课程文献中心 更多>>

关键词： 围绝经期   听力损失   左慈丸   中药化学成分   网络药理学   分子对接  

摘要： 背景近年来,围绝经期听力损失(PMS-HL)症状得到普遍关注,但无针对性治疗。左慈丸治疗耳聋已有百年历史,但尚无该药治疗PMS-HL的相关研究。目的在网络药理学和分子对接技术的基础上,进一步通过动物实验验证,初步探讨左慈丸对PMS-HL的作用机制及治疗靶点。方法检索数据库时限均为建库至2023年2月。根据左慈丸的组方,通过TCMSP和Uniprot数据库挖掘该药物活性成分和作用靶点,根据GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、PharmGKB数据库获取PMS-HL的蛋白靶点,取其交集,筛选左慈丸治疗PMS-HL的潜在治疗靶点,构建“药物-活性成分-靶点”相互作用网络图。利用String数据库的蛋白相互作用分析功能筛选核心靶点。采用Metascape数据库对蛋白的功能及其通路进行富集分析。使用Autodock和Pymol对核心蛋白进行分子对接,确定核心靶点与左慈丸的关键活性成分之间的结合能力。于2022年9月—2023年1月建立绝经大鼠模型:假手术组(SHAM)组、去卵巢组(OVX)组、左慈丸(ZCW)组,并检测血清中关键蛋白白介素1β(IL-1β)水平,使用SPSS26.0进行统计分析。结果左慈丸组方中化合物的活性成分90个,潜在蛋白靶点226个,PMS-HL相关靶点2481个,左慈丸与PMS-HL交集靶点150个。基因本体论(GO)功能中获得生物过程共183个条目,分子功能103个条目,细胞成分103个条目;京都基因和基因组百科全书(KEGG)前三位分别是癌症通路、脂质与动脉粥样硬化病变通路和化学致癌的受体激活通路。分子对接显示,左慈丸治疗PMS-HL的主要活性成分有槲皮素、山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇、异鼠李素、薯蓣皂苷、四氢鸭脚木碱和海风藤酮;左慈丸的活性成分与核心靶蛋白:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、白介素6(IL-6)、血管内皮生长因子(VEGFA)、胱天蛋白酶3(CASP3)、IL-1β、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)结合能稳定。3组大鼠血清IL-1β水平比较,差异有统计学意义(F=11.73,P<0.001)。结论左慈丸中的槲皮素等90个活性成分通过作用于AKT1等226个潜在蛋白,实现调控组织细胞的抗氧化应激、调节血脂血糖代谢、抗肿瘤等途径,直接或间接地起到保护围绝经期听力功能的作用,IL-1β可能是其中发挥作用的关键靶蛋白。

关键词： 二至丸   早发性卵巢功能不全   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学方法探讨二至丸治疗早发性卵巢功能不全(POI)的可能分子作用机制。方法使用网络药理学平台(TCMSP)采集二至丸的有效成分和相关的基因;通过基因组注释数据平台(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)数据库获取POI疾病靶点;用蛋白互作网络数据库(STRING)构建蛋白质相互作用网络(PPI),通过CytoHubba筛选核心靶点。使用生物学信息注释数据库(DAVID)平台进行富集分析,采用Cytoscape 3.10.0软件进行拓扑学分析,利用AutoDockTools进行分子对接。结果二至丸内最主要的有效成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、刺槐素等,其中的AKT1、TP53等是关键靶点,包含的通路主要为PI3K-Akt信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路等。分子对接验证大部分靶点与成分能进行有效结合。结论揭示二至丸能够经多种成分、靶点及多条信号通路对POI发挥协同治疗作用。

关键词： “互联网+”   药理学   课程思政  

摘要： 本文旨在分析“互联网+”时代《药理学》课程思政建设,并探讨其对学生专业能力和思政教育的影响。研究现有的教育模式与《药理学》课程内容,可以发现利用互联网技术可以为学生提供更广泛、便捷的学习资源,增强他们的信息获取能力和创新精神。此外,在课堂教学中,将思想政治教育元素融入教学环节,可以提升学生的爱国主义情操,提高职业操守及道德水准,实现立德树人、润物细无声的效果。综上所述,《药理学》课程思政建设需要紧跟时代发展潮流,以适应学生全面发展的需求。

