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关键词： 便通灵胶囊   脑卒中后便秘   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨便通灵胶囊治疗脑卒中后便秘(PSC)的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选出便通灵胶囊潜在活性成分及靶点,采用GeneCards数据库与在线人类孟德尔遗传数据系统(OMIM)获得PSC靶点,得到药物与PSC的交集靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件绘制活性成分靶点疾病交互网络图。采用STRING数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并应用Metascape数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。结果:筛选后收集得到所有中药成分189个,收集疾病靶点882个,疾病与药物交集靶点共31个。PPI网络提示核心靶点主要涉及到凋亡、趋化、炎症、细胞周期、增殖等方面。GO富集主要包括蛋白酶结合、整合素结合、对脂多糖的反应、细胞增殖的负调控、薄膜筏、细胞外基质等。KEGG富集主要涉及脂质与动脉粥样硬化信号通路、松弛素信号通路、癌症通路等。结论:便通灵胶囊治疗PSC具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点。

关键词： 桃仁   红花   骨质疏松症   网络药理学  

摘要： 目的 运用网络药理学的方法,从分子信息学层面分析桃仁-红花药对的药物活性成分、骨质疏松症的疾病基因靶点,研究其疗效的物质基础和作用机制。方法 运用系统药理学研究方法,在TCMSP数据库收集桃仁-红花药对的主要化学成分。再通过DrugBank等数据库查找与骨质疏松症相关的靶点,利用Cytoscape软件构建“药物-有效成分-疾病-靶点”网络,运用String数据库分析共同靶点并构建PPI网络。从PDB数据库下载合适的靶点蛋白结构,运用AutoDock Vina对靶点蛋白和活性成分进行分子对接试验。结果 去除重复成分后共研究44个活性成分,生物功能和通路分析提示,桃仁-红花药对的生物学主要过程包括对雌二醇的反应、血管内皮生长因子产生的正调控等过程;作用通路则主要有癌症信号通路、动脉粥样硬化信号通路、PI3K-Akt信号通路等;并推测木犀草素最有可能是桃仁-红花药对治疗骨质疏松症的关键成分。结论 桃仁-红花药对的木犀草素等44种活性成分治疗骨质疏松症主要通过多靶点、多通路共同作用,其中木犀草素和槲皮素最有可能是关键组分,为后续治疗骨质疏松症提供了新思路。

关键词： 互联网技术   药理学   教学新模式   教学改革  

摘要： 互联网技术的迅速发展和普及,使得教学工作的形式、场所和对象都发生了巨大的改变。传统教学模式需适应技术的发展,进行整体变革与重构,才能克服发展与传统的矛盾掣肘。建立与“互联网+”背景相适应的教学机制,构建新型线上线下课堂教学体系是当今课堂教学改革的重要方向。文章基于教学实践,思考和讨论如何将互联网技术与传统课堂教育相融合,建立以互联网结合课堂的平台为依托,以学生能力培养为核心,符合我国国情,促进师生共同成长发展的药理学教学新模式。

关键词： GEO数据库   网络药理学   分子对接   扶脾柔肝颗粒   肝癌  

摘要： 目的采用GEO数据库、网络药理学和分子对接探讨扶脾柔肝颗粒(FRG)治疗肝细胞癌(HCC)的物质基础及其作用机制。方法首先,通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、GEO数据库获取FRG治疗HCC的活性成分与潜在靶点。其次,使用Cytoscape软件构建“中药-活性成分-潜在靶点”网络,利用Network Analyzer插件筛选关键成分。采用String数据库和Cytoscape软件构建潜在靶点蛋白质互作(PPI)网络,利用CytoNCA插件筛选核心靶点。使用Metascape数据库对潜在靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体论(GO)功能富集分析。最后,采用AutoDock Vina软件将关键成分与核心靶蛋白进行分子对接。通过KM Plotter数据库分析核心靶基因对HCC患者总生存率(OS)的影响。结果预测结果显示FRG与HCC有63个共同靶点。“中药-活性成分-潜在靶点”网络分析显示关键成分为山奈酚、β-谷甾醇、汉黄芩素等;PPI网络分析显示核心靶点为雌激素受体(ESR)1、雄激素受体(AR)、前列腺素G/H合酶(PTGS)2、原癌基因MYC、原癌基因FOS。KEGG富集分析主要涉及癌症通路、p53通路、白细胞介素(IL)-17通路和缺氧诱导因子(HIF)-1通路等。分子对接结果显示关键成分与核心靶点之间具有较强的亲和力。核心基因的OS分析结果显示,与肝癌中ESR1基因高表达比较,ESR1低表达的OS明显更低(P<0.05)。结论FRG通过多成分、多靶点和多途径对HCC发挥治疗作用,为下一步实验研究提供理论依据。

