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关键词： 支气管哮喘   用药规律   麻黄   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:探讨中医药治疗支气管哮喘的组方规律,预测核心药物潜在作用机制,以期为后续实验研究及临床应用提供依据与参考。方法:检索中国知网、万方数据库和维普数据库中采用中药复方治疗支气管哮喘的临床研究文献,对中药处方进行频次统计、关联规则分析,探究支气管哮喘的组方规律,并在此基础上以网络药理学策略,筛选高频药物核心靶点,通过基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,研究药物对疾病的潜在作用靶点和通路,以期阐明其作用机制。结果:共纳入448项研究,包含459首处方、210味中药;其中,化痰止咳平喘药(占28.70%,1 413次/4 924次)和补虚药(占21.83%,1 075次/4 924次)应用较多,以温性(占49.31%,2 483次/5 035次)、辛味(占29.75%,2 295次/7 713次)为主,归经以入肺经(占29.08%,3 608次/12 408次)最多;关联分析得到高频药对与高频角药各10组。麻黄为治疗支气管哮喘的核心药物,其与支气管哮喘共有147个交集靶点,主要有白天竺葵苷元、草本菌素和无色矢车菊素等23种活性成分,核心靶点为热休克蛋白90AA1、肿瘤蛋白p53和JUN等,主要通路为癌症信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、糖尿病并发晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体信号通路等。结论:中医药治疗支气管哮喘注重清肺化痰、止咳平喘及健脾益肾,兼顾解表与清热类药物的应用;高频药物麻黄的潜在靶点和作用机制主要参与药物的反应、基因表达的正向调节及凋亡过程的负调控等生物过程,发挥治疗作用。

关键词： 硬皮病   补肾益精法   芳香烃受体   网络药理学  

摘要： 目的通过网络药理学方法、分子对接方法分析芳香烃受体(AhR)信号通路在补肾益精法治疗硬皮病中的作用及其机制。方法通过TCMSP等数据库及LC-MS分析结果获取补肾益精法中药复方的有效活性成分及其靶点基因、AhR信号通路基因和硬皮病疾病基因,构建补肾益精法活性成分-AhR信号通路-硬皮病交集靶点网络图;使用STRING数据库构建蛋白互作网络;进行GO、KEGG富集分析;最后通过分子对接验证有效活性成分与AhR结合能力。结果阿魏酸、槲皮素、山奈酚、异阿魏酸、木犀草素在补肾益精法靶向AhR信号通路治疗硬皮病中发挥关键作用;其机制可能与调控参与硬皮病发病机制的IL-6、CTNNB1、HSP90AA1、TNF、PTGS2等AhR信号通路分子有关;分子对接显示阿魏酸、山奈酚、槲皮素、异阿魏酸、木犀草素等活性成分与AhR结合能均低于-6.0 kcal/mol,具有较好结合活性。结论补肾益精法治疗硬皮病的机制可能与阿魏酸、槲皮素、山奈酚、异阿魏酸、木犀草素等多种关键活性成分,靶向AhR信号通路,调控IL-6、CTNNB1、HSP90AA1、TNF、PTGS2等核心靶点相关。

关键词： 人参皂苷Rg1   神经母细胞瘤   网络药理学   分子机制   预后模型  

摘要： 目的:从网络药理学角度探讨人参皂苷Rg1与神经母细胞瘤(NB)的核心靶点及其分子作用机制。方法:利用PharmMapper等数据库筛选Rg1治疗NB的作用靶点并进行GO/KEGG富集分析、核心靶点筛选、Hub基因预后模型以及分子对接模型,分析Hub基因在神经母细胞瘤作用机制。结果:初步筛选出Rg1-NB交集靶点129个,GO、KEGG分析结果发现Rg1可能通过PI3K/Akt、MAPK、JAK/STAT信号通路影响神经母细胞瘤增殖、迁移、凋亡等生物过程;PPI互作聚类分析结果表明,Rg1可能通过调控细胞凋亡、生物节律、酪氨酸蛋白激酶等发挥治疗作用;通过对Rg1治疗NB作用靶点进行Hub基因筛选以及基因、表型分析,发现Rg1治疗Hub基因为AKT1、MTOR、STAT3,进一步预后模型分析发现STA3高表达组的NB患者的生存率显著高于低表达,说明STAT3为预后保护因素,且Rg1与STAT3有9个结合位点,结合自由能为-6.57 kcal/mol,结合效果较好。结论:通过数据库筛选出3个人参皂苷Rg1治疗神经母细胞瘤核心靶点依次为AKT1、MTOR、STAT3,进一步通过建立核心基因预后模型、分子对接实验及GO、KEGG分析表明,人参皂苷Rg1可能通过JAK/STAT信号通路发挥功能,影响神经母瘤细胞的发展,为Rg1治疗神经母细胞瘤分子机制、药物靶点的选择及新型治疗技术的开发提供一定的参考和理论依据。

