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关键词： 新疆樱桃李花色苷   动脉粥样硬化   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:研究新疆樱桃李花色苷(XJP-ACY)抗动脉粥样硬化(AS)作用的活性成分及作用机制。方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)鉴定的新疆樱桃李花色苷主要成分,从XJP-ACY主要成分和AS角度,应用网络药理学方法,筛选其潜在活性成分潜在靶点,构建“成分-疾病-靶点”网络,并预测XJP-ACY抗AS作用信号通路。观察XJP-ACY对氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)诱导***926内皮细胞损伤模型作用,分析内皮细胞活力、测定抗氧化酶活力,细胞凋亡以及内皮细胞黏附等的影响。蛋白质印迹检测相关蛋白表达,初步验证网络药理学的预测结果。结果:从新疆樱桃李花色苷中鉴定成分4个,预测得到其潜在抗AS作用靶点21个;聚类分析得到2个基因簇和2个核心基因,核心基因为FGF2、ADRA2C。基因本体(GO)分析结果表明筛选得到的靶点主要涉及炎症反应、MAPK的正调控等生物过程。京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析得到28条信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、C型凝集素受体信号通路等相关通路。细胞实验表明,ox-LDL诱导***926建立内皮细胞损伤模型:100μmol/L ox-LDL作用24 h,为适合本研究的最优条件。XJP-ACY可提高ox-LDL诱导的***926细胞存活率,增加一氧化氮(NO)水平和超氧化物歧化酶(SOD)活力,降低乳酸脱氢酶(LDH)、丙二醛(MDA)含量和内皮素-1(ET-1)表达水平,降低细胞活性氧(ROS)水平,抑制细胞间黏附分子-1(ICAM-1)的表达,减少炎症介质分泌;XJP-ACY可抑制ox-LDL诱导的***926细胞凋亡,其机制与其提高B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)蛋白表达相关。结论:本研究初步阐释XJP-ACY治疗AS多成分、多靶点、多途径的作用特点在于参与抑制炎症反应、促进细胞凋亡。

关键词： 二冬汤   文献计量学   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于“文献计量-网络药理学-分子对接”模式探讨二冬汤的典型药效成分及其作用机制。方法通过文献计量学分析二冬汤的临床主治病症,并对其化学成分进行搜集汇总。根据相关实验报道初步筛选潜在药效成分。使用Cytoscape软件构建二冬汤“成分-靶点-通路”网络图,探讨与二冬汤临床主治病症密切相关的典型药效成分,将典型药效成分与核心靶点进行分子对接。结果二冬汤的典型药效成分包括千层纸苷A、黄芩素和荷叶碱等化合物,它们通过与蛋白激酶B1、表皮生长因子受体和类固醇受体共激活因子等核心靶点的相互作用,调控神经活性配体-受体相互作用、钙信号和磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B等信号通路进而治疗糖尿病。结论“文献计量-网络药理学-分子对接”模式有效揭示了二冬汤治疗糖尿病的“多组分、多靶点、多途径”特点。

关键词： 强肝胶囊   非酒精性脂肪性肝病   多靶点虚拟筛选   网络药理学   作用机制  

摘要： 基于多靶点虚拟筛选、网络药理学分析和体外实验,探讨强肝胶囊(QGC)治疗非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的潜在作用机制。利用基于PPARα/γ、FXR及sEH的多靶点虚拟筛选选出QGC中具有治疗NAFLD的活性成分,运用网络药理学预测活性成分靶点、疾病相关靶点,筛选调控疾病的关键靶点,通过Discovery Studio 2020软件和Gromacs软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接和分子动力学模拟分析。最后,通过实验验证QGC中的关键活性成分对肝细胞脂肪变性的改善作用。多靶点虚拟筛选得到235个QGC活性成分,网络药理学分析得到320个成分-疾病共同靶点。分子对接结果表明,芹菜素、异鼠李素、迷迭香酸、大黄素甲醚、木犀草素与关键靶点PTPN1、PPARα、PPARγ、AR具有良好的结合能力。分子动力学模拟进一步验证了迷迭香酸、大黄素甲醚等化合物与关键靶点具有良好的结合稳定性。体外实验结果显示,5个关键活性成分均能改善HepG2细胞的脂肪变性,其中异鼠李素、迷迭香酸、大黄素甲醚改善细胞脂肪变性模型的效果最佳。本研究通过多层面探讨,为QGC在NAFLD治疗中的开发和应用提供理论依据。

