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关键词： 糖尿病视网膜病变   通脉糖眼明胶囊   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨通脉糖眼明胶囊对糖尿病视网膜病变(DR)的作用机制。方法:通过TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction等数据库和相关文献获取通脉糖眼明胶囊中药物的主要化学成分及其靶点,运用UniPort数据库进行基因名称统一,运用Cytoscape软件构建药物-化合物-靶点作用网络图;通过GeneCards数据库筛选DR的相关靶点,获取与药物作用靶点交集,基于STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过Metascape平台对活性成分靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDock Vina对活性成分与关键靶点进行分子对接。结果:通脉糖眼明胶囊中含有99种活性成分,对应DR 92个靶点;主要通过肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤蛋白P53(TP53)、趋化因子配体2(CCL2)等关键靶点发挥疗效,主要途径为糖尿病并发症中的晚期糖基化产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等;具体生物学功能表现在正向调控细胞因子受体结合、蛋白质均二聚活性、转录共激活因子结合、氧化还原酶活性、激酶结合的调节等;分子对接结果显示,筛选的主要活性成分及靶点蛋白具有较好的结合活性。结论:本研究初步揭示了通脉糖眼明胶囊通过多成分、多靶点、多通路治疗DR的作用机制,为临床应用提供了理论依据。

关键词： 中药药理学   课程思政   学思践悟   教学改革  

摘要： 结合中药药理学教学实际,从挖掘多功能课程思政元素、构建多维度课程思政体系、创新多元化思政教学方法、建立全方位课程思政的评价体系等四方面阐述了多维度思政元素在中药药理学教学中的应用策略,旨在进一步培养学生大格局、大智慧、大情怀的思政教育目标,引导学生树立正确的中医药科学观、认知观和价值观,培植守护中医药伟大宝库的职业素养和社会责任。

关键词： 网络药理学   破格救心汤   急性心力衰竭   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学研究方法对破格救心汤(PJD)治疗急性心力衰竭(AHF)主要活性成分及核心靶基因进行分析。方法采用中药系统药理学分析平台获得破格救心汤的有效活性成分及作用靶点基因,然后通过GeneCards数据库收集AHF疾病基因,然后对药物作用基因及疾病相关基因进行韦恩分析,确定药物作用交集靶点,然后取交集靶点进行综合分析。结果研究发现破格救心汤治疗AHF的主要活性成分为槲皮素、山柰酚、谷固醇、柚皮素、人参皂苷-Rh2等,主要调控的关键基因为胱天蛋白酶3、禽肉瘤病毒17的假定转化基因、血管内皮生长因子A、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53、雌激素受体α、白细胞介素-6、低氧诱导因子-1A、肿瘤坏死因子和丝氨酸/苏氨酸激酶-1。结论本研究结果初步探讨了破格救心汤治疗AHF的基本药理作用及其机制,并为进一步的试验研究奠定了良好的基础。

关键词： 齐墩果酸   非酒精性脂肪肝   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接等方法,分析齐墩果酸(OA)治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)的作用机制。方法利用TCMSP、SwissTargetPrediction数据库和文献研究收集OA的潜在靶点(检索截止时间:2023年11月10日);利用GeneCards和OMIM数据库收集NAFLD相关靶点(检索截止时间:2023年11月10日)并与OA靶点进行交叉匹配,得到OA治疗NAFLD的潜在靶点。构建蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络筛选核心靶点。进行GO和KEGG富集分析,进一步构建“成分-靶点-关键通路”网络。采用分子对接技术验证OA与核心靶点之间的相互作用,以验证网络药理学预测结果的准确性。结果通过文献和各数据库检索得到OA靶点94个、NAFLD靶点2816个,交集得出63个OA治疗NAFLD的潜在靶点。PPI网络分析发现PPARG、PPARA、PTGS2、ESR1和HMGCR等可能是OA治疗NAFLD的核心靶点。KEGG结果显示,潜在靶点主要富集在PPAR信号通路。进一步分子对接结果显示,OA与上述核心靶点的结合能均<-7 kcal/mol,有较高结合性能,与网络药理预测结果相符。结论OA可能是治疗NAFLD的候选药物,其可能通过调控多靶点实现治疗NAFLD的作用。该研究为OA治疗NAFLD的药理研究及临床应用提供参考。

