课程文献中心 更多>>

关键词： 芦荟大黄素   Ⅱ型糖尿病   网络药理学   分子对接  

摘要： 该文通过网络药理学结合分子对接的技术研究了芦荟大黄素改善Ⅱ型糖尿病的作用机制。利用数据库平台筛选出芦荟大黄素的潜在靶点和改善治疗Ⅱ型糖尿病的相关靶点,将二者取交集获得芦荟大黄素改善Ⅱ型糖尿病的潜在靶点;构建共同靶点间的蛋白互作网络,并对共同靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;通过筛选主要通路并构建“芦荟大黄素-Ⅱ型糖尿病-通路”网络图,对芦荟大黄素与通路及各通路所富集的靶点间的联系进行可视化分析,通过分子对接,研究芦荟大黄素与关键靶点的结合机制。结果表明,芦荟大黄素具有63个改善治疗Ⅱ型糖尿病的相关靶点,并根据蛋白互作网络筛选出AKT1、PIK3CA、HRAS和MAPK8等22个核心靶点,这些靶点主要富集在PI3K/AKT和胰岛素抵抗等信号通路,芦荟大黄素主要通过氢键、范德华力和π-π相互作用等分子间作用力与靶点结合,从而调控靶点的表达,改善Ⅱ型糖尿病。

关键词： 七味参地颗粒   慢性肾小球肾炎   网络药理学   铁死亡   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和在体实验从铁死亡途径探究七味参地颗粒治疗慢性肾小球肾炎(CGN)的有效性及作用机制。方法运用GeneCards、OMIM、DrugBank数据库筛选CGN相关疾病靶点,TCMSP、HERB、BATMAN-TCM数据库筛选七味参地颗粒有效成分和靶标,FerrDb数据库筛选铁死亡相关靶点,利用Cytoscape软件构建了活性成分-作用靶点和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,使用R语言进行GO富集和KEGG通路分析,采用AutoDockTools 1.5.7进行分子对接分析,采用Western blot技术检测CGN小鼠肾脏组织中PPARA、MAPK14、HRAS和PTGS2的表达。结果筛选出1896个CGN疾病靶点,564个铁死亡靶点,33种七味参地颗粒药物活性成分,对应405个靶标,三者交集靶点共17个。采用MCODE,Degree,MCC,DMNC,MNC,EPC,EcCentricity,Closeness,Radiality,BottleNeck 10种算法筛选出PPARA、MAPK14、HRAS及PTGS2这4个核心靶蛋白,分子对接结果显示七味参地颗粒药物活性成分与核心靶蛋白均有良好的结合能力,动物实验结果表明七味参地颗粒可逆转4个核心靶蛋白的表达。结论七味参地颗粒可能通过调控PPARA、MAPK14、HRAS及PTGS2从铁死亡途径发挥治疗CGN的作用。

关键词： 补肾活血方   多囊卵巢综合征   胰岛素抵抗   PI3K/Akt信号通路   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的基于网络药理学及动物实验探讨补肾活血方治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制。方法通过TCMSP、GeneCards、OMIM、CTD数据库获取疾病靶点,构建PPI网络、“药材-成分-靶点”网络,对关键靶点进行GO、KEGG分析,并对关键活性成分与靶点进行分子对接。通过动物实验验证补肾活血方对多囊卵巢综合征的作用靶点。结果网络药理学表明,补肾活血方的关键成分为槲皮素、山柰酚、谷甾醇、异补骨脂查耳酮、阿魏酸,治疗多囊卵巢综合征的关键靶点为EGFR、SRC、JUN,主要通过PI3K/Akt、MAPK、Rap1、Ras、Ca^(2+)等信号通路发挥作用。动物实验表明,与模型组比较,补肾活血方能降低胰岛素水平,增加各级卵泡数和黄体数,降低LH、T水平,升高E2、FSH水平,改善卵巢组织病理形态,颗粒细胞层数变多且规则排列,升高卵巢组织PI3K、p-Akt/Akt蛋白表达。结论补肾活血方具有多成分、多靶点、多途径特性,可能通过PI3K/Akt信号通路改善胰岛素抵抗治疗多囊卵巢综合征。

关键词： 西洋参-红花   早期糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   细胞实验   晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路   炎症介质  

摘要： 目的:通过网络药理学、分子对接技术及细胞实验探讨西洋参-红花有效成分治疗早期糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得西洋参-红花活性成分的干扰靶点,再与GeneCards、TTD等数据库中早期DN基因靶点相映射即为交集靶点。采用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,运用Cytoscape 3.8.2软件筛选出核心靶点;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,运用Cytoscape 3.8.2软件进行“有效成分-关键靶点-通路-疾病”网络图展示;通过Autodock Tools软件进行分子对接,采用MTT法检测有效成分对脂多糖(LPS)诱导的人肾小球系膜细胞(HMC)活性,利用酶联免疫吸附试验检测有效成分对炎症介质的影响。结果:得到西洋参-红花治疗早期DN的活性成分有24个,对应的药物靶点207个,其中72个和早期DN相关。网络拓扑参数分析得出了肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、IL-1β等15个关键靶点,KEGG通路分析筛选出晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体(RAGE)、TNF、低氧诱导因子-1(HIF-1)、IL-17、核因子κB等20个信号通路;分子对接表明IL-6与槲皮素、木犀草素、黄芩素、人参皂苷rh2稳定结合。细胞实验得出西洋参-红花活性成分槲皮素、木犀草素、黄芩素能显著抑制IL-6、TNF-α和IL-1β表达。结论:本研究初步证实西洋参-红花有效成分能有效抑制早期DN炎症,对肾脏具有保护作用,为后期深入研究提供了依据。