关键词： 溶髓方   软骨细胞凋亡   颈椎间盘退行性病变   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接技术,探讨溶髓方干预终板软骨细胞凋亡(CA)的潜在作用机制,为治疗颈椎间盘退行性病变(CIDD)寻找新思路。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中医药百科全书(ETCM),获取溶髓方中13种药物的活性成分和预测分子潜在作用靶点。检索Gennecards和OMIM数据库,筛选出与CA进程相关的靶基因,并与药物靶点取交集。应用Cytoscasp 3.7.2软件构建“中药-活性成分-靶点”网络并借助CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络进行拓扑分析,应用STRING数据库构建蛋白互作网络并筛选出核心靶点,使用R4.2.6软件对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。通过AutoDock4和Python3.2对获得的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果:(1)获得溶髓方治疗CA的154个活性成分,主要为槲皮素、γ-谷甾醇、山柰酚、黄芩素、桑辛素C等,通过拓扑网络筛选出关键候选基因肿瘤蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、Jun原癌基因(JunProto-Oncogene,JUN)等。KEGG富集分析显示,与CA治疗相关的信号通路主要为AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路;(2)分子对接结果显示,溶髓方中核心有效成分与CA核心靶点均能通过氢键结合,且分子对接结合能均≤-5.0 kcal/mol,显现出良好的结合力。结论:溶髓方干预CA进程具有多成分、多靶点、多途径等特征,作用机制可能是溶髓方中的槲皮素、γ-谷甾醇、山柰酚、黄芩素、桑辛素C等活性成分作用于TP53、MAPK3、JUN等靶点,通过调控AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等信号通路发挥干预CA进程的作用。

关键词： 清肺解毒汤   肺纤维化   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接技术挖掘清肺解毒汤(QFJDT)治疗肺纤维化(PF)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库,获取QFJDT的配方活性成分,利用Swiss Target Prediction数据平台对靶标进行预测。使用GeneCards数据库收集PF相关的靶标,并与药物作用靶标相比较,筛选出共同部分,作为药物成分作用的预测靶标。进而使用Cytoscape3.6.1绘制“药物-成分-基因-疾病”网络图、构建蛋白互作网络(PPI),并筛选出核心靶标。最后对潜在作用靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,建立成分-靶点-通路网络,并对关键靶点进行核心化合物分子对接。结果:从TCMSP中获取QFJDT有效活性成分280个,靶点4571个;从GeneCards数据库获取PF相关基因5149个;通过构建“药物-成分-基因-疾病”网络获得QFJDT治疗PF的关键靶点224个;通过GO富集分析发现QFJDT治疗PF与3340个生物过程有关,包括抗氧化反应、对活性氧的反应等。KEGG富集涉及164条信号通路,表明QFJDT主要通过糖尿病并发症中的AGEs-RAGE信号通路等发挥治疗PF的作用,最后以花生四烯酸5-脂氧合酶靶蛋白与QFJDT中15个主要活性成分进行分子对接,发现橘皮素、香豆酚C、山奈酚等多个成分均表现出较好的亲和力,表明其与PF已知靶标有直接作用关系。结论:QFJDT包含多个与PF有抑制作用的药效成分,可通过多成分多靶标协同起效的作用机制发挥药效,本文可进一步为研究QFJDT治疗PF的药效物质基础及作用靶点提供参考。

关键词： 健脾清热活血方   溃疡性结肠炎(UC)   Meta分析   网络药理学  

摘要： 溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种难治性肠病,严重影响患者生活质量和身心健康。UC病位虽在肠道,但与脾肾有密切联系,中医认为“脾肾两虚为本,湿热淤毒为标”为其发病关键,故健脾清热活血法为中医治疗UC的重要方法之一。本文采用Review Manager 5.3软件对健脾清热活血方治疗UC的数据进行Meta分析,并对其临床及作用机制研究进行总结分析,运用网络药理学方法分析其可能的作用机制,以期为UC中医药防治研究提供新思路。结果显示,健脾清热活血方治疗UC疗效较佳,甚至结合西药治疗效果更佳,主要涉及PI3K-Akt、mTOR、NF-κB、IL-17、JAK-STAT等通路。健脾清热活血方等中药复方在防治UC方面表现出多靶点、多机制、多通路的优势。

