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关键词： 编辑部主任   中国药理学会   药源性疾病   副总编辑   名誉主任委员   工作会议纪要   张永祥   专委会主任  

摘要： 《药物不良反应杂志》(本刊)第六届编辑委员(编委)会、中国药理学会药源性疾病学第二届专业委员会(DID专委会)及合理用药国际网络中国中心组临床安全用药组(INRUD临床安全用药组)联席工作会议于2024年5月24日在广州成功召开。出席会议的有中国药理学会张永祥理事长,本刊编委会名誉总编辑、DID专委会名誉主任委员、INRUD临床安全用药组名誉组长王育琴教授,本刊编委会顾问、总编辑、副总编辑、编委、通讯编委和青年编委,DID专委会主任委员、副主任委员、秘书长、副秘书长、所属分委会主任委员,INRUD临床安全用药组组长和专家,本刊编辑部主任孟艳博士和部分工作人员等50余人。

关键词： 酒精性股骨头坏死   补肾通蚀丸   基因测序   网络药理学  

摘要： 目的:通过网络药理学联合基因测序技术探讨补肾通蚀丸治疗酒精性股骨头坏死的潜在分子作用机制。方法:从中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)与BATMAN数据库中寻找补肾通蚀丸组成中药的活性有效成分和作用靶点。提取3名酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者外周血进行基因测序,利用R语言软件中的“DESeq2”包筛选具有差异表达的信使核糖核酸(Msessenger RNA,mRNA)。通过perl软件将基因测序获得的差异基因与药物靶基因取交集,剔除重复有效成分,获得本研究的关键基因及其对应的有效成分。将关键基因及其对应的有效成分导入Cytoscape3.8.0软件中构建成分-靶点网络。利用STRING在线数据库和R语言软件筛选出度(Degree)值得分前10的关键基因。对获得的关键基因进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。Degree值前2的目标基因与其对应的有效成分进行分子对接验证。结果:基因测序共获得921个差异表达基因。补肾通蚀丸共获得483个药物靶基因,74个不重复有效成分,两者交集共获得27个关键基因。半胱氨酸蛋白酶(Caspase,CASP)9和胰岛素样生长因子结合蛋白3(Insulin Like Growth Factor Binding Protein 3,IGFBP3)是本次实验获得的目标基因,β-谷甾醇、槲皮素、β-胡萝卜素、木犀草素和川陈皮素是其对应的有效成分。GO结果表明关键基因生物学过程涉及白细胞凋亡过程、血小板活化和对皮质类固醇的反应;KEGG结果表明关键基因富集在卵巢类固醇生成信号通路。分子对接显示CASP9和IGFBP3与其对应的有效成分结合良好。结论:补肾通蚀丸是通过β-谷甾醇、槲皮素、木犀草素和川陈皮素等有效成分,抑制CASP9和IGFBP3靶点蛋白的表达,调控卵巢类固醇生成通路,参与骨代谢,调节骨稳态,促进血管生成和抑制炎症因子表达,发挥治疗酒精性股骨头坏死的作用。

关键词： 黄芪   川芎   瘢痕   网络药理学  

摘要： 基于网络药理学探讨黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的作用机制。通过TCMSP数据库筛选出黄芪和川芎的有效成分及其靶点,同时使用OMIM、GeneCards和DrugBank数据库获取得到黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的潜在交集靶点。采用Cytoscape3.7.0软件构建中药-有效成分-靶点-疾病网络,并通过STRING数据库构建PPI网络,利用微生信网站进行KEGG富集分析及GO功能分析可视化,再佐以分子对接验证。结果显示,共筛选得到川芎有效成分7个,对应靶点42个;黄芪有效成分20个,对应靶点462个;瘢痕靶点2216个。黄芪-川芎配伍治疗瘢痕的关键成分有槲皮素和山柰酚等;治疗瘢痕的关键靶点是TP53和白细胞介素6等。KEGG富集分析结果表明,黄芪-川芎主要与IL-17信号通路和TNF信号通路有关。分子对接表明,黄芪-川芎主要活性成分槲皮素、山柰酚和杨梅酮与关键靶点AKT1、IL6和TNF具有良好的稳定性。本文基于网络药理学和分子对接验证研究表明,黄芪和川芎可能通过多成分、多靶点和多通路来治疗瘢痕。

