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关键词： 肺纤维化   人参平肺方   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学探讨人参平肺方治疗肺纤维化(PF)的作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取人参平肺方的活性成分,采用Swiss Target Prediction检索活性成分对应靶点;采用疗效药靶数据库(TTD)、DrugBank数据库筛选PF相关靶点,将活性成分对应靶点及疾病相关靶点取交集得到人参平肺方抗PF的潜在靶点,并利用UniProt数据库校正靶点名称;运用Cytoscape 3.9.0构建“药物-成分-靶点”网络;并对潜在靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 筛选出药物和疾病交集靶点50个;“药物-成分-靶点”网络识别出槲皮素、山奈酚及β-谷甾醇等关键活性成分10个,得到前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、β_(2)肾上腺素能受体(ADRB2)等核心靶点14个;GO富集分析得到条目352个;KEGG通路富集分析得到磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等115条信号通路。结论 人参平肺方可通过多成分、多靶点、多途径发挥抗PF的作用。

关键词： 参芪抑瘤方   胃癌癌前病变   网络药理学   TLR4/NF-κB通路   Th17/Treg  

摘要： 目的基于网络药理学与动物实验探讨参芪抑瘤方对胃癌癌前病变的影响。方法通过TCMSP数据库获取参芪抑瘤方有效成分和作用靶点,通过GeneCards数据库获取胃癌癌前病变相关靶点,Cytoscape 3.10.0软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,通过STRING数据库建立PPI网络,进行GO功能和KEGG通路富集分析。SD大鼠随机分为空白组、模型组、叶酸组(2 mg/kg)和参芪抑瘤方高、中、低剂量组(37.5、18.75、9.38 g/kg),每组10只,采用复合慢性损伤因素造模法构建胃癌癌前病变模型。观察大鼠一般情况变化,HE染色观察大鼠胃组织形态变化,ELISA法检测大鼠胃组织IL-6、IL-17A、TGF-β水平,RT-qPCR法和Western blot法检测大鼠胃组织TLR4、MyD88、NF-κB、FOXP3、RORγt mRNA和蛋白表达。结果共获得参芪抑瘤方与胃癌癌前病变交集靶点137个,涉及79种活性成分,KEGG通路富集分析结果表明,参芪抑瘤方可能通过Toll样受体信号通路作用于胃癌癌前病变。与空白组比较,模型组大鼠胃黏膜结构排列紊乱,显微镜下可见肠上皮化生,上皮细胞异型以及细胞核的增大、拉长,胃组织IL-17A,IL-6水平和TLR4、MyD88、NF-κB、RORγt mRNA和蛋白表达升高(P<0.05),TGF-β水平和FOXP3 mRNA和蛋白表达降低(P<0.05);与模型组比较,各给药组大鼠胃黏膜腺体异常改善,参芪抑瘤方各剂量组大鼠胃组织IL-17A、IL-6水平降低(P<0.05),各给药组大鼠胃组织TGF-β水平和FOXP3 mRNA表达和蛋白表达升高(P<0.05),TLR4、MyD88、NF-κB、RORγt mRNA和蛋白表达降低(P<0.05)。结论参芪抑瘤方可能通过抑制TLR4/NF-κB信号通路,调控Th17/Treg免疫平衡轴,进而减轻胃癌癌前病变大鼠胃组织的炎症反应,改善生存状况。

关键词： 鬼箭羽-夏枯草   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接技术   β-谷甾醇  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨鬼箭羽-夏枯草药对治疗糖尿病肾脏病的潜在作用机制。方法:首先在TCMSP、SwissTargetPrediction数据库中获取鬼箭羽-夏枯草主要活性成分及对应靶点,然后在GeneCards、OMIM及DisGeNET数据库中获取糖尿病肾脏病相关靶点,利用Venny作图工具筛选出药对与疾病交集靶点。接着在String数据库中对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络构建,通过DAVID数据库对交集靶点进行GO及KEGG富集分析并构建“药物活性成分-靶点-通路图”。最后在AutoDock及Pymol软件中对主要活性成分及交集靶点进行分子对接和可视化分析。结果:鬼箭羽-夏枯草的主要活性成分为β-谷甾醇、山奈酚、槲皮素,作用于AKT1、EGFR、SRC、BCL2等核心靶点,主要影响PI3K-Akt信号通路及其他细胞凋亡与自噬相关通路对糖尿病肾病起治疗作用。结论:鬼箭羽-夏枯草可通过多成分、多靶点、多通路治疗糖尿病肾病。

关键词： 锁阳   阿尔茨海默病   研究进展  

摘要： 锁阳作为我国传统中药,在临床中具有广泛的用途,化学、药理等多学科综合研究加深了人们对它的认识。锁阳及其提取物表现出一定的有益健康功能,吸引了更多的患者和药学研究者的关注,它具有广泛的体外和体内药理活性,包括抗疲劳、抗缺氧、抗氧化、抗糖尿病、免疫调节、抗病毒等作用。目前也常用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的临床治疗,在防治AD的研究中发现,锁阳可调控MAPK/ERK1/2等信号通路的表达,改善学习记忆能力;改善胰岛素信号通路,减少淀粉样蛋白β(Aβ)的积累;可降低海马组织损伤;促进神经元突触重塑;也可调节神经中胆碱能系统;延长脑组织细胞染色体末端端粒长度及血细胞端粒长度,起到抗衰老作用;也可通过对丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的调节发挥类雌激素作用等。锁阳通过多途径、多靶点共同作用,在神经退行性疾病AD防治中具有极大的潜在研究价值。该文总结了近年来锁阳防治AD的相关研究,以期为其开发和使用提供一定参考。

