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关键词： 网络药理学   黄芪   莪术   肿瘤血管正常化   信号转导与转录激活因子1  

摘要： 目的通过网络药理学联合分子对接技术探讨黄芪-莪术促进肺癌肿瘤血管正常化的潜在作用机制,为进一步研究寻找方向。方法利用公共数据库(TCMSP)检索并获取黄芪-莪术活性成分及相关靶点,通过基因卡、OMIM、TTD、药物GKB数据库和药物库数据,发现肺癌血管正常化的相关靶点,Met细胞景观插件ClueGO平台用于基因本体(GO)富集分析和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDock及Vina软件进行分子对接打分,Pymol软件进行对接结果的可视化展示。结果共筛选出486个黄芪-莪术生物活性成分和184个黄芪-莪术与肺癌肿瘤血管正常化相关的靶点;根据生物信息学分析,槲皮素、异鼠李素、山奈酚、7-O-甲基异脲醇、芒柄花黄素、毛芯异黄酮可能是黄芪-莪术调控肺癌肿瘤血管正常化的潜在活性成分,而RB1、MAPK1、EGFR、ESR1、AKT1、HIF1A、TP53、STAT1和CCND1是潜在的起效靶点;根据富集和分子对接结果显示异鼠李素与STAT1之间具有较高的结合亲和力,JAK2/STAT1通路可能是黄芪-莪术调控肺癌血管正常化的主要作用通路。结论黄芪-莪术促进肺癌肿瘤血管正常化作用的潜在机制可能是IFN-γ-JAK2/STAT1通路。

关键词： 六味地黄丸   卵巢功能不全   网络药理学  

摘要： 本研究采用网络药理学方法,系统分析六味地黄丸中的活性成分及其与卵巢功能不全相关靶点的相互作用,深入探讨六味地黄丸治疗卵巢功能不全的潜在作用机制,旨在为六味地黄丸治疗卵巢功能不全的临床应用提供理论依据。方法 通过TCMSP数据库获取六味地黄丸的活性成分及其作用靶点,构建“六味地黄丸药物—活性成分—预测靶点”网络。同时,利用DisGeNet、OMIM和Drugbank数据库获取卵巢功能不全的疾病靶点。取卵巢功能不全的疾病靶点与六味地黄丸药物作用靶点的交集,作为六味地黄丸治疗卵巢功能不全的潜在作用靶点,构建“药物—潜在作用靶点—疾病”网络。通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白相互作用(PPI)网络图,筛选出六味地黄丸干预卵巢功能不全的关键靶点。对关键靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,筛选出核心通路,并构建六味地黄丸干预卵巢功能不全的“活性成分—关键靶点—核心通路”网络。筛选出核心的活性成分、靶点及通路。结果 从六味地黄丸中筛选得到42个活性成分、216个潜在靶点。其中,48个作用靶点可能与卵巢功能不全的发生相关。通过MCODE分析最终确定了28个关键靶点。这些关键靶点主要涉及癌症相关通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路等。干预卵巢功能不全的核心活性成分为PTGS2、AKT1、BCL2、VEGFA、TP53、MAPK8、CASP3、IL6、BAX、TNF、MTOR,共同参与六味地黄丸预防卵巢功能不全的发生。结论 六味地黄丸通过多靶点、多通路的协同作用来改善卵巢功能不全的发生。

关键词： 肝癌   虎杖   金钱草   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接方法探究虎杖-金钱草药对治疗肝癌的作用机制。方法:以TCMSP、TCMIP、BATMAN-TCM、HERB、GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库为来源,获取虎杖及金钱草的活性成分、作用靶点及肝癌疾病靶点。使用STRING数据库和Cytoscaape软件对共同靶点绘制蛋白质相互作用网络(PPI)获取核心靶点。应用DAVID数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。应用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病-信号通路”网络。最后运用AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接验证。结果:经过筛选得到“虎杖-金钱草”治疗肝癌的潜在核心靶点17个。GO功能分析得到663条结果,KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等139条通路。分子对接结果显示,虎杖-金钱草主要活性成分与关键潜在作用靶点Akt1、Src、EGFR、HSP90AA1和ErbB2均能自发结合且具有较好的亲和力。结论:虎杖-金钱草可能结合多个成分和靶点,调控多条通路发挥靶向治疗肝癌的作用。

