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关键词： 金线莲   降血脂   网络药理学   分子对接   机制  

摘要： 以网络药理学为理论基础,通过分子对接技术探究金线莲降血脂的作用机制。通过国内外金线莲化学成分数据库,以类药性高、胃肠道吸收性较好为条件,筛选金线莲有效化学成分,使用GeneCards数据库筛选出与高脂血相关的靶点。结果表明,金线莲含有42个降血脂的活性成分,共计645个靶点,其中与高血脂交集靶点43个,关键靶点有6个,如IL6、PPARA、PPARG、MMP9、CYP3A4、VEGFA;金线莲降血脂化学成分与核心靶点间具有较强亲和力,研究为金线莲药食两用的深入研究提供了理论基础。

关键词： 心绞痛   瓜蒌薤白桂枝汤加减   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白桂枝汤加减防治心绞痛(AP)的作用机制。方法:采用TCMSP数据库获取瓜蒌薤白桂枝汤加减的活性成分及靶点,并通过文献检索进行补充。采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络模型。采用DrugBank、GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选AP的关键靶点,与药物成分靶点取交集获取潜在基因作用靶点。使用软件的拓扑分析插件筛选核心成分与作用靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。对成分-疾病交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。基于Autodock软件将核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:共筛选到300个活性成分靶点,获取疾病靶点1216个,取交集获得潜在基因作用靶点124个,筛选出核心靶点30个,对应100个核心药物成分,发挥作用的核心成分为槲皮素、山柰酚等,核心靶点为肿瘤细胞坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt1)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)等。富集分析推测瓜蒌薤白桂枝汤加减主要经过癌症调节、脂质与动脉粥样硬化通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等20条相关通路发挥作用。分子对接结果显示瓜蒌薤白桂枝汤加减中槲皮素、山柰酚与TNF、Akt1结合性较好。结论:瓜蒌薤白桂枝汤加减可能通过核心成分槲皮素与山柰酚、核心靶点TNF、Akt1,经由脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路发挥防治AP的作用。

关键词： 胃宁散   指纹图谱   网络药理学   胃溃疡  

摘要： 目的 根据指纹图谱及网络药理学探讨胃宁散(Weining San,WNS)抗胃溃疡(gastric ulcer,GU)的药效关联物质及作用机制。方法 采用HPLC建立12批WNS指纹图谱,并进行方法学考察,结合对照品指认特征峰,筛选药效关联物质,进行网络药理学分析。利用TCMIP、Swiss Target Prediction数据库检索成分靶点;利用OMIM、Gene Cards和Drugbank数据库检索GU疾病靶点,取成分与疾病的交集靶点,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并进行拓扑学参数分析;采用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分-疾病-靶点”网络图;采用Metascape网站对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。随后采用灌胃无水乙醇的方式建立酒精性GU小鼠模型,对网络药理学预测的结果进行验证。结果 HPLC指纹图谱方法学考察的精密度、稳定性、重复性均良好。经对照品比对及综合分析,确定三七皂苷R1、人参皂苷Rg1、1,4-二[4-(葡萄糖氧)苄基]-2-异丁基苹果酸酯、人参皂苷Rb1、五味子醇甲、五味子醇乙、五味子甲素、五味子酯甲为WNS中的药效关联物质,其可能通过调控AKT1、IL-6、STAT3、TNF、IL1B等核心靶点及PI3K-Akt、JAK-STAT等关键信号通路来发挥作用。小鼠胃溃疡指数和溃疡抑制率测定、HE染色观察结果显示,WNS对GU小鼠胃黏膜损伤有良好的改善作用。ELISA、WST-1及TBA测定结果表明,WNS干预后能降低模型小鼠TNF-α、IL-6、IL-1β、MDA水平,升高SOD、PGE2水平,提示WNS抗GU作用与抑制炎症反应与氧化应激机制相关,进一步验证了网络药理学预测的结果。结论 本研究结合指纹图谱、网络药理学及动物实验验证,对WNS抗GU药效关联物质及作用机制进行了探讨,为WNS的质量控制及临床研究提供参考。

关键词： 健脾益肺颗粒   慢性阻塞性肺疾病急性加重   急性呼吸衰竭   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学探析健脾益肺颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重合并急性呼吸衰竭的潜在作用机制,并通过分子对接技术加以验证,以期为后续基础及临床试验的开展提供方向和依据。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SwissADME、PharmMapper数据库及文献筛选健脾益肺颗粒的活性成分并预测相应的作用靶点,利用GeneCards、DisGeNet、OMIM、DrugBank和NCBI数据库分别获得慢性阻塞性肺疾病急性加重、急性呼吸衰竭的疾病靶点,取药物与疾病的交集靶点。利用STING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建“中药-活性成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用R软件进行交集靶点的基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过分子对接验证主要活性成分与核心靶点间的对接活性。结果:共筛选出健脾益肺颗粒111种活性成分和119个潜在作用靶点,与慢性阻塞性肺疾病急性加重及急性呼吸衰竭的交集靶点有32个。核心活性成分包括茯苓酸A、茯苓酸B、桑根酮B等;核心靶点包括白蛋白(Albumin,ALB)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、酪氨酸蛋白激酶(Sarcoma,SRC)、胱天蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、激酶插入区受体(Kinase Insert Domain Receptor,KDR)等;治疗主要涉及血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)信号通路、酪氨酸激酶受体(Receptor Tyrosine Protein Kinase,ErbB)信号通路及促性腺激素释放激素(Gonadotropin-releasing Hormone,GnRH)信号通路。主要活性成分与核心靶点间有较高的结合活性。结论:健脾益肺颗粒可能通过多成分、多靶点在慢性阻塞性肺疾病急性加重合并急性呼吸衰竭的治疗中发挥抗炎、抗血管生成的辅助性治疗作用。

