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关键词： 脊髓损伤   补阳还五汤   网络药理学   PI3K/Akt通路   NF-κB通路   P53通路  

摘要： 目的运用网络药理学及实验验证探讨补阳还五汤治疗脊髓损伤的潜在靶点及机制。方法通过网络药理学相关数据库筛选补阳还五汤和脊髓损伤相关靶点并进行映射,将共有靶点进行PPI网络分析、GO和KEGG富集分析。构建大鼠脊髓损伤模型,并将造模成功的24只大鼠随机分为假手术组、模型组和补阳还五汤组,每组8只探索和验证补阳还五汤治疗脊髓损伤的相关通路和靶点。结果获得214个补阳还五汤靶点、2647个脊髓损伤相关靶点,取交集的58个共有靶点。PPI网络筛选得到两个核心子网络,其中ALB、Akt1、HIF-1α、VEGFA和JUN为关键靶点。GO分析得到1583个条目。KEGG分析表明补阳还五汤治疗脊髓损伤与PI3K-Akt、NF-κB、P53等多条通路密切相关。补阳还五汤组Basso-Beattie-Bresnahan(BBB)评分高于模型组(P<0.01,P<0.0001)。补阳还五汤上调脊髓损伤后关键蛋白HIF-1α、ALB、VEGFA和JUN水平(P<0.05,P<0.01);补阳还五汤下调脊髓损伤后通路蛋白p-PI3K/PI3K、p-Akt1/Akt1、p-NF-κB p65/NF-κB p65、P53水平(P<0.05)。结论补阳还五汤能够抑制脊髓损伤后SD大鼠脊髓损伤节段PI3K-Akt、NF-κB、P53等通路和促进HIF-1α、ALB、VEGFA和JUN等关键蛋白表达,从而促进神经功能恢复,发挥治疗脊髓损伤的作用。

关键词： 生姜   鲜药   超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱   网络药理学   分子对接   传统功效   作用机制   质量标志物  

摘要： 目的:基于超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术和网络药理学对生姜的质量标志物(Q-Marker)进行预测分析。方法:采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术在正、负离子模式下对生姜中化学成分进行定性分析;运用网络药理学分析生姜传统功效的现代药理作用机制从而初步探索生姜的Q-Marker,并利用分子对接技术验证活性成分与靶点蛋白的结合活性。结果:通过UPLC-Q-TOF-MS/MS技术共分析得到生姜中48种化学成分,筛选后得到活性成分33个,以这33个活性成分为Q-Marker候选成分做网络药理学分析,获得靶点基因508个,作用于157条信号通路,如磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、大鼠肉瘤蛋白(Ras)信号通路等。该实验初步探究了8-姜酮(8-gingerone)、6-姜烯酚(6-shogaol)、8-姜酚(8-gingerol)、四氢姜黄素(Tetrahydrocurcumin)、1-脱氢-8-姜二酮(1-dehydro-8-gingerdione)和(E)-4-(3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-yl)-2-methoxy phenol等6个化合物发挥药效的作用机制并预测为生姜的Q-Marker。结论:本研究初步预测了生姜传统功效的Q-Marker。

关键词： 模块药理学   网络药理学   复杂网络   多组学数据   分析平台  

摘要： 模块药理学通过对多维度、多靶点生物网络的系统解构阐释疾病复杂机制和药物多靶点相互作用关系,在疾病发生发展机制、病证生物学基础、中药多靶点药理机制解析、方剂组方配伍规律研究、中药复方新药发现等领域取得了应用进展。多组学数据和生物网络的复杂性特点为网络的模块化解构和应用带来障碍,该文研究构建了“模块药理计算平台”在线分析系统,针对定量表达谱数据和蛋白-蛋白相互作用(PPI)数据实现网络构建与模块划分、模块判别分析、主要模块分析、模块内关系分析、模块间关系分析、网络拓扑和可视化等功能,为基于模块药理学的复杂疾病和多靶点药物机制研究提供有力工具。平台将在疾病模块识别与关联机制、中医药科学原理解读、中药及方剂复杂作用机制解析、多靶点药物发现等领域具有广阔的应用空间。

