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关键词： 香连丸   腹泻   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接技术探究香连丸治疗腹泻作用机制。方法采用TCMSP数据库检索中药活性成分和靶点,基于DisGeNET、GeneCards数据库收集腹泻靶点。利用Cytoscape3.10.1软件构建蛋白相互作用网络、药物-活性成分-靶点网络,获取关键成分和核心靶点,使用微生信在线平台进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用AutoDockTools软件将中药活性成分和核心靶点进行分子对接。结果香连丸中药物活性成分共22个,药物-疾病核心靶点106个,包括TP53、TNF、AKT1、IL6、ESR1等;GO功能富集分析得到364个条目,KEGG通路富集到129条信号通路,主要涉及癌症、血脂与动脉粥样硬化、甲型流感、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路等。分子对接结果表明,豆甾醇与AKT1的结合能最强。结论香连丸可能通过TP53、TNF、AKT1、IL6、ESR1等多个靶点,调控相关炎症、癌症信号通路等发挥功效。

关键词： 柴胡皂苷a   抑郁症   网络药理学   白蛋白   热休克蛋白90α家族A类成员1   叉头框-O信号通路   磷酸肌醇-3激酶/蛋白激酶B  

摘要： 目的通过网络药理学探讨柴胡皂苷a在抑郁症治疗中的作用机制。方法从PubChem、PharmMapper和SwissTarget Prediction数据库中获取柴胡皂苷a的分子结构和潜在靶点。将柴胡皂苷a和抑郁症的共同靶点导入STRING 11.0数据库,构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用DAVID 6.8数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果本研究共获得柴胡皂苷a靶点408个,抑郁相关靶点3799个,最终得到200个共同靶点,包括白蛋白(ALB)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B(Akt1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、转录信号转导和激活因子3(STAT3)和表皮生长因子受体(EGFR)等。GO和KEGG富集分析表明,癌症、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌、癌症蛋白多糖、内分泌耐药、叉头框-O(FoxO)信号通路、磷酸肌醇-3激酶(PI3K)/Akt信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、Th17细胞分化、催乳素信号通路等通路在柴胡皂苷a抗抑郁中发挥了重要作用。结论柴胡皂苷a可能通过作用于FoxO、催乳素、PI3K/Akt信号通路及ALB、Akt1、HSP90AA1、STAT3等靶点发挥抗抑郁作用。

关键词： 支气管哮喘   苓甘五味姜辛汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接方法探讨苓甘五味姜辛汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选苓甘五味姜辛汤中5种中药活性成分及靶点;利用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)以及DisGeNeT、Drugbank数据库筛选支气管哮喘的相关靶点,取药物与疾病交集靶点,制作韦恩图;利用STRING 11.5分析交集靶点蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)关系,并通过Cytoscape 3.8.2构建PPI网络,应用MCODE插件进行蛋白质功能聚类分析;运用Metascape进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;通过Cytoscape 3.8.2构建“药物活性成分-靶点-通路”网络;利用Analyze Network分析得到药物核心成分与核心靶点,并采用AutoDock vina进行核心成分与关键靶点的分子对接验证。结果:共筛选得到苓甘五味姜辛汤126个活性成分,对应169个靶点,支气管哮喘相关靶点3484个,取交集后得到共同靶点112个;网络拓扑分析获得MAPKs、AKT1、RELA、JUN、PRKCA、BCL2等13个关键靶点,得到山柰酚、常春藤苷配基、β-谷甾醇、柚皮素等7个核心成分;KEGG通路富集分析显示主要涉及AGE-RAGE、IL-17、PI3K/AKT、cAMP、雌激素、Ca2+、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示主要活性成分与关键靶点均有较强结合性。结论:苓甘五味姜辛汤通过多成分、多靶点、多通路治疗支气管哮喘,其作用机制可能与MAPKs、AKT1、RELA、JUN、PRKCA、BCL2等靶点调控AGE-RAGE、IL-17、PI3K/AKT、cAMP、雌激素、Ca2+、HIF-1等信号通路有关。

