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关键词： 薏苡仁-苍术   异病同治   网络药理学   类风湿关节炎   痛风性关节炎  

摘要： 基于“异病同治”的中医理念,从网络药理学角度,分析了薏苡仁-苍术治疗类风湿关节炎(RA)、痛风性关节炎(GA)的具体机制及作用原理。方法 以中药成分数据库为检索工具,收集薏苡仁-苍术中药化学成分相关结果,并对SwissTargetPrediction数据库上完成对应靶点的预测,建立有效活性成分-靶点网络。经数据库分析掌握RA、GA疾病靶点,活性成分、疾病靶点筛选均在STRING平台完成,并构建PPI网络。GO功能、KEGG通路富集分析在Rx4.0.5软件上进行。结果 筛选最终结果显示,薏苡仁-苍术存在8种活性成分,筛选68个靶点68个;RA、GA疾病靶点分别为4685个、1550个,疾病与药物存在交集的靶点有24个。GO富集结果显示,揭示了1230条与生物过程相关的条目。120条KEGG通路中,与RA、GA相关的有AGE-RAGE、IL-17、Toll样受体信号通路。结论 薏苡仁-苍术药物活性成分参与免疫与炎症调节主要通过对AGE-RAGE、IL-17、Toll样受体等信号通路实现,进而实现对RA、GA的异病同治。

关键词： 胆汁淤积症   胆通胶囊   作用机制   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:采用网络药理学方法和分子对接技术分析胆通胶囊治疗胆汁淤积症的作用机制。方法:使用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)、PharmMapper和Uniprot数据库搜索胆通胶囊的活性成分及作用靶点。使用GeneCards数据库获取胆汁淤积症的靶点。绘制韦恩图得到药物-疾病交集靶点。利用Cytoscape 3.10.0软件构建胆通胶囊活性成分-靶点网络,得到胆通胶囊的主要活性成分。将主要活性成分、药物-疾病交集靶点通过STRING数据库与Cytoscape 3.10.0软件进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,得到核心靶点。利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用PubChem数据库与PyMol、AutoDockTools软件将胆通胶囊主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:共收集胆通胶囊的活性成分25个,获得疾病靶点1039个。韦恩图显示,药物-疾病的交集靶点92个。胆通胶囊活性成分-靶点网络分析结果显示,苏齐内酯、决明内酯、番泻苷E、20-殷金醇棕榈酸、(-)-儿茶素和棕榈胺A有较高的度值,为胆通胶囊的主要活性成分。PPI网络分析结果显示,白蛋白(ALB)、有丝分裂原-活化蛋白激酶1(MAPK1)、类视黄醇X受体α(RXRA)等蛋白在PPI网络中的度值较高,是核心靶点。GO功能富集分析结果显示,药物-疾病交集靶点在体内主要参与精氨酸分解代谢、尿素循环、雌激素反应等生物过程。KEGG通路富集分析结果显示,药物-疾病交集靶点在体内主要涉及精氨酸生物合成、甲状腺癌、内分泌抵抗等信号通路。分子对接结果显示,胆通胶囊的主要活性成分可对核心靶点蛋白发挥调控作用。结论:胆通胶囊通过多种活性成分作用于胆汁淤积症的多个靶点,发挥多通路治疗的作用。

关键词： 混合式教学   高职院校   “药理学”课程   应用实践  

摘要： 在当前“互联网+”背景下,线上线下混合式教学成为了高职院校课程教学中的重要教学方式。通过对高职院校“药理学”课程开展课前、课中、课后的混合式教学,打造生动富有活力、活泼富有成效的高效课堂,大大提高了学生的学习兴趣,并提升了教学效果。同时,采用多元的评价指标来全面评价学生,让学生更注重学习过程,逐步提高学生的自主学习能力,实现深度高效的学习。

