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关键词： 化瘀消痞汤   萎缩性胃炎癌前病变   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术预测化瘀消痞汤干预萎缩性胃炎癌前病变(Precancerous lesions of gastric cancer,PLGC)作用靶点和分子机制,并进行实验验证。方法60只SPF级SD雄性大鼠,随机选取10只为空白对照,其余大鼠进行PLGC模型复制,造模成功后随机分为模型组,叶酸组(2 mg·kg^(-1)·d^(-1)),化瘀消痞汤高、中、低剂量组(24.8、12.4、6.2 g·kg^(-1)·d^(-1)),连续给药干预90天,记录大鼠体质量和3 h进食量,HE染色观察大鼠胃组织病理形态;采用网络药理学和分子对接技术预测化瘀消痞汤干预PLGC的潜在靶点,采取Western blot技术对核心靶点进行验证。结果与空白组比较,模型组大鼠体质量和3 h进食量明显降低(P<0.05),镜下见大鼠胃黏膜明显变薄,腺体明显减少并且排列紊乱,部分区域可见肠上皮化生的杯状细胞及大量炎性细胞浸润,与模型组相比较,各给药组大鼠体质量和3 h进食量不同程度改善,化瘀消痞汤中、高剂量改善明显(P<0.05),大鼠胃黏膜不同程度的修复,腺体排列趋于整齐,间质炎性细胞逐渐减少。网络药理学及分子对接结果表明TP53、JUN、MAPK3/1(ERK1/2)是化瘀消痞汤干预PLGC的核心靶点。分子生物学检测结果显示:与空白组相比较,模型组大鼠胃组织中TP53、c-Jun、ERK1/2蛋白磷酸化水平显著升高(P<0.05);与模型组相比较,各给药组大鼠胃组织中TP53、c-Jun、ERK1/2蛋白磷酸化水平不同程度降低,其中化瘀消痞汤高、中剂量组显著降低(P<0.05)。结论化瘀消痞汤可明显改善PLGC大鼠生存状况,促进胃黏膜修复,其具体机制可能与化瘀消痞汤降低PLGC大鼠胃组织中ERK1/2、c-Jun、TP53蛋白磷酸化水平,进而调节下游信号分子响应有关。

关键词： 黄芩   2型糖尿病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接技术系统分析黄芩治疗2型糖尿病的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)挖掘收集黄芩的化学成分,经口服生物利用度(OB)、类药性(DL)、半衰期(HL)3个条件筛选得到药物的有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库进行有效成分靶点预测;同时从TTD、Drugbank和DisGeNET数据库对T2DM的靶点进行检索及筛选;成分靶点与疾病靶点映射后使用String数据库绘制核心靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;对核心靶点基因利用DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析;利用Cytoscape 3.6.1构建成分-靶点-通路网络,探讨黄芩治疗T2DM的潜在作用机制;应用SYBYL软件对黄芩活性成分与核心靶点进行分子对接以验证预测结果。结果从黄芩中筛选出29个化学成分,涉及治疗T2DM的26个靶点;GO分析结果表明其涉及细胞对缺氧的反应、血压调节、基因表达的昼夜调节等10个生物过程,涉及血红素结合、药物绑定、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性等10个主要分子功能,主要包括细胞内膜结合细胞器、rDNA异染色质、染色质沉默复合物等10个细胞组成;KEGG分析结果表明其可能通过AMPK、PPAR、胰岛素抵抗、化学致癌作用等10个主要信号通路治疗糖尿病。分子对接结果表明豆甾醇-PIK3CG、β-谷甾醇-ABCG2表现出较强的结合活性,黄芩素-PIK3CG、β-谷甾醇-PIK3CG、黄芩素-IGF1R、β-谷甾醇-IGF1R、去甲汉黄芩素-IGF1R等表现出较好的结合活性。结论黄芩通过多成分、多靶点、多通路治疗T2DM,为更全面深入地探究中药复方的作用机制提供理论支撑。

