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关键词： 数据挖掘技术   网络药理学   藏药   慢性萎缩性胃炎  

摘要： 目的研究藏药治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的作用机制。方法在中国知网、万方数据库、维普期刊数据库检索藏药治疗CAG的藏药复方。对符合纳入排除条件的文献进行信息提取,构建数据库统计高频词藏药,进行关联度分析,获取藏药治疗CAG的核心药物。在TCMSP数据库检索藏药活性成分及作用靶点,利用GeneCads、OMIM在线数据库获取疾病靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定藏药治疗CAG的潜在靶点,应用String数据库、Cytoscape 3.7.1软件构建“藏药-活性成分-潜在靶点”相互作用网络与蛋白相互作用(PPI)图。使用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果共纳入藏药复方78个,包含136味藏药。根据置信度与关联性选取诃子、豆蔻、荜茇、石榴子四味核心药物,筛选出槲皮素、木犀草素、玫瑰树碱、鞣花酸、胡椒碱、去氢二异丁香酚等32个药物活性成分,核心靶点为AKT1、TNF、IL6、TP53、MMP9、HIF1A、CASP3、BCL2、IL1B、PTGS2等92个,获得747条GO条目,KEGG富集条目涉及癌症相关通路、脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE等共139条通路。结论通过数据挖掘筛选出豆蔻、荜茇、石榴子和诃子这四味藏药作为藏药治疗CAG的核心药物,并运用网络药理学方法分析得出这四味藏药可能通过下调AKT1、TNF、IL6和TP53等基因的表达抑制炎症因子的释放;并通过调控癌症相关通路、脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17等信号通路直接或间接参与机体抗炎、抗氧化、促进血管再生等过程发挥治疗CAG的作用。

关键词： 乳腺康注射液   乳腺癌   网络药理学   分子对接   作用机制   TP53  

摘要： 利用网络药理学和分子对接技术探讨乳腺康注射液治疗乳腺癌(Breast Cancer,BC)的有效成分和作用机制.通过TCMSP数据库和查询文献获取乳腺康注射液中的中药活性成分及其作用靶点,检索乳腺癌疾病相关靶点,两者取交集后,使用Cytoscape 3.9.0建立“药物-成分-共同靶点”网络.将共同靶点输入String数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图.将相同的靶基因输入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.根据活性成分节点和靶点的适当参数进行排序,使用PyMol软件对筛选到的靶基因编码的蛋白质和核心成分进行分子对接.共筛选出106个潜在活性成分和891个作用靶点,乳腺癌疾病相关靶点1341个,药物疾病交集靶点为236个,PPI网络及拓扑学分析显示TP53、EGFR、VEGFA、ESR1、HRAS、STAT3、CCND1、SRC等是乳腺康注射液治疗BC的核心靶点.GO功能富集分析显示主要参与酶的调控、RNA转录等生物过程.KEGG通路富集分析得到了癌症信号通路、PIK3/AKT、Hepatitis B等20条相关性最高的通路.将核心靶点编码蛋白与活性成分对接,结果良好.通过网络药理学探讨和分子对接验证,显示乳腺康注射液可能通过多靶点、多信号通路发挥干预乳腺癌的形成和治疗疾病的作用.

关键词： 桑叶   免疫调节   网络药理学   作用机制   信号通路  

摘要： 基于网络药理学分析桑叶调控免疫功能的作用机制。依托TCMSP数据库获得桑叶有效活性成分和相应作用靶点,构建有效成分——靶点网络图。结合Genecards、OMIM等数据库筛选桑叶免疫调节交集基因,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),并对核心靶点进行GO功能富集和KEGG通络分析。研究结果显示,桑叶的主要成分槲皮素、山柰酚、花生四烯酸、β-谷甾醇、四甲氧基木犀草素和豆甾醇等作用于TP53、AKT1、TNF、ESR1、IL6等关键靶点,参与癌症、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等,发挥了免疫调节作用。桑叶具有多成分、多靶点及多途径的特点,对免疫调节起到了良好的作用,为桑叶在畜禽养殖中的应用提供依据。