关键词： 药理学   近视   氧化应激   三七   黄精  

摘要： 本研究采用网络药理学的研究方法挖掘三七与黄精治疗近视的物质基础及其作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索中药三七和黄精的主要活性成分,并进行靶点预测,靶点应用uniprot数据库查询出相对应的基因名。通过GeneCards数据库检索近视、氧化应激的相关靶点,将中药靶点与近视、氧化应激的靶点取交集,得到交集靶点。同时使用String数据库构建蛋白互作网络和Cytoscape软件,筛选出关键基因和网络药理图;DAVID数据库,对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。三七活性成分7个;黄精活性成分5个。删除重复项后得到187个靶点和近视、氧化应激共同靶点92个。通过PPI蛋白互作关系,得到5个hub基因;功能注释结果显示:富集于细胞核、细胞膜等。KEGG通路富集分析表明交集靶点的KEGG信号通路主要为癌症通路、脂质与动脉粥样硬化等。通过调节JUN、TP53、ESR1、IL6、TNF等靶点基因,特别是在细胞核和细胞膜等细胞组分中的靶点基因,有可能实现抗近视作用。

关键词： 自主探究   药理学   教学模式  

摘要： 借助超星平台和学习通APP开设线上药理学虚拟实验课,作为线下实验课的有益补充和延伸;开设线上药理学课程思政微课,与线下课堂同向同行,协同育人,深化药理学线上教学改革。在治疗抗菌药和糖尿病药物教学中探索课堂引导下的学生自主探究的学习模式,培养学生的临床思维,使其把所学知识转变成临床治疗疾病的能力,提高学生的临床竞争力和综合素养,扩展药理学一流课程建设的内涵,取得了较好的教学效果。

关键词： 柴葛芩连汤   肺炎支原体肺炎   作用机制   网络药理学   分子对接   儿童  

摘要： 目的:通过网络药理学方法和分子对接技术分析柴葛芩连汤治疗儿童肺炎支原体肺炎(Mycoplasma Pneumoniae Pneumonia,MPP)的作用机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库收集柴葛芩连汤的有效成分及对应靶点,采用Perl语言命令在UniProt数据库中批量检索预测靶标的上游基因名称;借助GeneCards与OMIM疾病数据库获取MPP相关疾病靶点;运用R软件得到两者交集靶标,并绘制韦恩图;通过Cytoscape 3.8.0软件对柴葛芩连汤治疗MPP的“中药-活性成分-潜在作用靶点”网络进行可视化,筛出核心节点;通过STRING 11.5数据库结合Cytoscape3.8.0软件构建交集靶点之间的蛋白相互作用网络,使用Cytoscape3.8.0软件的插件CytoHubba挖掘互作网络中的核心靶点;利用R语言对交集靶点进行基因本体论(GO)分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)相关通路的富集分析;最后通过AutoDock Vina对前期所得的关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到柴葛芩连汤治疗MPP的153个有效成分和47个药物-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与介导白细胞介素(Interleukin,IL)-17、核因子-κB(Nuclear Factor-κB,NF-κB)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等106条信号通路相关。槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩苷、千层纸甲素A等有效成分与IL-6、白细胞介素(C-X-C Motif Chemokine Ligand,CXCL)8、TNF等靶标对接结果良好。结论:柴葛芩连汤的有效成分可能通过抑制炎性反应、调节免疫紊乱、改善肠道菌群失调等药理作用来治疗MPP。