关键词： 宫瘤宁胶囊   指纹图谱   网络药理学   含量测定   质量标志物  

摘要： 目的建立10批宫瘤宁胶囊UPLC指纹图谱及10种主要成分的含量测定方法,并进行网络药理学研究,为预测宫瘤宁胶囊的质量标志物(Q-marker)提供依据。方法应用UPLC-DAD技术建立宫瘤宁胶囊样品指纹图谱,获取宫瘤宁胶囊完整的化学成分信息。借助网络药理学研究技术手段,对多个数据库筛选得到的宫瘤宁胶囊化学成分作用靶点与相关通路进行预测分析,构建蛋白相互作用网络、成分-靶点-通路网络,预测宫瘤宁胶囊功效成分。基于获得的药效物质建立宫瘤宁胶囊含量测定方法,用于评价宫瘤宁胶囊的质量。结果宫瘤宁胶囊指纹图谱指认17个共有峰,结合网络药理学方法对候选化学成分进行分析,筛选获得10个核心靶点,42条代谢通路。基于成分可测性和对照品的可获得性,选择贡献度较高的10个化合物进行含量测定,方法学验证结果表明10个被测化合物在检测范围内均具有良好的线性关系(r2>0.9994),精密度、准确度和稳定性均良好。结论建立的宫瘤宁胶囊UPLC指纹图谱、网络药理学及多成分含量测定方法的专属性强,准确、可靠,结合化学模式识别可有效用于宫瘤宁胶囊质量控制及质量标志物预测。

关键词： 网络药理学   桑黄总黄酮   高尿酸血症   炎症   尿酸转运蛋白  

摘要： 目的基于网络药理学和实验验证探究桑黄总黄酮(total flavonoids of Phellinus igniarius,TFPI)抗炎、降尿酸的作用机制。方法通过TCMSP和TCMID数据库筛选桑黄活性成分和有效靶点,使用DisGeNET数据库进行高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)疾病靶点筛选,取交集靶点使用STRING数据库构建蛋白相互作用网络,采用Metascape数据库进行基因本体(GO)及京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析,利用微生信进行可视化处理。构建尿酸钠(monosodium urate,MSU)晶体诱导的HK-2细胞损伤模型,给予TFPI干预。通过氧化敏感探针(DCFH-DA)检测细胞活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平,酶联免疫法(ELISA)检测炎症因子,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blotting检测基因和蛋白表达水平,对部分网络药理学结果预测结果进行实验验证。结果网络药理学结果表明,TFPI治疗HUA的关键靶点涉及白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)和Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)、NLRP3及核因子κB(nuclear factorκB,NF-κB)。与模型组相比,TFPI处理可有效抑制MSU诱导的HK-2细胞凋亡,降低细胞内ROS荧光水平,降低细胞上清液中IL-6、IL-1β、IL-18和TNF-α含量;Western blotting结果显示,TLR4、NLRP3、ASC、Caspase-1、NF-κB、YAP、TAZ、ABCG2和OAT1的蛋白相对表达水平均显著下降,β-TRCP和URAT1蛋白相对表达水平显著增加;qRT-PCR结果表明,ABCG2和OAT1的mRNA的表达显著增加,URAT1的mRNA的表达显著下降。结论研究证实了网络药理学的部分预测结果,表明TFPI通过多成分、多靶点、多通路的途径发挥抗炎、降尿酸作用,为临床应用提供了科学依据。

关键词： 竹沥   卒中   治疗   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学探讨鲜竹沥辅助治疗脑卒中的作用机制。方法基于查阅文献汇总的鲜竹沥中的化学成分和TCMSP数据库中的化学成分合并去重后参考类药五原则——Lipinski规则过滤;在PubChem数据库下载获得相应结构文件;应用Seaware软件、Swiss Target Prediction在线工具预测化学成分对应靶点;通过GeneCards、OMIM数据库检索脑卒中疾病相关靶点;通过String数据库分析92个潜在脑卒中疾病靶标的相互作用,获得靶标之间的蛋白质互作网络;通过DAVID数据库对竹沥治疗脑卒中的潜在作用靶点进行基因本体、京都基因与基因组百科全书分析。结果鲜竹沥的预测靶点与脑卒中的疾病靶点取交集得到92个共同靶点,其中甘油醛-3-磷酸脱氢酶、白细胞介素6、丝氨酸/苏氨酸激酶1、表皮生长因子受体等靶标有可能是竹沥治疗脑卒中的核心靶点,Cassyformin、桃醛、对甲氧基苯酚度值较高,分子对接所需能量较低,可能是鲜竹沥辅助治疗脑卒中的关键化合物。结论利用网络药理学和分子对接对鲜竹沥发挥治疗“中风舌强”功效的活性成分、靶点、信号通路进行初步探索,可为阐明鲜竹沥发挥功效机制、开发治疗脑卒中新药提供参考。

