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关键词： 脓毒症   血必净注射液   网络药理学   分子对接   炎症反应   靶点  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术,探讨血必净注射液治疗脓毒症的潜在作用机制。方法利用Swiss Target Prediction和TCMSP数据库预测血必净注射液的药物成分和作用靶点,筛选核心成分;利用STITCH、DisGeNET和Genecards数据库预测脓毒症作用靶点,使用Venny 2.1.0工具将药物与疾病靶点映射得到二者交集靶点,进而构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出核心作用靶点;利用DAVID数据库进行KEGG和GO富集分析获取相关通路,依据条目的P值筛选出相关性较高的信号通路;依托Chem 3D、AutoDock、Pymol等软件对核心成分和关键靶点进行分子对接,在分子层面进一步阐明血必净注射液治疗脓毒症的具体机制。结果筛选并获得113个血必净注射液治疗脓毒症的潜在作用靶点。PPI网络分析依据degree值筛选出排名前5的核心靶点,分别是白细胞介素(IL)-1β、IL-6、蛋白激酶B(AKT)1型、肿瘤抑制蛋白(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。GO和KEGG富集分析显示血必净注射液在脓毒症治疗中涉及多条信号通路,主要包括IL-17、肿瘤坏死因子(TNF)、缺氧诱导因子(HIF)-1信号通路及Th17细胞的分化等,其中IL-17信号通路高度富集。通过分子对接,发现血必净注射液中排名前3的核心成分槲皮素、山奈酚、木樨草素与IL-1β、IL-6和TP53的对接结合能均小于-5 kcal/mol,说明槲皮素、山奈酚和木樨草素能够较好地与核心靶点结合,具有较好的结合能力。结论血必净注射液具有“多成分、多靶点、多途径”的功效。槲皮素、山奈酚和木樨草素可能是血必净注射液的主要活性成分,IL-1β、IL-6和TP53蛋白可能是血必净注射液治疗脓毒症的潜在治疗靶点。血必净注射液可能通过IL-17、TNF、HIF-1信号通路和Th17细胞的分化等途径发挥治疗作用。

关键词： 脉络舒通丸   股骨骨折后肌肉肿胀   网络药理学   药效物质   作用机制  

摘要： 旨在通过网络药理学及动物实验探讨脉络舒通丸(MLST)对股骨骨折后肢体肿胀(SCFF)的作用机制。利用液质联用技术分析MLST入血成分,网络药理学预测其入血成分对SCFF的靶点和信号通路,分子对接进行验证。通过动物实验建立SCFF模型大鼠,给予不同剂量的MLST治疗,检测其肢体肿胀程度,苏木精-伊红(HE)染色检测肌肉组织病理变化,酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定外周血白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,采用Western blot测定相关信号通路表达。网络药理学结果显示,MLST与SCFF疾病作用靶点共计153个,关键靶点有IL-6、TNF等,涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路等;对主要入血成分和关键靶点进行分子对接,结合能均小于-7.0 kcal·mol^(-1),说明网络分析结果可靠。动物实验结果表明,与模型组相比,MLST可以减轻SCFF大鼠后肢肌肉肿胀度及其病理损伤,降低SCFF大鼠血清中IL-6、IL-1β及TNF-α水平,降低SCFF大鼠中p-AKT、p-PI3K、p-NF-κB、p-p38 MAPK、p-ERK蛋白表达。综上,MLST可能通过调节PI3K/AKT与MAPK相关信号通路蛋白的表达,降低血清中炎症因子含量,改善大鼠SCFF。

关键词： 褪黑素   急性肺损伤   网络药理学  

摘要： 目的本文旨在研究褪黑素(MT)对急性肺损伤(ALI)可能的干预靶点和其抑制作用。方法通过数据库筛选获取MT的主要靶点及ALI的疾病作用靶点。经过Venn图的解析MT和ALI的共同靶点。利用Cytoscape 3.8.2工具构建“药物-疾病”的网络模型。借助STRING工具对蛋白质之间的相互作用进行分析,并构造PPI网络。使用R工具进行GO和KEGG的富集分析。同时,构建ALI动物模型并进行MT治疗干预,观察肺组织病理学的变化,气管切开插管检测各组肺功能Ri-area、Re-area和Cldyn-area水平。结果经筛选后获得196个MT靶点、3948个ALI靶点及118个药物-疾病共同靶点。EGFR、HIF1A和ERBB2等均为MT靶向ALI疾病的关键核心点。在GO富集分析中,生物过程共涉及到1690种,细胞组分涉及到90种,而分子功能则涉及到176种。至于KEGG路径富集筛选中,共发现与此相关的157条生物通路。体内实验结果显示MT治疗干预对ALI有明显抑制作用。结论MT可能通过多靶点抑制ALI的发病和进展。