关键词： 臭灵丹草   新型冠状病毒感染   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:探寻云南特色中药材臭灵丹草防治新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的潜在效应物质基础及可能的分子机制,为COVID-19的中医药治疗及科研提供参考。方法:借助中国知网、万方、BATMAN-TCM数据库检索臭灵丹草的中药化学成分和作用靶点。通过GeneCards数据库筛选出COVID-19的疾病靶点。使用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和潜在靶点的相互作用关系,通过Metascape富集分析预测核心模块和作用机制。将主要活性成分分别与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的3-胰凝乳蛋白酶样蛋白酶(3-chymotrypsin-like Protease,3CLPro)和血管紧张素转换酶2(Angiotensin Converting Enzyme 2,ACE2)进行分子对接。结果:挖掘出臭灵丹草中43种化学成分、285个药物靶点,COVID-19相关疾病靶点475个,二者的交集靶点有29个,主要化学成分有3个。关键靶点涉及半胱氨酸蛋白酶-3、白细胞介素-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ、前列腺素-内过氧化物合酶2、白细胞介素-1B、一氧化氮合酶3、白细胞介素-13、C反应蛋白等。基因本体论(GO)功能富集分析共得到条目78个,主要涉及细胞因子受体结合、受体配体活性、细胞因子反应、泛素蛋白连接酶结合等。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析筛选出48条信号通路,包括流体剪切应力与动脉粥样硬化、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、细胞凋亡、乙型肝炎、人巨细胞病毒感染、TNF信号通路等。分子对接发现槲皮素、臭灵丹酸、β-谷甾醇、柽柳素、臭灵丹二醇、洋艾素、金腰乙素、冬青酸等与3CLPro和ACE2均形成氢键作用,并有较好的结合力。结论:臭灵丹草可能主要通过调节机体免疫和炎症反应等对COVID-19发挥潜在的防治作用。

关键词： 网络药理学:尖锐湿疣   派特灵   基因本体功能富集分析   京都基因与基因组百科全书通路分析  

摘要： 目的基于网络药理学研究外用派特灵治疗尖锐湿疣(CA)的作用机制。方法基于网络药理学的方法,经研究表明派特灵是主要由金银花、苦参、白花蛇舌草、鸦胆子、五倍子、蛇床子和大青叶等组成的中药复方制剂,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取派特灵主要组成中药的活性成分与相应靶点;通过GeneCards数据库获得与CA相关的疾病靶点,取其基因与靶点交集制作韦恩图;通过STRING数据库和Cytoscape3.7.1软件共同构建蛋白互作网络(PPI),应用R语言下载安装Bioconductor数据库中的相关R包对交集得到的核心靶点进行相应的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果在TCMSP数据库共获取109个活性化合物,主要为β谷甾醇、鸦胆甙、槲皮素等,GeneCards数据库共获取疾病靶点74个,PPI网络分析显示共涉及前列腺素内过氧化物合酶-2(PTGS-2)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(BCL-2)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPAR-γ)、血管内皮生长因子-A(VEGF-A)、同期蛋白D1(CCND1)等15个核心蛋白,GO、KEGG富集分析显示派特灵可以通过各类癌症通路、人乳头状瘤病毒(HPV)感染、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、人巨细胞病毒感染信号通路等多途径、多靶点作用于CA。结论派特灵通过抗HPV病毒、调节免疫等方面达到治疗CA的目的。

关键词： 茯苓泽泻片   网络药理学   分子对接   肥胖   减肥  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术探究茯苓泽泻片的减肥作用及机制。方法:根据中医证型和用药经验辩证组方,通过TCMSP数据库和UniProt数据库收集茯苓泽泻片的活性成分和作用靶点;利用DrugBank、OMIM数据库和GeneCards数据库获取肥胖相关靶点;使用venn diagram得到茯苓泽泻片治疗肥胖的靶点;STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络;运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-关键靶点”网络;利用Metescape数据库对关键靶点进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;最后使用PyMOL 2.2和Autodock Tools 1.5.6软件对核心靶点和核心成分进行分子对接。结果:经过拓扑分析,共得到52个关键靶点,PTGS2、PPARG可能是茯苓治疗肥胖的重要靶点;KEGG分析中,Insulin resistance、HIF-1 signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway、Adipocytokine signaling pathway治疗肥胖密切相关;分子对接显示了槲皮素与PTGS2、PPARG对接结果良好,表明槲皮素可能是茯苓泽泻片治疗肥胖的关键成分。结论:茯苓泽泻片对脾虚阴阻肥胖具有减肥功能,主要相关成分为槲皮素,并通过多靶点多途径实现减肥功能。