关键词： 网络药理学   分子对接模拟   儿童   厌食   赖氨肌醇维B_(12)口服液   分子机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨赖氨肌醇维B_(12)口服溶液治疗小儿厌食症的作用机制。方法通过查阅说明书,挖掘赖氨肌醇维B_(12)口服溶液的成分,并通过Swiss Target Prediction网站预测成分的相关靶点,与厌食症靶点进行交集映射,获得其治疗小儿厌食症的作用靶点。利用蛋白互作筛选核心靶点,并进行分子对接验证。基于共有靶点,采用功能注释生物信息学芯片进行分析,得到赖氨肌醇维B_(12)口服溶液治疗小儿厌食症的关键通路。结果赖氨肌醇维B_(12)口服溶液中的主要成分为盐酸赖氨酸、肌醇和维生素B_(12),共预测出40个靶基因,其中有13个靶基因与厌食症极为密切,主要涉及谷氨酸受体信号通路、神经活性配体-受体相互作用等相关分子。结论赖氨肌醇维B_(12)口服溶液可能发挥类似于谷氨酸的作用,通过激活突触后膜的谷氨酸受体来改善小儿的厌食症,体现了多成分、多靶点协同起效的作用特点。

关键词： 智能   药物   释放系统   药理学  

摘要： 智能药物释放系统代表了药理学领域的一项创新技术,旨在优化药物的输送和释放,从而提高治疗效果并最小化副作用。这些系统通过精确控制药物释放的时间和地点,响应生物环境的变化,或者直接针对病变部位,实现对疾病的更有效管理。本文综述了智能药物释放系统在药理学中的多种应用前景,特别是在癌症治疗、慢性病管理、神经系统疾病治疗及药物多样化管理中的应用,探讨了这些技术如何改变未来药物治疗的模式。

关键词： 人参   牙周炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨人参治疗牙周炎的潜在作用机制。方法 通过多种数据库获得人参、牙周炎的潜在靶点,利用VENNY获得人参-牙周炎交集靶点,在STRING平台形成蛋白质互作网络关系图,采用Cytoscape软件形成核心靶点图并构建人参-活性成分-靶点网络图,将核心靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过分子对接技术分析人参活性成分治疗牙周炎的核心靶点。结果 分析获得22个人参活性成分、591个人参活性成分潜在作用靶点、2 249个牙周炎基因靶点和145个人参-牙周炎交集靶点。人参对血管内皮生长因子A、表皮生长因子受体等核心靶点以及低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B (PI3K-Akt)信号通路分子具有较强的结合活性。结论 人参及其活性成分可通过调节HIF-1、PI3K-Akt等多条信号通路发挥治疗牙周炎的作用。

关键词： 尖尾芋   石油醚部位   抗乳腺癌活性   化学成分   网络药理学   MAPKs信号通路  

摘要： 本研究通过UPLC-Q-TOF-MS/MS技术、网络药理学策略探究尖尾芋石油醚部位抗乳腺癌药效物质基础及作用机制,并通过4T1乳腺癌荷瘤小鼠模型验证尖尾芋石油醚部位(petroleum ether fraction of Alocasia cucullata,EAC)体内抗乳腺癌作用及机制。基于UPLC-Q-TOF-MS/MS数据获取EAC化学成分41个,包括11种芳香类成分、8种萜类成分、5种生物碱类成分、4种脂肪酸类成分、2种香豆素类成分和11种其他类成分;基于鉴定出的化合物通过网络药理学得到556个潜在作用靶点;蛋白互作网络(PPI)分析发现MAPK1、Bcl-2等10个核心靶点,富集分析发现核心靶点可能通过MAPK、PI3K-Akt等细胞凋亡相关信号通路发挥抗乳腺癌作用,并通过分子对接技术验证了毛地黄毒苷配基等活性成分与细胞凋亡相关蛋白pERK、Bcl-2、Bax具有良好的结合能力。抗乳腺癌活性研究结果表明与模型对照组比较,EAC低、中、高剂量组肿瘤生长趋势渐缓,肿瘤质量减少,抑瘤率逐渐增加;EAC中、高剂量组脾脏指数有显著性差异,EAC低剂量组脾脏指数效果不显著(P<0.05);HE染色观察到给药组肿瘤组织中细胞排列疏松,轮廓不清晰。ELISA法检测小鼠血清,发现EAC高、中剂量组、5-氟尿嘧啶阳性对照组的IL-1β、TNF-α含量均降低。动物验证实验结果表明不同浓度EAC均能下调MAPKs信号通路中p-ERK蛋白的表达(P<0.01),而对ERK、JNK、p-38、p-JNK、p-p38蛋白水平无显著性差异;EAC能显著升高小鼠乳腺癌组织中Bax/Bcl-2蛋白水平和基因表达水平。综上,尖尾芋石油醚部位能下调p-ERK蛋白水平,促进癌细胞凋亡从而抑制4T1乳腺癌荷瘤小鼠肿瘤的生长。

