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关键词： 益气养阴化浊通络方   糖尿病肾病   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的:通过网络药理学技术探究益气养阴化浊通络方治疗糖尿病肾病的分子机制。方法:通过TCMSP数据库获取益气养阴化浊通络方相关药物靶点,GeneCard、OMIM及PharmGkb数据库获取糖尿病肾病相关靶点。Venny R软件获取益气养阴化浊通络方治疗糖尿病肾病的潜在靶点,Cytoscape 3.8.0软件构建药物-有效成分-靶点-疾病网络图。对潜在靶点进行PPI互作网络分析、GO功能及KEGG通路富集分析。结果:共获取益气养阴化浊通络方有效成分66个,有效靶点254个,糖尿病肾病相关靶点4755个,取交集后获取潜在靶点179个。PPI分析获取核心靶点MAPK3、TP53、MAPK1、HSP90AA1、JUN、AKT1、RELA、MAPK14等;GO功能富集分析体现在对氧化应激的反应、细胞对化学压力的反应、对外来刺激的反应、对活性氧的反应等;细胞组分多在膜筏、膜微域、转录调节因子、复合囊泡腔等;分子功能多在DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、核受体活性、配体激活的转录因子活性等;KEGG通路富集分析多在糖尿病并发症中的脂质与动脉粥样硬化、年龄-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、前列腺癌、乙肝、人巨细胞病毒感染、化学致癌-受体激活及流体切应力与动脉粥样硬化等通路。结论:通过网络药理学技术探究益气养阴化浊通络方治疗糖尿病肾病的作用机制,为后续相关研究提供理论依据和数据支撑。

关键词： 复方木鸡颗粒   肝癌   网络药理学   生物信息学   分子对接   作用机制  

摘要： 利用网络药理学和生物信息学方法揭示复方木鸡颗粒治疗肝癌的作用机制。通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库分别获取复方木鸡颗粒的活性成分以及相关靶点;在GEO数据库筛选肝癌的相关靶点;利用Venny 2.1在线平台获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物–成分–靶点–疾病网络;用STRING数据库构建PPI网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;利用Kaplan Meier-Plotter数据库对关键基因的表达量及预后关联性进行分析;运用AutoDock软件对关键成分和靶点进行分子对接验证。复方木鸡颗粒中共获得37个活性成分,筛选出57个共有靶点,涉及生物过程98条、细胞成分17条、分子功能37条,介导15条信号通路。生存期分析结果显示,ESR1、CYP3A4、G6PD基因的表达量与肝癌患者的生存期具有相关性。分子对接表明筛选的6个活性成分与6个关键靶点蛋白之间具有较好的结合能力。复方木鸡颗粒中的大豆皂苷C、柚皮素、β-谷固醇、汉黄芩素等活性成分可以作用于ESR1、CYP3A4、G6PD等靶点,可能通过P53、戊糖磷酸途径、MAPK等信号通路发挥治疗肝癌的作用。

关键词： 儿童   肺炎支原体肺炎   麻黄化瘀汤   作用机制   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学的方法探究麻杏化瘀汤主要成分治疗儿童肺炎支原体肺炎(MPP)的可能分子机制。方法在中药系统药理学分析平台(TCMSP)中检索并提取麻杏化瘀汤的有效活性成分及相关作用靶点;在疾病靶点筛选数据库Genecards和OMIM中筛选出儿童MPP的相关基因,与药物作用靶点取交集,筛选出麻杏化瘀汤治疗儿童MPP的潜在靶点,并构建药物-化学成分-关键靶点网络图;采用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用(PPI)网络;对关键靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果筛选出麻杏化瘀汤有效活性成分共126个,药物靶点与疾病靶点的交集靶点共78个。GO富集得到了632个条目,包括生物过程497个、分子功能91个、细胞组分44个。KEGG富集分析得到相关通路134个,主要与胞内磷脂酰肌醇激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、T细胞17(Th17)细胞分化有关。结论本研究基于网络药理学筛选出了麻杏化瘀汤治疗儿童MPP的关键作用靶点和信号通路,这些靶点、通路与儿童MPP密切相关,各个通路、靶点之间相互联系、影响,产生协同效应,从侧面证实了麻杏化瘀汤治疗儿童MPP的复杂机制。