关键词： 网络药理学   分子对接   云岭中医疏调学派   疏调气机汤   抑郁症  

摘要： 目的:运用网络药理学及分子对接技术探讨张震教授运用疏调气机汤治疗抑郁症的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集药物活性成分及靶标,利用Cytoscape 3.8.0构建“药物-活性成分-靶点”网络图;在OMIN、Genecards、Drugbank等多个数据库中以“depression”为关键词检索疾病相关靶点,利用STRING数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用网络图并进行拓扑分析。运行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。将关键成分与核心靶点进行分子对接验证并绘制相应对接构象。结果:疏调气机汤共含233个活性成分,潜在作用靶点有258个,筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、环腺苷酸反应元件结合蛋白1(cAMP Responsive Element Binding Protein 1,CREB1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member 1,HSP90AA1)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)1等共18个核心靶标。GO富集结果共3 075条;KEGG富集结果涉及193条信号通路。分子对接结果显示,β-谷甾醇与AKT1、槲皮素与AKT1、木犀草素与HSP90AA1、异鼠李素与FOS原癌基因(Fos Proto-Oncogene,FOS)结合性能最佳。结论:疏调气机汤通过“多成分、多通路、多靶点”积极拮抗抑郁,为挖掘抗抑郁复方及化合物奠定了基础和依据。

关键词： 室性心律失常   养心定悸胶囊   网络药理学   分子机制   信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨养心定悸胶囊治疗室性心律失常(Ventricular Arrythmia,VA)的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM等数据库筛选养心定悸胶囊的有效成分及其作用靶点,通过GeneCards、OMIM等数据库检索VA的疾病靶点,制作韦恩图,获得相关交集。使用STRING数据库制作靶点间相互作用网络,筛选关键靶点及关键成分,使用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络。运用DAVID网站进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:检索到活性成分146种,预测靶点761个,疾病靶点2 126个,交集靶点222个。构建的网络最终获得47个节点和708条边,获得10个核心靶点,包括重组人信号转导与转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Serine-Threonine Protein Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等。GO和KEGG富集分析与筛选显示,养心定悸胶囊治疗VA的作用通路包括磷代谢过程的正调控、细胞运动的正调控、对外源性刺激的反应等。结论:养心定悸胶囊治疗VA通过多成分、多靶点作用于磷代谢过程的正调控、对激素的反应、细胞运动的正调控等多通路发挥药效。

关键词： 当归   骨关节炎   活性成分   作用机制  

摘要： 骨关节炎(osteoarthritis,OA)属于骨科临床常见的慢性、增龄性疾病,炎症和软骨退变在其发病机制中起着关键作用。近年来,随着对中医药研究的不断深入,运用中医药防治OA在临床上被广泛应用。活血化瘀类中药能够有效抑制炎症反应,延缓软骨退变,有望成为防治骨关节炎的潜在药物资源。当归是常见的活血化瘀中药,其在骨关节炎的治疗中使用频率较高。药理学研究表明,活性成分阿魏酸(ferulic acid,FA)、当归多糖(Angelica sinensis polysaccharide,ASP)、藁本内酯(ligustilide,LIG)能够有效抑制炎症反应,抑制细胞外基质降解,调节软骨细胞的代谢和阻碍软骨细胞的凋亡,对OA有显著的疗效。该文就当归活性成分在骨关节炎防治领域取得的最新进展与突破做一综述,旨在系统梳理当归活性成分治疗骨关节炎的药理学机制及作用价值,为进一步的基础研究与药物研发提供科学依据。

关键词： 桑叶   清肺润燥   肺燥咳嗽   肺热咳嗽   UPLC-TOF-MS/MS技术   网络药理学   信号通路  

摘要： 目的本研究以中医药理论中桑椹滋阴补血的功效为依据,利用超高压液相色谱串联四级杆飞行时间质谱(UPLC-TOF-MS/MS)技术结合网络药理学探讨桑叶清肺润燥的潜在药效成分和作用机制。方法利用UPLC-TOF-MS/MS技术结合SwissADME鉴定桑叶的主要活性成分,使用PharmMapper数据库、Swiss Target Prediction数据库预测桑叶活性成分的靶点,在GeneCards数据库、SymMap数据库中筛选肺热咳嗽和肺燥咳嗽的潜在作用靶点。将成分靶点与症状群靶点取交集后,导入STRING数据库构建PPI网络获得核心靶点,最后对核心靶点基因做GO生物过程分析和KEEG通路富集分析。结果结果显示桑椹有效药效成分有55个,靶点261个,与肺热咳嗽、肺燥咳嗽证候相关的核心靶点分别为15和27个。四个证候群的GO生物过程和KEGG通路分析结果存在共性和特性,HIF1x信号通路、白细胞跨内皮迁移是桑叶清肺润燥的主要途径。结论因此桑叶通过多成分、多靶点、多通路的协同作用发挥清肺润燥作用,为进一步研究探讨桑椹滋阴补血的药效成分及作用机制研究提供了理论依据。

