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关键词： 线粒体自噬   巨噬细胞   神经内分泌   神经肽FF   脂肪组织   炎症反应   药理学   自我更新  

摘要： 目的神经肽FF(NPFF)是一种调节各种细胞过程的八肽,尤其是疼痛感知。最近,人们越来越有兴趣了解NPFF在神经内分泌炎症中的调节作用。本综述旨在全面概述巨噬细胞介导的生物过程中NPFF的调控。方法深入研究NPFF对巨噬细胞极化、自我更新调节和线粒体自噬促进的影响,促进从产热脂肪向储脂脂肪组织的转变。此外,还探讨了巨噬细胞介导的炎症反应的NPFF依赖性调节,其对巨噬细胞分化的影响,以及其诱导巨噬细胞转录组改变的能力。还讨论了NPFF作为神经内分泌炎症领域治疗分子的潜力。结论这篇综述提供了对以前未探索的神经内分泌炎症领域以及NPFF在这种情况下的调节作用的见解。总体而言,本工作提供了NPFF对巨噬细胞影响的理解,有助于探索其在未来研究中的药理学意义。

关键词： 网络药理学   小承气汤   马肠梗阻  

摘要： 肠梗阻是马最常见的疾病之一,小承气汤是治疗肠梗阻的经典方剂。研究旨在通过网络药理学分析阐明小承气汤治疗马肠梗阻的作用机制。首先在中药系统药理学数据库中检索了小承气汤的全部化学成分和靶标,然后利用STRING、DAVID、NCBI数据库和Cytoscape软件构建化合物-靶点网络、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、靶点-通路网络,筛选小承气汤的活性化合物和靶标,建立治疗马肠梗阻的小承气汤网络图,研究分析小承气汤治疗马肠梗阻的GO、KEGG通路。结果表明,通过OB、DL和Caco-2筛选出16个有效化合物和32个对应靶标;小承气汤作用于马肠梗阻的PPI网络图包含45个靶点,主要关键靶点为TP53、ESR1、NCOA1、NCOA2、IGF1、MAPK14等,其中与马肠梗阻直接相关的靶点主要有TP53、ESR1、TGFB1、MMP9、HSP90AB1;共有24个基因本体(GO)条目和7条KEGG通路。说明小承气汤可能通过泽兰黄醇、决明内酯、胡萝卜苷_qt、β-谷甾醇、桉树醇、异橙黄酮等调控TP53、ESR1、NCOA1、NCOA2、IGF1、MAPK14等蛋白的表达。并通过肿瘤通路,MAPK信号通路,肿瘤蛋白聚糖,肿瘤坏死因子信号通路等治疗马肠梗阻。其作用机制有待进一步的生物学验证。

关键词： 丹参   三七   膝骨关节炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 利用网络药理学和分子对接技术研究丹参-三七药对治疗膝骨关节炎(Knee osteoarthritis,KOA)的分子机制,为其临床应用提供理论支持。首先通过TCMSP数据库检索丹参-三七药对的主要活性成分和作用靶点;再利用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库检索KOA的相关靶点,使用维恩图得到丹参-三七药对和KOA的交集靶点;随后通过STRING数据库结合Cytoscape软件构建成分-靶点-疾病网络和PPI网络,筛选丹参-三七药对治疗KOA的核心成分和靶点;再通过DAVID数据库对交集靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并使用AutoDock软件对核心成分和靶点进行分子对接。共筛选得到丹参、三七活性成分66个和相关靶点232个,药物和疾病交集靶点130个。槲皮素、木犀草素和丹参酮ⅡA为药物作用核心化合物,PTGS2、ADRB2和OPRM1为核心靶点。GO功能分析得到794个条目,KEGG分析得到相关通路141条。分子对接结果显示,丹参酮ⅡA与ADRB2有较好的亲和力。药对治疗KOA的机制主要涉及癌症途径、AGE-RAGE信号通路、脂质代谢和流体剪切力信号通路等,丹参酮IIA与ADRB2可能是关键作用成分和靶点。

