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关键词： 芦丁   网络药理学   亚急性瘤胃酸中毒   反刍动物  

摘要： 研究基于网络药理学、分子对接方法研究芦丁在缓解反刍动物亚急性瘤胃酸中毒(SARA)中的潜在作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等筛选芦丁与SARA的作用靶点。使用微生信平台对芦丁与SARA作用靶点取交集后并绘制交集靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络图,借助DAVID数据库对芦丁与SARA的交集作用靶点进行GO功能和KEGG富集分析。通过Autodock 1.5.7对芦丁与核心靶点进行分子对接。结果显示,芦丁有359个靶点基因,SARA有145个靶点基因,两者交集靶点基因有16个,PPI网络分析筛选出半胱天冬酶3 (CASP3)、白细胞介素-1β (IL-1β)、白细胞介素-6 (IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、前列腺素G/H合酶(PTGS2)及胰岛素(INS) 6个核心靶点。GO功能富集分析得到63个细胞组分条目,4个生物学过程条目,9个分子功能条目。KEGG通路富集分析得到白细胞介素-17 (IL-17)、核因子-κB (NF-κB)、TNF、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、Toll样受体信号通路等16条通路。分子对接结果显示,芦丁与6个核心靶点均具有较高的亲和力。研究表明,芦丁可通过作用于CASP3、IL-1β、IL-6、TNF、PTGS2和INS靶点基因,影响和调控IL-17、NF-κB、TNF、MAPK、Toll样受体等炎症通路,达到缓解SARA的效果。

关键词： 银丹心泰滴丸   心绞痛   网络药理学   分子对接   异银杏叶素   丹参酮I   绞股蓝素   龙脑  

摘要： 目的结合网络药理学和分子对接技术探究银丹心泰滴丸治疗心绞痛的活性成分和作用机制。方法运用TCMSP、ETCM、BATMA-TCM、HERB数据库收集银丹心泰滴丸中4味药材的成分和靶点,并从GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取心绞痛的靶点。通过Cytoscape软件构建银丹心泰滴丸治疗心绞痛的活性成分和交集靶点网络图;采用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络图;运用欧易云平台进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用分子对接技术验证银丹心泰滴丸治疗心绞痛的核心成分和靶点的结合强度。结果银丹心泰滴丸活性成分有33种,其中异银杏叶素、银杏新内酯、银杏内酯B、槲皮素、丹参酮I、隐丹参酮、绞股蓝皂苷XXVIII、绞股蓝素和(−)-龙脑等为其治疗心绞痛的核心成分;银丹心泰滴丸治疗心绞痛的交集靶点有53个,主要有免疫炎症因子白细胞介素(IL)-1B、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF)、IL-8和细胞间黏附分子1(ICAM1),血管新生因子血管内皮生长因子(VEGF)、人纤溶酶原激活物抑制剂1(SERPINE1)、内皮素1(EDN1)、内皮型一氧化氮合酶(NOS)2和NOS3;银丹心泰滴丸治疗心绞痛参与IL-17、TNF、核因子-κB(NF-κB)和缺氧诱导因子-1(HIF-1)等信号通路。分子对接证实银丹心泰滴丸的核心活性成分与心绞痛靶点的结合力较强。结论挖掘了银丹心泰滴丸治疗心绞痛的活性成分、治疗靶点和调控机制,为后期银丹心泰滴丸的机制探索和个性化治疗提供参考。

关键词： 结直肠癌前病变   黄芪   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪经铁死亡途径治疗结直肠癌前病变的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄芪的主要活性成分及靶点;通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、疗效药靶数据库(TTD)、GeneCards和DrugBank数据库获取结直肠癌前病变、铁死亡的主要作用靶点;通过微生信网站得到黄芪与铁死亡、结直肠癌、结直肠癌前病变的共同靶点;用Metascape平台分析药物-成分-靶点及交集靶点参与的生物过程(BP),运用Cytoscape3.8.0软件构建活性成分-靶点-通路网络图,并使用AutoDock对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证。结果从黄芪中筛选得到13种主要活性成分,并得到黄芪与铁死亡、结直肠癌、结直肠癌前病变的共同靶点33个,与结直肠癌前病变有关的核心活性成分为槲皮素、山奈酚、芒柄花黄素、异鼠李素、7-O-甲基异木糖醇等,关键靶点为肿瘤蛋白53(TP53)、米克基因(MYC)、原癌基因(JUN)、磷酸酶张力蛋白同源物(PTEN)、低氧诱导因子-1α(HIF-1α)等;分子对接结果显示,筛选的主要活性成分与对应靶点具有良好的结合活性。结论黄芪可能通过槲皮素、山奈酚、芒柄花黄素、异鼠李素、7-O-甲基异木糖醇等主要活性成分作用于TP53、MYC、JUN、PTEN、HIF-1α等相关靶点,通过调控炎症、细胞凋亡、自噬等,经铁死亡途径发挥治疗结直肠癌前病变的作用。