关键词： 补骨脂   性早熟   豆甾醇   补骨脂酚   异补骨脂素   补骨脂查尔酮   补骨脂乙素   分子对接   网络药理学  

摘要： 【目的】基于网络药理学方法及分子对接技术,探讨补骨脂是否可能促进儿童性早熟及其潜在机制。【方法】通过BATMAN-TCM在线平台获取补骨脂主要活性成分及其作用靶点,从GeneCards数据库中获取性早熟相关疾病靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件构建“活性成分-疾病靶点”可视化网络。基于STRING在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的网络图构建。使用Metascape在线工具进行靶点基因的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析。从PubChem数据库中获取主要活性成分结构,从RCSB PDB数据库中获取核心靶点结构,导入Autodock进行分子对接,最后利用PyMOL软件绘制分子对接模拟图。【结果】得到12种补骨脂的活性成分,涉及274个靶点,其中11种活性成分和98个靶点与性早熟相关。主要活性化合物为豆甾醇、补骨脂酚、异补骨脂素、补骨脂查尔酮、补骨脂乙素、甲氧基补骨脂素,主要靶点有雌激素受体1(ESR1)、雌激素受体2(ESR2)、胰岛素样生长因子1(IGF1)、孕酮受体(PGR),主要涉及卵巢类固醇生成通路、Hippo信号通路。分子对接结果表明这些活性化合物与靶标具有良好的结合作用。【结论】补骨脂存在促进儿童性发育的可能性及具有潜在药理作用机制,分析结果可为儿童性早熟、青春期早发育等临床防治提供理论参考。

关键词： 肺癌   用药规律   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于中医传承辅助平台分析吴良村教授治疗肺癌的用药规律,运用网络药理学分析核心药物治疗肺癌的作用机制。方法:收集2019年―2022年吴良村教授门诊治疗肺癌的处方,通过中医传承辅助平台v2.5组建处方数据库,运用Microsoft Excel 2021对药物频次、类别、性味、归经进行描述性分析,运用SPSS Statistics 25.0和SPSS Modeler 18.0软件对高频药物进行关联规则和系统聚类分析,归纳总结组方规律,确定核心药物组合。运用网络药理学筛选核心药物活性成分及作用靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,并进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,运用分子对接技术对获得的成分和靶点进行验证分析。结果:共纳入处方128首,用药173味,共计频次2422次,药性以寒为主,药味以甘为主,药物归经以归肺、胃经为主,药类以补虚药为主。本团队结合临床经验总结得出核心药物组合是北沙参-南沙参-苦杏仁-麦冬-浙贝母。通过网络药理学筛选得到22个核心活性成分及9个核心作用靶点。核心药物发挥作用涉及的通路主要包括癌症信号通路、脂质和动脉粥样硬化、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路等。分子对接显示结合能良好。结论:吴良村教授提出肺癌病机以气阴两虚为本、痰热瘀毒为标,治疗以益气养阴为主,辅以清热解毒、化痰散瘀等法,本团队总结的核心药物组合契合吴老临证经验。其核心药组的治疗机制可能通过腺苷、β-谷甾醇、木脂素、光甘草定等核心成分与细胞肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)3、热休克蛋白90α家族A类成员1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member 1,HSP90AA1)、SRC原癌基因(SRC Pro-Oncogene,SRC)等核心靶点紧密结合,调控多项生物过程,作用于癌症信号通路、脂质和动脉粥样硬化、HIF-1等信号通路,从而抑制肿瘤细胞增殖及侵袭、血管生成及炎症发生。

关键词： UPLC-QTOF-MS   网络药理学   平卧菊三七   高尿酸血症  

摘要： 目的鉴定平卧菊三七入血化学成分,采用网络药理学方法探讨平卧菊三七治疗高尿酸血症潜在作用机制。方法通过超高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱(UPLC-QTOF-MS)联用技术鉴定大鼠入血成分,利用TCMSP、Swiss Target Prediction、Gene-Cards数据库获得入血成分及疾病作用靶点,并通过STRING数据库、Cytoscape软件筛选核心靶点并构建PPI网络图、“入血成分-交集靶点”图;运用DAVID平台进行基因本体(GO)功能富集及KEGG通路富集分析。结果测得平卧菊三七入血成分24个,共筛选得到13个核心靶点、162个生物过程、86条信号通路。结论平卧菊三七可能通过槲皮素、咖啡酸、芦丁、秦皮乙素等活性成分作用于STAT3、RELA、IL6、PTGS2等核心靶点来调控细胞增殖、迁移等多个生物学过程,从而协同发挥治疗高尿酸血症的作用。

