课程文献中心 更多>>

关键词： Astragalus   Salvia   Chronic nephritis   Drug pairs   Signaling pathway  

摘要： To elucidate the mechanism underlying the therapeutic impact of Astragalus-Danshen in chronic glomerulonephritis(CGN),a comprehensive exploration was conducted utilizing network *** TCMSP database was employed to aggregate the chemical constituents and targets associated with Astragalus and ***,disease targets specific to CGN were sourced from the Genecards *** convergence of these datasets yielded a set of intersection genes,representing potential targets for CGN treatment through Astragalus-Danshen ***,protein interaction networks and“chemical composition-target”networks were meticulously *** targets were subjected to GO and KEGG enrichment *** investigation revealed a total of 240 targets corresponding to 20 and 65 chemical components of Astragalus and Danshen,*** this pool,86 potential targets associated with CGN treatment were discerned,ultimately identifying 29 core *** among these were TNF,JUN,TP53,IL1B,RELA,MMP9,CASP3,IL10,MAPK14,MYC,and *** enrichment analysis illuminated pathways pertinent to CGN,encompassing the IL-17 signaling pathway,TNF signaling pathway,and the AGE-RAGE signaling pathway in diabetic *** summary,Astragalus-Danshen exhibited a potential anti-inflammatory and renoprotective effect on CGN,particularly through modulating the IL-17 signaling pathway,TNF signaling pathway,and AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications,involving key regulators such as TNF,JUN,TP53,IL1B,MAPK14,and others.

关键词： 佛手   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的 基于网络药理学、分子对接及体内实验验证探讨佛手治疗糖尿病肾病的作用机制。方法 通过检索公共数据库以确定佛手的生物活性化合物以及治疗糖尿病肾病的相关靶点和相关基因。利用PPI网络图,GO和KEGG富集分析来预测佛手治疗DN的核心靶点和信号途径,运用AutoDock软件对佛手关键成分和核心靶点进行对接验证。最后采用高糖高脂饮食联合链脲佐菌素诱导DN小鼠模型,评估佛手提取物在该模型中的药效作用及分子机制。结果 佛手中筛选出活性成分9个,匹配相关靶点信息200个,获得药物与疾病交集靶点104个,潜在的关键治疗靶点有AKT1、MAPK3、SRC和EGFR,主要参与癌症途径和PI3K-AKT-mTOR等信号通路。分子对接显示,活性成分与靶点间有较强的接合能力。动物试验证实,佛手可以通过降糖(FBG)、降脂(TC、TG)、调节自噬缺陷(24h UP、BUN、SCr),改善肾脏病理损伤,下调肾组织中p-PI3K、p-AKT和p-mTOR的表达,增加自噬相关蛋白的表达。结论 佛手可能通过抑制PI3K-AKT-mTOR信号通路的激活从而调节糖脂代谢紊乱和改善自噬缺陷,发挥防治糖尿病肾病的作用。

关键词： 成骨细胞   巴戟天丸   Aβ沉积   网络药理学  

摘要： 目的 探讨巴戟天丸组方对Aβ损伤成骨细胞的骨形成作用及其机制。方法 以新生24 h Wistar大鼠所分离的成骨细胞为研究对象,用Aβ1-42寡聚体对成骨细胞进行损伤,并用巴戟天丸组方水提物进行药物干预。分别采用MTT法、碱性磷酸酶(ALP)活性检测、过氧化氢酶(CAT)活性检测、超氧化物歧化酶(SOD)活性检测、谷胱甘肽(GSH)活性检测以及丙二醛(MDA)活性检测。采用蛋白质印迹法检测骨形成相关蛋白骨形态发生蛋白2(BMP2)、成骨特异性转录因子(RUNX-2)、骨保护蛋白(OPG)的表达水平;明确巴戟天丸组方对Aβ损伤成骨细胞的作用后,采用网络药理学方法对潜在的作用机制进行预测。结果 巴戟天丸组方可显著促进Aβ损伤成骨细胞的增殖,提高ALP、SOD、GSH活性,抑制MDA活性,并促进骨形成相关蛋白BMP2、RUNX-2、OPG的表达。网络药理学分析显示,巴戟天丸组方发挥改善Aβ损伤成骨细胞的作用主要与AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及神经活性配体与受体的相互作用通路等有关。结论 明确巴戟天丸组方具有改善Aβ损伤成骨细胞的作用,并通过网络药理学方法探究其相关作用通路,为传统方剂巴戟天丸抗骨质疏松的临床应用提供借鉴。