关键词： 欧前胡素   宫颈癌   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的探讨欧前胡素治疗宫颈癌的活性成分和作用机制。方法通过使用网络药理学筛选欧前胡素药用成分和疾病宫颈癌靶点并进行相关的分子对接技术验证。中草药系统药理平台查找欧前胡素的有效成分和作用靶点,采用OMIM和Gen⁃eCards数据库,对宫颈癌相关的目标基因进行交叉筛选,Cytoscape软件分析宫颈癌和欧前胡素的共同靶点,String数据库分析并建构PPI网络分析,Rstudo 4.0软件分析并绘图,DAVID生物信息数据库统计,GO富集、KEGG富集分析。分子对接使用AutoDock分析。结果PPI网络结果显示TERT、ESR1、PTGS2、PGR、PPARG、CA9、ESR2、AR、CASP9、ALPL、CLK1可能为欧前胡素和宫颈癌的核心靶点。GO富集得到26个生物过程,KEGG富集得到6条主要通路,包括Chemical cancer recep⁃tor activation、Estrogen、Breast cancer、VEGF、Prolactin等信号通路。分子对接结果显示LYS-243、ARG-240和GLU-272等化合物能与宫颈癌的核心靶点有良好的结合力。结论欧前胡素可能通过与ESR1、PGR、PTGS2、ESR2、CASP9等结合,在VEGE、雌激素、孕激素等信号通路发挥抗治疗宫颈癌的作用。

关键词： 网络药理学   白芷   色素沉着性疾病   自噬  

摘要： 目的利用生物信息学分析研究白芷有效成分靶基因及机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),分析白芷有效活性成分的靶基因;从综合数据库GeneCards中获取与黑色素相关的疾病靶基因,从芯片GSE114445中筛选色素沉着性疾病相关基因,取交集后获得白芷有效活性成分靶基因中与色素沉着性疾病相关的基因;从自噬数据库筛选自噬相关基因,与白芷有效活性成分靶基因中和色素沉着性疾病相关基因取交集,获得白芷有效活性成分靶基因中与色素沉着性疾病和自噬相关的基因;通过Metascape在线分析白芷有效活性成分靶基因中与色素沉着性疾病和自噬相关的基因富集通路。结果获得5342个白芷药靶基因,其中有152个和色素沉着性疾病相关基因,9个与色素沉着性疾病和自噬相关的基因;白芷有效活性成分靶基因中与色素沉着性疾病和自噬相关的基因主要富集在磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)、鼠类肉瘤病毒癌基因同源物(RAS)通路。结论筛选出的9个白芷药靶基因中与色素沉着性疾病和自噬相关的基因主要在PI3K-Akt、MAPK、RAS通路富集。本研究结果初步揭示了白芷药效的物质基础,为阐明白芷促进黑色素降解作用机制提供了参考。

关键词： 五汁饮   T2DM   网络药理学   蛋白互作   通路分析  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探究五汁饮治疗2型糖尿病(T2DM)作用靶点及机制。方法:通过文献检索和中药药理学系统分析平台(TCMSP)筛选五汁饮主要活性成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在靶点,采用Therapeutic Target Database(TTD)、DrugBank、DISGENET、Comparative Toxicogenomics Database数据库筛选T2DM疾病相关靶点。利用STRING数据库筛选出置信度最高(得分>0.900)的靶点并通过Cytoscape 3.7.1软件建立蛋白-蛋白互作网络图。利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO(gene ontology)富集分析及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析。结果:筛选出五汁饮活性成分15种及成分相关靶点182个,其中SRC、HSP90AA1、AKT1、JAK2、CDK1可能是五汁饮发挥效应的关键靶点;GO分析条目主要涉及促进细胞增殖、调控多条通路的激酶活性、调节脂质代谢等;涉及KEGG通路共计156条,主要包括调节AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、内分泌抵抗等。结论:五汁饮可能通过多种活性成分介导多靶点、多通路发挥治疗T2DM的作用。

关键词： 阿尔茨海默病   中药   网络药理学   分子对接   数据挖掘  

摘要： 目的基于数据挖掘和网络药理学探讨中药治疗阿尔茨海默病的作用机制。方法于Disgenet数据库、Genecards数据库中收集整理阿尔茨海默病备选靶点,借助String数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,进一步筛选疾病靶点,在TCMSP平台检索靶点对应药物成分与中药,并对中药性味归经进行统计分析,利用CytoScape3.9.1构建“靶点-成分”与“靶点-成分-中药”网络,筛选出核心靶点与核心成分,最后在AutoDockTools-1.5.7中进行分子对接验证。结果获得阿尔茨海默病备选靶点275个,靶点11个,药物成分40种,中药300味,核心成分包含槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-胡萝卜素、柚皮素、金合欢素、薯蓣皂苷元、汉黄芩素、黄芩素和花生四烯酸,核心靶点为TNF、TP53、IL6、AKT1、EGFR,核心成分与核心靶点能自发进行分子对接。中药性味多为寒、温、苦,主要归于肝经。结论黄酮类化合物、β-胡萝卜素、薯蓣皂苷元和花生四烯酸可能是干预AD的潜在成分。

