治NAFLD潜在活性成分及作用机制。最后,通过高脂饲料复合高糖饮水建立NAFLD小鼠模型,验证柴胡治疗效果及作用机制。【结果】柴胡可通过18个潜在活性成分直接作用于99个靶点来防治NAFLD,其中槲皮素、山奈酚、异鼠李素为其核心活性成分,AKT1、TNF、ESR1为其核心作用靶点。富集分析表明,柴胡可能通过干预PI3K-AKT、MAPK及TNF等信号通路来防治NAFLD。动物试验结果表明,柴胡治疗能显著降低NAFLD小鼠血清AST、ALT水平,改善NAFLD小鼠肝脏脂肪变性,并回调PI3K-AKT通路中AKT和MAPK通路中SREBP-1在肝脏组织中的表达。【结论】柴胡可有效的防治NAFLD,其作用机制与调控PI3K-AKT和MAPK信号通路密切相关。

关键词： 二氢杨梅素   炎症性肠病   网络药理学  

摘要： [目的]通过网络药理学和体外实验预测并验证二氢杨梅素(DHM)治疗炎症性肠病(IBD)的潜在靶点及作用机制。[方法]使用Pubchem数据库获取DHM作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB、Drugbank数据库获取IBD疾病靶点,获取药物与疾病的交集靶点。利用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络并使用Cytoscape可视化筛选核心靶点。运用R语言进行基因本体(GO)功能分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。体外实验验证DHM的抗炎作用及可能机制。[结果]DHM作用靶点与IBD疾病靶点相交共得到42个交集靶点,并筛选出5个核心靶点凝血因子Ⅱ(F2)、内皮型一氧化氮合酶3(NOS3)、丝氨酸羟甲基转移酶1(SHMT1)、造血细胞激酶(HCK)、二氢叶酸还原酶(DHFR)。GO功能分析和KEGG富集分析显示DHM可能通过黏附连接、趋化因子、Ras信号通路等发挥作用。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)显示DHM能抑制脂多糖(LPS)诱导的HT-29细胞炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-18(IL-18)mRNA水平升高。RT-PCR提示在LPS诱导后靶点NOS3、HCK mRNA表达水平升高,而DHM干预后其表达水平下降。蛋白免疫印迹法(Western blot)检测显示DHM能有效恢复LPS诱导的HT-29细胞连接蛋白的下调。[结论]研究揭示了DHM通过多通路、多靶点治疗IBD,并可能通过恢复细胞间连接改善屏障功能受损有效治疗结肠炎。

关键词： 口腔黏膜下纤维化   芒果苷   基因表达综合数据库   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制。方法基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾病靶标,使用EVenn平台绘制维恩图,STRING数据库绘制蛋白质互作(PPI)网络,DAVID平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,Cytoscape 3.10.1软件绘制药物—靶标—通路—疾病网络图,AutoDocktools 1.5.6软件进行分子对接分析及可视化。结果从多种数据库挖掘得到MF潜在靶标356个,OSF疾病靶标360个,选取PPI网络中排名前15个关键靶蛋白,GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,MF治疗OSF主要涉及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、表皮生长因子受体(EGFR)等信号通路。分子对接显示,MF与丝氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)等核心靶点有较佳结合活性。结论MF可能通过多靶点、多途径的方式对OSF发挥治疗作用。

关键词： 鸡血藤-附子   化疗所致血小板减少症   网络药理学   分子对接  

摘要： 基于网络药理学与分子对接的相关方法,探讨鸡血藤-附子配伍治疗化疗所致血小板减少症的机制。方法 在TCMSP数据库中可获取附子-鸡血藤的活性成分以及相关靶点信息。以“Chemotherapy-inducedthrombocytopenia”(化疗后血小板减少症)为关键词,在GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库中搜索,获取相关的疾病靶点。利用cytoscape对药物与疾病进行网络图的构建,通过各类数据库获取相关靶点或通路,再经Autodock分子对接软件探究鸡血藤-附子治疗化疗所致血小板减少症在理论上的机制。结果 通过TCMSP数据库得到去重后240个附子-鸡血藤的相关靶点,通过GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库得到相关疾病靶点727个。通过Venny在线网站绘制韦恩图,获得75个药物-疾病共同靶点和29个潜在活性成分,将75个共同靶点进行富集分析,得到KEGG通路主要富集于癌症中的蛋白聚糖信号通路,IL-17信号通路,胰腺癌信号通路,PI3K-Akt信号通路等发挥治疗化疗所致血小板减少症的作用。最后通过Autodock软件对接靶点蛋白与鸡血藤-附子的活性成分,得到结合能较低、结合稳定性较好的有AKT1与beta-sitosterol等的配体-蛋白,表明核心成分和核心靶点可形成稳定构象,具有较好的结合活性。结论 采用网络药理学方法对鸡血藤-附子治疗化疗所致血小板减少症的相关活性成分及潜在作用机制进行预测,为其临床应用及实验研究提供了理论依据。