关键词： 麻黄   桂枝   变应性鼻炎   网络药理学   分子对接   靶点   通路  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接技术研究麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎的作用机制。方法:应用TCMSP数据库和UnitProt数据库筛选麻黄-桂枝药对的活性成分和作用靶点,并应用OMIM、GeneCards、DrugBank、TTD数据库获得变应性鼻炎的疾病作用靶点,取两者交集,获得麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎的作用靶点并绘制韦恩图;应用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络;应用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白质相互作用网络,并进行拓扑分析;应用Metascape数据库进行KEGG富集分析与GO富集分析;应用Pubchem数据库、Chem3d软件等对关键成分和靶点进行分子对接验证。结果:获得麻黄-桂枝药对的活性成分27个,作用于变应性鼻炎的靶点109个;关键活性成分主要为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、木犀草素等;关键靶点主要为TNF、RMLA、IL-6、AKT1等;主要通过PI3K-Akt、TNF、AGERAGE、IL-17等信号通路发挥治疗作用;分子对接结果显示成分和靶点具有良好的结合性。结论:阐明了麻黄-桂枝药对治疗变应性鼻炎多成分、多靶点、多通路的作用机制,为进一步深入研究提供方向和依据。

关键词： 药理学   镇痛药   课程思政   思政元素  

摘要： 药理学主要讲授药物作用、临床应用和用药指导,在进行爱国主义教育、价值观引导、责任意识培育等方面具有天然优势。从育人困境、改革意义、设计思路、课程单元思政实施四个方面,探讨思政育人的必要性,探究思政元素融入课堂教学的实现路径和改革效果,以期实现专业教学和思政教育的水乳交融。

关键词： 感咳颗粒   急性肺损伤   入血成分   网络药理学   炎症反应   中性粒细胞胞外诱捕网   SRC/ERK1/2/STAT3  

摘要： 依据感咳颗粒在大鼠体内的入血成分研究基础,结合网络药理学、分子对接和动物实验验证探究感咳颗粒干预急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的潜在作用机制。将感咳颗粒的大鼠入血成分导入SwissTargetPrediction平台预测药物靶点,从疾病数据库收集ALI相关靶点,取交集并构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心靶点,随后进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Gnomes,KEGG)通路富集分析。构建“入血成分-靶点-通路-疾病”网络,根据其拓扑参数筛选感咳颗粒干预疾病的核心成分。借助分子对接预测核心成分与关键靶点的结合能力。通过脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的ALI小鼠模型验证感咳颗粒干预急性肺损伤的关键靶点。PPI拓扑参数分析得到与ALI有关的STAT3、SRC、HSP90AA1、MAPK3、HRAS、MAPK1前6个关键靶点。GO功能分析可知主要与ERK1和ERK2级联、炎症反应、对脂多糖反应等有关;KEGG分析结果显示,主要富集通路显示为MAPK、中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular trap,NET)形成等。根据“入血成分-靶点-通路-疾病”网络拓扑参数分析筛选出前6个核心成分(五味子酯乙、五味子醇甲、五味子醇乙、哈巴俄苷、异鸢尾黄素、颈花胺)。分子对接结果显示6个核心成分和该颗粒含量最高的射干苷与MAPK3、SRC、MAPK1、STAT3关键靶点具有较高的亲和力。体内实验结果表明,与模型组相比,感咳颗粒能有效缓解LPS诱导的小鼠肺组织病理损伤,抑制炎性浸润,降低支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中总蛋白含量、一氧化氮(nitric oxide,NO)与髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)水平,以及肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、干扰素γ(interferon-γ,IFN-γ)、白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)以及趋化因子(C-X-C基序)配体1[chemokine(C-X-C motif)ligand 1,CXCL1]含量,显著下调肺组织中淋巴细胞抗原6G(lymphocyte antigen 6G,Ly6G)、瓜氨酸化组蛋白3(citrullinated histones 3,Cit-H3)表达水平及SRC、ERK1/2、STAT3磷酸化蛋白表达水平。综上,感咳颗粒可有效抑制LPS诱导的急性肺损伤炎症反应,保护肺组织,调节炎性因子释放,抑制中性粒细胞浸润及NET形成,作用机制可能与抑制SRC/ERK1/2/STAT3信号通路激活有关。

关键词： 养血安胎颗粒   复发性流产   网络药理学   分子对接   作用机制   多维网络分析  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术研究养血安胎颗粒治疗复发性流产(RSA)作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)数据库收集养血安胎颗粒主要化学成分及其映射靶标,通过OMIM、GeneCards、Drugbank、PharmGkb、TTD数据库收集RSA疾病靶标,并通过在线工具draw venn diagram分析药物与疾病靶标交集,导入STRING数据库,分析共有靶标相互作用关系(PPI),并对其进行生物信息学分析。此外,根据Degree值分析养血安胎颗粒治疗RSA的核心靶标,采用分子对接技术,研究靶标与化学成分之间结合度,验证网络药理学分析结果。结果共收集养血安胎颗粒化学成分70个和靶标236个,疾病靶标去重后获得453个。通过交集分析共获得66分共有靶标。PPI互作分析发现IL6、MMP9、TNF、IL1B、IL10等靶标是养血安胎颗粒治疗RSA核心靶标。生物信息学富集分析发现,这些共有靶标主要作用于TNF信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路、雌激素信号通路等信号通路。进一步的分子对接结果表明,度值(degree)靠前的靶标MMP9与芍药苷、芝麻素、槲皮素和山柰酚对接良好。尤其是芍药苷对接结果优于阳性对照。结论通过网络药理学和分子对接分析,发现养血安胎颗粒中主要活性成分通过作用于MMP9影响多条信号通路发挥治疗RSA作用。