关键词： 疏风活络丸   网络药理学   类风湿性关节炎  

摘要： 目的:探索疏风活络丸治疗类风湿性关节炎的可能机制。方法:通过TCMSP及相关文献收集疏风活络丸中的化合物,建立化学成分数据库。使用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库检索其作用靶点,并与DisGeNET和GeneCards数据库中的类风湿性关节炎相关靶点进行对比。基于获得的交集靶点构建PPI网络并进行拓扑分析。进行GO和KEGG功能富集分析,并构建“化合物-靶点-通路”网络。小鼠40只,采用随机数字表法分为对照组、阳性对照组(地塞米松1.2896 mg·kg^(-1))、疏风活络丸低剂量组(422.5 mg·kg^(-1))及高剂量组(845 mg·kg^(-1))。连续灌胃给药4 d后,采用醋酸扭体法观察其镇痛作用。1周后,再次连续灌胃给药4 d,采用二甲苯致耳廓肿胀法观察其抗炎作用。测量耳片厚度和质量评价小鼠耳廓肿胀度。HE染色评估耳廓的病理组织学改变。ELISA试剂盒检测血清IL-1β、IL-6及TNF-α水平。免疫组化染色检测耳组织中IL-1β、IL-6及TNF-α的表达水平。免疫荧光染色检测耳组织中PI3K、AKT及MAPK的表达水平。结果:疏风活络丸中共检索出1352个化学组分,经筛选确定活性组分为184个。疏风活络丸入血成分的作用靶点为1514个,而类风湿性关节炎相关靶点为5211个,共有靶点为858个。PPI网络分析显示,核心靶点为291个,最为核心的包括TNF、CTNNB1、EGFR等。GO和KEGG分析显示,核心靶点主要涉及PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路。与对照组相比,疏风活络丸低、高剂量对乙酸诱导的内脏疼痛感受均具有显著的抑制作用(P<0.01)。疏风活络丸高剂量显著减轻耳廓肿胀小鼠的肿胀度(P<0.05)。耳廓肿胀小鼠耳组织真皮层增厚紊乱,中性粒细胞聚集,疏风活络丸高剂量减少小鼠右耳中性粒细胞数量,真皮层细胞排列较整齐。耳廓肿胀小鼠血清IL-1β、IL-6及TNF-α水平未发生变化(P>0.05),疏风活络丸低、高剂量未影响小鼠血清IL-1β、IL-6及TNF-α水平(P>0.05)。疏风活络丸低、高剂量显著降低小鼠耳组织中升高的IL-1β和IL-6的表达(P<0.05)。疏风活络丸显著降低小鼠耳组织中升高的PI3K、AKT及MAPK的表达(P<0.05)。结论:疏风活络丸可能通过影响PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路,实现对类风湿性关节炎的治疗作用。体现中药复方通过“多成分-多靶点-多途径”治疗疾病的特点。

关键词： 黄连   网络药理学   前列腺癌  

摘要： 目的通过网络药理学方法,探索黄连在前列腺癌治疗中的潜在价值。方法采用TCMSP数据库解析黄连的有效化学成分及其靶基因,GeneCards和OMIM数据库检索前列腺癌相关基因,交集上述基因集后,获得黄连治疗前列腺癌潜在基因。对潜在治疗基因进行功能富集分析以及蛋白质-蛋白质相互作用网络分析。结果获得黄连治疗前列腺癌潜在基因139个。功能富集分析提示,黄连主要通过白介素相关通路发挥作用。蛋白质-蛋白质相互作用网络提示,IL6、IL1B、JUN、CASP3、ESR1、PTGS2、HIF1A、MMP9、MYC、PPARG是黄连治疗前列腺癌机制中的重要环节。结论黄连具有治疗前列腺癌的潜在价值。

