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关键词： 党参   阿尔兹海默症   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的基于网络药理学与分子对接技术,探究党参治疗阿尔兹海默症的分子机制。方法在TCMSP、TCM-ID、BATMAN中药成分数据库获得党参主要药用成分。通过PharmMapper、Super-PRED、Swiss Target Prediction和ETCM平台获得党参成分靶点。运用GeneCards、OMIM、PharmGKB、DisGeNET疾病数据库获得阿尔兹海默症相关靶点。通过EVenn取交集获得党参与阿尔兹海默症的共同靶点,并使用Cytoscape3.8.1构建“党参-成分-靶点-阿尔兹海默症”网络图。利用STRIING数据库开展靶点的PPI分析,使用Cytoscape 3.8.1可视化并筛选核心靶点。使用David数据库开展GO基因功能和KEGG信号通路富集分析。使用PyMoL 2.6.0、AutoDockTool 1.5.7和OpenBabel 2.4.1软件对核心靶点与活性成分开展分子对接。结果党参中的主要药用分子为川芎哚(Perlolyrine)、豆甾醇(Stigmasterol)和蒲公英赛醇(Taraxerol)。党参与阿尔兹海默症的交集靶点有88个,其中核心靶点5个,为EGFR、SRC、PAK2、IGF1R、PTPN11。GO基因功能分析发现,核心靶点参于生物过程(BP)42条,细胞组分(CC)12条,分子功能(MF)20条。KEGG信号通路富集分析发现,交集靶点参与细胞中149条信号通路。分子对接发现,SRC-蒲公英赛醇、JAK2-川芎哚、SRC-川芎哚、IGFR-川芎哚和IGFR-豆甾醇结合紧密,结合能较低。结论党参含有的川芎哚、豆甾醇和蒲公英赛醇等药用成分,通过多靶点、多途径等方式治疗阿尔兹海默症。

关键词： 过氧麦角甾醇   乳腺癌   MCF-7细胞   网络药理学   细胞凋亡   线粒体膜电位   活性氧  

摘要： 基于网络药理学方法探究过氧麦角甾醇(EP)抗乳腺癌的靶点及作用机制,并通过体外实验验证。采用网络药理学对EP作用靶点进行筛选,构建靶点网络及蛋白-蛋白互作(PPI)网络,对EP抗乳腺癌潜在的作用靶点及相关通路进行预测。采用MTT法检测EP对乳腺癌MCF-7细胞的增殖抑制活性,克隆形成实验检测EP对MCF-7细胞增殖影响;采用流式细胞术和激光共聚焦显微镜检测细胞的凋亡情况、线粒体膜电位及活性氧水平的变化情况;通过Western blot法检测EP对B细胞淋巴瘤(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、细胞色素C(Cyt C)、半胱氨酸蛋白酶蛋白(caspase)-7、活化的caspase-7(cleaved caspase-7)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、丝氨酸-苏氨酸激酶B(AKT)蛋白表达水平的影响情况。结果显示,经网络药理学预测,得出EP与乳腺癌有173个共同靶点;KEGG富集分析结果显示EP治疗乳腺癌结果主要在癌症通路、PI3K-AKT信号通路、细胞衰老信号通路、病毒致癌作用等信号通路;MTT结果显示,与对照组相比,EP组MCF-7细胞的活性明显降低,呈时间-浓度依赖趋势;EP能够抑制乳腺癌细胞MCF-7集落形成;采用10、20、40μmol·L^(-1)的EP作用MCF-7细胞24 h后,MCF-7细胞总凋亡率均显著升高,线粒体膜电位均显著降低,活性氧水平均显著升高;此外,MCF-7细胞经过EP处理后,细胞内Cyt C、Bax、cleaved caspase-7蛋白的表达水平上升,p-PI3K、p-AKT、Bcl-2蛋白的表达水平下降。研究表明,EP可抑制乳腺癌MCF-7细胞增殖,减少集落形成,其机制可能与PI3K-AKT通路介导线粒体凋亡途径有关。