关键词： 蒙药   胡日查-6   变应性鼻炎   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的基于网络药理学及动物实验探讨蒙药胡日查-6治疗变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)的作用机制。方法从TCMSP数据库和文献获得胡日查-6的化合物及靶点,OMIM、TTD、Disgenet和GeneCards数据库搜索AR相关靶点,后将胡日查-6靶点与AR靶点取交集,构建“化合物—交集靶点”网络,选择关键化合物并应用STRING数据库绘制PPI蛋白互做网络进行核心靶点的筛选。使用R语言对交集靶点进行基因本体富集(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,借助AutoDockVina软件对关键化合物及靶点进行分子对接验证。构建AR豚鼠模型,以胡日查-6治疗6周后,对豚鼠鼻部症状进行行为学评分,取鼻黏膜组织进行HE染色观察病理改变,ELISA检测豚鼠血清IL-4、IFN-γ水平。结果筛选出胡日查-6治疗AR的可能靶点为107个,胡日查-6治疗AR相关的化合物30个,槲皮素、木犀草素、山柰酚、异鼠李素、奎宁等为关键化合物,核心靶点为VEGFA、STAT3、IL-1B、IL-6、ALB等。KEGG通路分析主要涉及TNF、IL-17、Toll样受体和HIF-1等多条信号通路,分子对接显示关键化合物与核心靶点之间具有较强的结合能力。动物实验表明,胡日查-6能够有效减轻豚鼠鼻部症状,改善鼻黏膜病理改变,降低豚鼠血清中IL-4水平,提高IFN-γ水平。结论胡日查-6通过多靶点、多通路治疗AR,并可能通过参与炎症反应减轻鼻黏膜组织炎性浸润、缓解AR。

关键词： 数据挖掘技术   网络药理学   藏药   慢性萎缩性胃炎  

摘要： 目的研究藏药治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的作用机制。方法在中国知网、万方数据库、维普期刊数据库检索藏药治疗CAG的藏药复方。对符合纳入排除条件的文献进行信息提取,构建数据库统计高频词藏药,进行关联度分析,获取藏药治疗CAG的核心药物。在TCMSP数据库检索藏药活性成分及作用靶点,利用GeneCads、OMIM在线数据库获取疾病靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定藏药治疗CAG的潜在靶点,应用String数据库、Cytoscape 3.7.1软件构建“藏药-活性成分-潜在靶点”相互作用网络与蛋白相互作用(PPI)图。使用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果共纳入藏药复方78个,包含136味藏药。根据置信度与关联性选取诃子、豆蔻、荜茇、石榴子四味核心药物,筛选出槲皮素、木犀草素、玫瑰树碱、鞣花酸、胡椒碱、去氢二异丁香酚等32个药物活性成分,核心靶点为AKT1、TNF、IL6、TP53、MMP9、HIF1A、CASP3、BCL2、IL1B、PTGS2等92个,获得747条GO条目,KEGG富集条目涉及癌症相关通路、脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE等共139条通路。结论通过数据挖掘筛选出豆蔻、荜茇、石榴子和诃子这四味藏药作为藏药治疗CAG的核心药物,并运用网络药理学方法分析得出这四味藏药可能通过下调AKT1、TNF、IL6和TP53等基因的表达抑制炎症因子的释放;并通过调控癌症相关通路、脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17等信号通路直接或间接参与机体抗炎、抗氧化、促进血管再生等过程发挥治疗CAG的作用。

关键词： 乳腺康注射液   乳腺癌   网络药理学   分子对接   作用机制   TP53  

摘要： 利用网络药理学和分子对接技术探讨乳腺康注射液治疗乳腺癌(Breast Cancer,BC)的有效成分和作用机制.通过TCMSP数据库和查询文献获取乳腺康注射液中的中药活性成分及其作用靶点,检索乳腺癌疾病相关靶点,两者取交集后,使用Cytoscape 3.9.0建立“药物-成分-共同靶点”网络.将共同靶点输入String数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图.将相同的靶基因输入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.根据活性成分节点和靶点的适当参数进行排序,使用PyMol软件对筛选到的靶基因编码的蛋白质和核心成分进行分子对接.共筛选出106个潜在活性成分和891个作用靶点,乳腺癌疾病相关靶点1341个,药物疾病交集靶点为236个,PPI网络及拓扑学分析显示TP53、EGFR、VEGFA、ESR1、HRAS、STAT3、CCND1、SRC等是乳腺康注射液治疗BC的核心靶点.GO功能富集分析显示主要参与酶的调控、RNA转录等生物过程.KEGG通路富集分析得到了癌症信号通路、PIK3/AKT、Hepatitis B等20条相关性最高的通路.将核心靶点编码蛋白与活性成分对接,结果良好.通过网络药理学探讨和分子对接验证,显示乳腺康注射液可能通过多靶点、多信号通路发挥干预乳腺癌的形成和治疗疾病的作用.

