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关键词： 新型冠状病毒感染   宣肺润燥解毒方   网络药理学   分子对接   机制  

摘要： 目的运用网络药理学及分子对接方法初步预测宣肺润燥解毒方对新型冠状病毒感染潜在机制。方法利用中医百科全书(ETCM)及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集宣肺润燥解毒方潜在活性成分及靶点,GeneCards数据库收集新型冠状病毒感染疾病靶点,Venny2.1.0取两者交集靶点及绘制Venn图,以Cytoscape3.9.1软件构建中药复方活性成分-靶点可视化网络;交集靶点导入String数据库进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,并基于Cytoscape3.9.1绘制PPI网络图、度值(degree)参数大小TOP5核心靶点预测互作网络图,同时DAVID数据库对交集靶点进行KEGG和GO基因集合富集分析后借助Bioinformatics微生信作图平台绘制可视化;将度值排名前5的主要活性成分与网络拓扑分析后得到的排名前5的核心靶点进行分子对接,AutoDock4.2.6软件预测其分子结合自由能及Pymol2.4.1软件作分子对接可视化图。结果宣肺润燥解毒方治疗新型冠状病毒感染主要活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素等;重要靶点包括AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53等;GO富集得到生物过程、分子功能和细胞组分依次为329条、59条、46条,KEGG通路富集得出149条信号通路(P<0.05)。槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素分别与AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53、ACE2、3CLpro对接结合能均<-5.00 kcal/mol。结论宣肺润燥解毒方治疗新型冠状病毒感染可能是通过主要活性成分槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素等有效成分作用于AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53等核心靶点调控AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路等发挥作用,从而发挥抗病毒,调节机体免疫,减少炎症反应对组织的损伤等功效以治疗新型冠状病毒感染。

关键词： 混合式教学模式   中职卫生类学校   药理学   胆碱受体阻断药  

摘要： 混合式教学模式通过结合传统面对面教学和在线学习的优势,为学生提供了多样化的学习资源和学习方式。本文旨在以胆碱受体阻断药章节为例探讨混合式教学模式在中职卫生类学校“药理学”课程中的应用研究实践。在介绍混合式教学模式、胆碱受体阻断药的药理学相关知识的基础上,通过在线学习资源、面对面教学、实验实践和网络互动等多种教学手段的结合,发现混合式教学模式能够显著提高学生的学习效果和实践能力,学生能够更全面地掌握胆碱受体阻断药的知识,提高临床应用的能力。本文同时对混合式教学模式的优势与挑战进行了总结,相关结论可为中职卫生类学校的“药理学”课程的教学改革提供有益的思路和经验。

关键词： 病炎清   流感   网络药理学   氧化应激   Nrf2途径   小鼠  

摘要： 目的明确病炎清的抗流感病毒活性,基于网络药理学和实验验证探究病炎清治疗流感的潜在机制。方法检测病炎清对流感模型小鼠死亡率、肺指数、肺病毒量的影响。检索TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库及文献,收集病炎清处方成分及靶点;通过Cytoscape软件构建病炎清抗流感“成分-共有靶点”网络;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,筛选核心靶点;对共有靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。在体内水平探究病炎清减轻流感所致氧化损伤的作用,以及对抗氧化和促氧化酶表达、P65蛋白磷酸化、核因子E2相关因子2(Nuclear Factor Erythroid-Derived 2-Related Factor 2,Nrf2)核易位的影响。结果病炎清可明显降低流感模型小鼠死亡率,降低肺指数和肺病毒量,减轻肺损伤。检索得到病炎清193个活性成分,对应338个靶点,其中与流感相关的靶点180个,IκBα激酶α(CHUK)、IκBα激酶γ(IKBKG)、NF-κB p65(RELA)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素6(IL6)等9个靶点为潜在核心靶点。GO分析提示病炎清具有抗菌、抗氧化应激等多种生物功能。KEGG分析表明病炎清涉及多条病毒及免疫通路,如疱疹病毒、甲型流感病毒、肿瘤坏死因子和Toll样受体途径。动物实验表明,相较于磷酸奥司他韦,病炎清高剂量组可更明显地降低流感模型小鼠肺丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量(P<0.01)、提升肺总超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)活性(P<0.001)。相较于磷酸奥司他韦,病炎清&磷酸奥司他韦联合给药组肺部具有更低的NADPH氧化酶2(NADPH Oxidase Type 2,NOX2)、4(NOX4)水平(P<0.001)和更高的过氧化氢酶(Catalase,CAT)、谷胱甘肽过氧化物酶4(Glutathione Peroxidase 4,GPX4)水平(P<0.001)。另外,联合给药组显示出更强的Nrf2核易位(P<0.05)。但联合给药组P65蛋白磷酸化水平与磷酸奥司他韦组比较,差异无统计学意义(P>0.05),但均低于模型组(P<0.05)。结论病炎清具有明显的抗流感病毒活性,可发挥抑制促氧化酶合成和促进抗氧化系统的双重作用,减轻流感引发的氧化应激损伤。