关键词： 柴胡   乳腺癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学探讨柴胡治疗乳腺癌的作用机制。方法:采用TCMSP数据库获取柴胡的化学成分,使用Pubchem数据库获得成分的SMILES信息,将成分SMILES信息输入SwissTargetPrediction数据库获得成分靶点;使用Genecards、OMIM等数据库获得乳腺癌疾病靶点,绘制Venn图获得柴胡成分靶点与乳腺癌靶点的交集靶点;采用String网站构建蛋白互作网络(PPI)图,得到的结果用Cytoscape软件处理,筛选靶点degree值;使用DAVID数据库进行GO和KEGG通路分析;使用Autodock软件进行分子对接,验证网络药理学结果。结果:柴胡中14个活性成分,调控乳腺癌的381个靶点,前4关键活性成分为槲皮素、矮千牛素、山奈酚、异鼠李素,前5核心靶点为SRC、HSP90AA1、EGFR、AKT1和TNF,作用机制涉及neuroactive ligand-receptor interaction,cancer pathway,cAMP signaling pathway,PI3K-Akt signaling pathway,prolactin signaling pathway等。分子对接结果发现4种成分与5个核心靶点具有较好的亲和作用。结论:柴胡治疗乳腺癌具有多通路、多靶点的特点,黄酮类成分可能是其发挥作用的核心成分。

关键词： 慢性萎缩性胃炎   苗药   金荞麦   网络药理学   分子对接   “炎—癌”转化  

摘要： 目的通过网络药理学联合分子对接技术探讨金荞麦主要活性成分治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法利用TCMSP数据库获取金荞麦的有效成分和靶点,以“Chronic Atrophic Gastritis”为关键词检索OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库以获取CAG疾病靶点,将金荞麦有效成分靶点与CAG疾病靶点导入R 4.2.0软件制作韦恩图,得到金荞麦-CAG交集靶点。将金荞麦-CAG交集基因输入STRING 11.0数据库进行PPI分析,基于“连接度”“亲和中心性”“间性中心性”参数对PPI网络进行拓扑分析,根据网络拓扑学参数判断CAG核心靶点。将“金荞麦-CAG共同靶点”导入R 4.2.0软件,使用ClsuterProfiler程序包进行GO生物功能富集分析和KEGG通路富集分析。将金荞麦有效成分、关键靶点和KEGG信号通路导入Cytoscape 3.8.2软件,绘制“有效成分—关键靶点—通路”网络图。将金荞麦有效成分与筛选出的CAG疾病核心靶点进行分子对接验证。结果获得金荞麦-CAG交集靶点68个。使用Cytoscape 3.8.2软件中“Analysis Network”工具得出连接度、亲和中心性、间性中心性排前5的核心靶点分别为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、抑癌基因p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)。GO生物功能富集分析结果显示,生物学过程主要涉及外源性凋亡信号通路、氧化应激反应、脂多糖反应、细菌来源分子反应、细胞对化学应激的反应等;细胞组分主要涉及囊泡腔、分泌颗粒腔、细胞质囊泡腔、膜筏等;分子功能主要涉及细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、信号受体激活活性、激酶调节活性等。KEGG通路富集分析共得到138条与CAG相关通路,将主要涉及PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、人类巨细胞病毒感染、流体剪切力与动脉粥样硬化、TNF信号通路、白介素-17信号通路等。“有效成分—关键靶点—通路”网络图结果显示,金荞麦的13个药物成分可调控多个关键靶蛋白,作用于多条通路而发挥治疗CAG的作用。结论通过网络药理学和分子对接表明苗药金荞麦的活性化合物与CAG疾病靶点间存在密切的联系,且具有良好的结合活性,金荞麦治疗CAG具有多成分、多靶点效应,可能通过AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA等靶点调控炎性反应、血管新生、细胞增殖等而抑制“炎—癌”转化机制,这为苗药金荞麦治疗CAG提供了新思路。

关键词： 药理学   育人资源   课程思政   混合式教学  

摘要： 线上线下混合式教学模式为课程思政育人提供了双渠道,除了在课堂开展思政教学外,推动专业课程线上教学育人资源建设和有效实施意义重大。齐齐哈尔医学院药理学课程线上教学育人资源基本建成,但缺乏思政元素的融入,线上育人渠道未充分利用。本研究利用“四载体-四映射”模式,以教学视频、临床案例、科研论文、测试习题为载体,通过开展线上线下混合式教学,映射家国情怀、社会责任、科研精神、辩证思维,以实现线上线下协同育人。