关键词： 桑叶   免疫调节   网络药理学   作用机制   信号通路  

摘要： 基于网络药理学分析桑叶调控免疫功能的作用机制。依托TCMSP数据库获得桑叶有效活性成分和相应作用靶点,构建有效成分——靶点网络图。结合Genecards、OMIM等数据库筛选桑叶免疫调节交集基因,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),并对核心靶点进行GO功能富集和KEGG通络分析。研究结果显示,桑叶的主要成分槲皮素、山柰酚、花生四烯酸、β-谷甾醇、四甲氧基木犀草素和豆甾醇等作用于TP53、AKT1、TNF、ESR1、IL6等关键靶点,参与癌症、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等,发挥了免疫调节作用。桑叶具有多成分、多靶点及多途径的特点,对免疫调节起到了良好的作用,为桑叶在畜禽养殖中的应用提供依据。

关键词： 麻黄   桂枝   变应性鼻炎   网络药理学   分子对接   靶点   通路  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接技术研究麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎的作用机制。方法:应用TCMSP数据库和UnitProt数据库筛选麻黄-桂枝药对的活性成分和作用靶点,并应用OMIM、GeneCards、DrugBank、TTD数据库获得变应性鼻炎的疾病作用靶点,取两者交集,获得麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎的作用靶点并绘制韦恩图;应用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;应用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白质相互作用网络,并进行拓扑分析;应用Metascape数据库进行KEGG富集分析与GO富集分析;应用Pubchem数据库、Chem3d软件等对关键成分和靶点进行分子对接验证。结果:获得麻黄-桂枝药对的活性成分27个,作用于变应性鼻炎的靶点109个;关键活性成分主要为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素等;关键靶点主要为TNF、RMLA、IL-6、AKT1等;主要通过PI3K-Akt、TNF、AGERAGE、IL-17等信号通路发挥治疗作用;分子对接结果显示成分和靶点具有良好的结合性。结论:阐明了麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎多成分、多靶点、多通路的作用机制,为进一步深入研究提供方向和依据。

关键词： 药理学   镇痛药   课程思政   思政元素  

摘要： 药理学主要讲授药物作用、临床应用和用药指导,在进行爱国主义教育、价值观引导、责任意识培育等方面具有天然优势。从育人困境、改革意义、设计思路、课程单元思政实施四个方面,探讨思政育人的必要性,探究思政元素融入课堂教学的实现路径和改革效果,以期实现专业教学和思政教育的水乳交融。

关键词： 感咳颗粒   急性肺损伤   入血成分   网络药理学   炎症反应   中性粒细胞胞外诱捕网   SRC/ERK1/2/STAT3  

摘要： 依据感咳颗粒在大鼠体内的入血成分研究基础,结合网络药理学、分子对接和动物实验验证探究感咳颗粒干预急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的潜在作用机制。将感咳颗粒的大鼠入血成分导入SwissTargetPrediction平台预测药物靶点,从疾病数据库收集ALI相关靶点,取交集并构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心靶点,随后进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Gnomes,KEGG)通路富集分析。构建“入血成分-靶点-通路-疾病”网络,根据其拓扑参数筛选感咳颗粒干预疾病的核心成分。借助分子对接预测核心成分与关键靶点的结合能力。通过脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的ALI小鼠模型验证感咳颗粒干预急性肺损伤的关键靶点。PPI拓扑参数分析得到与ALI有关的STAT3、SRC、HSP90AA1、MAPK3、HRAS、MAPK1前6个关键靶点。GO功能分析可知主要与ERK1和ERK2级联、炎症反应、对脂多糖反应等有关;KEGG分析结果显示,主要富集通路显示为MAPK、中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular trap,NET)形成等。根据“入血成分-靶点-通路-疾病”网络拓扑参数分析筛选出前6个核心成分(五味子酯乙、五味子醇甲、五味子醇乙、哈巴俄苷、异鸢尾黄素、颈花胺)。分子对接结果显示6个核心成分和该颗粒含量最高的射干苷与MAPK3、SRC、MAPK1、STAT3关键靶点具有较高的亲和力。体内实验结果表明,与模型组相比,感咳颗粒能有效缓解LPS诱导的小鼠肺组织病理损伤,抑制炎性浸润,降低支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中总蛋白含量、一氧化氮(nitric oxide,NO)与髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)水平,以及肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、干扰素γ(interferon-γ,IFN-γ)、白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)以及趋化因子(C-X-C基序)配体1[chemokine(C-X-C motif)ligand 1,CXCL1]含量,显著下调肺组织中淋巴细胞抗原6G(lymphocyte antigen 6G,Ly6G)、瓜氨酸化组蛋白3(citrullinated histones 3,Cit-H3)表达水平及SRC、ERK1/2、STAT3磷酸化蛋白表达水平。综上,感咳颗粒可有效抑制LPS诱导的急性肺损伤炎症反应,保护肺组织,调节炎性因子释放,抑制中性粒细胞浸润及NET形成,作用机制可能与抑制SRC/ERK1/2/STAT3信号通路激活有关。