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关键词： 胶质母细胞瘤   知母皂苷AⅢ   基质金属蛋白酶   网络药理学   分子对接   中药研究  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和体外实验验证探索知母皂苷AⅢ(TIA)治疗胶质母细胞瘤(GBM)的潜在靶点及其信号通路。方法利用Pharmmapper数据库预测TIA的作用靶点,通过GeneCards数据库获得GBM相关的疾病靶点;通过STRING数据库得到交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,并使用Cytoscape 3.6.0软件进行筛选和分析;交集靶点通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用分子对接技术考察TIA与关键靶点的结合能力。最后,采用GBM细胞U-87MG、U251进行体外细胞实验,运用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞存活率、Transwell迁移测定实验检测细胞迁移能力,采用Western blot实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)实验及药物亲和反应的靶点稳定性(DARTS)实验等验证网络药理学分析结果。结果网络药理学预测结果显示,TIA作用靶点与GBM疾病靶点存在65个潜在共用靶点;GO分析结果主要集中在炎症应答、细胞增殖的正向调节等过程;KEGG富集分析显示,TIA通过免疫球蛋白G Fcγ受体(FcγR)介导的吞噬作用、谷胱甘肽代谢等信号通路发挥作用;分子对接分析结果显示,TIA与基质金属蛋白酶-2(MMP-2)的结合潜能最强。体外细胞实验结果显示,TIA呈选择性和剂量依赖性抑制人GBM细胞U-87MG和U251的体外增殖和迁移,并通过靶向亲和MMP-2,抑制其表达而发挥作用。结论TIA可能通过靶向结合MMP-2并抑制其表达而抑制GBM细胞的体外增殖和迁移。

关键词： 桃红四物汤   动静脉内瘘   网络药理学   分子对接   分子动力学模拟  

摘要： 动静脉内瘘(AVF)失功与血液透析患者的临床预后呈负相关。本研究旨在通过网络药理学探索桃红四物汤改善AVF通畅性的潜在机制,并通过分子对接及分子动力学模拟技术进行验证。通过TCMSP、TCMIP以及Swiss Target Prediction数据库获取桃红四物汤的活性成分及其潜在靶点,AVF失功相关的靶点则通过OMIM、Dis Ge NET及Gene Cards数据库筛选。利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络,并通过STRING平台构建蛋白质相互作用网络。GO与KEGG信号通路富集通过Metascape数据库实现。采用Auto Dock软件进行核心成分与疾病靶点的分子对接,并通过Py MOL实现图像可视化。利用GROMACS软件对核心成分-靶点复合物进行分子动力学模拟以验证其稳定性。共获得桃红四物汤66个活性成分与769个潜在靶点,以及疾病相关靶点87个,筛选的核心化学成分为gibberellin A120、gibberellin A30、kaempferola、paeoniflorin,主要作用靶点为TNF-α、IL6、VEGFA和MMP9。信号通路富集表明桃红四物汤改善AVF失功的潜在机制主要为减轻炎症、调节流体剪切应力、以及改善细胞外基质重塑。分子对接提示核心成分与治疗靶点能自发结合,分子动力学模拟同样证实成分-靶点复合物的稳定性。研究表明,桃红四物汤可能通过改善炎症、流体剪切力、以及细胞外基质重塑改善AVF通畅性,为桃红四物汤的临床应用提供了分子学基础。

关键词： 新三中心   以学为中心   药理学   教学模式  

摘要： 从“老三中心”(教师、教室、教材)向“新三中心”(学生、学习、学习效果)转变,已成为新时代高等学校“教与学”模式改革的主要方向。以药理学课程为例,文章遵循“新三中心”教学范式,研究如何设置学习目标主导、设计层层问题引导、组织团队活动任务、翻转虚-实实验课堂、评定多元学习成效,构建基于“新三中心”的、以“明学、引学、思学、用学、评学”为进阶流程的五步进阶教学模式,为推动“以学为中心”教学改革提供借鉴。

