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关键词： 卵巢   早衰   红花逍遥片   网络药理学   分子对接   PI3K-Akt信号通路  

摘要： 目的运用网络药理学方法和分子对接技术探究红花逍遥片治疗卵巢早衰的作用机制,并进一步实验验证。方法应用TCMSP、PubChem数据库获得红花逍遥片活性成分及相关靶点,应用GeneCards数据库获得卵巢早衰相关靶点,利用Venn在线工具筛选两者交集基因,采用STRING数据库构建交集靶点PPI网络,通过Metescape数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,采用Cytoscape 3.7.1软件构建“活性成分-靶点”网络和“中药-活性成分-靶点-关键通路-疾病”网络,并进行分子对接验证。采用随机数字表法将小鼠分为空白组、模型组及红花逍遥片组,每组8只。除空白组外,其余各组小鼠采用透明带多肽3(ZP3)和弗式完全佐剂(FCA)建立免疫性卵巢早衰小鼠模型。红花逍遥片组灌胃红花逍遥片溶液0.56 g/kg,空白组、模型组灌胃等体积生理盐水,连续灌胃4周。采用HE染色观察小鼠卵巢组织病理变化。采用免疫组化染色检测ESR1表达,采用Western blot检测Akt、p-Akt表达。结果获得红花逍遥片与卵巢早衰交集靶点80个,PPI网络包含核心靶点44个,度值排名前5位的活性成分分别为芒柄花素、槲皮素、白桦脂酸、羟基红花黄A和黄芩苷,排名前5位的靶点分别为PPARG、ESR1、AR、AKT1和IL6。核心靶点分子功能主要为受体配体活性,生物过程主要涉及细胞迁移的正向调节,细胞组分主要包括膜筏,主要涉及信号通路有癌症信号通路、癌症中的蛋白聚糖、PI3K-Akt信号通路及HIF-1信号通路等。“中药-成分-靶点-通路-疾病”网络显示,红花逍遥片处方中8味药具有重要核心成分,其中甘草和红花涉及重要核心成分最多。分子对接结果显示,活性成分与核心靶点亲和力良好。实验验证结果显示,红花逍遥片可促进卵泡发育,提高卵巢组织中ESR1表达,并上调PI3K-Akt信号通路关键因子Akt磷酸化水平。结论红花逍遥片多种活性成分可能通过作用于PPARG、ESR1等多个靶点,并通过PI3K-Akt、HIF-1等信号通路治疗卵巢早衰,其潜在活性成分主要为芒柄花素、槲皮素等。

关键词： 骨质疏松症   复方骨疏康   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方骨疏康制剂治疗骨质疏松症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库中筛选出复方骨疏康制剂中各药材的活性成分及所对应的靶点,从GeneCards、OMIM、DrugBank、PharmGKB、TTD数据库中收集骨质疏松症的治疗靶点;通过R语言获得复方骨疏康-骨质疏松症共同靶点。将共同靶点输入至STRING数据库进行检索获取靶点间相互作用的网络关系数据,采用Cytoscape软件得到治疗骨质疏松症的关键核心靶点;通过R语言对交集基因进行GO和KEGG进行可视化分析。同时构建“复方骨疏康-主要通路-骨质疏松症”核心靶点网络,通过AutoDock Vina分子对接软件进行对接和模拟计算,再使用Pymol 3D绘制软件和Discovery Studio软件对部分对接结果进行三维和二维角度的作用力分析和可视化。结果 筛选出中药复方骨疏康128种活性成分、1 614个骨质疏松症相关的靶点,最终筛选出7个关键核心靶点(依据拓扑学属性),GO和KEGG富集分析发现其功能主要与成骨骨化、腺体发育、对外源性刺激等反应有关,富集在化学致癌-受体激活通路、癌症中的MicroRNAs通路、MAPK信号通路。分子对接显示:EGFR蛋白与小分子Luteolin和Quercetin、STAT1蛋白与小分子Kaempferol和Quercetin、MAPK3和FOS蛋白分别与小分子Naringenin和Quercetin之间均结合稳定。结论骨疏康制剂主要通过作用于钙信号通道,MAPK信号通道对骨质疏松症发挥防治作用。

关键词： 头风   偏头痛   柔肝愈偏饮   网络药理学   信号通路  

摘要： 目的运用网络药理学方法探究柔肝愈偏饮治疗偏头痛作用机制。方法用TCMSP数据库检索药物成分,筛选对应靶点。在GeneCards和OMIM数据库检索疾病靶点,绘制韦恩图得到交集靶点。完成PPI网络构建,绘制“成分-靶点”相互作用网络图,使用DAVID数据库将交集靶点进行GO及KEGG富集分析。结果得到交集靶点155个,核心靶点及成分10个,GO-BP结果799条,GO-CC结果98条,GO-MF结果150条,KEGG通路结果175条。结论柔肝愈偏饮治疗偏头痛主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,核心靶点为AKT1、IL-6、TNF等,并通过调控IL-17、TNF等信号通路干预治疗偏头痛。