关键词： 蛇莓   UPLC-Q-TOF-MS   血清药物化学   药效物质基础   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于血清药物化学研究方法结合网络药理学与分子对接研究蛇莓发挥抗炎作用的药效物质基础和作用机制。方法:大鼠灌胃给予蛇莓水提液,眼眶取血并分离血清。采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术,结合Agilent Masshunter Qualitative Analysis数据处理系统,通过对比蛇莓水提液、空白血清和含药血清,结合对照品、二级谱图和已有文献,对蛇莓入血成分进行鉴定。利用SwissTargetPrediction数据库获取入血成分靶点,Genecards、Drugbank数据库获得疾病靶点。利用Jvenn网站取成分靶点和疾病靶点的交集,通过String数据库绘制蛋白相互作用关系(protein-protein interaction,PPI)网络图,利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。使用Autodock软件对入血成分与核心靶点进行分子对接,使用Pymol软件对分子对接的结果进行可视化处理。结果:根据质谱分子量、碎片裂解规律并结合对照品、文献及数据库等相关信息,从大鼠含药血清当中鉴定出27个原型入血成分,包括黄酮类9个,有机酸类8个,苯丙素4个,香豆素3个,三萜类2个,醛类1个。化合物和疾病共有靶点356个,通过PPI网络筛选出SRC、EGFR、AKT1、TNF等11个核心靶点。KEGG分析结果显示蛇莓主要通过调控EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性通路、TNF信号通路、ErbB信号通路、HIF-1信号通路等发挥作用。对关键成分与核心靶点进行分子对接,结果显示蛇莓关键成分与核心靶点的结合能力良好。结论:所建立的方法能高效、灵敏地分析蛇莓的入血成分。蛇莓中的金丝桃苷、紫云英苷、木犀草素等黄酮类物质和鞣花酸等酚酸类物质可能是其发挥抗炎作用的药效物质,并通过EGFR、HIF-1、TNF等通路调节炎症反应从而发挥药理作用。该研究阐明了蛇莓的药效物质基础,为继续研究与开发蛇莓提供参考。

关键词： 中国药理学会   药效动力学   药物治疗学   新药研究   药物基因组学   定量药理学   征订启事   幅面尺寸  

摘要： 本刊为中国科学技术协会主管,中国药理学会主办的全国性、学术性刊物。月刊,幅面尺寸:280 mm×205 mm,120页,CN34-1206/R,ISSN1009-2501。以从事新药研究、临床药理学与治疗学工作的高中级医疗、科研、教学人员为主要读者对象。设有专论、综述与讲座、基础研究、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、临床药理学(包括药物基因组学及药物蛋白组学等)、药物治疗学、读者·作者·编者等栏目。

关键词： 三七皂苷Ft1   三七皂苷Fc   网络药理学   血栓疾病   血栓  

摘要： 为探讨三七中活性成分三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的作用机制,通过Swiss Target Prediction、Super-pred、BindingDB数据库检索三七Ft1、Fc靶点,在OMIM、Gene Cards、Drug Bank数据库中检索与血栓疾病发生相关靶点,借助Venny网站和STRING数据库建立靶蛋白互作网络模型,使用Centiscape 2.2进行拓扑参数分析,并且对三七Ft1和Fc核心靶点进行GO、KEGG通路富集分析,最后进行分子对接验证。结果表明,三七皂苷Ft1、Fc分别有90和149个预测靶点,4303个与血栓疾病发生相关靶点,维恩图分析核心靶点分别为14和18个,其中三七Ft1与其核心靶点STAT3、VEGFA、HSP90AA1紧密结合,三七Fc与其核心靶点STAT3、VEGFA、CXCR4紧密结合。基于网络药理学,探讨三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓多靶点和多途径的特性,为三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的研究提供了新思路。

