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关键词： 大黄-桃仁药对   逐瘀泻热   UPLC-TOF-MS   GC-MS   网络药理学   药效学实验  

摘要： 目的 分析大黄-桃仁药对水煎液的化学成分,探讨其逐瘀泻热的药效物质及作用机制。方法 采用UPLC-TOF-MS、GC-MS对大黄-桃仁药对水煎液进行成分分析,结合网络药理学方法构建大黄-桃仁药对逐瘀泻热的“疾病-成分-靶点”网络,筛选目标信号通路。采用间隔24 h两次大鼠尾静脉注射内毒素脂多糖复制“瘀热”大鼠模型,通过大鼠体温变化,血液流变、凝血四项(TT、PT、APTT、FIB)、炎症因子水平、氧化应激水平等的测定对大黄-桃仁药对逐瘀泻热进行药效评价。通过分子对接技术、实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-q PCR)对预测的核心靶点进行验证。结果 从大黄-桃仁药对水煎液中鉴定得到化合物64个,网络药理学分析结果表明大黄-桃仁药对中芦荟大黄素、圣草酚、表没食子儿茶素没食子酸酯、原花青素等核心成分,通过作用于AKT1、PTGS2、SRC、IL1B、TNF等核心靶点,调控VEGF、MAPK、IL-17、TNF等通路达到逐瘀泻热的目的。动物实验结果表明,大黄-桃仁药对给药后,模型大鼠的氧化应激(NO、SOD、MDA)、凝血四项、血液流变、体温等指标均向正常回调,大黄-桃仁药对能够降低炎症因子IL-1β、IL-17、TNF-α含量以及核心靶点AKT1、SRC、MYC、EGFR、PTGS2、TP53 mRNA表达。结论 圣草酚、芦荟大黄素、原花青素、没食子酸儿茶素、表没食子儿茶素没食子酸酯等化合物为大黄-桃仁药对逐瘀泻热的药效物质。大黄-桃仁药对通过多靶点,多通路调控机体炎症、氧化应激、血管生成、血管内皮等方面发挥逐瘀泻热作用。

关键词： 胸痹   心痛   冠心病   数据挖掘   网络药理学   用药规律  

摘要： 目的分析叶天士治疗胸痹心痛病的用药规律以及核心药物组合的潜在作用机制,为临床治疗提供依据。方法遴选《叶天士医学全书》中治疗胸痹心痛病的方剂,建立数据库,借助Microsoft Excel 2021、SPSS Modeler 18.0、SPSS 25.0进行中药频次统计分析、关联规则分析、聚类分析、因子分析。运用BATMAN-TCM网站、GeneCards、DrugBank、OMIM、TTD数据库获取核心药物组合与疾病的靶点,使用STRING网站和Cytoscape3.9.1软件分析靶蛋白相互作用关系,并筛选出核心靶点,采用Metascape网站和微生信网站对核心药物组合与疾病的相关靶点做基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果收集方剂100首,涉及中药169味,单味中药使用频次≥8次的高频中药有茯苓(45次)、半夏(23次)、桂枝(23次)、生姜(21次)等,其中药性以温、平为主,药味以甘、苦、辛为主,药物多归心、肺、脾经,功效排名前3位的是补虚药、化痰止咳平喘药、利水渗湿药。关联规则分析得到11组强关联药物组合,置信度最高的是半夏-生姜-茯苓。聚类分析得出5类药物组合,新处方3首,因子分析得出8个公因子,新处方3首,多有温阳、祛痰、活血、补血、益气养阴之效。网络药理学研究得出核心药物组合半夏-生姜-茯苓治疗胸痹心痛病有205个相关靶点,将肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、FOS原癌基因(fos proto-oncogene,FOS)、一氧化氮合成酶(nitric oxide synthase,NOS)3作为关键靶点,钙离子(calcium,Ca^(2+))信号通路和环状鸟苷单磷酸酯-蛋白激酶G(cyclic guanosine monophosphate-protein kinase,cGMP-PKG)信号通路是核心药物组合治疗胸痹心痛病的潜在信号通路。结论叶天士治疗胸痹心痛病多从温阳化痰、活血化瘀、益气养阴3个方面选方用药,核心药物组合半夏-生姜-茯苓可能通过TNF、FOS、NOS3等靶点对钙离子信号通路,cGMP-PKG信号通路进行调控从而发挥改善胸痹心痛的作用。