关键词： 拔尖创新人才培养   思想政治   药理学   药理学实验   课程群  

摘要： 拔尖创新人才培养是教育强国和人才强国的重大举措。我们通过多种方式,探索并实践了思政引领的、具有两性一度特色的药理学课程群建设。本文以药理学、临床药理学、药理学实验组成的课程群为例,探索强基础、宽视野、科研素质高的药学拔尖学生培养的药理学课程群生态体系。

关键词： 菊花   槲皮素   木犀草素   视神经病变   网络药理学   氧化应激反应   TNF   IL6   IL1B  

摘要： 通过TCMSP数据库对菊花活性成分进行筛选,预测菊花活性成分的潜在靶点并收集该疾病的靶点。分析构建中药成分靶点网络,蛋白互作(PPI)网络以及核心靶点,根据靶点GO分析和KEGG通路富集分析,由分子层面验证菊花有效成分同关键靶点分子的对接状况。在治疗视神经病变方面,菊花有效成分主要涉及木犀草素、山萘酚、槲皮素与金合欢素。通过调控关键靶点蛋白TNF、IL6、IL1B、JUN、TP53、VEGFA、EGFR、CCL2、CAT、PPARG表达,涉及氧化应激反应,细胞对氮化合物的反应,细胞凋亡与衰老、炎症反应等,减缓神经发生病变。研究结果表明菊花可能通过多组分、多靶点、多途径治疗青光眼,但这一结果还需更多实验验证。

关键词： 桑叶   口腔疾病   野生动物   网络药理学   R语言  

摘要： 为探究桑叶对防治圈养野生动物口腔疾病的活性成分和作用位点,本研究基于TCMSP中药系统药理学数据库与分析平台获取桑叶的有效成分和预测靶标,与GeneCards、OMIM上关于口腔疾病的相关靶点进行比对,对结果进行注释并上传至stringppi和构建蛋白质互作网络,并通过cytoscape构建MPPD-桑叶-有效成分-靶点关系网,利用R语言对相关靶点进行KEGG和GO富集分析。桑叶中的桑辛素家族、槲皮素、山奈酚等24种物质,可以作用于ALB、AKT1、IL6、TNF等115个口腔疾病相关位点。GO功能和KEGG富集分析显示,桑叶防治口腔疾病的机理与调节血糖血脂有关,通过调节DNA结合和转录因子结合、RNA聚合酶II特异性DNA结合和转录因子结合、转录协同调节子结合、细胞因子受体结合等实现多基因功能。桑叶具有通过调节血糖血脂,防治口腔疾病的功能,可以通过饲喂桑叶减少圈养野生食草动物牙病的发病率。本研究为桑叶防治口腔疾病提供了理论依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   酸枣仁汤   阿尔茨海默病   睡眠障碍   异病同治  

摘要： 目的探讨酸枣仁汤“异病同治”阿尔茨海默病(AD)和睡眠障碍(SD)的共性药效物质基础及作用机制。方法通过TCMSP中草药系统药理学平台和人类基因(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、DisGeNET、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、Drugbank数据库检索酸枣仁汤的化学成分、靶点和AD、SD疾病的靶点;利用Cytoscape3.7.2软件、String数据库、R4.1.3软件、Autodock Vina1.2.2软件和Auto Dock Tools1.5.6软件构建药物-活性成分-共有靶点-疾病网络关系图、蛋白相互作用(PPI)网络模型、基因本体论(GO)功能、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集和分子对接。结果经筛选后从酸枣仁汤中得到108种活性成分、220个作用靶点;关键活性成分为7-甲氧基-2-甲基异黄酮、柚皮素、豆甾醇等;酸枣仁汤治疗AD和SD的重要靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt)1、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-1β、血管内皮生长因子(VEGF)A等;其主要参与的通路有缺氧诱导因子(HIF)-1、TNF、IL-17信号通路等;分子对接结果表示活性成分与核心靶点均有较好的结合效果。结论酸枣仁汤“异病同治”AD和SD的共性药效物质基础为7-甲氧基-2-甲基异黄酮、柚皮素、豆甾醇等,其共同作用机制可能与Akt1、TNF、IL-1β调控HIF-1、TNF、IL-17信号通路等有关。