关键词： 芪菟二至方   化疗所致骨髓抑制   网络药理学   作用机制   UPLC-Q-TOF-MS  

摘要： 探究芪菟二至方(QTEZ)改善化疗所致骨髓抑制的作用机制及其拆方分别对三系造血细胞作用的侧重。采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)技术鉴定QTEZ肠吸收液成分并获取作用靶点,与从OMIM等多个数据库中收集的化疗所致骨髓抑制靶点取交集,基于网络药理学建立交互网络,进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。小鼠腹腔注射5-氟尿嘧啶进行骨髓抑制造模后取骨髓造血干细胞,随机分为模型组、芪菟二至方组、黄芪当归组、女贞子墨旱莲组、补骨脂菟丝子组和阳性药组,分别给予相应中药肠吸收液及阳性药粒细胞集落刺激因子,取正常造血干细胞为对照组,予生理盐水干预。通过流式细胞术观察细胞周期和集落形成实验观察三系造血祖细胞增殖情况。采用Western blot验证QTEZ对通路蛋白磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、磷酸化PI3K(phosphorylated PI3K,p-PI3K)、蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)及磷酸化AKT(phosphorylated AKT,p-AKT)的影响。采用RT-qPCR和Western blot检测QTEZ对细胞周期相关靶点蛋白细胞周期依赖性蛋白激酶抑制蛋白1(P21)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、细胞周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)的影响。结果表明,QTEZ共鉴定出158个成分,获得375个成分-疾病交集靶点,构建网络后获取21个核心成分和40个核心靶点,GO和KEGG富集显示PI3K/AKT等信号通路。QTEZ及其拆方可以促进5-氟尿嘧啶阻滞的细胞周期恢复运行,对集落均有不同程度的恢复作用,其中QTEZ恢复效果最佳,黄芪当归组对红细胞集落形成单位作用有所侧重。Western blot结果表明各组通路蛋白表达量无显著差异。RT-qPCR和Western blot结果表明QTEZ可以下调P21,上调CDK4和CCND1蛋白和mRNA表达。综上,QTEZ及其拆方可以通过促进细胞周期正常运行和集落形成对5-氟尿嘧啶损伤的骨髓抑制造血干细胞发挥保护作用,其机制可能与下调细胞周期相关靶点蛋白P21,上调CDK4和CCND1有关,其中黄芪和当归对红细胞具有针对性保护作用。

关键词： 参附注射液   心力衰竭   16S rRNA   肠道菌群   网络药理学   异丙肾上腺素  

摘要： 目的探讨参附注射液治疗心力衰竭(以下简称“心衰”)的作用机制。方法30只雄性SD大鼠随机分为空白组(n=7)和造模组(n=23)。造模组大鼠采用异丙肾上腺素皮下注射法(5 mg·kg^(-1)·d^(-1),连续1周)制备心衰大鼠模型,空白组大鼠经皮下注射等量生理盐水。造模完成后,将成模大鼠随机分为模型组(n=8)和参附组(n=8)。参附组大鼠腹腔注射参附注射液(6 mL·kg^(-1)·d^(-1),连续1周),空白组和模型组大鼠腹腔注射等量生理盐水。药物干预结束后,于麻醉状态下行心脏超声心动图检测;经腹主动脉取血,收集血液样本检测炎症指标;于结肠段收集粪便样本和结肠组织进行16S rRNA测序和HE染色;摘取大鼠心脏行HE染色。运用网络药理学方法,筛选参附注射液活性成分、靶点及心衰和差异菌群相关靶点,并对相同靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果与空白组比较,模型组大鼠射血分数(EF)、缩短分数(FS)下降(P<0.001),N末端B型利钠肽原(NT-proBNP)升高(P<0.001),脂多糖(LPS)、白细胞介素(IL)-6、IL-1β升高(P<0.001)。与模型组比较,参附组大鼠EF、FS升高(P<0.001),NT-proBNP下降(P<0.001),LPS、IL-6、IL-1β下降(P<0.01,P<0.001)。参附组与空白组的肠道菌群相似度高于模型组与空白组。群落组成和线性判别分析效应量(LEfSe)结果表明,与空白组比较,模型组大鼠多级物种丰度发生改变,上述改变在参附组中呈现回调趋势。网络药理学结果发现,“参附注射液-肠道菌群-心衰”的共同靶点为IL-10、IL-1β、IL-6、肿瘤坏死因子,并且GO功能、KEGG富集分析结果也与炎症反应密切相关。结论参附注射液可能通过调节肠道菌群,抑制机体炎症反应,进而改善心功能。

关键词： 网络药理学   异病同治   慢性阻塞性肺疾病   糖尿病   分子对接   参苓白术散  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨参苓白术散“异病同治”慢性阻塞性肺疾病(COPD)与糖尿病(DM)的作用机制。方法检索综合数据库,收集参苓白术散的活性成分及其靶点,并进行标准化处理;从人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)等数据平台收集COPD和DM的相关靶点。利用Evenn软件确定药物与疾病的交集靶点,将其导入STRING数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并应用Cytoscape软件进行可视化分析。使用R软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用CB-Dock2平台进行分子对接与可视化分析。结果经筛选共获得参苓白术散的215个潜在靶点;韦恩图分析显示,参苓白术散治疗COPD与DM有70个潜在的交集靶点。关键活性成分包括槲皮素、豆甾醇、山奈酚、谷甾醇和木犀草素等,核心靶点包括肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)和肿瘤蛋白p53(TP53)等。GO功能富集分析得到2599个生物过程条目、49个细胞组成条目和230个分子功能条目;KEGG通路富集分析获得的主要通路包括脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素17(IL-17)信号通路、TNF信号通路以及人巨细胞病毒感染等。分子对接结果显示,豆甾醇与PTGS2的对接活性最佳。结论参苓白术散可能通过多成分、多靶点和多途径实现对COPD与DM的“异病同治”,且这2种疾病在治疗机制上存在一定关联,为后续研究提供了理论依据和方向。