关键词： 补体抗痨散   网络药理学   肺结核  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨补体抗痨散对肺结核的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)收集补体抗痨散的主要化学成分,根据药物分布、吸收、代谢、排泄(ADME)筛选出口服利用度筛选药物活性成分,并获取对应靶点;通过Drugbank、Genecards、OMIM数据库获得肺结核(pulmonary tuberculosis PTB)的重要靶点并去除重复值,利用String数据库进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络;使用Cytoscape3.7.1构建“补体抗痨散-肺结核靶点-通路”网络。并利用Cytoscape3.7.1软件筛选出排名靠前的核心靶点;使用微生信数据库对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。结果:筛选出补体抗痨散232个药物靶点,肺结核1452个非重复疾病靶点,两者取交集,共获得110个共同交集靶点。Cytoscape3.7.1筛选出排名前五的核心靶点:槲皮素、山奈酚、木犀草素、异鼠李素、常春藤皂苷元,PPI分析得到的RELA、TP53、TNF、AKT1、IL-6为核心的基因靶点。结论:补体抗痨散通过多靶点、多途径发挥其治疗肺结核的作用。

关键词： 肝纤维化   茵陈   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨茵陈干预肝纤维化的作用机制。方法:通过TCMSP数据库获取茵陈的活性成分及作用靶点;在GeneCards数据库和OMIM数据库中获取肝纤维化的相关靶点,将茵陈成分靶点与疾病靶点取交集,获得茵陈干预肝纤维化的作用靶点。运用Cytoscape 3.10.0构建化合物-靶点-疾病网络图,使用STRING数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.10.0进行可视化呈现及分析。使用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选得到茵陈有效成分15个,作用靶点289个,其中肿瘤抑制蛋白基因53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、胱天蛋白酶3(CASP3)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)和B细胞淋巴瘤2(BCL2)等为核心靶点。GO功能和KEGG通路富集分析结果主要涉及激素的反应、细胞迁移的正向调节、对细菌来源分子的反应、磷代谢过程的正向调节、对外源性刺激的反应等生物过程及癌症途径、血脂与动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶(PI3K-Akt)、Janus激酶-信号传导及转录激活蛋白(JAK-STAT)、核因子-κB(NF-κB)等信号通路。结论:茵陈干预肝纤维化具有多成分、多靶点、多途径的特点,可为进一步研究提供参考。

关键词： 癌性发热   青蒿鳖甲汤   网络药理学   靶点   信号通路  

摘要： 目的 采用中药网络药理学初步分析青蒿鳖甲汤在治疗癌性发热方面的作用与机制。方法 借助TCMSP及HERB数据库初步筛查出青蒿鳖甲汤相关优效活性成分,利用Swiss Target Prediction和PubChem平台预测优效活性成分的相关作用靶点并在GeneCards上筛选治疗癌性发热的相关作用靶标,后在韦恩图上进行映射。通过STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建PPI网络以获取青蒿鳖甲汤在治疗癌性发热方面的关键靶点,最后借助DAVID数据库对青蒿鳖甲汤抗癌性发热作用的关键靶点进行GO和KEGG富集分析。结果 得到青蒿鳖甲汤药物成分与癌性发热疾病共132个共同靶点,KEGG通路125条。结论 本研究初步分析出青蒿鳖甲汤中含有槲皮苷、山奈酚、木犀草素、淫羊藿素等多种成分,这些成分可能作用于VEGFA、CASP3、AKT1、MMP9、TNF、HIF1A、EGF、TP53、PTGS2、IL6等治疗靶点上,并通过调控TNF、IL-17、PI3K-Akt等信号通路发挥治疗癌性发热的作用,为临床运用青蒿鳖甲汤提供了理论参考和依据。