关键词： 阿尔茨海默症   网络药理学   桃红四物汤   中医药  

摘要： 桃红四物汤(Taohong Siwu Decoction,THSWD)是活血化瘀的经典中药方剂,本研究利用网络药理学筛选THSWD潜在活性成分,探讨其治疗阿尔茨海默症的核心作用靶点和信号通路。首先,通过TCMSP和SEA数据库,筛选THSWD的活性成分及其作用靶点,共获得25个活性化合物(active compounds,ACs)和478个活性成分靶点;通过TTD、Dis Ge NET、Drug Bank、GAD和Gene Cards数据库共获得阿尔茨海默症疾病靶点724个。寻找活性成分作用靶点和疾病相关靶点的交集,共获得64个靶点(overlapping targets,OTs)。然后,构建25个ACs和64个OTs相互关系网络,获得21个一级关键化合物(first level key compound,FKCs)。通过对64个OTs进行PPI分析,获得33个核心靶点(core targets,CTs),并对这33个CTs进行KEGG聚类分析,获得排名靠前73条通路。最后,利用Cytoscape 3.7.2软件绘制“21个FKCs-33个CTs-73条通路”网络关系图,根据拓扑参数进行选择,进一步获得19个二级关键化合物(second key components,SKCs)。对“19个SKCs-33个CTs-73条通路”进行网络的分析与提取,最终构建得到THSWD干预阿尔茨海默症“6种单味药-8种潜在活性成分-13个核心作用靶点-54条信号通路”的网络图谱。研究结果为阐明THSWD的药效物质基础和进一步研究THSWD治疗阿尔茨海默症的作用机制和临床应用提供了新思路。

关键词： BOPPPS   教学模式   高职   药理学  

摘要： BOPPPS是一种以教育目标为导向,以学生为中心的教学模式,能有效发挥学生的主观能动性,提高学习效果。课程思政是当前专业课教学的重点改革内容,是落实立德树人根本任务、培养高素质技能人才的重要路径。基于BOPPPS教学模式对高职院校药理学课程进行总体设计与实践,并融入思政元素,通过问卷调查和纵向成绩分析对教学效果进行了评价,探讨了BOPPPS教学模式在高职药理学教学中的应用效果。

关键词： 肝肿瘤   网络药理学   生物信息学   金雀异黄酮   肝细胞癌  

摘要： 目的通过网络药理学及生物信息学方法阐明金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制。方法利用网络药理学、生物信息学和实验验证方法。从Pharm Mapper数据库获取金雀异黄酮的潜在作用靶点。使用Gene Cards数据库获取肝细胞癌的致病基因,分析确定金雀异黄酮潜在靶点与肝细胞癌相关靶点的交集基因。采用TCGA的肝细胞癌组织样本和正常组织样本的RNA测序数据及临床信息,筛选出差异表达的共同靶基因,并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过单因素Cox分析筛选影响患者总体生存期的差异表达基因(DEGs),利用STRING平台构建DEGs的靶点交互网络,并筛选核心基因进行验证。进行分子对接试验,检测金雀异黄酮对肝细胞癌增殖的影响。结果共筛选出235个金雀异黄酮的潜在作用靶点和9415个肝细胞癌的治疗靶点,其中40个差异表达的共同靶基因影响患者的预后。其中,ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4为核心靶点。GO功能注释富集分析获得333个富集项,KEGG通路富集分析获得23个富集结果。分子对接结果显示,金雀异黄酮与核心靶蛋白有强烈的结合能力。体外实验证实,金雀异黄酮显著抑制了肝细胞癌的增殖。结论金雀异黄酮通过多个代谢和信号通路抑制肝细胞癌的发展机制。ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4的表达水平可用于预测肝细胞癌患者的预后,为治疗提供有价值的靶点。