关键词： 类风湿关节炎   见血飞   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接方法研究苗药见血飞干预类风湿关节炎作用机制,为基础研究及临床研究提供依据。方法:文献检索筛选见血飞的活性成分,通过Swiss ADME网站预测药物靶点,利用Genecards数据库、DisGeNet数据库、DRUGBANK数据库、OMIM数据库、MalaCard数据库及TTD数据库筛选类风湿关节炎相关靶点;采用CytoScape 3.8.2软件构建蛋白互作网络及活性成分-关键靶点-通路;使用R语言进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;使用Molecular Operating Environment(MOE)进行分子对接。结果:预测TLR4、CASP3、PTGS2、MMP-9是见血飞干预类风湿关节炎的关键靶点;分子对接表明Decarine、飞龙掌血素、白屈菜红碱、二氢白屈菜红碱、珊瑚菜内酯、橙皮素、Oxychelerythrine和茵芋碱与TLR4、CASP3、PTGS2、MMP-9对接结合力平均值-5.92 kcal·mol^(-1)。结论:通过网络药理学和分子对接方法,初步揭示了见血飞干预类风湿关节炎的潜在机制。关键靶点包括TLR4、CASP3、PTGS2和MMP-9,进一步实验验证有望为见血飞的临床应用提供理论支持。

关键词： 白藜芦醇   前列腺癌   网络药理学   分子对接   作用机制   肿瘤抑制因子p53   蛋白激酶B1  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探究白藜芦醇治疗前列腺癌的潜在作用机制。方法 通过TCMSP、HERB、Drugbank等9个药物靶点数据库检索并收集白藜芦醇的作用靶点;利用DisGeNET、GeneCards、OMIM等6个疾病靶点数据库获得前列腺癌的相应靶点;利用Venny 2.1.0平台获得药物和疾病的交集靶点,然后利用String数据库和Cytoscape 3.9.1软件的Centiscape 2.2插件进行拓扑分析,进一步筛选得到白藜芦醇抗前列腺的作用靶点;再次利用String数据库和Cytoscape3.9.1软件进行网络的拓扑分析,筛选出核心靶点并绘制蛋白相互作用(PPI)图;利用David数据库进行基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并使用Rstudio软件对其结果进行可视化;使用AutoDoc 1.5.7软件对白藜芦醇与核心靶点进行分子对接;利用UALCAN数据库验证核心靶基因在前列腺癌组织中的表达情况。结果 共收集到585个白藜芦醇作用靶点和5 331个前列腺癌相关靶点,其中交集靶点441个,进一步筛选后得到白藜芦醇抗前列腺的作用靶点67个,其中核心靶点有肿瘤抑制因子p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、雌激素受体1(ESR1)、转录因子Jun(JUN)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、连环蛋白β1(CTNNB1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1);KEGG富集分析主要得到糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、催乳素信号通路等;分子对接结果显示,白藜芦醇和核心靶点之间均具有良好的结合性;核心基因表达量验证结果表明,TP53和Akt1在前列腺癌组织中表达量较高,STAT3、ESR1、CTNNB1、MAPK1则表达量较低。结论 白藜芦醇可能通过TP53、Akt1、STAT3、ESR1、JUN等靶点调节AGE-RAGE、PI3K/Akt等信号通路发挥抗前列腺癌的作用。

关键词： 数据图表   复制粘贴   化学结构式   图数据   作图软件   典型病变   电泳图   双击  

摘要： 1.论文中的病理照片、电泳图及化学结构式图等要求以“插入”→“图片”方式插入word文档,不要使用复制粘贴。病理照片必须加标尺,并以箭头指示典型病变位置。除照片外,其他图尽量不用彩色。2.统计的数据图表(包括线图和柱图等)一般通过“插入”→“图表”方式插入word文档,双击该图即可直接进入此图的作图软件,看到作图数据。3.双栏图大小:宽与高的比为3∶2,宽≤7.5 cm;通栏图大小为:宽≤15 cm;横、纵坐标字体为Arial,字号为8或9磅。

关键词： 加味当归芍药散   网络药理学   子宫内膜异位症   痛经   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨加味当归芍药散治疗子宫内膜异位症(EMs)痛经的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、人类孟德尔遗传在线数据库(OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)、人类疾病相关基因与突变位点信息数据库(DisGeNET)、疗效靶点数据库(TTD)等数据库分析组方活性成分及潜在作用靶点,构建加味当归芍药散活性成分-EMs痛经靶点网络,并对核心靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,应用分子对接vina(Autodock vina)软件对组方潜在活性成分及核心靶点进行分子对接,并采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)及蛋白免疫印记法初步验证组方对EMs小鼠模型子宫内膜预测靶点mRNA及相关蛋白表达的影响。结果:组方筛选出活性成分86个,其治疗EMs痛经对应的交集靶点共64个,其中度值较高的靶点包括表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤抑制基因p53(TP53)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素6(IL-6)、基序趋化因子配体8(CXCL8)、基质金属蛋白酶9(MMP9)等。GO功能富集分析共得到1990个条目,KEGG通路分析涉及雌激素、黏着斑等127条通络。分子对接结果显示,组方核心成分槲皮素与VEGFA、AKT1、低氧诱导因子1A(HIF1A)等关键靶点具有良好的结合力。验证实验显示,加味当归芍药散可显著下调EMs小鼠模型VEGFA、CXCL8、TP53等mRNA及MMP9、环氧合酶-2(COX-2)蛋白表达水平。结论:加味当归芍药散的核心成分可调控EMs痛经的多个靶点,其作用机制可能和调控细胞侵袭、雌激素、免疫、炎症反应等信号通路相关。