关键词： 槲皮素   乳腺癌   网络药理学   PI3K-AKT-mTOR   通路   实验验证  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术预测槲皮素干预乳腺癌的潜在分子机制,观察槲皮素对乳腺癌细胞增殖、迁移、上皮-间质转化(epithelia-mesenchymal transition,EMT)的影响,验证可能的信号通路。方法运用Swiss Target Prediction、PubChem数据库预测槲皮素潜在作用靶点,通过OMIM、TTD、CTDbase和DisGeNET数据库获取乳腺癌相关靶点,取交集后获得两者的共同靶点,采用STRING分析靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析筛选核心靶点,使用DAVID数据库对交集靶点进行基因功能分析和通路富集分析,以关键信号通路上的相关蛋白为受体,槲皮素为配体,通过AutoDock vina软件进行分子对接验证,最后通过MDA-MB-468细胞建立乳腺癌体外模型,采用CCK-8法、细胞划痕和Transwell实验观察细胞增殖和迁移侵袭情况,采用Western blot检测增殖、凋亡、EMT相关蛋白的表达水平,以及关键信号通路上相关蛋白的磷酸化情况。结果共得到槲皮素潜在靶点103个,乳腺癌相关靶点2526个,药物-疾病交集靶点53个,PPI网络筛选得到核心靶点12个,富集到563个GO功能条目和109条信号通路。分子对接结果显示,槲皮素可以与相关蛋白良好对接。体外实验结果表明,槲皮素可以抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭及EMT,Western blot结果显示槲皮素能够降低PCNA、Bcl-2、p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT、p-mTOR/mTOR的表达水平(P<0.01,P<0.05),升高Bax的表达水平(P<0.01,P<0.05)。结论槲皮素对乳腺癌的干预作用具有多靶点、多途径的特点,其机制可能与抑制PI3K-AKT-mTOR信号通路,诱导细胞凋亡有关。本实验可以为后续槲皮素的深入研究及临床应用提供科学依据。

关键词： 康妇消炎栓   慢性前列腺炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学与分子对接技术探讨康妇消炎栓治疗慢性前列腺炎的作用机制。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、UniProt、化源网、Drug bank等平台并结合文献获取康妇消炎栓有效成分及作用靶点;通过GeneCards、DisGeNET、PharmGKB数据库获取慢性前列腺炎的靶点;采用Venny 2.1.0获得药物与疾病共有靶点;将共有靶点导入STRING平台构建蛋白互作网络;采用Cytoscape软件筛选出核心靶点并建立“药物-核心成分-核心靶点-疾病”网络;采用DAVID平台对核心靶点进行GO与KEGG通路富集分析,选择与慢性前列腺炎最相关通路,建立“关键通路-靶点”网络并筛选关键靶点,运用Pymol、AutoDock Tools等软件对关键靶点和关键成分进行分子对接。结果获得康妇消炎栓150个有效成分的315个靶点,与4327个疾病靶点求交集后产生250个共有靶点。42个核心靶点的GO与KEGG分析显示影响的生物学过程主要有RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、DNA转录的正调控、基因表达正调控等;涉及C型凝集素样受体、辅助T细胞17(Th17)分化、肿瘤坏死因子(TNF)和白介素-17(IL-17)等信号通路。关键靶点与药物关键成分能够成功对接。结论康妇消炎栓通过多成分、多靶点、作用于多条通路对慢性前列腺炎发挥治疗作用。

关键词： 新农科   兽医药理学   课程思政   多维度融合  

摘要： 新农科建设对兽医专业人才培养提出了更高要求。兽医药理学作为核心基础课之一,是指导临床合理用药的理论基础,关乎国计民生,课堂教学过程中必须融入思政元素。通过分析兽医药理学课程内容特点,筛选契合的思政内容,在教学过程中采用典型案例以及翻转课堂等方式,多手段、多层次、跨领域、多角度地融入思政元素,实现专业知识传授与核心价值观引领互融共进,为培养新时代兽医领域的高素质创新型人才提供思路,更好满足人民对动物性食品安全提出的要求。