关键词： 中药复方   网络药理学   膝骨关节炎   靶点通路预测   机制探索  

摘要： 目的:基于网络药理学方法分析六味骨痹丸治疗膝骨关节炎的作用机制,为六味骨痹丸的临床拓展运用提供进一步的理论基础支撑。方法:通过TCMSP数据库获取六味骨痹丸组成药物淫羊藿、骨碎补、生甘草、怀牛膝的主要化学成分及相关作用靶点,通过ADME进行中药活性组分的筛选;使用HERB数据库搜取南五加、龟甲的主要化学成分及其靶点。通过DRUGBANK、Gencards、OMIM数据库获取膝骨关节炎疾病靶点,采用Uniprot数据库进行信息转换,利用STRING平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络。利用Metascape网站进行“药物-成分-靶点”通路的可视化分析,同时探索其可能参与的相关靶点信号通路及生物过程,利用GO和KEGG富集分析以及CytoScape-3.7.1平台构建六味骨痹丸成分—膝骨关节炎靶点—通路网络图以进一步探索六味骨痹丸治疗膝骨关节炎的内在可能通路机制。结果:六味骨痹丸治疗KOA的核心成分为槲皮素、山柰酚、柚皮素、β-谷甾醇等,核心靶点有TNF、IL-6、AKT1、TP53、PTGS2、IL1B、VEGFA、CASP3、MAPK3、ESR1、MMP9等。六味骨痹丸治疗KOA的作用机制可能与VEGFA信号通路、TNF信号通路、MAPK3信号通路、IL-6信号通路及细胞凋亡信号通路有关,从而发挥消炎止痛、调控软骨代谢、抗氧化、调节局部微循环等作用。结论:本研究初步揭示了六味骨痹丸多成分、多靶点、多通路治疗KOA的内在可能机制作用,为六味骨痹丸的临床使用及疗效提供了一定理论基础。

关键词： 胃宁颗粒   胃癌   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的探究胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础及作用机制。方法利用CCK-8及transwell实验检测胃宁颗粒对胃癌细胞增殖及迁移的影响;通过液相色谱–质谱联用及蛋白质组技术分别获得胃宁颗粒活性成分及差异表达蛋白;通过网络药理学及Cytoscape 3.9.1软件构建胃宁颗粒活性成分–靶点–胃癌网络;利用GO/KEGG开展富集分析;利用分子对接阐明关键核心靶点与活性成分的相互作用。结果共筛选出胃宁颗粒治疗胃癌有效成分23个,作用靶点19个;PI3K-Akt及凋亡通路可能是胃宁颗粒治疗胃癌的主要作用通路;VEGFA、BCL2L1及CDK4可能是胃宁颗粒治疗胃癌的关键靶点。结论刺芒柄花素、槲皮素、莪术二酮可能是胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础,与调控VEGFA、BCL2L1及CDK4信号通路有关。