关键词： 阿拉坦五味丸   慢性胃炎   网络药理学   分子对接   五灵脂二萜酸   鞣花酸   槲皮素  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术研究阿拉坦五味丸治疗慢性胃炎的分子机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库和中国知网、维普、万方检索库确定阿拉坦五味丸活性成分,并从Swiss Targer Prediction、SEA、Pharm Mapper平台中预测活性成分相关靶点,在DisGeNET和GeneCard数据库中收集慢性胃炎相关靶点。将活性成分靶点与疾病靶点取交集,并构建“药物–活性成分–核心靶点”相互作用网络,利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络;应用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用Auto Dock 4.2.6软件对阿拉坦五味丸的关键活性成分和PPI网络中的核心靶点进行分子对接,以评价其结合能力。结果共获得阿拉坦五味丸活性成分30个,治疗慢性胃炎的核心靶点106个。分析PPI网络获知肿瘤坏死因子(TNF)、白蛋白(ALB)、白细胞介素(IL)-6、蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)起主要作用。GO富集分析主要涉及对无机物的反应、磷酸化的正调控和细胞死亡的正调控等生物过程,蛋白激酶活性、蛋白激酶结合和蛋白酪氨酸激酶活性等分子功能,膜筏、薄膜侧面、囊泡腔及受体复合物等细胞组分。KEGG通路分析主要涉及癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、糖尿病并发症中的糖基化终末产物-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)信号通路等。分子对接结果显示,阿拉坦五味丸中五灵脂二萜酸、鞣花酸、槲皮素与关键靶点之间具有较好的亲和力。结论阿拉坦五味丸可能通过五灵脂二萜酸、鞣花酸、槲皮素等主要活性成分作用TNF、ALB、IL-6等靶点,可能通过参与癌症的发病途径、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、低氧诱导因子-1(HIF-1)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等信号通路有效治疗慢性胃炎。

关键词： 病毒性心肌炎   网络药理学   GEO数据库   靶基因   microRNA   心瘅方  

摘要： 目的:基于网络药理学与GEO数据库探讨心瘅方治疗病毒性心肌炎的microRNA-mRNA调控机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选心瘅方中药物活性成分及其靶基因;利用GEO数据库筛选病毒性心肌炎与健康人的差异microRNA;利用FunRich3.1.3对差异microRNA进行mRNA富集,并与药物靶基因取交集基因;通过蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)以及cytoNCA筛选出核心基因;运用R软件对核心基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:心瘅方中药物活性成分共199个,潜在作用靶点490个,GEO数据库Series GSE148153符合要求,通过筛选得到差异microRNA 438个,50个microRNA与核心基因有对应关系,上调基因45个,下调基因5个;筛选得到交集基因207个,其中33个为核心基因;GO功能注释主要富集在肌细胞增殖、MAP激酶活性等生物学过程,并且主要富集在PI3K/Akt、人巨细胞病毒感染、白细胞介素17等信号通路。结论:心瘅方调控microRNA-mRNA过程治疗病毒性心肌炎与中药成分干预肌细胞增殖、MAP激酶活性等生物学过程和PI3K/Akt、人巨细胞病毒感染、肿瘤坏死因子信号通路等有关,此过程可能涉及hsa-miR-15b-5p和hsa-miR-21-5p等外泌体的表达。