关键词： 胚胎反复种植失败   滋肾养血活血汤   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨滋肾养血活血汤治疗胚胎反复种植失败(RIF)的作用机制。方法:利用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)查找滋肾养血活血汤组成药物的化学成分,并筛选出有效活性成分及有效活性成分的作用靶点,通过GeneCards和人类在线孟德尔遗传(OMIM)数据库筛选RIF疾病靶点,将药物有效活性成分作用靶点与RIF疾病靶点取交集,借助String平台制作蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络,然后利用Cytoscape3.9.1软件进行网络结构的拓扑分析筛选核心靶点,并构建中药-活性成分-靶点可视化网络图,利用DAVID在线数据库对核心靶点进行富集分析,采用AutoDock Vina软件对筛选出的主要药物有效活性成分和疾病关键靶点进行分子对接验证。结果:共获得122个药物有效活性成分和256个药物作用靶点,疾病相关靶点2215个,药物-疾病核心靶点36个。经筛选获得5个主要药物有效活性成分与9个疾病关键靶点。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析结果显示,滋肾养血活血汤治疗RIF可能主要通过调控缺氧诱导因子-1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等多种信号通路发挥治疗作用。分子对接结果表明,β-谷甾醇与蛋白激酶B1(AKT1)、丹参酮ⅡA与HIF-1A、丹参酮ⅡA与TNF、槲皮素与HIF-1A对接活性较好。结论:滋肾养血活血汤可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、丹参酮ⅡA等与靶蛋白相互结合,调控多种信号通路发挥治疗RIF的作用。

关键词： 寻常型银屑病   千里光   高效液相色谱-质谱联用技术   网络药理学  

摘要： 目的:探究千里光治疗寻常型银屑病的成分-靶点-通路作用机制,为其进一步研究提供依据。方法:使用高效液相色谱-质谱联用技术(HPLC-MS)检测千里光入血成分;在TCMIP数据库中检索千里光入血成分靶点,并在OMIM、DrugBank、GeneCards、TTD数据库中检索寻常型银屑病靶点,绘制Venn图取两者交集靶点;使用String构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用网络,使用Cytoscape 3.8.2构建千里光核心入血成分-交集靶点网络,使用Metascape进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用AutoDockTools1.5.7进行分子对接,并用PyMOL实现可视化。结果:共得到千里光入血成分50个,其中核心入血成分9个。核心入血成分靶点85个,寻常型银屑病靶点1 175个,两者交集靶点18个。蛋白互作网络得到关键靶点HSP90AA1、ESR1、AKT1,千里光核心入血成分-交集靶点网络得到主要成分山柰酚、槲皮素,KEGG富集分析得到PI3K-Akt等关键信号通路,GO富集分析中生物过程主要涉及对激素的反应、对炎症反应的调节、细胞对脂质的反应等,细胞组成主要涉及转录调控复合体、囊泡腔、分泌颗粒腔等,分子功能主要涉及激酶结合、蛋白激酶结合、蛋白激酶活性等。山柰酚、槲皮素与核心靶点AKT1分子对接结合能分别为-6.59 kcal/mol、-6.67 kcal/mol。结论:千里光核心入血成分山柰酚、槲皮素可能通过AKT1靶点,作用于PI3K-Akt信号通路发挥对寻常型银屑病的治疗作用。

关键词： 雨课堂   信息化教学   融合教学模式   药理学  

摘要： 目的探讨基于雨课堂的药理学课程LTC融合教学模式对药学专业学生学习能力的影响。方法选取59名药学专业学生作为研究对象,随机分为实验组(n=30)和对照组(n=29)。实验组采用基于雨课堂的LTC融合教学模式进行教学,对照组采用讲授式教学,对比2组学生对教学模式的满意度及期末考试成绩差异。结果实验组学生对LCT融合教学模式满意度较高,期末成绩高于对照组(P<0.05)。结论基于信息化教学的LTC融合教学模式可激发学生学习的主动性,促进学习能力提升,增加课程满意度。