关键词： 黄芪   苦参   网络药理学   分子对接   结肠癌  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术探讨黄芪苦参药对配伍治疗结肠癌的作用机制。方法根据中药系统药理学据库分析平台(TCMSP)筛选黄芪、苦参的所有活性成分;通过TCGA、GeneCards、OMIM得到结肠癌靶点基因;然后利用Cytoscape3.8.2等软件,建立“药-效物质-靶标”模型。利用PPI进行蛋白质交互作用的网络图谱;使用ClusterProfiler对靶点基因进行进一步GO、KEGG分析。对筛选出的黄芪和苦参的关键活性成分和主要靶点利用AutoDock Vina(1.1.2)进行分子对接验证。结果通过网络药理学、分子对接和生信分析,共筛选获得37个活性成分,167个药物治疗结肠癌的交互靶点基因,2616条GO条目;将涉及的排位前20的主要信号通路作图。分子对接结果显示核心成分与IL6、TNF、TP53、AKT1、IL1B靶点之间有较好的结合力。结论初步揭示了黄芪、苦参药对的物质基础及作用机制,为其治疗结肠癌的临床应用提供了理论基础。

关键词： 医学研究院   军事科学院   研究论著   药理学与毒理学   生物医学期刊   专题评述   新技术新方法  

摘要： 1《中国药理学与毒理学杂志》为军事科学院主管,军事科学院军事医学研究院主办的学术性刊物,月刊,国内外公开发行。编辑部设在军事医学研究院毒物药物研究所。本刊主要刊登药理学和毒理学各分支学科的研究论著、专题评述、综述和新技术新方法的创建。2来稿可用中文或英文撰写,基本按照国际医学期刊编辑委员会(International Committee of Medical Journal Editors)制定的《生物医学期刊投稿的统一要求》〔Uniform requirements for manuscripts submitted to biomedical *** Intern Med,1997,126(1):36-47〕的格式撰写。

关键词： 虎掌草提取物   抗前列腺癌   作用机制   网络药理学   实验验证  

摘要： 运用网络药理学预测结合实验验证研究苗药虎掌草不同溶剂提取物的抗前列腺癌活性及其作用机制。分别以水、75%乙醇和乙酸乙酯提取虎掌草获得粗提物,通过MTT法体外检测3种溶剂提取物对前列腺癌细胞PC3增殖的影响,流式细胞术检测其对细胞凋亡的影响,评价提取物对PC3细胞的抑制作用;采用GC-MS分析乙酸乙酯提取物的化学成分;运用网络药理学分析虎掌草的活性成分及抗前列腺癌作用靶点,构建PPI网络,拓扑分析筛选核心靶点,通过GO生物功能富集和KEGG通路富集分析构建虎掌草抗前列腺癌的信号通路,预测潜在作用机制;利用RT-PCR检测虎掌草提取物对预测的TNF信号通路相关基因转录水平表达的影响,验证预测靶点,进一步分析作用机制。细胞实验表明,3种溶剂提取物对PC3细胞均具有较强的抑制增殖作用,且能显著诱导细胞凋亡(P<0.01);GC-MS和网络药理学结果表明白桦脂酸和虎掌草皂苷D为提取物的主要药效成分,检索得到与抗前列腺癌相关的靶点89个,进一步筛选得到核心靶点15个,涉及ALB、JUN、HSP90AA1等靶点;GO功能富集涉及142个生物过程、28个细胞组成和41个分子功能,KEGG通路富集分析交集靶点主要涉及TNF、TRP、NF-κB、癌症通路等。RT-PCR靶点验证实验表明3种溶剂提取物均能显著影响TNF信号通路关键基因的表达,证明了网络药理学预测机制的可靠性。本研究揭示了虎掌草水、75%乙醇和乙酸乙酯提取物具有较强的抗前列腺癌活性,白桦脂酸和虎掌草皂苷D为主要药效成分,其作用机制可能与调控TNF、TRP、NF-κB、癌症通路等有关。