关键词： 湿疹   黄芩   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学探讨黄芩治疗湿疹的作用机制。方法:运用TCMSP数据库检索黄芩的活性成分及相应靶点,在Gene Cards数据库和OMIM数据库及TTD数据库中检索并筛选出湿疹对应靶点,利用Jvenn生成黄芩和湿疹的交集靶点,运用Cytoscape 3.10.0软件构建黄芩-活性成分-靶点网络图,通过STRING平台构建蛋白质相互作用网络,再利用Metascape数据库进行GO生物功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后通过分子对接技术将筛选出的化合物成分和核心靶点进行结合能力的验证。结果:通过筛选,得到黄芩的主要活性成分36种,潜在靶点507个,通过3个疾病数据库检索获得湿疹的相关靶点687个,共生成33个交集靶点。富集分析结果显示,黄芩治疗湿疹主要涉及突触传递的负调节、血管内皮细胞增殖的负调节、精氨酸分解代谢过程、脂多糖介导的信号通路、T细胞凋亡过程等生物进程;可能涉及脂质和动脉粥样硬化、癌症的通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、癌症中的蛋白聚酶、钙信号通路等信号通路。通过分子对接技术得到验证,黄芩中活性成分黄芩素、莫索黄酮、β-谷甾醇均具有与VEGFA、MMP9较好的结合能力。结论:通过网络药理学方法及分子对接技术,证实黄芩治疗湿疹具有通过多成分、多靶点、多通路的特点。

关键词： 药理学   课程思政   思政教育   思政基因,基因式   肾上腺素受体激动药  

摘要： 在深入推进校园课程思政建设的时代背景下,文章探讨了医药学专业基础课程——药理学教学中思政教育的有机融入路径。以“肾上腺素受体激动药”的教学为例,文章从师资建设、思政元素的深入挖掘(识别思政教育的遗传密码)、构建思政素材库(积累丰富的思政教育氨基酸)以及精细的教学设计(确保思政教育的蛋白质得以准确表达)等方面,详细阐述了思政教育如何以“基因式”的方式融入药理学教学的具体路径,依据本章的专业教学内容,制定了明确的思政目标,深入挖掘了与之相关的思政元素,并运用多种载体形式的素材,巧妙地在不同教学环节中融入思政教育;将思政教育延伸至课后、线上教学和实验教学,实现了广泛而深入的教育效果,获得了学生的认可。

关键词： 桃红四物汤   缺血性脑卒中   分子对接   网络药理学   作用机制  

摘要： 运用网络药理学和分子对接的研究方法探究桃红四物汤治疗缺血性脑卒中的作用机制。首先在TCMSP数据库下载桃红四物汤中各个中药的有效成分,并将其与Uniprot数据库中的靶点对应相应的基因名;缺血性脑卒中的疾病靶点分别在GeneCards、PharmGKB等数据库中搜索,将得到的药物基因与疾病靶点做交集基因分析,导出韦恩图,将交集基因输入String数据库平台,构建蛋白相互作用网络(PPI网络),将PPI网络数据导入Cytoscape3.9.1软件进行分析,得到核心靶点,并采用分子对接进行分析。结果显示,选出115个中药有效成分,以及对应的257个药物靶点、和数据库搜索的4223个疾病靶点,分析后得到177交集靶点。通过PPI分析得到的主要靶点分别为STAT3、AKT1、MAPK3、TNF、CASP3、EGFR、IL6,并且得到中药有效成分中槲皮素、木犀草素和山奈酚三个关键有效成分与三个关键靶点PTGS2、HSP90AA1和ESR1PPI, GO富集分析和KEGG信号通路分析得到2768个条目和187条信号通路;分子对接也显示关键有效成分和关键靶点有很好的亲和力。结果表明,桃红四物汤治疗缺血性脑卒中的关键有效成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚,其主要通过IL17以及TNF信号通路发挥作用。

关键词： 苦荞   黄酮   超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱   芦丁  

摘要： 为优化苦荞黄酮提取工艺并明确其具体成分结构和含量及药理作用,本研究以四川省凉山彝族自治州甘洛县优质苦荞为研究对象,对超声提取苦荞黄酮工艺进行了优化,采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-QTOF-MS)对主要黄酮成分进行结构鉴定,并采用超高效液相色谱-三重四级杆质谱联用仪对鉴定到的黄酮进行准确定量,同时利用中药系统药理学(TCMSP)系统分析其网络药理学特性。结果表明,超声辅助乙醇提取苦荞黄酮的最优条件为乙醇浓度90%(V/V)、超声功率140 W、超声温度70℃、超声时间60 min、提取溶剂与苦荞原料比50∶1(mL·g^(-1)),该条件下,提取液中共鉴定到黄酮16种,其中芦丁、表儿茶素和儿茶素含量分别达到115.81、72.99和23.08μg·mL^(-1)。这16种黄酮在防治心血管疾病、慢性炎症性疾病上具有重要作用。本研究可为苦荞精深加工综合利用尤其是功能性苦荞产品开发利用奠定基础。