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关键词： 三阴性乳腺癌   网络药理学   白花蛇舌草  

摘要： 三阴性乳腺癌(TNBC)在乳腺癌中预后较差且治疗手段有限。本研究采用网络药理学方法,以白花蛇舌草为对象探究其对 TNBC 的抑制机制。结果 显示,白花蛇舌草的黄酮类、蒽醌类等多种化学成分对应多个活性成分靶点,与 TNBC 靶点交集后获得关键靶点如 ABCB1、ABCG2 等。其参与的生物学过程包括 icosanoid 代谢、跨上皮转运等,涉及 ABC 转运蛋白通路、化学致癌-DNA 加合物通路等信号通路。表明白花蛇舌草通过多成分、多靶点、多通路的协同作用对 TNBC 产生抑制效果,为 TNBC 的中医药治疗提供了科学依据与新思路,也为后续进一步研究其具体作用机制及药物研发奠定了基础。

关键词： 金藤清痹颗粒   网络药理学   膝骨关节炎   炎症因子   软骨损伤  

摘要： 目的基于网络药理学探讨金藤清痹颗粒对大鼠膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的影响及与促进线粒体自噬改善铁死亡的相关性。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库搜集金藤清痹颗粒的活性成分及靶点,利用人类基因数据库(Gene Cards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in Man,OMIM)等数据库搜集KOA及金藤清痹颗粒药物作用靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络和“中药-活性成分-靶点”网络。应用Autodock软件对筛选出的有效成分和关键靶点进行分子对接。将大鼠随机分为对照组、假手术组、模型组、双氯芬酸钠(5 mg/kg)组和金藤清痹颗粒高、中、低(5.4、2.7、1.4 g/kg)剂量组,各组ig相应药物,1次/d,给药4周后取材。ELISA检测白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、IL-6、肿瘤坏死因子α(tumornecrosisfactor-α,TNF-α)的含量;苏木素-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色评估软骨病理变化;蛋白免疫印迹(Western blotting,WB)法检测半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(cystein-asparate protease-1,Caspase-1)、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、磷酸酶及张力蛋白同源物诱导的蛋白激酶1(PTEN-induced putative kinase 1,Pink1)、帕金抗体(Parkinson disease,Parkin)、泛素结合蛋白(sequestosome 1,SQSTM1/p62)、膜铁转运蛋白1(ferroportin 1,FPN1)、谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)、酰基辅酶A合成酶长链家族成员4(acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4)、铁蛋白(ferritin)、转铁蛋白受体蛋白1(transferrin receptor protein 1,TFR1)、过氧化还原酶3重组蛋白(recombinant peroxiredoxin 3,PRDX3)的表达。结果数据库共检索到金藤清痹颗粒116种活性成分、268个作用靶点,共有靶点107个,关键靶点涉及NF-κB信号通路、线粒体自噬信号通路等;分子对接结果提示靶蛋白与小分子之间存在结合位点且结合能较低,提示有较强的结合活性。动物实验结果表明,与对照组比较,模型组大鼠IL⁃1β、IL⁃6、TNF⁃α水平显著升高(P<0.01、0.001);膝关节软骨病理组织增生明显;Pro-Caspase-1、p-NF-κB、NF-κB、p62、ASL4、TFR1、PRDX3表达量显著上升(P<0.05);Pink1、Parkin、FPN1、GPX4、ferritin表达量显著下降(P<0.05),自噬蛋白Beclin、LC3BII/I的值显著下降(P<0.05);与模型组比较,金藤清痹颗粒各组病理形态损伤减轻;IL-1β、IL-6、TNF-α,Pro-Caspase-1、p-NF-κB、NF-κB、p62、ASL4、TFR1、PRDX3、NCOA4显著降低(P<0.05);Pink1、Parkin、FPN1、GPX4、ferritin及自噬蛋白表达量Beclin、LC3BⅡ/Ⅰ显著升高(P<0.05)。结论金藤清痹颗粒可能与增强线粒体自噬,改善铁死亡,抑制NF-κB炎症信号等实现对膝骨关节炎的治疗。

关键词： 泽漆   肺癌   网络药理学   生物信息学  

摘要： 目的基于网络药理学与生物信息学,探究泽漆抗肺癌的物质基础及分子机制。方法通过TCMSP平台,以“泽漆”为关键词,检索药物的活性成分和相应靶标,整合GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank、TCGA数据库获取肺癌基因。将肺癌基因与药物靶点取交集得到“药物—疾病”靶点,并将其导入Cytoscape数据库构建PPI网络,经拓扑分析筛选出核心成分和核心靶标。使用ClusterProfiler包进行核心靶点的GO功能和KEGG通路富集分析。利用单因素COX回归筛选预后相关靶标。最后利用AutoDockVina和Gromacs 2023对预后靶点进行分子对接和分子动力学模型验证。结果通过匹配获得“药物—疾病”潜在靶标109个,对应9种活性成分,拓扑分析筛选出32个核心基因和5种核心成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素。GO分析和KEGG富集分析表明,泽漆通过T细胞增殖、B细胞活化、CD+4T细胞产生细胞因子等生物学过程中及TNF、P53、HIF-1等信号通路发挥抗肺癌作用。单因素COX分析发现6个预后相关靶点,CDK1、BIRC5、PPARG、IGFBP3、CAV1的表达与患者的不良预后相关,CAT可能是抑癌因素。分子对接和分子动力学模拟结果表明,泽漆核心成分与预后靶标蛋白具有良好的结合作用。结论泽漆可能通过山柰酚、柚皮素、木犀草素、槲皮素等核心成分作用于CDK1、BIRC5、PPARG、IGFBP3、CAV1、CAT6等靶点促进免疫激活,调控TNF、P53等信号通路发挥抗肺癌作用。