关键词： 佛手   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的 基于网络药理学、分子对接及体内实验验证探讨佛手治疗糖尿病肾病的作用机制。方法 通过检索公共数据库以确定佛手的生物活性化合物以及治疗糖尿病肾病的相关靶点和相关基因。利用PPI网络图,GO和KEGG富集分析来预测佛手治疗DN的核心靶点和信号途径,运用AutoDock软件对佛手关键成分和核心靶点进行对接验证。最后采用高糖高脂饮食联合链脲佐菌素诱导DN小鼠模型,评估佛手提取物在该模型中的药效作用及分子机制。结果 佛手中筛选出活性成分9个,匹配相关靶点信息200个,获得药物与疾病交集靶点104个,潜在的关键治疗靶点有AKT1、MAPK3、SRC和EGFR,主要参与癌症途径和PI3K-AKT-mTOR等信号通路。分子对接显示,活性成分与靶点间有较强的接合能力。动物试验证实,佛手可以通过降糖(FBG)、降脂(TC、TG)、调节自噬缺陷(24h UP、BUN、SCr),改善肾脏病理损伤,下调肾组织中p-PI3K、p-AKT和p-mTOR的表达,增加自噬相关蛋白的表达。结论 佛手可能通过抑制PI3K-AKT-mTOR信号通路的激活从而调节糖脂代谢紊乱和改善自噬缺陷,发挥防治糖尿病肾病的作用。

关键词： Astragalus   Salvia   Chronic nephritis   Drug pairs   Signaling pathway  

摘要： To elucidate the mechanism underlying the therapeutic impact of Astragalus-Danshen in chronic glomerulonephritis(CGN),a comprehensive exploration was conducted utilizing network *** TCMSP database was employed to aggregate the chemical constituents and targets associated with Astragalus and ***,disease targets specific to CGN were sourced from the Genecards *** convergence of these datasets yielded a set of intersection genes,representing potential targets for CGN treatment through Astragalus-Danshen ***,protein interaction networks and“chemical composition-target”networks were meticulously *** targets were subjected to GO and KEGG enrichment *** investigation revealed a total of 240 targets corresponding to 20 and 65 chemical components of Astragalus and Danshen,*** this pool,86 potential targets associated with CGN treatment were discerned,ultimately identifying 29 core *** among these were TNF,JUN,TP53,IL1B,RELA,MMP9,CASP3,IL10,MAPK14,MYC,and *** enrichment analysis illuminated pathways pertinent to CGN,encompassing the IL-17 signaling pathway,TNF signaling pathway,and the AGE-RAGE signaling pathway in diabetic *** summary,Astragalus-Danshen exhibited a potential anti-inflammatory and renoprotective effect on CGN,particularly through modulating the IL-17 signaling pathway,TNF signaling pathway,and AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications,involving key regulators such as TNF,JUN,TP53,IL1B,MAPK14,and others.

关键词： 成骨细胞   巴戟天丸   Aβ沉积   网络药理学  

摘要： 目的 探讨巴戟天丸组方对Aβ损伤成骨细胞的骨形成作用及其机制。方法 以新生24 h Wistar大鼠所分离的成骨细胞为研究对象,用Aβ1-42寡聚体对成骨细胞进行损伤,并用巴戟天丸组方水提物进行药物干预。分别采用MTT法、碱性磷酸酶(ALP)活性检测、过氧化氢酶(CAT)活性检测、超氧化物歧化酶(SOD)活性检测、谷胱甘肽(GSH)活性检测以及丙二醛(MDA)活性检测。采用蛋白质印迹法检测骨形成相关蛋白骨形态发生蛋白2(BMP2)、成骨特异性转录因子(RUNX-2)、骨保护蛋白(OPG)的表达水平;明确巴戟天丸组方对Aβ损伤成骨细胞的作用后,采用网络药理学方法对潜在的作用机制进行预测。结果 巴戟天丸组方可显著促进Aβ损伤成骨细胞的增殖,提高ALP、SOD、GSH活性,抑制MDA活性,并促进骨形成相关蛋白BMP2、RUNX-2、OPG的表达。网络药理学分析显示,巴戟天丸组方发挥改善Aβ损伤成骨细胞的作用主要与AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及神经活性配体与受体的相互作用通路等有关。结论 明确巴戟天丸组方具有改善Aβ损伤成骨细胞的作用,并通过网络药理学方法探究其相关作用通路,为传统方剂巴戟天丸抗骨质疏松的临床应用提供借鉴。

关键词： 类风湿关节炎   见血飞   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接方法研究苗药见血飞干预类风湿关节炎作用机制,为基础研究及临床研究提供依据。方法:文献检索筛选见血飞的活性成分,通过Swiss ADME网站预测药物靶点,利用Genecards数据库、DisGeNet数据库、DRUGBANK数据库、OMIM数据库、MalaCard数据库及TTD数据库筛选类风湿关节炎相关靶点;采用CytoScape 3.8.2软件构建蛋白互作网络及活性成分-关键靶点-通路;使用R语言进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;使用Molecular Operating Environment(MOE)进行分子对接。结果:预测TLR4、CASP3、PTGS2、MMP-9是见血飞干预类风湿关节炎的关键靶点;分子对接表明Decarine、飞龙掌血素、白屈菜红碱、二氢白屈菜红碱、珊瑚菜内酯、橙皮素、Oxychelerythrine和茵芋碱与TLR4、CASP3、PTGS2、MMP-9对接结合力平均值-5.92 kcal·mol^(-1)。结论:通过网络药理学和分子对接方法,初步揭示了见血飞干预类风湿关节炎的潜在机制。关键靶点包括TLR4、CASP3、PTGS2和MMP-9,进一步实验验证有望为见血飞的临床应用提供理论支持。