关键词： 黄芪桂枝五物汤   奥沙利铂   周围神经病变   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨“黄芪桂枝五物汤”治疗奥沙利铂致周围神经病变(oxaliplatin-induced peripheral neuropathy,OIPN)的作用机制。方法:利用Traditional Chinese Medicine System Pharmacology(TCMSP)数据库、Swiss Target Prediction数据库、Therapeutic Target Database(TTD)数据库、Traditional Chinese Medicine Information Database(TCMID)数据库及查阅相关文献筛选黄芪、桂枝、芍药、生姜、大枣活性成分和相关靶点,通过UniProt数据库进行靶点标准化;运用Cytoscape(V3.9.1)软件构建活性成分-靶点网络;通过GeneCards数据库检,OIPN相关基因;利用STRING数据库构建蛋白互作网络图;通过R语言软件(V3.6.1)和Bioconductor数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)生物学功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;最后通过分子对接技术将核心活性成分与核心靶点进行对接。结果:筛选后得到黄芪桂枝五物汤共141个活性成分,196个药物靶点,核心靶点有TNF、IL6、IL1B、AKT1、CXCL12等;GO分析得到233个相关生物过程,KEGG分析得到112条信号通路,分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有较好的结合能。结论:“黄芪桂枝五物汤”通过多个靶点、多条通路来发挥治疗奥沙利铂致周围神经病变的作用,为“黄芪桂枝五物汤”的临床应用及相关疾病的临床研究提供理论依据。

关键词： 虫草菌丝   心脏衰老和损伤   网络药理学   氧化应激   细胞凋亡   Nrf2/HO-1/NF-κB通路  

摘要： 借助动物实验和网络药理学,探究虫草菌丝(Cordyceps sinensis,CS)在体内改善小鼠心脏衰老和损伤的作用及机制。实验研究采用D-半乳糖(D-galactose,D-gal)连续皮下注射建立心脏衰老小鼠模型,30只小鼠随机分成正常组、模型组、CS低剂量(CS-low,CS-L)组、CS高剂量(CS-high,CS-H)组和维生素E(vitamin E,VE)组,在实验期间,每天经灌胃分别给予生理盐水、不同剂量CS混悬液或VE混悬液。在D-gal和不同药物联合干预60 d后,处死全部小鼠,收集血液及心脏组织,进而针对小鼠心脏衰老和损伤相关的各项指标进行检测和观察。实验结果显示,高、低剂量的CS和VE都能不同程度地改善模型小鼠衰老表型、心脏指数、心肌酶谱、细胞周期阻滞蛋白和衰老相关分泌表型(senescence-associated secretory phenotypes,SASP)蛋白表达水平、心脏组织纤维化水平和心脏组织病理学特征。进一步开展网络药理学分析,采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获取CS活性成分259个,根据Gene Cards、OMIM数据库获取心脏衰老相关靶点2568个,得出CS与心脏衰老交集靶点133个。通过靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进一步分析,发现与心脏衰老相关的通路涉及氧化应激、凋亡、炎症相关信号通路等。故进一步实验验证发现,高、低剂量的CS和VE都能不同程度地改善模型小鼠心脏组织氧化应激和细胞凋亡程度。此外,CS-H和VE能激活模型鼠核因子E2相关因子2(nuclear factor E2-related factor 2,Nrf2)/血红素加氧酶-1(heme oxygenase-1,HO-1)通路和抑制核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路关键信号分子蛋白表达水平。总之,该研究基于网络药理学分析和实验证实,CS可能通过调控Nrf2/HO-1/NF-κB通路活性,减轻衰老小鼠心脏氧化应激、细胞凋亡和炎症反应水平,进而减轻心脏衰老和损伤。

关键词： 三子养亲汤   网络药理学   非小细胞肺癌   全国名老中医  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨三子养亲汤治疗非小细胞肺癌的作用机制。方法:运用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)收集三子养亲汤的主要化学成分,根据药物口服利用度和类药性筛选药物活性成分,并获取对应靶点;从Drugbank、GeneCards和OMIM数据库获取非小细胞肺癌(NSCLC)的相关靶点,并去除重复值,使用STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;利用Cytoscape3.7.1构建“三子养亲汤-非小细胞肺癌靶点-通路”网络。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用微生信平台对三子养亲汤与NSCLC共同靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:获得106个三子养亲汤药物靶点,4083个非重复的非小细胞肺癌疾病靶点,两者取交集,共获得84个交集靶点。通过Cytoscape3.7.1获取排名前5的核心药物靶点,分别为木犀草素、β-谷甾醇、β-胡萝卜素、(+)-儿茶素、青风藤碱,通过STRING数据库分析确立TP53、ESR1、CASP3、AKT1、TNF为关键的靶点。结论:三子养亲汤通过多靶点、多途径发挥治疗非小细胞肺癌的作用。