关键词： 糖尿病症状   药物治疗方案   慢性并发症   2型糖尿病   临床结局   生存质量   代谢性疾病   治疗学  

摘要： 2型糖尿病是一组由多病因引起的代谢性疾病,严重影响患者生存质量,增加病死率。2型糖尿病及其慢性并发症的规范化综合管理尤为重要,治疗以管控高血糖和相关代谢紊乱来逆转糖尿病症状及延缓慢性并发症等。2型糖尿病相关的个性化药物治疗方案以及中医药综合干预方案有利于改善2型糖尿病患者的临床结局。有关2型糖尿病的基础研究更加深入,临床循证证据不断提升,中西医协同发展更好结合,有效推动了2型糖尿病精准防治。

关键词： 地格达-8味散   胆汁淤积型肝炎   网络药理学   分子对接   炎症   生物信息学  

摘要： 目的 结合网络药理学和分子对接技术研究地格达-8味散治疗α-萘异硫氰酸酯(ANIT)诱导大鼠胆汁淤积型肝炎模型的机制。方法 建立ANIT致大鼠胆汁淤积型肝炎模型,观察地格达-8味散对大鼠胆汁淤积型肝炎的影响;利用Cytoscape软件建立“疾病-药物-靶点”网络,确定生物学过程和信号通路;结合生物信息学方法,对其中的活性物质和作用靶标进行分子对接,初步验证其作用机制。结果 地格达-8味散可治疗大鼠ANIT致胆汁淤积型肝炎,并改善肝脏病理损伤。网络药理学预测地格达-8味散主要成分对应565个靶基因,胆汁淤积型肝炎相关基因885个,二者共有靶点131个;其中,STAT3、TNF、TP53、AKT1、SRC、VEGFA、IL1B、CASP3、PIK3R1、MAPK8等为关键蛋白。地格达-8味散的主要化学成分能与预测的靶点良好对接。结论 地格达-8味散通过AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、流体切应力和动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子等信号通路发挥作用,且可能通过调控TNF、AKT1、TP53、SRC、STAT3蛋白起到防治胆汁淤积型肝炎的作用。

关键词： 杞菊地黄丸   失眠   抑郁症   焦虑症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接技术,探求杞菊地黄丸治疗失眠、抑郁症、焦虑症的药理作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选杞菊地黄丸的中药活性成分,在PubChem、SEA、SwissTargetPrediction、Batman-TCM数据库获取其作用靶点;在GeneCard、CTD数据库获取疾病作用靶点,利用UniProt数据库规范靶点名称。将杞菊地黄丸中药物与疾病的靶点取交集,导入STRING平台搭建蛋白互作(PPI)网络,使用基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.9.1软件构建“中药化学成分-作用靶点”网络图,最后进行分子对接试验。结果:检索到杞菊地黄丸中药物有效成分138个,作用靶点1682个,疾病靶点97个,交集靶点68个,其中CYP3A4、MAOA、NOS2、BAX、GSK3B、APP、VEGFA、IL-2、ABCB1、PARP1为核心疾病靶点,与活性成分山奈酚、槲皮素、7-O-甲基木犀草素-6-C-β糖苷等分子对接良好;GO功能富集分析得到生物过程586个、细胞组成77个、分子功能110个,其中生物过程包括对药物的反应、细胞对氮化合物的反应、细胞对有机氮化合物的反应等,细胞组成包括突触后膜、树突、树状突触等,分子功能包括神经递质受体活性、胺结合、5-羟色胺结合等;KEGG途径共292条,其中人类物种154条。GO功能及KEGG通路富集分析发现,杞菊地黄丸“异病同治”的传导通路主要涉及TNF信号通路、细胞凋亡、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路。结论:杞菊地黄丸通过一系列靶点和途径调节酶活性、激素水平、细胞凋亡,修复神经系统以及炎症,对失眠、抑郁症和焦虑症具有“异病同治”的作用。