关键词： 安替可胶囊   肝癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探究安替可胶囊治疗肝癌的作用机制。方法使用TCMSP、SWISStarget、Uniprot数据库结合文献,查找安替可胶囊的作用化合物和化合物靶点。使用TCGA数据库获取肝癌疾病相关靶点。获得药物与疾病交集靶点,将其导入Cytoscape 3.8.2软件进行药物-靶点-疾病可视化网络图。对交集靶点进行PPI网络分析、极限乘积法生存分析、基因GO功能分析和KEGG通路分析,并将关键靶点进行分子对接。结果得到安替可胶囊靶点215个,肝癌靶点674个,其中交集靶点10个,其中CYP2C19、GCGR、ADCY1、DPP4表达与肝癌病死率呈负相关;AURKA、NUDT1、CDK1、AURKB、G6PD表达与肝癌病死率呈正相关。富集分析发现,10个关键靶点与19个生物学过程相关,与8个细胞组成相关,与6个组织学功能和2条信号通路相关。分子对接显示,G6PD是化合物作用最多的靶点,其次是AURKA;PARP1是结合能最好的靶点,其次是AURKA。结论安替可胶囊可能作用于CYP2C19、GCGR、ADCY1、AURKA、PARP1、NUDT1、CDK1、AURKB、DPP4、G6PD等多途径治疗肝癌,为进一步研究其药效作用机制奠定基础。

关键词： 克罗恩病   乌梅   网络药理学   分子对接  

摘要： 试验旨在采用数据挖掘的方法探究乌梅治疗克罗恩病(CD)的靶点及其作用机制。利用TCMSP数据库筛选、查找乌梅中主要活性成分,利用Swiss Target Prediction软件、GeneCards数据库预测乌梅活性成分和CD的对应靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作(PPI)网络。将关键靶点导入DAVID数据库,进行GO功能分析与KEGG信号通路富集分析,最后使用Autodock软件进行CD关键靶点与乌梅主要成分的分子对接。结果显示:共筛选出26个乌梅具有潜在活性的成分,乌梅与CD有156个共同靶点。通过GO分析获得283个生物学过程,KEGG富集分析结果显示出35条信号通路。分子对接的结果表明,乌梅的活性成分与CD的靶点对接良好。研究表明,乌梅中活性成分可与CD的相关靶点蛋白作用,并呈现出多成分、多靶点、多途径的特点。

关键词： 升降散   急性肺损伤   网络药理学   NF-κB信号通路   散剂   水煎液  

摘要： 目的基于网络药理学和动物实验探究升降散治疗急性肺损伤(ALI)的作用机制。方法在中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和Swiss Target Prediction数据库中检索升降散的成分及靶点,在基因数据库(Gene Cards)中检索ALI的疾病靶点。将药物与疾病交集靶点上传至STRING数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,运用DAVID网站进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。体内实验,除对照组外,升降散各给药组分别ig给药20 mL·kg^(−1)药液(散剂、水煎液高、低剂量分别为175、350 mg·kg^(-1)),每天早晚各1次,共连续给药14 d;地塞米松组第12天开始ip地塞米松(5 mg·kg^(-1)),连续给药3 d;除对照组外,其余各组第15天分别向气管内滴注1 mg·mL^(-1)脂多糖(5 mg·kg^(-1))进行造模,观察肺组织病理损伤情况,ELISA法检测白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平,实时荧光半定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法检测Toll样受体4(TLR4)、磷酸化-丝裂原活化蛋白激酶p38(p38-MAPK)、细胞外调节蛋白激酶(ERK)、c-Jun氨基末端激酶(JNK-1)mRNA表达量,Western blotting法检测核因子κB(NF-κB)和人核因子κB抑制蛋白α(IκBα)表达量。结果网络药理学预测出升降散活性成分32个,关键靶点292个,ALI疾病靶点有1454个,两者交集靶点95个;升降散治疗ALI的关键靶点主要参与NF-κB、MAPK等信号通路。通过ALI小鼠模型实验结果显示,升降散能够显著减轻ALI小鼠肺部组织炎症,改善肺泡间隔及肺泡壁增厚程度;降低血清中炎症因子IL-6、IL-1β、TNF-α的水平(P<0.05、0.01);下调TLR4、p38-MAPK、ERK、JNK-1 mRNA的表达量(P<0.05、0.01);Western blotting结果表明升降散可通过抑制NF-κB蛋白磷酸化水平(P<0.01),激活IκBα蛋白(P<0.01),缓解ALI。结论升降散能够基于多成分、多靶点、多通路的特点相互协同治疗ALI,其机制可能与NF-κB、MAPK等信号通路有关,且散剂治疗ALI的作用优于水煎液。