关键词： 动脉粥样硬化   冠心病   养心汤   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学及体内实验探讨养心汤治疗动脉粥样硬作用机制。方法网络药理学部分利用TCMSP数据库筛选养心汤的药物活性成分及对应靶点,Gene Cards、DisGeNet、OMIM、TTD数据库筛选动脉粥样硬化疾病靶点,EVenn平台交互映射得到药物-疾病交集靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-核心靶点-疾病互作网络图,交集靶点导入STRING数据库获取PPI网络图,同时Cytoscape软件可视化处理,利用Metascape v3.5平台进行GO、KEGG富集分析,微生信平台可视化处理。体内实验部分:ApoE^(-/-)小鼠通过高脂饮食建立动脉粥样硬化动物模型,成模小鼠随机分为模型组(Model)、养心汤低剂量组(YXT-L)、养心汤高剂量组(YXT-H),C57BL/6小鼠为Control组,YXT-L组、YXT-H组分别灌胃养心汤浸膏水溶液2.6 g·kg^(-1)·d^(-1)和5.2 g·kg^(-1)·d^(-1),Control组、Model组灌胃等体积蒸馏水,灌胃4周。油红O染色观察主动脉窦斑块面积,ELISA检测血清IL-6、IL-1β、Caspase-3、VEGF水平,全自动生化仪检测血脂TG、TC、LDL-C、HDL-C水平,Western blot检测主动脉NF-κB p65、TNF-α、IKKβ蛋白的表达。结果网络药理学部分:共筛选出养心汤活性成分105个,对应靶点535个,动脉粥样硬疾病靶点4921个,药物-疾病交集靶点162个,前10位的靶点包括AKT1、TNF、IL-6、VEGFA、IL-1β、TP53、JUN、CASP3、PPARG、PTGS2,GO分析共得到2224个条目,其中生物学过程1946条,细胞成分100条,分子功能178条。KEGG信号通路富集分析共得到信号通路216个,主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、NF-κB信号通路、cAMP信号通路、糖尿病心肌病、半胱氨酸和蛋氨酸代谢、VEGF信号通路、钙信号通路等。体内实验部分:养心汤呈剂量依赖性降低ApoE^(-/-)动脉粥样硬化小鼠血清TG、TC、LDL-C增加HDL-C水平,减少主动脉窦斑块面积,降低血清IL-6、IL-1β、Caspase-3、VEGF水平;抑制主动脉NF-κB p65、TNF-α、IKKβ蛋白表达。结论养心汤可能通过抑制TNF-α/IKKβ/NF-κB信号通路,调节脂质代谢、抑制炎症反应、调控细胞凋亡等途径发挥抗动脉粥样硬化的作用。

关键词： 早发性卵巢功能不全   杞蓉片   网络药理学   数据挖掘  

摘要： 目的:采用网络药理学方法探讨杞蓉片治疗早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的作用机制。方法:在中药药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中获取杞蓉片的有效成分及相应靶点,同时查询人类基因数据库(Genecards)等数据库,获取疾病相关的靶点,并利用韦恩图(Venn)图与药物作用靶点取交集,筛选杞蓉片治疗POI的关键靶点。利用STRING平台建立预测靶蛋白之间的相互关系网络,根据联系密切程度筛选出核心靶标,用R语言进行核心靶标的基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)。结果:收集到符合筛选条件的杞蓉片活性成分102个,染料木素、槲皮素、芹菜素、β-谷固醇等化合物可能为其作用的主要活性成分,药物与POI共同靶点243个,其中肿瘤蛋白p53基因、丝氨酸/苏氨酸激酶1、转录激活因子3、肿瘤坏死因子、表皮生长因子受体、白细胞介素6在促分裂素原活化蛋白激酶、血管内皮生长因子为核心靶基因,通过KEGG通路分析显示,杞蓉片治疗POI的生物信号通路主要集中在磷脂酰肌醇3激酶和蛋白激酶B、缺氧诱导因子1等。分子对接结果显示大部分靶点与成分结合活性较强。结论:杞蓉片通过多种成分、多核心靶点参与了一系列通路,通过发挥多种生物、分子过程来治疗POI。

关键词： 白芍   网络药理学   非酒精性脂肪性肝病   作用机制  

摘要： 目的本研究运用网络药理学的研究方法探索白芍治疗非酒精性脂肪性肝病的作用机制。方法通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库筛选出白芍的有效成分及主要成分靶点;运用Genecards数据库查找疾病靶点基因;通过Venny2.1在线作图工作平台获取白芍成分靶点与疾病靶点的交集图,通过Cytoscape3.7.2软件构建白芍-活性成分-靶点网络;并通过String数据库构建PPI蛋白网络、DAVID数据库进行基因GO分析和KEGG通路分析。结果通过筛选共获得白芍有效成分13个,药物靶点基因264个,疾病靶点基因有950个,共取得交集靶点基因83个。基因GO分析得出白芍主要参与RNA聚合酶II启动子转录的正向调节、细胞凋亡过程的负调节、蛋白质结合等多种生物过程。KEGG通路分析得出癌症的途径、HIF-1信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化等20条与之密切的相关通路。结论白芍通过多靶点、多途径发挥其治疗非酒精性脂肪性肝病的作用。