关键词： 大黄   炒炭   芍药汤   溃疡性结肠炎   UPLC-QE-Orbitrap-MS   网络药理学  

摘要： 基于生大黄与大黄炭治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的药效差异,结合超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱联用(UPLC-QE-Orbitrap-MS)技术及网络药理学探索生大黄与大黄炭的差异成分及其作用机制。使用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium,DSS)诱导的小鼠模型评价生大黄与大黄炭分别组方的芍药汤(Shaoyao Decoction,SYD)治疗UC的药效,结果表明生大黄与大黄炭分别组方的芍药汤均能在不同程度上改善小鼠UC疾病症状,大黄炭组方在减轻血性腹泻、降低炎症水平方面更具优势。采用UPLC-QE-Orbitrap-MS共鉴定出生大黄与大黄炭水煎液中78种小分子化合物,通过多元统计方法筛选得到炒炭后含量明显升高的7种成分包括5种游离蒽醌、没食子酸、5-羟甲基糠醛,炒炭后含量明显降低的9种成分为结合蒽醌、儿茶素类化合物等。网络药理学与分子对接结果表明游离蒽醌、没食子酸及5-羟甲基糠醛可能作用于B细胞淋巴瘤-2(B-cell lymphoma-2,BCL2)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)等核心靶点,干预磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(phosphoinositide-3-kinase/protein kinase B,PI3K/Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、TNF、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等信号通路,调控机体炎症、氧化应激及细胞凋亡过程,发挥UC治疗作用。该研究对大黄炒炭后药效及物质基础变化进行了分析,为临床治疗UC的大黄用药选择提供了参考。

关键词： 动脉粥样硬化   加味血脉通2号颗粒   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学方法分析加味血脉通2号颗粒抗动脉粥样硬化(AS)的作用靶点及信号通路,进而探讨其潜在作用机制。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),中医药研究整合数据库(TCMID)及Swiss Target Prediction数据库筛选加味血脉通2号颗粒相关活性成分及靶点;通过Gene-Cards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库查找与AS相关的靶点,并将二者靶点通过基因标准化后进行映射;运用Cytoscape 3.7.1软件构建“化合物-靶点”网络图,利用STRING数据库绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共筛选得到活性成分140个,成分相关靶点943个,AS疾病靶点2157个,药物-疾病的交集靶点389个;GO功能富集分析得到GO条目1291个,其中生物过程(BP)条目943个、细胞组成(CC)条目98个、分子功能(MF)条目250个,主要涉及炎症反应、细胞外基质分解、酶结合、类固醇激素受体活性等;KEGG通路富集分析得到信号通路149条,主要涉及Toll样受体信号通路、癌症、肿瘤坏死因子、缺氧诱导因子-1信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。结论加味血脉通2号颗粒可能是熊果酸、谷甾醇等通过丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)1、MAPK3、MAPK8、白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶(MMP)2、MMP9等多靶点调节炎症反应、细胞凋亡、氧化应激而治疗AS。

关键词： 盐敷方   膝骨关节炎   网络药理学   信号通路   作用机制  

摘要： 目的:探讨盐敷方组方治疗膝骨关节炎可能的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选盐敷方的活性成分及其对应的靶点基因,并用UniProt数据库对基因名进行校正,通过Disgenet和Drugbank数据库获取膝骨关节炎的疾病靶点,并得到盐敷方与膝骨关节炎的共同靶点,利用Cytoscape3.10.0软件绘制“盐敷方成分靶点网络图”,利用String数据库构建盐敷方与膝骨关节炎共同靶点PPI网络,利用Cytoscape数据库进行GO及KEGG富集分析。结果:(1)共筛选出盐敷方活性成分86个及活性成分作用靶点255个;(2)与疾病的交集靶点共有51个,核心靶点为TNF、IL-6、IL-1β、ALB、PTGS2等;(3)GO分析结果共涉及882个生物学过程(BP)、26种细胞成分(CC)、78个分子功能(MF);(4)KEGG分析结果显示,盐敷方治疗膝骨关节炎的信号通路主要有IL-17、肿瘤坏死因子、类风湿关节炎、核因子κB等信号通路。结论:盐敷方可通过下调细胞因子表达、抑制炎症反应、减慢软骨降解退变等途径来延缓膝骨关节炎的发展。