关键词： 柴胡龙骨牡蛎合甘麦大枣汤   脑卒中后抑郁   网络药理学   分子对接   动物实验  

摘要： 目的:基于网络药理学、分子对接与动物实验探究柴胡龙骨牡蛎合甘麦大枣汤治疗脑卒中后抑郁(PSD)的作用机制。方法:利用TCMSP等数据库预测柴胡龙骨牡蛎合甘麦大枣汤的活性成分及靶点;在PharmGKB等数据库检索PSD疾病靶点,利用Cytoscape(v 3.9.1)建立交集靶点网络,String(v11.5)数据库构建PPI网络,利用DAVID 6.8数据库进行GO富集及KEGG通路分析;运用AutoDock vina(v 1.1.2)软件进行分子对接,并使用Pymol(v 2.5)等软件进行可视化分析;动物实验设置空白组、模型组、盐酸氟西汀组、中药组、中药+盐酸氟西汀组,给药21 d后检测各组大鼠神经行为学评分、脑组织内神经递质以及炎症因子表达,RT-qPCR和Western blot检测关键基因PPARG、MAPK3、AKT1、PIK3CA mRNA及蛋白表达。结果:得到柴胡龙骨牡蛎合甘麦大枣汤活性成分225种,作用于PSD的靶点119个,关键靶点包括MAPK3、AKT1、PIK3CA、PPARG,关键通路包括MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等。与模型组比较,中药组与中药+盐酸氟西汀组MAPK3 mRNA及蛋白表达降低,AKT1、PIK3CA、PPARG mRNA及蛋白表达升高(P<0.05)。结论:柴胡龙骨牡蛎合甘麦大枣汤治疗PSD的作用机制可能与抑制MAPK3表达、促进AKT1、PIK3CA、PPARG表达,减缓脑组织炎症反应和氧化应激有关。

关键词： 疏肝消脂方   酒精性脂肪肝   网络药理学   靶点   作用机制  

摘要： 目的:筛选疏肝消脂方主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,探讨疏肝消脂方干预酒精性脂肪肝(AFLD)的多成分、多靶点、多通路作用机制。方法:检索BATMAN-TCM和TCMSP数据库,收集疏肝消脂方的活性成分及靶点。从GeneCards、OMIM等数据库收集AFLD的作用靶点,并与疏肝消脂方活性成分靶点取交集;用STRING数据库构建蛋白相互作用网络图(PPI);使用Cytoscape软件构建疏肝消脂方活性成分-靶点网络图,并利用CytoNCA插件对该网络进行拓扑属性分析,筛选出核心靶点。采用DAVID数据库对筛选到的核心靶点进行GO(基因本体)功能富集分析和KEGG(京都基因和基因组百科全书)信号通路富集分析,并通过R语言实现可视化分析。结果:疏肝消脂方筛选获得活性成分203种,对应靶点678个,AFLD相关靶点1784个,交集靶点278个。核心靶点主要关联AFLD中的氧化应激、蛋白质结合、对脂多糖反应等生物过程,并且参与肿瘤坏死因子信号通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路等,以上生物过程和信号通路介导疏肝消脂方干预AFLD潜在作用机制。结论:疏肝消脂方通过MAPK等信号通路作用于AFLD,为进一步研究干预AFLD提供新的依据。

关键词： 细辛   肝损伤   网络药理学   非靶向代谢组学  

摘要： 细辛是临床常用解表药,但其毒性限制了其使用。该研究采用网络药理学与代谢组学相结合的方法探讨细辛的肝损伤机制。GEO数据库下载肝损伤相关数据集GSE54257,采用Limma包对数据集GSE54257进行差异表达基因分析。TCMSP、ECTM、TOXNET等数据库筛选细辛有毒成分与靶点基因,与GSE54257差异表达基因相映射,得到细辛肝损伤靶点基因并构建PPI网络。对靶点基因进行GO和KEGG富集分析,结合上游调控miRNA信息绘制“miRNA-靶点基因-信号通路”网络。30只大鼠分为空白组与细辛高、低剂量组,每日给药1次,连续给药28 d后检测肝功能指标和肝脏病理变化。空白组与细辛高剂量组随机取5个肝脏组织样本,采用超高效液相色谱-质谱(UHPLC-MS)技术分析各组样本小分子代谢产物。利用正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)筛选差异代谢物,并对差异代谢物进行富集分析、相关性分析和聚类分析,最后利用MetaboAnalyst平台对差异代谢物进行通路富集分析。经分析发现,细辛中有毒成分有14个,对应靶点基因37个,经与GSE54257中差异表达基因映射得到12个与细辛肝脏毒性相关的基因。动物实验结果显示,细辛可以显著升高大鼠肝功能指标,降低自由基清除酶活性,改变肝脏氧化应激水平,诱发脂质过氧化损伤。非靶向代谢组学分析结果显示,与空白组比较,细辛组大鼠肝脏组织中有9个代谢物上调,16个代谢物下调,这25个代谢物相关性较强,聚类良好。通路富集分析显示,这些差异代谢物与细辛12个肝毒性靶点基因主要参与嘌呤代谢,以及缬氨酸、亮氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸等的生物合成与代谢。该研究证实,细辛致肝损伤作用是多成分、多靶点、多信号通路作用的结果,其机制可能与抑制核苷酸合成,影响蛋白质代谢有关。