关键词： 网络药理学   益气化痰活血方   冠心病   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学研究方法探讨益气化痰活血方治疗冠心病的作用机制。方法在中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选益气化痰活血方的成分和靶点;并通过相关数据库检索冠心病相关靶点;通过韦恩图得到益气化痰活血方和冠心病的共同靶点,然后利用STRING网站进行化合物-疾病共同靶点蛋白互作分析;利用David数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,采用Cytoscape3.82软件构建药物-成分-作用靶点-通路-疾病的网络模型。结果通过筛选得到益气化痰活血方的潜在主要活性成分154个,涉及71个疾病作用靶点,主要活性化合物为柚皮素、槲皮素、川陈皮素、山奈酚等,调节机制与脂质和动脉粥样硬化、白细胞介素17(IL-17)信号通路、细胞凋亡、流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路有关,从而发挥治疗冠心病的作用。结论益气化痰活血方治疗冠心病是多成分、多靶点、多途径相互作用的结果,为益气化痰活血方的基础或临床研究提供一定的理论依据。

关键词： 苍附导痰汤   多囊卵巢综合征   代谢组学   网络药理学   类固醇激素   生物合成  

摘要： 目的基于超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱串联质谱(UHPLC-QE-MS)分析苍附导痰汤对多囊卵巢综合征大鼠血清中内源性标志物的影响,并结合网络药理学研究其发挥药效的作用通路。方法将40只大鼠随机分为正常组、模型组、达英-35组和苍附导痰组,每组10只。采用来曲唑法诱导多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型,造模成功后,达英-35组给予达英-35灌胃,苍附导痰组给予苍附导痰汤灌胃,每天1次,连续28 d。ELISA法检测大鼠血清促卵泡生长激素(FSH)、促黄体生成素(LH)、睾酮(T)、雌二醇(E2)含量差异水平;苏木精-伊红(HE)染色法观察大鼠卵巢组织病理形态学变化;采用UHPLC-QE-MS分析各组大鼠血清样品,基于主成分分析法(PCA)及正交偏最小二乘判别分析法(OPLS-DA)筛选出相关差异代谢物,并依据MetaboAnalyst数据库查询相关代谢通路。采用网络药理学探究苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的关键靶点,使用KEGG数据库富集分析作用通路,并借助MetScape插件构建“代谢物-反应-酶-基因”网络。结果与正常组相比,模型组大鼠血清中FSH含量明显上升(P<0.05),LH、T、E2含量显著上升(P<0.01);与模型组相比,达英-35组大鼠血清中LH、T、E2含量显著降低(P<0.01),苍附导痰组大鼠血清中T明显降低(P<0.05),LH、E2含量显著降低(P<0.01)。与模型组比较,达英-35组和苍附导痰组大鼠卵巢组织形态明显改善;代谢组学筛选15个苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的差异代谢物,涉及类固醇激素生物合成、甘油磷脂代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等途径。网络药理学分析显示苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的核心靶点为AKT1、ESR1、EGFR等,KEGG富集显示涉及内分泌抵抗、类固醇合成、雌激素信号通路等;采用MetScape插件构建“代谢物-反应-酶-基因”网络,发现6个关键靶点CYP1B1、CYP19A1、AKR1C1、AKR1C3、HSD17B1、HSD17B2,以及涉及类固醇激素生物合成通路。结论苍附导痰汤对多囊卵巢综合征大鼠显示出潜在的治疗作用,这可能与其对类固醇激素合成代谢路径的调节作用有关,治疗的内源性标志物包括17a-羟基孕烯醇酮、孕酮、皮质酮,这些指标有助于监测治疗效果。