关键词： 碳离子辐射   当归   网络药理学   分子对接  

摘要： 基于网络药理学技术探讨当归抗碳辐射的可能机理。利用中药系统药理学数据库与分析平台和文献挖掘获取当归活性成分及其作用靶点,利用GeneCard数据库获取碳离子辐射靶点,活性成分靶点与碳离子辐射靶点的交集靶点为当归抗碳离子辐射的潜在靶点;构建活性成分-潜在靶点网络;对潜在靶点进行功能富集和通路富集分析;构建潜在靶点的蛋白质相互作用网络,获得核心靶点;将核心靶标与活性成分进行分子对接,以验证网络药理学的结果。共获得9个活性成分和98个抗碳离子辐射的潜在靶点;当归抗辐射作用的主要活性成分是阿魏酸、藁本内酯、谷甾醇和豆甾醇;功能富集分析显示,潜在靶点主要参与细胞应激反应、炎症反应、激酶活性等生物过程,以及DNA结合、激酶结合、核受体活性等分子功能;通路富集分析显示,潜在靶点主要参与PI3K-Akt、MAPK等多条相互作用的信号通路;蛋白质相互作用分析显示,VEGFA、EGFR、CTNNB1等靶点为当归抗碳离子辐射的核心靶点;分子对接表明活性成分与核心靶点具有良好的结合能力。本研究结果表明,当归主要通过调节炎症反应、免疫反应、细胞凋亡与存活以及损伤修复等发挥抗碳离子辐射作用。

关键词： 香青兰   脑卒中   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学研究香青兰(Dracocephalum moldavica L.)对于脑卒中的保护作用机制。方法:通过NCBI、CNKI找出香青兰有效成分,使用Pubchem、swiss target prediction数据库预测香青兰的有效靶点,运用GeneCards、Omim数据库搜索与脑卒中(cerebral stroke)相关靶基因,构建维恩图筛选交集基因,利用cytoscape建立药物、成分、靶点、疾病关系网络图并可视化,利用String软件构建蛋白网络互作图,利用DAVID数据库进行GO富集和KEGG分析。结果:通过查找文献共找出香青兰有效成分23个,对应的靶点有1682个,主要分子有NADPH氧化酶4(NOX4)、黄嘌呤氧化脱氢酶(XDH)、髓过氧化物酶(MPO)等;通过PPI拓扑分析得到核心靶点57个;GO富集分析显示涉及生物过程(biological process,BP)443个、分子功能(molecular function,MF)104个、细胞组成(cellular component,CC)66个;KEGG结果显示共涉及信号通路有143个,其中主要有癌症通路(hsa05200:pathways in cancer)、PI3K-Akt信号通路(hsa04151:PI3K-Aktsignaling pathway)、神经活性配体-受体相互作用(hsa05022:neuroactive ligand-receptor interaction)等。结论:本研究初步揭示了香青兰可通过多种靶点、通路等治疗脑卒中,为进一步科学实验提供理论基础。

关键词： 补肺活血胶囊   肺纤维化   网络药理学   TNF信号通路  

摘要： 为探究补肺活血胶囊抗肺纤维化的潜在作用机制与作用靶点。本研究首先利用TCMSP、SwissTargetPrediction及SEA数据库筛选出BHC活性成分及其潜在作用靶点;通过GeneCards Suite、CTD、TTD数据库检索与PF疾病相关靶点;将疾病相关靶点映射到化合物潜在靶点中,得到公共靶点,并导入STRING平台,借助Cytoscape软件进行拓扑学分析,获取关键靶点;通过DAVID平台进行KEGG富集分析。为验证数据,通过Masson染色及胸部CT明确肺组织胶原沉积和影像学情况,借助Western blot及q-PCR实验明确相关靶点蛋白表达及基因转录情况。共获取BHC潜在作用靶点206个,PF相关靶点487个,公共靶点57个;共筛选出包括TNF-α、MMP9和p38在内的15个关键靶点;富集分析提示,TNF信号通路为关键通路。动物实验发现,BHC能够缓解肺组织胶原沉积,减少小鼠肺组织近胸膜处纤维网格影,降低PF小鼠肺组织内MMP9、TNF及p38蛋白及mRNA含量(P<0.01)。上述研究结果揭示BHC通过多成分-多靶点-多途径共同调控PF的作用机制,为BHC的临床应用提供理论基础和科学依据。

关键词： 数据图表   复制粘贴   化学结构式   图数据   作图软件   典型病变   电泳图   双击  

摘要： 1. 论文中的病理照片、电泳图及化学结构式图等要求以“插入”→“图片”方式插入word文档,不要使用复制粘贴。病理照片必须加标尺,并以箭头指示典型病变位置。除照片外,其他图尽量不用彩色。2. 统计的数据图表(包括线图和柱图等)一般通过“插入”→“图表”方式插入word文档,双击该图即可直接进入此图的作图软件,看到作图数据。3. 双栏图大小:宽与高的比为3∶2,宽≤7.5 cm;通栏图大小为:宽≤15 cm;横、纵坐标字体为Arial,字号为8或9磅。