关键词： 桂皮醛   宫颈癌   凋亡   RPS16  

摘要： 目的探究桂皮醛(CA)抗宫颈癌(CVC)的潜在靶点,并对相关通路及靶点进行验证。方法采用Swiss Target Prediction数据库预测CA的作用靶点,利用STRING数据库对筛选后的50个预测靶点进行富集分析;通过Auto Dock Tools软件进行分子对接;通过生物信息学数据分析RPS16蛋白临床预后信息;采用CCK-8法检测CA对Hela细胞的抑制作用;采用Hoechst 33342荧光染色法测定细胞凋亡情况;采用蛋白质印迹(WB)法测定CA对磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(PI3K/Akt)信号通路以及RPS16的蛋白表达的影响。结果筛选得到50个CA的潜在靶点,主要聚集于PI3K/Akt通路,WB实验结果证实CA抑制了Akt、PI3K和Stat3的磷酸化。此外,CA能与RPS16结合并抑制其表达。结论RPS16可能是CA抗CVC的潜在靶点。

关键词： 葛根素   炎症   网络药理学   分子对接  

摘要： 基于网络药理学和分子对接验证方法探讨葛根素抗炎的作用机制.通过Swiss target prediction数据库收集葛根素靶点102个,通过GeneCards、OMIM和NCBI数据库收集炎症相关靶点15 602个.利用STRING 12.0数据平台获得葛根素和炎症交集靶点的PPI数据,将结果导入Cytoscape3.9.1软件,拓扑分析得到核心靶点17个,对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析发现,核心靶点涉及177个基因功能条目和93条通路(P<0.05).建立“葛根素-核心靶点-通路”网络图并进行拓扑分析,共筛选出AKT1、TP53、BCL2、EGFR、PRKCA、MMP9、PRKACA和TNF共8个关键靶点.分子对接验证结果显示,葛根素与关键靶点结合良好,构象稳定.研究发现葛根素抗炎具有多靶点、多通路的作用特点;葛根素可能通过调节AKT1、TP53、BCL2和EGFR等靶点来实现抗炎作用,为后续葛根素抗炎相关机制的研究提供思路和依据.

关键词： 美洲大蠊CII-3   结直肠癌   网络药理学   分子对接   甘油醛-3-磷酸脱氢酶   蛋白激酶B1   表皮生长因子受体  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨美洲大蠊CII-3治疗结直肠癌的作用机制。方法通过查阅文献归纳总结筛选美洲大蠊CII-3的有效活性成分;利用PubChem数据库、SwissADME、SwissTargetPrediction平台进行作用靶点的预测;通过DisGeNet、GeneCards、TTD、OMIM数据库检索、归纳、筛选结直肠癌相关靶点;通过Venny 2.1.0对美洲大蠊CII-3活性成分作用靶点与结直肠癌相关靶点取交集,共同靶点即为CII-3抗结直肠癌的潜在作用靶点。将潜在靶点导入STRING数据库,构建蛋白互作(PPI)网络。通过PPI网络和Cytoscape 3.10.1软件及centiscape 2.2插件,筛选出美洲大蠊CII-3治疗结直肠癌的关键活性成分及核心靶点,构建“药物-成分-靶点基因”和“疾病-通路-靶点-成分-药物”网络。利用DAVID数据库对CII-3和结直肠癌潜在的作用靶点进行基因本体论(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用AutoDockTools 1.5.7软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果筛选汇总了24种美洲大蠊CII-3的有效成分,通过网络药理学验证环(脯氨酸-亮氨酸)、环(亮氨酸-丙氨酸)等为主要活性成分,通过Venny 2.1.0平台取交集,得到150个潜在的作用靶点。甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、蛋白激酶B1(Akt1)和表皮生长因子受体(EGFR)等为主要的核心靶点。KEGG通路富集分析显示主要涉及癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路等;分子对接显示,美洲大蠊CII-3的主要活性成分与预测的核心靶点对接结果均小于0 kJ/mol,结果显示较好的结合活性。结论美洲大蠊CII-3可能通过多成分、多靶点、多通路协同作用治疗结直肠癌,为揭示CII-3治疗结直肠癌的分子机制提供了理论基础。

关键词： 系统药理学   产教融合   药品生产  

摘要： “系统药理学”是药学专业研究生的核心课程,连接着药学与医学的桥梁,在高校药学研究生培养过程中发挥着十分重要的作用。“系统药理学”着重阐明药物的基本理论知识,但理论知识最终都要应用于实践,由于缺乏药物的产业化意识,理论与实践融合程度浅,导致药学人才培养难以满足企业创新发展的需求。本文以药品生产为例,围绕其研究过程、药理作用以及临床应用等内容,提高药学专业研究生的创造性思维、实践能力和综合素质,使教书与育才并举。对接医药行业需求,采用产教融合的方式,将经过“系统药理学”课程教学中得到的信息反馈到产业实践中,以满足理论与实践相结合的需求,有力地推动药物的研发,助力企业技术升级,加快科研成果由理论向现实转化。