关键词： 人参   网络药理学   阿霉素   心脏毒性  

摘要： 目的:该研究运用网络药理学的方法,筛选出人参有效成分及其对应靶点和阿霉素心脏毒性的靶点,结合人参治疗阿霉素心脏毒性的潜在靶点与GO和KEGG通路分析,探讨人参治疗阿霉素心脏毒性的作用机制。方法:通过TCMSP、GeneCards和pharmGKB数据库检索得到人参有效成分及其靶点和阿霉素心脏毒性靶点。将所得人参靶点与阿霉素心脏毒性靶点进行venn分析,得到交集靶点。将获得的交集靶点导入STRING数据库构建人参治疗阿霉素心脏毒性靶蛋白PPI网络,再将交集靶点导入DAVID数据库进行GO分析及KEGG信号通路分析。结果:得到人参有效成分17个,对应靶点114个,阿霉素心脏毒性靶点532个,PPI网络分析得到人参治疗阿霉素心脏毒性核心靶点5个,分别为AKT1、CASP3、PTGS2、TNF以及BCL2。GO富集分析得到生物过程(BP)中凋亡过程的正调控、对脂多糖的反应、上皮细胞凋亡过程和神经元凋亡过程的正调控等155个条目;细胞组分(CC)中在胞质、细胞质、质膜和胞核等9个条目;分子功能(MF)中在蛋白结合、蛋白同源二聚体化活性、血红素结合和酶结合等27个条目。KEGG通路富集分析主要涉及脂质和动脉粥样硬化、癌症途径、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等94条。结论:人参治疗阿霉素心脏毒性的作用机制,可能是通过多靶点和多通路来实现的。

关键词： 非酒精性脂肪性肝炎   三七   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学研究方法探索三七治疗非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的作用机制。方法:通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库收集三七的有效成分及其靶点,运用GeneCards数据库筛选NASH疾病靶点基因;通过Venny 2.1.0在线作图工作平台获取三七成分靶点与疾病靶点的交集图,通过Cytoscape 3.7.2软件构建三七-活性成分-靶点网络;通过STRING 12.0数据库构建PPI蛋白网络,筛选核心靶点基因;通过David数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果:通过筛选共获得三七有效成分8个,药物靶点基因338个,疾病靶点基因729个,共取得交集靶点基因75个。GO功能富集分析得出三七主要参与RNA聚合酶II启动子转录的正向调节、RNA聚合酶II启动子转录的负调节、细胞质、蛋白质结合等多种生物过程。KEGG通路分析得出癌症的通路、PI3K-Akt信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等20条与之密切的相关通路。结论:三七通过多靶点、多途径发挥其治疗非酒精性脂肪性肝炎的作用。

关键词： 黄连   慢性牙周炎   牙龈卟啉单胞菌  

摘要： 目的为了探究黄连治疗牙龈卟啉单胞菌相关性慢性牙周炎作用机制,本研究利用网络药理学方法分析黄连的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对黄连的药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库收集疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape3.6.1软件以及String数据库分别构建“药物-化合物-潜在靶点”相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果黄连中槲皮素、小檗碱和小檗红碱等9种药物是黄连治疗牙龈卟啉单胞菌相关性慢性牙周炎的活性化合物,其作用机制涉及IL-1β、IL-6等47个潜在靶点以及TNF-α信号通路。经生物信息学验证,最终筛选出5个在牙周炎患者牙龈组织中上调的靶点,其中以黄连碱的结合能最低。结论黄连治疗慢性牙周炎伴牙龈卟啉单胞菌感染,是通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控炎症进展的作用,这为使用传统中药治疗慢性牙周炎奠定一定的理论基础。

关键词： 麻杏石甘汤   COVID-19肺炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接研究方法探讨麻杏石甘汤干预COVID-19肺炎的作用机制。方法:经TCMSP、HTDocking数据库检索麻杏石甘汤所有药物的成分并进行ADME筛选得到活性成分,在Uniport数据库检索其发挥治疗作用可能的基因靶点;借助GeneCards、PharmGKB等数据库检索COVID-19肺炎相关基因靶点,利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶基因-疾病网络;借助String系统构建PPI网络,并进行拓扑学特征分析,筛选核心基因;利用R语言的clusterProfiler包对核心基因进行GO、KEGG富集分析;利用AutoDock Vina软件对疾病靶蛋白及药物活性成分进行分子对接验证。结果:共筛选出麻杏石甘汤与COVID-19肺炎交集基因靶点67个。PPI网络分析显示,其发挥治疗作用的核心基因靶点有MAPK1、MAPK3、STAT1、JUN等8个。GO富集分析显示,相关生物过程1863个,分子功能95个,细胞成分36个;KEGG富集分析显示,相关作用通路167条。分子对接结果显示,麻杏石甘汤活性成分槲皮素、山奈酚、熊果酸等与核心基因靶点JUN、MAK1、IL2等有较好的结合活性。结论:麻杏石甘汤可能以槲皮素、山奈酚等为物质基础,多成分、多靶点、多通路、相互协同发挥抑制病毒活性,降低炎症反应,保护肺部组织,从而对COVID-19肺炎起到积极的干预作用。