关键词： 芪丹糖肾颗粒   糖尿病肾病   网络药理学   作用机制   动物实验   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的探讨芪丹糖肾颗粒治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法通过TCMSP和HERB数据库获取芪丹糖肾颗粒的主要成分,利用SwissTargetPrediction数据库获得芪丹糖肾颗粒的作用靶点。通过OMIM,GeneCards,TTD数据库获得疾病作用靶点,采用Venny 2.1软件得到药物作用靶点和疾病作用靶点的共有靶点;使用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,使用STRING数据库对共有靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析,并使用Cytoscape软件的Network Analyzer功能分析芪丹糖肾颗粒治疗DN的核心成分和核心靶点。利用DAVID数据库对共有靶点进行基因本体论(GO)功能富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。以药理学实验验证DN模型大鼠中PI3K/Akt信号通路相关蛋白的表达情况。结果共检索出药物主要成分121个,药物作用靶点909个,疾病作用靶点997个,共有靶点107个,拓扑分析得药物治疗DN的核心成分17个。GO功能富集分析得相关功能条目825个,包括生物过程646个,细胞组分81个,分子功能98个,主要包括基因表达的正调控、细胞质膜、蛋白结合等。KEGG通路富集分析共得到通路147条,主要涉及癌症通路、AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路等。在药物作用下,DN模型大鼠肾组织匀浆中p-PI3K/PI3K及p-Akt/Akt蛋白表达水平均显著降低(P<0.05)。结论芪丹糖肾颗粒可经过多个作用靶点和多条信号通路干预DN,通过调控PI3K/Akt信号通路改善肾损伤可能是其作用机制之一。

关键词： 何首乌   网络药理学   抗氧化   抗肿瘤   HPLC法  

摘要： 目的基于网络药理学探究广东省不同产地的12批次何首乌主要活性成分EBYXG和蒽醌类化合物(大黄素、大黄素甲醚)的抗氧化和抗肿瘤活性机制,并通过测定化合物质量分数,对何首乌的质量进行评价。方法通过HPLC法测定12批次何首乌样品中EBYXG与大黄素、大黄素甲醚的质量分数。通过SwissTargetPrediction、SuperPred数据库筛选成分作用靶点,利用Uniprot进行校准。通过String数据库、Cytoscape3.7.2软件筛选核心靶点,绘制蛋白互作网络;通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析预测药物作用机制。利用AutoDock平台进行分子对接,预测药物作用靶点程度,结合细胞及抗氧化实验,验证网络药理学分析结果。结果12批何首乌样品中EBYXG、蒽醌类化合物含量分别在1.526%~3.936%、0.129%~1.390%。找到“成分-疾病”交集基因共179个。GO与KEGG富集分析结果显示EBYXG、大黄素、大黄素甲醚主要通过PI3K-Akt、HIF-1、MAPK、cAMP等信号通路发挥抗氧化、抗肿瘤作用。分子对接结果显示,活性成分可以与靶点蛋白中心相结合。抗氧化及细胞试验证明,12批次何首乌均具有良好的抗氧化、抗肿瘤活性。结论广东省不同产地何首乌中的主要有效成分EBYXG、大黄素、大黄素甲醚质量分数均达到2020年版《中华人民共和国药典》规定。基于网络药理学及药理试验证实何首乌可通过多成分、多靶点、多信号通路产生抗氧化、抗肿瘤的功效,为何首乌在抗肿瘤领域的应用提供参考。

关键词： SGLT2抑制剂   膳食干预   糖耐量   胰岛素敏感性  

摘要： 本研究通过随机、双盲、安慰剂对照的临床试验,探讨了新型SGLT2抑制剂达格列净和个性化膳食干预对糖耐量异常(IGT)患者的影响。结果显示,SGLT2抑制剂能显著提高糖耐量指数,优于膳食干预。两种方法均能改善胰岛素敏感性,SGLT2抑制剂通过减轻胰岛β细胞负担降低血糖,膳食干预则调节饮食模式。SGLT2抑制剂因其高安全性和有效性,具有推广应用的潜力。

关键词： 乳腺癌   黄芪补肾活血汤   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接预测黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicines systems pharmacology platform,TCMSP)、BATM-TCM数据库等筛选黄芪补肾活血汤主要活性成分以及相关靶点,通过Gene Cards数据库搜索乳腺癌相关基因并进行筛选,将黄芪补肾活血汤靶点与乳腺癌基因进行映射,利用Cytoscape 3.8.2软件构建中药-成分-靶点可视化网络,绘制蛋白互作网络及进行基因本体(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,筛选出核心基因。将黄芪补肾活血汤复方成分与关键靶点通过Swiss Dock网站进行分子对接验证。结果:黄芪补肾活血汤有效成分136个,潜在治疗靶点828个,其中76个是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的潜在靶点。在蛋白互作网络中发现TP53、VEGFA、MAPK8、JUN、EGF等可能是黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的关键靶点。通过GO、KEGG富集分析发现作用机制涉及的通路包括PI3K-Akt信号通路、肿瘤中的microRNAs、RNA聚合酶Ⅱ转录因子复合物肌膜、转录因子结合、G蛋白偶联胺受体活性、血红素结合、蛋白质结构域特异性结合、核受体活性、癌症中的转录调控异常、血管内皮生长因子信号通路等。通过分子对接验证显示,化合物槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、植物甾醇与关键靶点PGR、ADRB2、NR3C2、PREE1、SCN5A具有较好的结合能力。结论:通过网络药理学构建“药物-成分-靶点-信号通路”网络及分子对接技术验证,发现黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌主要是通过抗癌、抑制雌激素受体的表达、调节免疫等多通路、多靶点实现的,为临床治疗乳腺癌提供了更多的治疗方法,给临床用药提供了更多的选择。