关键词： 临床药理学   研讨式教学   案例教学   课程思政  

摘要： 临床药理学是桥接临床医学与药理学的重要学科,在该学科的教学实践中需紧跟教育改革形势,采用研讨式(Seminar)教学法联合案例教学法(case⁃based learning,CBL)以切实提高“教”与“学”的双重获益。而课程思政教学是培养学生高度责任心和高尚医德,实现立德树人目标的重要路径。目前,抗肿瘤药物的临床药理课程教学中存在学生肿瘤药理专业基础知识薄弱、传统讲授方法导致“教”与“学”分离、教材内容陈旧且滞后、学生积极性不高等问题。因此,本文以这一部分课程教学为例,初步探讨“Seminar⁃CBL⁃课程思政”这一创新模式在临床药理学教学实践中的作用,以期激发学生的学习兴趣,培养学生正确的世界观、人生观、价值观,实现“教”与“学”的双重目标,为优化临床药理学教学提供借鉴。

关键词： 白色念珠菌   D-柠檬烯   2-茨醇   抑菌实验   网络药理学  

摘要： 目的:采用抑菌实验研究蛇床子-冰片药对成分中的D-柠檬烯及2-茨醇的体外抗白色念珠菌作用,并运用网络药理学预测D-柠檬烯和2-茨醇治疗念珠菌病的核心靶点和通路。方法:以白色念珠菌为研究对象,K-B纸片扩散法分别测定0.5、1.0、1.5 mg的D-柠檬烯、2-茨醇、制霉菌素的药液抑菌圈直径;采用试管双倍稀释法和棋盘法,测定D-柠檬烯、2-茨醇的最低抑菌浓度(MIC)以及两两联用的MIC,计算出联合抑菌分数(FIC)。通过Pubchem、SwissTargetPrediction数据库预测D-柠檬烯、2-茨醇的有效靶点;通过GeneCards、OMIM数据库检索念珠菌病相关的疾病靶点;运用Venny软件获得两种化学成分和念珠菌病的共同靶点;运用Cytoscape 3.9. 0软件构建“成分-靶点-疾病”网络;利用STRING数据库构建蛋白互作PPI网络;利用R软件进行GO功能及KEGG通路富集分析。结果:D-柠檬烯的MIC为5 mg/mL,2-茨醇的MIC为2.5 mg/mL。D-柠檬烯与2-茨醇联用的FIC指数为0.75,呈相加作用。网络药理学筛选得到两种成分相关作用靶点152个,疾病靶点893个,两者交集靶点为24个;网络拓扑分析得到核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、雌激素受体(ESR1)等;KEGG分析得到核心通路为C型凝集素受体信号通路(C-type lectin receptor signaling pathway)、Fc epsilon RI信号通路(Fc epsilon RI signaling pathway)、催乳素信号通路(prolactin signaling pathway)等。结论:D-柠檬烯、2-茨醇对白色念珠菌均有抑制作用,且2种组分药物联合使用具有一定的协同作用。网络药理学预测初步提示D-柠檬烯、2-茨醇可能通过作用于TNF、PPARG、ESR1等核心靶点调控C型凝集素受体信号通路(C-type lectin receptor signaling pathway)、Fc epsilon RI信号通路(Fc epsilon RI signaling pathway)等以治疗念珠菌病。

关键词： 灵芝多糖   糖尿病足   网络药理学  

摘要： 目的:运用网络药理学方法研究灵芝多糖(ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)治疗糖尿病足(diabetic foot,DF)的作用机制。方法:通过查阅文献、TCMSP、PharmMapper数据库获得GLP化学成分信息及其作用靶点。通过GeneCards和OMIM数据库检索DF相关靶点。基于在线软件Venny 2.1获得二者交集靶点。运用Cytoscape软件构建“成分-靶点-疾病”网络图。使用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白互作(PPI)网络分析,根据度值筛选出核心靶点。结合DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果:GLP与DF的交集靶点有98个,其中非受体酪氨酸蛋白激酶(SRC)、热休克蛋白90α编码基因(HSP90AA1)、HRas原癌基因(HRAS)、Ras同源基因家族成员A(RHOA)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)等20个靶点可能是GLP治疗DF的关键靶点,参与癌症通路(pathways in cancer)、血管内皮生长因子(VEGF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、脂质和动脉粥样硬化(lipid and atherosclerosis)、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)等关键通路。结论:GLP在治疗DF方面显示出多靶点、多通路协同作用的特点,这将为中药多糖治疗糖尿病足研究提供有益的参考。