关键词： 中药方剂   经间期出血   角药   女贞子   墨旱莲   地黄  

摘要： 探究中药治疗经间期出血的用药规律及角药“女贞子-墨旱莲-地黄”治疗经间期出血的作用机制。以CNKI数据库为数据来源,检索中药治疗经间出血的临床文献,采用Excel 2016、IBM SPSS Modeler 18.0、IBM SPSS Statistics 24软件对处方统计处理、关联规则与聚类分析。通过TCMSP、Gene Cards数据库检索核心药物成分靶点及疾病相关靶点,利用Venny平台获取疾病与药物的交集靶点,通过String数据库和Cytoscape 3.7.0软件构建蛋白互作网络关系,应用AutoDockTools-1.5.6软件进行分子对接验证。结果:筛选处方76首,涉及185味中药,其中温、寒性,甘、苦味,归肝经的中药比例较高。相关分析提示“墨旱莲-女贞子-地黄”关联度较高,位居核心地位;网络药理学结果提示苏丝氨酸特异性蛋白激酶1(AKT1)、基质金属蛋白酶2(MMP2)、完全纤溶酶原激活物抑制剂1(SERPINE1)等,槲皮素、木犀草素、阿魏酸甲酯等是该角药治疗经间期出血的关键靶点与有效成分,分子对接结果提示部分有效成分与核心靶点SERPINE1结合较为稳定。中医治疗该病遵从“清热滋阴、凉血止血”的原则,角药“女贞子-墨旱莲-地黄”通过干预AKT1、MMP2、SERPINE等靶点进而治疗经间期出血。

关键词： 关节炎,类风湿   骨破坏   数据挖掘   中医药   作用机制  

摘要： 目的探究中医药治疗类风湿关节炎骨破坏的规律,预测核心中药组合的药理机制。方法2022年12月至2023年2月,通过搜索中国知网(CNKI)、万方(Wanfang)、维普(VIP)、PubMed数据库中关于中医药改善类风湿关节炎骨破坏的文献,建立处方数据库,统计出处方中药的性、味、归经和功效类别;通过关联规则分析确定核心药物组合;通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot、GeneCards、DrugBank等数据库获取核心药物和疾病的靶点信息,并统计出交集靶点;通过对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、基因本体(GO)功能分析和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析预测核心中药的作用机制;最后,通过分子对接法反向检验关键靶点和中药成分的关系。结果纳入78首方剂,涉及137味中药,以补虚药和祛风湿药为主,多性温,味苦、甘,归肝、肾经。关联规则结果表示“甘草-防风-白芍”为具有强关联性的核心药物组合,其主要成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、刺芒柄花素等。PPI分析得到信号转导及转录活化因子3(STAT3)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、转录因子p65(RELA)、蛋白激酶B(AKT)1、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等为关键靶点。KEGG结果表示白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路可能与类风湿关节炎骨破坏相关。分子对接结果表示关键靶点与药物主要成分的对接活性较好,其中山柰酚与TP53具有最低的结合能,对接活性最好。结论中医药改善类风湿关节炎骨破坏以补益肝肾,祛风除湿为主。“甘草-防风-白芍”为核心药物组合,其作用机制以改善炎症、调整免疫、改善骨代谢过程为主。

关键词： 网络药理学   鱼腥草   急性肺损伤   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学去探究鱼腥草治疗急性肺损伤的作用机制。方法:首先,通过TCMSP、Swisws Target Prediction数据库查找鱼腥草的有效成分,并利用Uniport数据库将有效成分转化为基因靶点;然后通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取急性肺损伤疾病的靶点,再将两者基因相交,筛选得到共同的基因靶点,并用Venny绘图,再使用Cytoscape去构建中药–疾病–成分–靶点的网络图,并从STRING数据库分析并筛选获得相同靶点蛋白–蛋白相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape软件分析绘制PPI网络图,运用cytoHubba的Degree算法,筛选关键基因靶点,建立关键基因靶点的网络模型。同时,使用微生信在线平台去进行富集分析,分析潜在靶点的基因功能以及信号通路,从而从系统生物学整体水平揭示鱼腥草潜在有效成分和作用机制。结果:结果分为三部分:成分、靶点和途径。在成分方面,发现鱼腥草的5种活性成分,其中槲皮素、山奈酚是主要活性成分。共发现132个靶点,其中128个主要靶点和ALI共同拥有。此外,鱼腥草治疗ALI的主要通路是Pathways in cancer信号通路、Lipid and atherosclerosis信号通路、AGE-RAGE信号通路等。结论:由于鱼腥草的多组分、多靶点和多通道功能,本研究通过网络药理学初步揭示了鱼腥草治疗ALI的潜在调节网络。为合理开发利用鱼腥草植物资源、保护和发展民族医药文化提供研究依据。