关键词： 温胆汤   心力衰竭   抑郁   网络药理学   分子对接   富集分析   信号通路   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨温胆汤对心力衰竭合并抑郁共病同治机制,并通过分子对接初步验证。方法通过TCMSP数据库与文献搜索得到温胆汤有效成分并预测作用靶点;在GeneCards、OMIM、DisGeNET以及TTD数据库搜索心力衰竭、抑郁症相关疾病靶点,与温胆汤作用靶点取交集。通过STRING平台完成交集靶点的蛋白质相互作用网络的构建并预测核心靶点,并对交集靶点进行基因本体注释及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最后利用分子对接验证核心成分及核心靶点的结合能力。结果温胆汤治疗心力衰竭合并抑郁的核心成分为木犀草素、川陈皮素、β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇等,核心靶点主要包括肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、蛋白激酶B1、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53等,通过KEGG主要富集在晚期糖基化终产物及其受体、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、环磷酸腺苷、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路。分子对接结果表明,木犀草素等核心成分与肿瘤坏死因子、白细胞介素-6等核心靶点的结合活性较好。结论温胆汤可能通过抑制炎症反应及氧化应激反应、调节神经递质的释放等方面来治疗心力衰竭合并抑郁。

关键词： 芪归抵挡汤   糖尿病肾病   代谢记忆   网络药理学   基因表达综合数据库数据芯片  

摘要： 目的:基于基因芯片数据挖掘和网络药理学研究芪归抵挡汤治疗糖尿病肾病(DKD)分子机制。方法:利用相关数据平台,挖掘芪归抵挡汤治疗DKD的活性成分和作用靶点,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。最终,通过体内实验验证芪归抵挡汤调控糖尿病肾病的作用机制。结果:芪归抵挡汤共获得349个潜在靶点,GEO数据库分析获得具有显著性差异基因有841个,将二者取交集共获得45个交集靶点,经复合网络筛选出槲皮素、山柰酚、芦荟大黄素、常春藤皂苷元和β-谷甾醇等重要成分;CASP3、EGF、CXCL8、CCL2及ICAM1等治疗DKD的重要核心靶点。GO功能富集显示,药物反应、炎症反应和对缺氧的反应等在生物过程中富集度较高,质膜、细胞溶质和细胞外空间等在细胞组分中富集度高,蛋白质结合、受体结合和整合素结合等在分子功能中富集度较高;KEGG分析表明该方药效基础主要与AGE-RAGE、甲型流感、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、EB病毒感染和NF-κB等信号通路有关。体内研究发现,与正常对照组比较,模型对照组小鼠FBG含量明显升高,血清Scr、BUN含量明显增加,肾组织中AGE、RAGE、Caspase-3蛋白表达上调(P<0.01);与模型对照组比较,芪归抵挡汤3.34 g/kg组可有效改善db/db小鼠血糖和肾功能(P<0.01),显著减轻肾脏病理损伤,下调AGEs-RAGE信号通路相关的AGE、RAGE、Caspase-3蛋白的表达(P<0.01);与白藜芦醇组比较,芪归抵挡汤3.34 g/kg组小鼠治疗6 w、12 w FBG含量,Scr含量明显降低,肾组织AGE、RAGE、Caspase-3蛋白表达明显下调(P<0.05或P<0.01)。结论:芪归抵挡汤可有效降低糖尿病肾病小鼠的血糖水平、改善肾脏功能及病理损伤,并可调控AGEs-RAGE信号通路,具有清除糖尿病肾病“代谢记忆”潜能。