关键词： 中医药   冠心病稳定性心绞痛   可视化   网络药理学  

摘要： 心脑血管疾病在致死性病症的排名中稳居前三。文章首先就医学领域对于中医药防治稳定性心绞痛(stable angina pectoris, SAP)的重要课题以及未来趋势进行梳理,随后在网络药理学方法的基础上,针对治疗SAP有效处方中的复方丹参滴丸展开研讨,包括其活性成分、靶点以及潜在的作用机制等多个方面,旨在为SAP的中医药防治提供重要的参考与依据。同时文章通过就中医药防治冠心病稳定性心绞痛展开的可视化分析以及网络药理学机制予以综述,以此促进未来临床中医药防治冠心病稳定性心绞痛临床疗效的提升。

关键词： 教学方法   药理学   教学  

摘要： 探讨多种教学模式在药理学教学中的应用与成效。随机选择药学院2020级药学专业1-3班为实验班级,采用多种模式进行教学;2019级药学专业1-3班为对照班级,采用传统教学模式。从多个评价指标评价两种教学模式成效。结果显示实验班级试卷情况、学生课程知识融合度、人文素养等均显著高于对照班级。药理学多种教学模式实施有利于学生培养。

关键词： 党参   肠黏膜炎   炎症   网络药理学   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的利用网络药理学和细胞实验研究党参(Codonopsis Radix,CR)治疗肠黏膜炎(intestinal mucositis,IM)的潜在作用机制。方法从中药系统药理学数据库(TCMSP)中获取党参的化学成分,UniProt、SwissTargetPrediction数据库获得党参化学成分对应的靶点,在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库获得疾病相关基因,微生信数据分析平台筛选党参和IM的交集靶点,获得党参治疗IM的作用靶点。使用Cytoscape软件绘制化学成分-靶点-疾病交互网络,利用STRING数据库获取蛋白相互作用(PPI)网络图,利用注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用不同浓度的党参醇提物(0,50,100μg/mL)处理五氟尿嘧啶(5-FU,10μg/mL)刺激的小肠上皮细胞IEC-6,酶联免疫吸附实验(ELISA)检测细胞炎症因子水平,免疫组化检测细胞磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)和蛋白激酶B(AKT)蛋白表达,荧光法检测细胞内活性氧(ROS)含量。结果共筛选出党参活性成分21个,对应401个靶点。肠黏膜炎相关靶点2210个,交集靶点197个。GO和KEGG富集分析显示,党参治疗肠黏膜炎主要涉及PI3K/AKT信号通路等。细胞实验结果显示,100μg/mL党参醇提物显著降低细胞炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白介素-6(IL-6)的含量(P<0.05),上调IL-4和IL-10的含量(P<0.01),而50μg/mL党参醇提物降低细胞炎症因子TNF-α和IL-6的效果不显著,降低IL-4和IL-10的含量(P<0.05);100μg/mL党参醇提物明显降低细胞ROS水平(P<0.01),下调PI3K和AKT的表达量(P<0.01),50μg/mL党参醇提物降低细胞AKT和PI3K水平(P<0.05),降低ROS的效果不显著。结论党参可能通过调控PI3K/AKT信号通路发挥治疗肠黏膜炎的作用。

关键词： 中枢性性早熟   数据挖掘   网络药理学   高频药对   活性成分   靶点  

摘要： 目的运用数据挖掘、网络药理学和分子对接的方法,探讨中药复方治疗中枢性性早熟(CPP)的用药规律和作用机制,为其临床治疗提供更多依据。方法在中国知网(CNKI)、万方数据(Wanfang)、维普中文期刊(VIP)等数据库中检索从建库至2022年10月发表的中药复方治疗CPP的文献,用Excel 2021收集整理临床治疗CPP的常用中药复方,并通过Excel 2021、SPSS Modeler 18.0、SPSS Statistics 25.0等软件对其进行频次、关联规律等分析,研究CPP治疗的用药规律。在上述基础上采用网络药理学的研究方法,筛选出高频药对的活性成分、作用靶点以及疾病的相关靶点,构建蛋白互作网络,并通过基因本体和京都基因基因组百科全书通路富集分析来阐明药物的作用机制。最后运用Autodock Vina软件进行分子对接对结果验证。结果共筛选出224篇文献,包含方剂133首,中药188味。发现18味使用超过25次的高频药物;清热类、补虚类的药物应用较多;药物性味以寒及苦为主;归经之中以肝经占比最高;进一步关联分析得到高频药对14个;核心处方4个。网络药理学结果显示,共得到44个活性成分、200个药物靶点、1287个疾病靶点、70个共有靶点、573条GO富集条目及136条KEGG通路,药物主要成分槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇作用于雌激素受体、黄体酮受体等核心靶点,通过内分泌抵抗、雌激素等信号通路发挥治疗作用。分子对接结果显示药物主要活性成分与相应核心靶点具有较好的结合能力。结论中药复方治疗CPP多为滋阴清热、补虚类药物,与药性寒,药味苦、甘,归肝、肾经的药物配伍使用。其中高频药对“知母-黄柏”通过多成分、多靶点调控内分泌抵抗、雌激素信号通路发挥治疗作用。