关键词： 芍药苷   脂肪肝   炎症   网络药理学   分子对接  

摘要： 基于网络药理学、分子对接探讨芍药苷(paeoniflorin,PAE)治疗非酒精性脂肪肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的作用途径与靶点,并进行实验验证。采用油酸钠(sodium oleate,NaOA)诱导的HepG2脂肪肝细胞模型评价PAE体外药效;网络药理学预测和筛选出PAE治疗NAFLD核心靶点;通过分子对接和脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)诱导的RAW 264.7炎症细胞验证模型进行验证。体外脂肪肝细胞模型结果显示PAE可以缓解NaOA诱导的HepG2的脂质堆积;网络药理学结果显示,PAE治疗NAFLD共预测60个潜在靶点;蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析发现获得Degree值前10的靶点是肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)等;GO富集分析共涉及核心靶点可能通过白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)与核转录因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路等炎症信号通路发挥作用;分子对接结果显示:PAE与TNF、IL6、AKT等具有良好的结合力;LPS诱导的体外炎症RAW 264.7细胞模型结果显示,PAE可以抑制LPS诱导的RAW 264.7细胞增殖,降低TNF-α、IL-6、IL-1β、活性氧(reactive oxygen species,ROS)、超氧化物(O_(2)^(-·))、一氧化氮(nitric oxide,NO)的水平(P<0.05或P<0.01)。综上,PAE通过抑制细胞炎症与氧化应激,缓解脂质堆积。

关键词： 网络药理学   分子对接   先兆流产   固肾安胎丸  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接技术分析固肾安胎丸治疗先兆流产的潜在靶点通路及其作用机制。方法疾病靶点数据从Genecards数据库中获取,中药成分及靶点数据来源于TCMSP和Herb数据库,在Venn网站获取药物-疾病交集靶点;采用Cytoscape3.7.1软件绘制“中药-活性成分-交集靶点”网络图,采用R4.2.1软件进行基因本体(GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析;利用STRING数据库构建蛋白互作网络,导入Cytoscape3.7.1软件,基于CytoHubba插件获取核心靶点;利用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果获得固肾安胎丸治疗先兆流产靶点94个。主要通路有晚期糖基化终末产物(AGE)-糖基化终末产物受体(RAGE)、动脉粥样硬化、癌症、白介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路。分子对接结果示,度值排名前3位的成分槲皮素、刺槐素、山奈酚与白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、TNF、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、前列腺素-内过氧化物合酶2(PTGS2)对接结合能在-10.4~-6.6 kcal·mol^(-1),均具有良好的结合力。结论固肾安胎丸中的槲皮素、山奈酚、刺槐素可能通过调控MMP9、CASP3、TNF、PTGS2、IL-1β、IL-6等靶点来干预AGE-RAGE、动脉粥样硬化、癌症、IL-17、TNF等信号通路,实现降糖调脂、抗炎抗氧化的功能,达到保胎安胎的效果。

关键词： 金丝桃苷   糖尿病肾病   链脲佐菌素  

摘要： 目的:通过网络药理学及动物实验研究探讨金丝桃苷(Hyp)干预糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制。方法:利用TCMSP和Uniprot数据库预测Hyp相关靶点基因,GAD数据库得到DKD相关靶点基因名,通过Hyp靶点和DKD靶点相互作用关系PPI网络构建交集网络,Degree值筛选核心靶点,并使用DAVID数据库对Hyp的DKD保护作用靶点进行GO分析,预测Hyp干预糖尿病肾病的作用机制。8周龄C578L/6J雄性小鼠32只,随机选取8只为空白对照组(N组),使用普通饲料喂养,其余采用高脂联合链脲佐菌素(STZ)的方法建立DKD小鼠模型。造模成功小鼠随机分为模型组(M组)、金丝桃苷组[H组,200 mg/(kg·d)]和辛代他汀组[S组,5.2 mg/(kg·d)],每组8只,灌胃给药16周,每天1次。使用免疫组化和免疫印迹技术检测ERK1/2信号通路相关蛋白及下游炎症因子,从分子水平探讨Hyp对DKD的干预作用机制。结果:网络药理学分析得到核心靶点蛋白5个,对应的基因名称分别为TP53、ICAM-1、HSP90AA1、ESR1、EGFR,生物过程及信号转导通路20条(P<0.05),预测ERK1/2信号通路可能是Hyp干预DKD的主要通路之一。动物实验结果表明,与模型组相比,Hyp干预后金丝桃苷组小鼠肾脏组织中Ras/Raf/MEK/ERK1/2通路有关蛋白Ras、Raf、MEK、ERK1/2、p-ERK1/2蛋白表达减少,其下游炎症因子NF-κB、TNF-α、MCP-1和ICAM-1的表达也明显减少,差异具有统计学意义(P<0.01,P<0.05)。结论:Hyp可通过抑制Ras/Raf/MEK/ERK1/2信号转导通路的活化,进一步抑制下游炎性因子产生,保护肾脏,改善肾功能,延缓DKD的发生和发展。

关键词： 高校药理学   理论课   思政教育   网络教学  

摘要： 简要分析了思政教育与高校药理学理论课网络教学的必要性,如增强学生对树立正确职业道德观和价值观的意识、适应网络发展趋势、增强课程思政教育效果、满足个性化育人需求。从教学资源库建设、教学方式方法拓展、混合式教学模式实施、教学评价体系完善、个性化教学管理等维度,探讨高校药理学理论课网络教学中融入思政教育存在的问题以及相应的优化策略,以期为相关教师提供有益参考。