关键词： ADDIE模型   药理学   课程思政   教学设计  

摘要： 目的 从课程论的认识层面出发,使用ADDIE教学模型对药理学教学过程进行设计,充分融入思政元素,创新药理学课程思政教学体系。方法 利用ADDIE教学模型,按照教学目标设计、教学策略运用、教学评价实施三个过程,对教学内容、教学模式和考核方式进行重构,深挖药理学课程中的思政元素,进行润物无声地融合。结果 构建了三位一体的药理学课程思政教学体系,积极发挥药理学思政的育人功效。结论 基于ADDIE教学模型构建的药理学课程思政教学体系能够提升教学和育人效果。

关键词： 补肾培元汤   指纹图谱   网络药理学   质量标志物  

摘要： 目的:基于指纹图谱和网络药理学,预测补肾培元汤潜在的质量标志物成分。方法:运用高效液相色谱法建立10批补肾培元汤指纹图谱,指认并归属其共有峰,进行相似度评价和聚类分析,评价不同批次样品间质量差别,基于化学成分有效性,可测性和网络药理学对其潜在的质量标志物预测分析。结果:指纹图谱共确认43个共有峰,指认12个共有峰,包括绿原酸、芦丁、山柰酚、苦杏仁苷、京尼平苷酸、大黄酚、大黄酸、芦荟大黄素、京尼平龙胆双糖苷、积雪草苷、槲皮素、毛蕊异黄酮,并且其相似度均大于0.9,样品可聚为2类,通过网络药理学预测可知,12个成分能通过RELA、MMP3和GSK3B等多个靶点调控癌症,肾病,粥样硬化等多条通路。结论:预测绿原酸、芦丁、山柰酚、苦杏仁苷、京尼平苷酸、大黄酚、大黄酸、芦荟大黄素、京尼平龙胆双糖苷、积雪草苷、槲皮素、毛蕊异黄酮12个化学成分可作为潜在的质量标志物,以期为补肾培元汤质量控制及后续的研究提供参考。

关键词： 网络药理学   GEO差异基因芯片   芦丁   脊髓损伤   分子对接   体内实验  

摘要： 为了探究芦丁治疗脊髓损伤的作用机制,基于网络药理学和GEO差异基因芯片数据分析,结合体内实验,筛选芦丁对脊髓损伤的作用靶点.首先通过TCMSP、Swiss Target Prediction和SuperPred数据库获得芦丁的作用靶点,同时采用GEO差异基因、CTD、OMIM、PharmGkb疾病数据库获取脊髓损伤的疾病靶点;然后应用Cytoscape软件采用蛋白互作的方式筛选芦丁治疗脊髓损伤的核心靶点,并采用R语言对核心靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析;最后采用Rutgers MASCIS脊髓损伤撞击器建立大鼠急性脊髓损伤模型,芦丁干预3 d后采用BBB运动评分法对大鼠后肢运动功能进行评价,采用酶联免疫吸附测定法检测脊髓中炎症因子TNF-α、IL-6、IL-1β和NF-κB的表达水平以及ROS和MDA含量.结果发现:(1)芦丁共有56个对应的蛋白靶点,脊髓损伤筛选到4 624个疾病靶点,合并后得到5个核心靶点,即CASP3、ESR1、GSK3B、IL-6、MTOR;(2) GO功能主要集中在对氧化应激的反应、活性氧代谢过程、NF-κB结合等,KEGG通路分析显示,芦丁治疗脊髓损伤相关的通路包括PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路等;(3)分子对接实验和分子动力学模拟表明,芦丁与5个核心靶点均有良好且稳定的结合;(4)体内实验结果显示,脊髓损伤后使用芦丁进行药物干预处理可以降低脊髓的含水量,减少炎性因子和氧化应激因子的产生.上述结果证实,芦丁可以通过多个靶点以及多条通路在治疗脊髓损伤中发挥抗炎和抗氧化作用.