关键词： 中医药   支气管扩张症   数据挖掘   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的运用数据挖掘和网络药理学方法探讨中医药治疗支气管扩张症(支扩)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、万方、维普、PubMed等数据库中收集运用中药复方治疗支扩的临床研究文献,提取方药信息并构建数据库,分析组方规律;运用网络药理学分析高频药物组合的作用机制并通过分子对接进行反向验证。结果纳入文献252篇,收集处方284首,涉及中药242味,使用频率较高的中物有甘草、黄芩、桔梗、桑白皮、薏苡仁、鱼腥草,具有强关联性的药物组合是薏苡仁、冬瓜子;薏苡仁、冬瓜子主要成分有谷甾醇、豆甾醇、扁桃醇、奥马因、亚麻酸等,治疗支扩的靶点86个,蛋白激酶1(AKT1)、白介素-6(IL-6)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、信号传导及转录激活蛋白3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)为其核心靶点,通过细胞对化学压力、氧化应激、细菌分子的反应和炎症细胞的迁移、黏附等生物过程发挥作用,涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、核转录因子-κB(NF-κB)等信号通路。分子对接结果表明核心靶点与主要活性成分对接良好,具有稳定的结合能。结论初步阐明了中药复方治疗支扩多以清肺解毒、化痰消痈为主,从分子水平揭示了核心药物组合薏苡仁-冬瓜子治疗支扩的机制,为临床应用和药物开发提供理论基础。

关键词： 网络药理学   川芎   赤芍   冠状动脉粥样硬化性心脏病心绞痛   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学理念和技术研究川芎-赤芍药对治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)心绞痛的主要活性成分、靶点及生物学过程和通路。方法:通过TCMSP数据库检索出川芎和赤芍的主要活性成分、靶点信息,再通过GeneCards、OMIM、TTD数据库获取冠心病心绞痛的相关靶点信息,继而得到川芎-赤芍与冠心病心绞痛的交集靶点,采用Cytoscape 3.10.0软件构建中药-成分-靶点-疾病靶点网络,将获取的交集靶点信息通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选出核心靶点。利用David数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从川芎和赤芍中共筛选得到36个主要活性成分,其中川芎7个、赤芍29个,相关作用靶点共166个,筛选去重后得到76个,冠心病心绞痛的相关作用靶点共1213个,川芎和赤芍与冠心病心绞痛交集靶点共35个,核心靶点18个。GO功能富集分析结果显示主要涉及对外源刺激的反应、凋亡过程的负调控、细胞外区域、质膜、酶绑定、相同蛋白结合等生物过程,KEGG通路富集分析结果显示主要涉及癌症通路、流体剪切力与动脉粥样硬化、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白聚糖类、化学致癌作用-受体活化、血脂与动脉粥样硬化等信号通路。结论:本研究初步揭示了川芎-赤芍药对治疗冠心病心绞痛疾病的主要活性成分、靶点、生物学过程和通路,为进一步研究其药理学作用及临床应用提供参考依据。

关键词： UPLC-Q-TOF-MS   HS-GC-MS   网络药理学   胆汁制陈皮   化痰止咳   质量标志物   作用机制  

摘要： 目的:系统分析孟河医派特色饮片胆汁制陈皮的化学成分,探讨其化痰止咳的质量标志物和作用机制。方法:通过UPLC-Q-TOF-MS和HS-GC-MS技术对胆汁制陈皮进行定性分析并构建成分库,采用网络药理学技术筛选质量标志物,分析潜在作用机制,通过分子对接技术对结果进行验证。结果:通过UPLC-Q-TOF-MS鉴定得到67个化学成分,HS-GC-MS分析得到39个化学成分,共鉴定出106个化学成分。通过“药物-成分-靶点”网络筛选得到5个潜在质量标志物(Q-marker):黄柏酮、异橙黄酮、Naringenin、(+/–)-Naringenin及甜橙黄酮。通过分子对接筛选3个核心靶点:NOS3、EGFR、PTGS2。通过GO富集分析得到BP 502条,CC 85条,MF 146条,共计733条信号通路,KEGG富集分析得到162条信号通路。结论:该研究初步建立了胆汁制陈皮的化学成分库,明确了潜在Q-maker的裂解规律,探讨了其化痰止咳的作用机制,为胆汁制陈皮药效物质研究奠定了基础,为特色饮片的推广应用提供了科学依据。