关键词： 药理学   蒙古蒿   面膜乳液   微量肉汤稀释法   体外生物化学法   挥发油  

摘要： 利用微量肉汤稀释法和兔耳痤疮模型试验考察添加蒙古蒿挥发油面膜乳液的祛痘功效,并采用体外生物化学法检测其美白作用。结果显示,该面膜乳液对痤疮丙酸杆菌和金黄色葡萄球菌具有良好的抑制作用,对兔耳痤疮模型具有良好的治疗和修复皮损效果。美白验证试验结果表明该面膜乳液对DPPH自由基和酪氨酸酶具有较强的抑制作用。因此,蒙古蒿挥发油面膜乳液在化妆品市场上具有潜在的开发利用价值。

关键词： 当归   轻度认知功能障碍   网络药理学   分子对接   靶点   通路.  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探究当归治疗轻度认知功能障碍(MCI)的关键作用靶点。方法采用TCMSPW、SwissTargetPrediction、UniProt等数据库检索当归的有效成分,并得到相应靶点;再通过DisGeNET、GeneCards等数据库检索轻度认知功能障碍的相关靶点,使用Venny2.1.0平台对当归和轻度认知功能障碍相关靶点取交集,并构建韦恩图。再使用Cytoscape3.9.1软件建立可视化蛋白互作网络(PPI),再利用David数据库和微生信网站进行GO富集分析和KEGG通路与基因功能富集分析及网络可视化,最后通过AutoDock Tools进行分子对接验证。结果当归关键基因有44种共同基因,包括NPC1L1、NR1H3、RORC、ESR1、ESR2、SHBG等,MCI关键基因有3190个,包括APOE、SPG11、PAH、MAPT、SCN8A、APP等。取交集后当归和MCI相关基因共有25个交集,包括ESR1、ESR2、SHBG、HMGCR、CYP19A1、AR、CYP17A1等,其中PPI显示的关键靶点按MCC值排序,前10位依次为CYP19A1、CYP17A1、ESR1、SHBG、AR、NR3C1、ESR2、HSD11B1、PPARG、PPARA。GO分析提示主要参与了包括细胞内类固醇激素受体信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、胆固醇储存的负调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的负调控、细胞内雌激素受体信号通路、甘油三酯稳态、胆固醇生物合成过程、RNA聚合酶Ⅱ启动子的mRNA转录等生物过程,再由KEGG分析,设置P<0.05为筛选条件,得到6条通路,包括化学致癌-受体激活、类固醇激素生物合成、催乳素信号通路、PPAR信号通路、胰岛素抵抗、癌症通路。最后分子对接显示,核心成分与靶点对接得分均<-0.5,说明具有良好的对接活性。结论当归在治疗轻度认知功能障碍的过程中可通过豆甾醇及β-谷甾醇等活性成分发挥作用,涉及到CYP19A1、CYP17A1、ESR1等作用靶点及类固醇激素生物合成、催乳素信号通路、PPAR信号通路、胰岛素抵抗等信号通路。初步明确了当归对MCI具有疗效。

关键词： 淡豆豉   网络药理学   骨质疏松  

摘要： 为探索淡豆豉治疗骨质疏松的作用效果及机制,文章利用网络药理学方法,通过TCMSP等数据库采集淡豆豉活性成分及对应作用靶点,采用Cytoscape软件构建活性成分-潜在疾病靶点网络图及蛋白相互作用(PPI)网络图,并对共同靶点进行GO和KEGG富集分析。结果表明,本研究共收集得到51个淡豆豉活性成分作用靶点、6797个与骨质疏松疾病相关靶点及40个淡豆豉治疗骨质疏松的共同作用靶点。通过蛋白互作网络分析筛选出IL6、CASP3等15个核心蛋白。GO及KEGG富集分析表明,共同靶点参与肽基丝氨酸磷酸化、肽基丝氨酸修饰及类固醇激素反应等生物学过程,主要与脂质和动脉粥样硬化、IL-17及酒精性肝病等信号通路有关。