关键词： 高等院校   药理学   制药工程   教学改革  

摘要： “药理学”是制药工程专业的核心课程,具有系统性强、知识面广、发展迅速的特点。探索专业课程在教学和育人方面的守正创新方法,有利于培养担当民族复兴大任的新时代高级人才。课程团队结合所在院校的教学特点,按照“以学生为中心、成果导向、持续改进”的OBE理念,探索面向制药工程专业以问题为导向的“药理学”教学创新模式,结合虚拟实验教学平台,调动学生学习的积极性、主动性、创造性,同时融入敬业、责任、法制等思政元素,在潜移默化中提高学生的学习兴趣和职业道德水平,培养实用型制药工程人才。通过灵活教学方式的运用,课程整体教学质量得到明显提高,课堂教学与创新训练的融合探索,促进了创新人才的培养。

关键词： 慢性乙型肝炎   代谢相关脂肪性肝病   网络药理学   逍遥散  

摘要： 目的借助网络药理学方法对逍遥散治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)合并代谢相关脂肪性肝病(metabolic associated fatty liver disease,MAFLD)药效成分以及作用机制进行了预测和分析,为下一步实验验证研究提供思路和方向。方法通过TCMSP获取逍遥散中中药的主要化学成分及活性物,在Uniprot蛋白质数据库将化合物作用的蛋白质靶点进行规范。通过GeneCards数据库获取CHB和MAFLD的主要靶点,利用韦恩分析工具绘制韦恩图,并得到三者交集靶点。随后在STRING 11.5数据库及CytoScape 3.9.1构建PPI网络模型。利用Metascape数据平台对潜在的靶点进行富集分析。结果逍遥散干预CHB合并MAFLD的核心活性成分为山奈酚、槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等化合物。核心靶点有:RELA、MAPK1、MAPK3、AKT1、IL6等靶点。逍遥散干预CHB合并MAFLD的生物学通路主要作用于Relaxin信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路等信号通路,起到抗炎、抗氧化、抑制胶原蛋白的沉积等作用,从而减少肝脏的炎症损伤,改善肝纤维化。结论逍遥散治疗CHB合并MAFLD可能通过Relaxin信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路等信号通路作用于RELA、MAPK1、MAPK3、AKT1、IL6等靶蛋白的表达,起到抗炎、抗氧化、抑制胶原蛋白的沉积等作用,从而减少肝脏的炎症损伤,改善肝纤维化。

关键词： 结肠癌   黄芩   苦参   网络药理学   分子对接   靶点预测  

摘要： 目的本研究基于网络药理学及分子对接方法,探讨黄芩-苦参治疗结肠癌的药理作用机制,为药物机制研究提供理论依据。方法通过TCMSP平台获取黄芩-苦参主要化学成分及其作用靶标;通过Gene Cards数据库搜索获得结肠癌靶点;通过STRING数据库进行蛋白质互作(PPI)分析,构建PPI网络图;通过Metascape数据库对靶点进行GO与KEGG富集分析,利用Cytoscape软件绘制“黄芩、苦参-结肠癌成分-靶点-通路”图,并对网络图进行拓扑分析。从PDB数据库中获得的靶蛋白晶体结构导入Autodock软件,对活性成分和靶蛋白进行分子对接分析。结果通过数据库筛选获得黄芩-苦参47种有效成分及167个蛋白靶点,其中与结肠癌相关潜在靶点124个。黄芩-苦参治疗结肠癌的核心活性成分为木樨草素、黄芩素、刺芒柄花素、β-谷甾醇和豆甾醇等,通过调控蛋白质为肿瘤抑制基因p53(TP53)、原癌基因(JUN)、丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等关键疾病靶点起到抗结肠癌的效果。GO功能分析发现2019个条目,KEGG通路分析发现330个条目。GO与KEGG富集分析结果显示,黄芩-苦参可能通过靶向PI3K/AKT信号通路治疗结肠癌。分子对接结果显示,黄芩-苦参药对活性成分与结肠癌关键靶点具有良好的结合能力。结论本研究初步验证了黄芩-苦参治疗结肠癌的作用机制,并为黄芩-苦参的机制研究和临床应用提供理论基础。

关键词： 参知健脑方   糖尿病认知功能障碍   网络药理学   分子对接  

摘要： 本研究旨在运用网络药理学方法及分子对接技术初步探讨参知健脑方治疗糖尿病认知功能障碍的潜在作用机制。试验采用TCMSP、TCMMESH和ETCM平台筛选出参知健脑方中人参、知母、赤芍的活性成分和作用靶点,利用GeneCards、OMIM、DisGeNET和DigSee等数据库检索糖尿病认知功能障碍的相关靶点,然后运用Cytoscape 3.8.0构建“中药-活性成分-靶点”网络,并通过STRING平台得到药物与疾病靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络,DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。对参知健脑方关键活性成分与关键靶点进行分子对接,共筛选出参知健脑方的43个活性成分和相应靶点759个,糖尿病认知功能障碍靶点6314个;获得“药物-疾病”共同靶点584个,关键靶点为AKT1、TNF、CTNNB1、SRC和EGFR。分子对接结果显示,参知健脑方关键活性成分与关键靶点的结合潜能和活性较好。本研究初步探讨了参知健脑方对糖尿病认知功能障碍的多维网络调控机制,为临床研究提供了可靠的理论依据。