关键词： 芹菜素   前列腺癌   生物信息学   网络药理学   分子对接   B细胞淋巴瘤因子-2   低氧诱导因子-1A   肿瘤坏死因子  

摘要： 目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制。方法 通过ETCM、HERB、HIT2.0及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌预测的疾病靶点,并检索GeneCards和OMIM数据库作为补充。应用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点。采用Metascape数据库进行富集分析,使用PyMOL、AutoDock Tools、AutoDock Vina软件以及PDB数据库进行分子对接。结果 共预测到236个芹菜素抗前列腺癌作用靶点,主要与激素反应、细胞死亡调控及激酶调节有关,且京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路与前列腺癌密切相关。筛选得到70个核心靶点,分子对接发现B细胞淋巴瘤因子-2(Bcl-2)、V-Jun肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、低氧诱导因子-1A(HIF-1A)、肿瘤坏死因子(TNF)、ERG、雌激素相关受体α(ESRRA)与芹菜素有良好结合力。结论 芹菜素通过多靶点和多通路实现抗前列腺癌作用。

关键词： 香蜂草苷   非酒精性脂肪肝   代谢组学   网络药理学   高分辨液相色谱—质谱   鞘脂代谢通路   胰岛素抵抗  

摘要： 目的:利用非靶向代谢组学联合网络药理学研究香蜂草苷改善非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)脂代谢的作用机制。方法:将大鼠随机分为正常组、模型组和香蜂草苷组。模型组与香蜂草苷组给予高脂饮食(HFD)8周诱导NAFLD动物模型。灌胃给药,连续8周。采用苏木精—伊红(HE)、油红染色观察细胞形态和脂质堆积情况。用高分辨液相色谱—质谱(UPLCQTOF/MS)对大鼠肝组织进行代谢组学检测,并利用KEGG数据库分析代谢通路。采用网络药理学对香蜂草苷与NAFLD共同作用的靶点进行预测,并联合代谢组学进一步分析潜在的靶点。结果:香蜂草苷明显减轻大鼠肝损伤、抑制肝脏脂质的过度沉积;正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)分析显示组间的代谢物有显著差异,火山图显示正常组与模型组存在404个差异代谢物(上调293个,下调111个),模型组与香蜂草苷组存在147个差异代谢物(上调95个,下调52个);代谢通路分析显示差异代谢物主要富集于鞘脂代谢通路;网络药理学筛选药物与疾病共同靶点共139个,联合代谢组学和网络药理学分析显示,香蜂草苷可通过调节TNF、Bcl2、Mapk8、Pik3ca、Akt1、mTOR、Gsk3β来调控鞘脂代谢通路和胰岛素抵抗。结论:香蜂草苷能够通过鞘脂代谢通路和胰岛素抵抗调节脂质代谢紊乱从而发挥治疗NAFLD的作用。

关键词： 冬虫夏草   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   分子对接   花生四烯酸   啤酒甾醇   β-谷甾醇   麦角醇  

摘要： 目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨冬虫夏草干预慢性阻塞性肺疾病的物质基础及作用机制。方法 通过TCMSP等数据库筛选冬虫夏草活性成分并预测其作用靶点。采用GeneCards、OMIM数据库筛选慢性阻塞性肺疾病靶点,合并后去重,与活性成分靶点取交集。运用String数据库构建交集靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape 3.8.2软件进行拓扑分析和可视化处理。采用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用SwissDock、Pymol软件进行分子对接验证。结果 筛选得到冬虫夏草14个主要活性成分,包括花生四烯酸、啤酒甾醇、β-谷甾醇、麦角醇、黄豆黄素、棕榈酸胆固醇酯、胆固醇、乙酸亚油酯、豆甾醇、过氧麦角甾醇、菜油甾醇、腺苷、D-甘露醇和麦角甾醇。冬虫夏草活性成分与慢性阻塞性肺疾病相关的交集靶点有91个,核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白p53(TP53)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、非受体蛋白酪氨酸激酶(SRC)等。GO和KEGG分析结果显示,冬虫夏草干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制主要涉及癌症通路、癌症相关蛋白聚糖、脂质和动脉粥样硬化通路、Ca2+信号通路、VEGF信号通路、TRP通道的炎症介质调节通路等。分子对接结果显示,冬虫夏草活性成分啤酒甾醇与核心靶点MMP9具有较高亲和力。结论 本研究发现冬虫夏草可能通过其有效成分花生四烯酸、啤酒甾醇、β-谷甾醇、棕榈酸胆固醇酯、乙酸亚油酯、腺苷、麦角甾醇等作用于TNF、TP53、CASP3、EGFR、MMP9、SRC等慢性阻塞性肺疾病相关靶点,通过调控癌症通路、癌症相关蛋白聚糖等发挥干预慢性阻塞性肺疾病的作用。