关键词： 木犀草素   促分裂原活化的蛋白激酶信号通路   膀胱癌   细胞增殖   网络药理学   HT1376细胞  

摘要： 目的:用网络药理学和体外实验验证的方法探讨木犀草素抑制膀胱癌细胞增殖的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台、SwissTarget Prediction数据库、Pharmmapper数据库和GeneCards数据库,筛选出木犀草素和膀胱癌的作用靶点,利用Venny2.1取出交集靶点,用交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析并利用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,最后用Cytoscape构建成分-通路-靶点-疾病网络图。通过细胞计数试剂盒-8(CCK8)、集落形成实验检测膀胱癌细胞的活力以及集落形成能力、蛋白质免疫印迹检测促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)通路上蛋白的表达以及增殖细胞核抗原(PCNA)的表达,5-乙炔基-2′-脱氧尿苷(EDU)实验进一步检测木犀草素对膀胱癌细胞增殖的影响。结果:通过网络药理学一共筛出136个木犀草素与膀胱癌的潜在靶点,GO分析中与生物过程相关主要涉及491个功能簇,与细胞组分相关主要涉及52个功能簇,与分子功能相关主要涉及112个功能簇。KEGG通路富集分析共获得151条通路,主要有癌症通路、PI3K-AKT信号通路、MAPK信号通路。体外实验表明木犀草素通过MAPK信号通路有效抑制了膀胱癌细胞HT1376的增殖;CCK8实验结果表明,木犀草素能明显抑制膀胱癌细胞HT1376的活力;集落形成实验表明木犀草素具有明显抑制膀胱癌细胞集落形成的能力;蛋白质免疫印迹实验结果表明,木犀草素能明显抑制MAPK通路上P-RAF、P-MEK、P-ERK1/2蛋白的表达,并且降低了PCNA蛋白的表达水平;EDU实验表明木犀草素能明显抑制膀胱癌HT1376细胞的增殖。结论:本实验通过网络药理学和体外实验验证的方法证明了木犀草素可能通过MAPK信号通路抑制膀胱癌HT1376细胞的增殖。

关键词： 生物信息学   中药药理学   酸枣仁汤   异病同治  

摘要： 以酸枣仁汤为例,将生物信息学融入实验教学设计与实践,实现了理论教学与实验教学的双融合。生物信息学多靶点、多途径的协同调控与中医药的“整体观念”相契合,而数据可视化帮助学生直观“看到”并理解中药复方的作用机制和科学内涵。将酸枣仁汤“异病同治”失眠和阿尔茨海默病的实验划分成3个教学模块,即基础生物信息实验、异病同治实验、机制探索实验,围绕预习探索、模拟实验和团队协作能力进行系统训练,引导学生自主设计并完善验证性实验。通过线上操作、线下考核、课程汇报等方式优化实验教学模式,全方位提升学生对关键知识的理解能力、应用能力和创新能力。

关键词： 抑郁症   抑郁症合并心肌梗死   开心散   网络药理学  

摘要： 目的:采用网络药理学方法探讨开心散治疗抑郁症和抑郁症合并心肌梗死(myocardial infarction,MI)的主要成分、作用靶点、传导通路和作用机制的异同并对关键靶点进行实验验证。方法:基于公共数据库结合ADME算法筛选开心散有效成分和作用靶点;通过DisGeNET数据库筛选抑郁症和MI及其共病靶点;利用STRING 11.0数据库构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络;通过核心靶基因导入基因功能注释数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)靶点相关通路分析;通过Cytoscape构建“药物成分-靶点-通路”网络;分析药物成分血脑屏障通过性,并采用Autodock Vina软件进行分子对接验证;建立抑郁症体外模型,采用蛋白质免疫印迹法(western blot,WB)对关键蛋白表达进行验证。结果:筛选出抑郁症与MI共同靶点28个;开心散主要成分30种,治疗抑郁症潜在靶点36个,其中关键靶点为Akt1、TNF、MAPK8、JUN、PTGS2、IL1B、IFNG、GSK3B、NOS2、DRD1等;开心散治疗抑郁症合并MI的主要成分14种,共同作用关键靶点为Akt1、TNF、IL1B、GSK3B、NOS2、BAX、NR3C2、NOS3、ESR1、ADRB1;开心散治疗抑郁症的成分较治疗抑郁症合并MI共同成分具有更强的血脑屏障通过性;分子对接结果显示山柰酚作用于Akt1靶点,参与调控PI3K/Akt通路;体外实验证实山柰酚可上调抑郁模型细胞Akt1蛋白表达。结论:开心散治疗抑郁症和抑郁症合并MI成分和靶点既有相同之处也有不同之处,体现“异病同治”的特点,且其治疗抑郁症主要侧重于对中枢神经系统和内分泌系统的调节,验证实验证实开心散对于治疗抑郁症和抑郁症合并MI具有有效性。