关键词： 白芍   抽动症   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:查询筛选白芍治疗抽动症的靶点、通路,明确白芍治疗抽动症的机制。方法:通过使用国家中药系统药理学研究平台(TCMSP),将筛选的标准定义为生物利用度(OB) ≥ 30%,类药性(DL) ≥ 0.18,挑选白芍的主要活性成分和功能靶位,利用DrugBank数据库、OMIM数据库、GeneCards数据库、DisGeNET数据库的基因靶位,检索与抽动症相关的疾病靶位,通过UniProt数据库挑选出白芍的成分以及和疾病靶点有关的基因位点,再通过Cytoscape 3.9.1软件构建一个白白芍物–有效成分–常见靶点–疾病网络图,并利用蛋白质相互作用(PPI)网络挑选出白芍治疗抽动症的核心疾病靶点。再通过DAVID数据库进行基因本体论(GO)生物过程分析和京都基因与基因组百科(KEGG)通路富集分析,预测核心靶蛋白的作用机制,并绘制GO柱状图和KEGG气泡图对数据进行可视化。最后,利用OpenBabel-2.4.1、AutoDockTools-1.5.7和PyMOL软件,验证了白芍有效成分与白芍核心靶点在抑制抽动症中的分子对接。结果:得到了β-谷甾醇、山萘素、芍药苷元、芍药苷等13个活性成分和SLC6A4、IL6、TNF、CYP3A4等29个关键靶点;通过使用GO功能富集分析,共得到332个GO项目(P β-谷甾醇、山萘素、芍药苷元、芍药苷等活性成分作用于SLC6A4、IL6、CYP3A4、TNF、CHRNA7等靶点,调节胆碱能突触、GABA神经突触、钙信号通路、神经活性配体–受体相互作用、环腺苷酸信号途径等信号通路,发挥缓解痉挛、改善肌肉张力和身体微循环等作用,从而达到防治小儿抽动症的目的。

关键词： 新医科   药理学   跨校修读学分   教学模式  

摘要： 在医学发展新形势下,通过“新医科”建设培养具有交叉学科背景的复合人才已成为发展趋势。大连大学药理学课程从2018年开始,依托辽宁省高等教育智慧教育平台开展跨校修读学分试点工作。结合目前国内教育发展现状及大连大学医学院的专业特点和人才培养目标,大连大学药理学课程设计了一套以学生为中心、以专业能力培养为导向的临床医学与基础医学相结合的跨校修读学分教学模式。该模式对促进学生主动学习,合理利用网络资源,提高学生的终身学习能力方面起到了积极的推动作用。通过近五年的跨校修读学分工作,不仅实现了同一学科不同学校之间优质教学资源的共享,打破了高校间的壁垒,而且也满足了学生交叉学科学习的需求,为医学教育的改革做出了积极的探索。

关键词： 消渴清颗粒   糖尿病前期   网络药理学   分子对接   槲皮素   山柰酚   小檗碱  

摘要： 目的 利用网络药理学及分子对接探究消渴清颗粒治疗糖尿病前期的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库搜索有关于消渴清颗粒中中药的有效成分与靶点,在GeneCards数据库、OMIM数据库搜索糖尿病前期的基因靶点,进而获得药物–疾病交集靶点,将交集靶点导入String蛋白质相互作用数据库和Cytoscape构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,并筛选核心靶点,再将药物–疾病交集靶点导入DAVID数据库,对其分别进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,筛选出与疾病相关的通路,通过Cytoscape得出“通路–靶点”网络图,再通过插件分析得出“通路–靶点”网络核心靶点,取二者度值排名前7位的靶点交集作为消渴清颗粒治疗糖尿病前期的关键靶点,最后选择关键靶点与有效成分用AutoDock与Pymol软件进行分子对接及可视化。结果 筛选出消渴清颗粒中药活性成分36种,其中筛选出6种关键活性成分,分别为槲皮素、山柰酚、小檗碱、β-谷甾醇、花生四烯酸、知母皂苷C,靶点基因232个;筛选出糖尿病前期靶点685个,交集靶点93个,关键靶点5个,分别为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、环加氧酶2(PTGS2)。GO通路富集主要涉及内容有炎症、药物反应,细胞生长凋亡等;KEGG通路富集分析显示糖尿病并发症中的晚期搪基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、IL-17信号通路、胰岛素抵抗通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路等,分子对接结果显示关键靶点与有效成分具有较稳定的结合能力。结论 消渴清颗粒中各种药物成分通过多靶点、多通路协同治疗糖尿病前期的作用机制,为进一步研究治疗糖尿病提供了线索。