关键词： 艾草抗炎   网络药理学   作用机制  

摘要： 通过网络药理学方法研究蕲艾的抗炎潜能及作用机制。运用网络药理学方法在SymMap、DisGenet和GeneCards数据库获取蕲艾相关成分以及抗炎靶点数据,并通过韦恩图和蛋白质相互作用网络分析了共同靶点。从29个核心靶点中识别出关键蛋白质,并展示这些蛋白质在抗炎症通路中的重要性,进一步揭示了CXCL2、PTGS2、IL6、CXCL8、CXCL1等基因在整个网络中的关联和重要性。研究结果表明,蕲艾通过调节这些基因有参与抗炎的作用,为其作为抗炎药物的科学应用提供了理论依据。

关键词： 七白粉   美白   黑色素沉积   网络药理学   分子对接   中药复方   抗氧化   酪氨酸酶  

摘要： 目的:研究七白粉的皮肤美白作用,并结合网络药理学和分子对接技术预测其达到美白效果的作用机制。方法:采用紫外线B波段(UVB)照射诱导豚鼠皮肤色素沉着,建立动物模型。观察七白粉对模型豚鼠的美白效果,同时检测黑色素细胞数和超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、酪氨酸酶(TYR)及脂褐质(LF)等与皮肤色素沉积相关的生化指标。利用网络药理学预测七白粉美白的作用机制,并通过分子对接和表面等离子体共振(SPR)进行验证。结果:在动物实验中,与模型组比较,七白粉可显著改善皮肤亮度,且黑色素细胞数和TYR、LF、MDA水平均显著降低,而SOD水平显著升高。网络药理学研究发现七白粉通过儿茶素没食子酸酯、茯苓酸C、别欧前胡素等关键成分,作用于蛋白激酶Bα(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、表皮生长因子(EGFR)等关键靶标,调控磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)和TNF等信号通路改善黑色素沉积而发挥美白作用。分子对接和SPR结果显示关键成分与关键靶标有较好的亲和力。结论:七白粉可通过抗氧化和抑制TYR的活性达到美白皮肤的效果。此外,七白粉通过多成分作用于多靶点,调控多通路改善黑色素沉积而发挥美白作用,体现了中药复方君臣佐使相互协同,多成分,多靶点,多通路的特点。

关键词： 大丁草   类风湿关节炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学联合分子对接技术探究大丁草治疗类风湿关节炎的潜在作用机制。方法:选用化学专业数据库、HERB本草组鉴查找大丁草化学成分,经Swiss ADME数据库筛选出有效成分,应用Swiss Target Prediction预测有效成分的潜在靶点,从Gene Cards、OMIM等数据库查筛类风湿关节炎的靶点,应用Venny 2.1.0数据库获得大丁草与类风湿关节炎交集靶点和韦恩图,采用Cytoscape 3.8.2构建大丁草-有效成分-靶点-类风湿关节炎网络并筛选核心成分,利用Cytoscape插件Biso Genet构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,经2次筛选获得核心靶点,应用Metascape平台对核心靶点进行富集分析,运用Auto Dock vina将5种核心成分与10个核心靶点进行对接。结果:大丁草治疗类风湿关节炎活性成分有大丁草酚、大丁苷等13种,靶点448个,类风湿关节炎靶点618个,交集靶点101个,核心靶点有雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、生长因子受体结合蛋白2(Growth Factor Receptor-Bound Protein 2,Grb2)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)等;通过基因本体论(GO)分析获得调节先天免疫反应等条目,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析获得磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)、破骨细胞分化、白细胞介素-17(Interleukin 17,IL-17)等92条通路;核心成分与核心靶点有较好的结合活性。结论:大丁草中大丁草酚、大丁苷等核心成分可能通过ESR1、Grb2、EGFR等靶点,调控PI3K-Akt、MAPK等信号通路来治疗类风湿关节炎。