关键词： 黑桑   阿尔兹海默病   HPLC   指纹图谱   网络药理学  

摘要： 利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)和理想解相似性排序法(technique for order preference by similarity to ideal solution,TOPSIS)对12批黑桑样品进行评价;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得黑桑的活性成分与靶点信息。使用Gene Cards数据库和AD专属数据库(Chemogenomics Database For Alzheimer’s Disease)获得AD的疾病靶点信息,得到黑桑治疗AD的潜在作用靶点。通过String(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,String)和Cytoscape3.7.2构建PPI网络图并进行拓扑分析。利用R软件对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。通过Auto Dock软件进行模拟分子对接。黑桑HPLC指纹图谱的相似度均>0.96,并指认出3个色谱峰,通过聚类分析将12批样品聚为3类,主成分分析结果与聚类分析结果一致。网络药理学筛选后最终得到12个核心靶点,并对核心靶点进行富集分析得到1480个GO条目和104个KEGG通路。黑桑可能通过核心靶点调节PI3K-Akt信号通路、中性粒细胞外陷等信号通路,进而调控炎症等反应,多靶点-多通路-多途径达到治疗和预防AD的效果。

关键词： 肺纤维化   桃红化瘀方   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学方法探讨桃红化瘀方治疗肺纤维化的作用机制。方法应用TCMSP检索桃红化瘀方的活性成分、作用靶点,运用DisGeNET等数据库获得肺纤维化疾病靶点,对药物基因和疾病基因取交集得到共同靶点基因。导入String数据库得到蛋白相互作用关系。使用DAVID 6.8行GO功能富集分析,并行KEGG通路富集分析。对主要成分与靶点作分子对接验证。结果共获得39个有效活性成分,108个作用靶点,GO基因富集561条目,KEGG富集共170条,包含PI3K-Akt、MAPK、IL-17、TNF信号通路。有效成分和靶蛋白间的亲和力均<0 kcal/mol。结论桃红化瘀方通过槲皮素等有效成分,通过PI3K-Akt等信号通路,调控AKT1等核心蛋白,从而发挥抗炎、信号转导、抗凋亡、抑制成纤维细胞增殖等作用。

关键词： LHQWXYS   COVID-19 olfactory impairment-associate   Network pharmacology   Molecular docking  

摘要： To explore the target of action of LHQW-XYS on the main components of COVID-19 olfactory impairment by using network pharmacological methods and try to reveal its mechanism of action in the treatment related to COVID-19 induced olfactory impairment,we used the TCMSP platform to obtain potential active ingredients through oral utilization and drug-like properties screening;the Swiss TargetPrediction platform to predict the targets of the active ingredients and construct a drug-ingredient-target network,and then obtained the gene targets of COVID-19 olfactory injury through GeneCards,OMIM,and TTD platforms to intersect the drug targets and disease genes to obtain common *** drug targets and disease genes were intersected to obtain common *** and Cytoscape 3.8.2 software were used to construct the target-disease gene PPI network,screen the key targets and core gene clusters,and analyze the key targets by GO and KEGG enrichment analyses with the help of the Metascape platform,and then map the screened core active ingredients and their targets into the pathway to construct the core active ingredients-targets-pathway *** core active ingredient-target-pathway network was constructed,and finally,molecular docking was carried *** results showed that there were 4669 potential targets,5609 disease targets,and 17 drug-disease cross-targets for the active ingredients of *** GO and KEGG enrichment analyses indicated that the mechanism of LHQW-XYS in the treatment of olfactory impairment in COVID-19 may be due to the regulation of related signaling pathways,such as Serotonergic synapse and Regulation of lipolysis in *** docking showed that six active components(quercetin,luteolin,kaempferol,7-methoxy-2-methylisoflavone,wogonin,medicarpin)and two key genes(PTGS2,PPARG)had good binding *** the end,we conclude that LHQW-XYS may act on Serotonergic synapse and Regulation of lipolysis in adipocyte pathways to achieve an