关键词： 柚皮素   药理学特性   哮喘   肺炎   肺损伤   肺癌  

摘要： 柚皮素是一种属于黄酮类化合物的天然多酚类植物化学物质,被证实具备多种生物和药理活性,包括抗炎、抗氧化、抗过敏、抗病毒、抗肿瘤、免疫调节、抗糖尿病、抗动脉粥样硬化和神经保护等,其具有重要的药用价值,已成为多种疾病的潜在治疗药物。近年越来越多的研究发现,柚皮素对哮喘、肺炎、肺纤维化、肺损伤和肺癌等呼吸系统疾病均存在保护作用。因此,本文将基于柚皮素的药理学特性就其在呼吸系统疾病中作用机制的最新研究进展做一综述,以期为柚皮素的临床应用提供理论依据。

关键词： 犀角地黄汤   川崎病   过敏性紫癜   靶点   网络药理学  

摘要： 目的采用网络药理学方法分析犀角地黄汤治疗川崎病和过敏性紫癜“异病同治”机制,为相关研究提供参考。方法通过TCMSP数据库检索犀角地黄汤活性成分及作用靶点,利用GeneCards、OMIM、DrugBank数据库检索川崎病和过敏性紫癜的靶点基因,通过STRING平台构建蛋白相互作用网络,应用Metascape平台分析靶点参与的生物学过程及作用通路,构建犀角地黄汤成分-川崎病和过敏性紫癜靶点-通路网络,最后进行分子对接验证。结果犀角地黄汤治疗川崎病和过敏性紫癜的核心成分为槲皮素、山柰酚、黄芩素等,核心靶点有IL6、AKT1等。犀角地黄汤治疗川崎病和过敏性紫癜的生物学通路主要作用于血管病变通路及炎症因子通路,其功能主要为调节细胞因子及信号受体的生命活动等。GO富集分析结果显示,交集靶点富集于细胞因子相互作用及信号相互作用。结论犀角地黄汤通过保护血管内皮、抗炎、调节免疫等作用达到川崎病和过敏性紫癜“异病同治”目的,其机制可能是槲皮素等通过抑制IL6、AKT1生成,阻止TNF信号通路激活及保护流体剪切力谱。

关键词： 麦门冬汤   特发性肺纤维化   网络药理学   实验验证   自噬  

摘要： 目的:利用网络药理学方法并结合实验研究,深入探究麦门冬汤对特发性肺纤维化的治疗作用及其机制。方法:采用中药系统药理学数据库TCMSP、中国传统医学百科全书ETCM和SwissADME筛选并确定麦门冬汤中的活性成分。接着利用PubChem、SwissTargetPrediction和Uniport数据库挑选出中药活性成分的潜在作用靶标。借助GeneCards和OMIM数据库获取特发性肺纤维化的靶点基因。Venn diagrams绘图工具筛选出中药与疾病的交集靶点,利用Cytoscape3.9.1软件构建“中药-活性成分-疾病-靶点”网络关系图,并通过CytoNCA插件构建蛋白质相互作用网络,筛选得到核心靶点蛋白。运用DAVID进行GO及KEGG通路富集分析。最后使用博来霉素建立SD大鼠肺纤维化模型,观察大鼠肺组织肉眼标本及病理切片,并对其进行实时荧光定量PCR分析,比较治疗组与对照组TGF-β1、α-SMA、IL-4、IFN-γ、LC3-Ⅱ、beclin1的mRNA表达水平。结果:本研究共筛选得到麦门冬汤治疗IPF的作用靶点402个,其中核心靶点50个,对应5种中药的159种有效成分。GO富集分析和KEGG富集分析涉及PI3K-AKT信号通路、MAPK信号通路等信号通路治疗特发性肺纤维化。动物实验结果显示,与模型对照组相比,麦门冬汤治疗组可显著下调TGF-β1、α-SMA、IL-4 mRNA的相对表达水平(P<0.05),显著上调LC3-Ⅱ、beclin1、IFN-γmRNA的相对表达水平(P<0.05)。结论:本研究提示,麦门冬汤中关键活性成分可能在细胞自噬、炎症反应、巨噬细胞极化等生物过程方面发挥作用,发挥改善肺纤维化的作用。