关键词： 肝纤维化   中药   药效   网络药理学   治疗  

摘要： 目的基于网络药理学解析临床常用中药抗肝纤维化主要活性成分及其作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台TCMSP和Swiss Target Prediction获得21味临床常用中药的有效成分和潜在作用靶点;用GEO数据库解析乙型肝炎病毒(HBV)感染、酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝病致肝纤维化差异基因,结合肝纤维化细胞外基质生成和逆转关键基因预测中药治疗靶点;采用Cytoscape软件构建“药物-治疗靶点-通路”网络解析中药抗纤维化成分及其作用机制;体外实验考察核心成分对巨噬细胞(THP-1)和肝星状细胞(LX2)的影响。首先对数据进行正态性检验和方差齐性检验,然后对数据两组间的比较采用t检验,多组间比较行One-Way ANOVA法进行分析。结果21味中药含355个单体化合物,对应315个已知药物靶点,基于肝纤维化发生和消退的关键环节结果显示其中57个基因为中药的抗纤维化治疗靶点;“药物-靶点-通路网络”关联分析结果显示槲皮素和山奈酚是多种复方中药最为核心的抗肝纤维化成分,主要通过调控PI3K-Akt、AGE-RAGE、MAPK、肿瘤坏死因子(TNF)和白细胞介素(IL)-17等信号通路中核心基因TNF、蛋白激酶B1、基质金属蛋白酶9、B淋巴细胞瘤2、趋化因子受体2、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3、C-X-C模体趋化因子受体8、V-rel网状内皮细胞病毒癌基因同源物A、MYC和信号传导和转录激活蛋白1改善HBV、酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝病疾病进程和纤维化进展;细胞实验显示槲皮素较山奈酚具有更强的抑制炎症型THP-1细胞释放促炎因子IL-1β、IL-6和TNF-α的能力,而山奈酚降低趋化因子趋化因子受体2更为明显。槲皮素和山奈酚明显抑制THP-1介导的LX2细胞增殖,伴随α-平滑肌肌动蛋白、胶原蛋白IA、转化生长因子-β显著降低和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3、Cleaved-半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3的增加,二者具有协同作用。结论槲皮素和山奈酚是构成治疗肝纤维化复方中药的基石,为后续多靶点抗肝纤维化药物的研发提供参考。

关键词： 网络药理学   海牡方   含药血清   细胞周期   细胞凋亡  

摘要： 目的 通过运用网络药理学和血清药理学方法探讨海牡方(Haimufang Decoction,HMF)治疗非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)的主要成分、核心靶点、关键信号通路以阐明其可能的作用机制。方法 分别采用TCMSP和DisGeNET等数据库检索、汇总HMF的化合物成分、作用靶点及NSCLC疾病相关靶点;将药物的作用靶点与疾病的靶点取交集获得共有靶点,并上传至STRING数据平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心靶点;运用DAVID数据库对核心靶点进行GO及KEGG富集分析,并采用Cytoscape 3.9.1软件构建HMF“药味-成分-靶点-通路”网络,预测HMF可能的作用机制;最后通过HMF含药血清对NSCLC NCI-H1975细胞的细胞周期阻滞和细胞凋亡诱导试验验证HMF对肺癌的作用及其潜在机制。结果 从HMF中鉴定了65个化合物,筛选出24-酮胆固醇、槲皮素、邻苯二甲酸二异丁酯等47个主要化合物,PPI网络分析结果显示,肿瘤蛋白p53、肿瘤坏死因子、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3等共55个可能是HMF治疗NSCLC的核心靶蛋白,涉及癌症通路等多条信号通路。在随后的验证实验中,癌症通路中的细胞周期阻滞和凋亡诱导已被证实参与抑制NSCLC。结论 HMF通过多成分、多靶点和多途径信号通路的方式发挥治疗NSCLC的作用,为HMF的作用机制和临床应用提供了理论基础。