关键词： 早发性卵巢功能不全   网络药理学   作用机制   研究进展  

摘要： 早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)是指女性在40岁之前出现卵巢功能减退,主要表现为雌激素水平波动性下降、促性腺激素水平升高及月经异常[1]。在POI概念产生之前,卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)是被临床广泛使用的专业术语,但随着人们对该病研究的深入,发现其病因复杂、临床表现多样且呈进行性发展,“卵巢早衰”逐渐被“早发性卵巢功能不全”所代替[2]。最新研究显示,全球女性POI的总体患病率为3.5%,其中发展中国家POI患病率为5.3%,且处于上升趋势[3]。现代女性生育年龄普遍后移以及“三孩政策”的实施使得35岁以上女性的生育需求增加,因而POI成为影响女性生育能力的重要问题,且其与心血管疾病、骨质疏松、神经认知功能障碍以及心理社会问题等多种健康问题相关[4]。目前西医临床对POI尚无特效药物和方法,主要是使用激素替代疗法,然而激素替代疗法具有急性肝损伤、肝功能障碍、血管栓塞等风险[5],不易被患者接受。临床实践表明,中医药治疗POI疗效显著,然而其作用机制难以被揭示。网络药理学是一门以基因组学、蛋白组学等理论为基础的新兴学科,近年来运用网络药理学的方法研究中医药治疗POI的机制成为新的研究热点。基于此,本文就目前运用网络药理学研究中药治疗POI的机制研究进展进行综述,旨在揭示中医药对POI的作用机制,并为进一步的研究提供思路与方法。

关键词： 湿润烧伤膏   糖尿病足   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学探究糖尿病足(Diabetic foot,DF)应用湿润烧伤膏(Moist exposed burn ointment,MEBO)治疗的作用机制。方法采用中药系统药理学分析系统(TCMSP)收集整合MEBO的化学成分及有效成分靶点信息,借助UniProt数据库统一处理靶点基因名称;通过人类基因综合数据库(Gene Cards)分析DF的相关靶点基因,利用Venny 2.1软件分析MEBO活性成分靶点与DF靶点的相关性,获取潜在靶点。利用STRING网站分析交集靶点,随后利用Cytoscape 3.10.0软件构建PPI网络图,找出关键靶点基因。结果MEBO的主要成分包含黄连、黄柏、黄芩、黄麻苷A等;关键作用靶点为表皮生长因子受体(EGFP)、白细胞介素-1B(IL-1B)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等;关键作用通路为VEGF、AGE-RAGE、HIF-1等。结论经研究MEBO的有效化学成分能够从多靶点、多通路治疗DF,具有促进上皮细胞生长、调节细胞生长与胶原纤维分泌、降低血糖与镇痛作用、保护创面与促进愈合以及减少瘢痕形成等优势。

关键词： 药理学   实验教学   混合式教学   虚拟仿真  

摘要： 药理学实验对于医学生理解药理学基本理论,学习和掌握科学研究的思路、方法和技能具有重要的作用。在“互联网+”背景下,河北医科大学践行“一个理念”“一个特色”和“一个中心”的“三个一”实验教学改革,通过自建或选用适当的线上实验教学资源,配合线下实验开展教学活动,并坚持教学方法的创新,灵活运用信息技术手段充实实验教学内容,合理设计教学活动和优化实验考核方式,充分地调动了医学生学习实验的主动性,有力地助推药理学实验教学质量的提升,也为其他医学基础课的实验教学改革提供一种可借鉴的范式。

关键词： 灯盏细辛   高血压   药理作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接技术,探究灯盏细辛治疗高血压的作用机制。方法:借助中药系统药理学平台检索灯盏细辛的活性成分及其作用靶点,在GeneCards、TTD和OMIM数据库检索高血压的相关蛋白靶点,通过Uniprot数据库和STRING数据库获取靶点的基因名称;绘制韦恩图(Venn-diagram),得到交集靶点,随后利用Cytoscape 3.10.0版软件构建“灯盏细辛-成分-高血压-靶点”网络图获取主要的化合物成分,然后通过构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络获取灯盏细辛治疗高血压的主要靶点;再利用DAVID数据库对药物和疾病的交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;最后,对主要化合物和主要靶点进行分子对接验证,计算结合能。结果:经筛选,得到灯盏细辛作用靶点207个、高血压相关靶点1585个和交集靶点113个;其中,Degree值前5位的成分依次为槲皮素、山柰酚、木犀草素、刺芒柄花素、黄芩素,而Degree值前5位的交集靶点依次为蛋白转录因子激活蛋白1(JUN)、抑癌基因p53(TP53)、热休克蛋白HSP90-α(HSP90AA1)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1);GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果显示,活性氧信号通路、PI3K-Akt、肿瘤坏死因子信号通路等是灯盏细辛治疗高血压的主要通路;分子对接结果显示,前5位成分和前5位交集靶点的结合能均小于-5 kJ/mol,表明主要成分和主要靶点的结合较好。结论:灯盏细辛中的主要活性成分可以较好地与高血压的治疗靶点相结合,因而具有可开发成为治疗高血压药物的潜在可能。