关键词： 病毒性肺炎   网络药理学   分子对接   虎杖   体外实验  

摘要： 目的:通过网络药理学方法、分子对接技术和体外实验,探讨虎杖干预病毒性肺炎的可能作用机制。方法:通过TCMSP平台筛选中药虎杖的活性成分及其作用靶点,从GeneCards数据库筛选病毒性肺炎的相关靶点,取交集得到潜在作用靶点;通过STRING数据库结合Cytoscape 3.7.2软件对潜在作用靶点进行交集靶点蛋白互作(PPI)分析和拓扑学分析,得到虎杖核心成分和病毒性肺炎关键靶点。采用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,结合Cytoscape 3.7.2软件构建“虎杖-活性成分-靶点-通路”调控网络。采用AutoDock Vina、OpenBabel、PyMOL等软件对虎杖活性成分和病毒性肺炎关键靶点进行分子对接。以脂多糖(LPS)诱导的急性肺损伤人Ⅱ型肺泡上皮细胞A549建立急性肺损伤模型,对网络药理学的研究结果进行验证。结果:共获得虎杖10个活性成分,对应188个作用靶点,病毒性肺炎靶点1216个,取药物与疾病交集靶点93个;槲皮素、木犀草素、毒扁豆次碱、β-谷甾醇等可能是虎杖的核心成分;丝氨酸/苏氨激酶1(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL6)、白介素-1β(IL1β)、JUN激酶(JUN)、前列腺素G/H合成酶2(PTGS2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、半脱氨酸蛋白酶-3(CASP3)等蛋白可能是虎杖干预病毒性肺炎的核心靶点;GO功能分析和KEGG通路富集分析发现,靶点蛋白在细胞外基质、线粒体、核浆、胞质等中通过调控细胞因子、生长因子、蛋白、蛋白激酶以及TNF、PI3K-Akt、Toll样受体等信号通路发挥作用。分子对接发现,虎杖5种核心成分与TNF、Akt1、CASP3、IL1β、JUN、TP53、VEGFA靶点均有强烈的结合能力,结合能<-7.0 kcal/mol,与IL6、PTGS2均有较好的结合能力,结合能<-5.0 kcal/mol,与MMP-9有一定的结合能力,结合能<-4.25 kcal/mol。体外实验结果表明,虎杖可以降低模型组TNF-α、IL-1β、IL-6的表达,与空白组比较,差异有统计学意义(P<0.01,P<0.05),可以抑制Toll样受体4(TLR4)、核因子-κB(NF-κB)表达,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:虎杖可能通过调控TNF-α、IL-1β、IL-6、TLR4、NF-κB等靶点干预病毒性肺炎,发挥治疗作用。

关键词： 前列腺癌   网络药理学   WGCNA   淫羊藿  

摘要： 目的基于网络药理学和WGCNA方法探讨淫羊藿治疗前列腺癌的潜在作用靶点,以期为前列腺癌的临床治疗提供理论依据。方法借助TCMSP、ETCM数据库和2020版药典获得淫羊藿活性成分及其对应靶点基因;R语言对数据集GSE46602进行差异分析,WGCNA筛选出前列腺癌关键基因,获得淫羊藿前列腺癌交集靶点基因;进一步进行GO和KEGG通路富集分析,STRING及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络、药物活性成分靶点通路疾病网络;UALCAN网站及GEPIA数据库验证关键基因与Gleason分级的相关性并进行验证。结果淫羊藿有效活性成分31个,对应靶点基因228个,淫羊藿抗前列腺癌的潜在作用靶点9个;GO分析显示疾病交集基因富集在腺体发育、VEGF⁃A复合物等过程,KEGG通路富集显示主要富集在化学致癌作用受体激活、VEGF信号通路等通路上。药物活性成分共同靶点通路疾病网络分析淫羊藿核心活性成分为槲皮素、木犀草素和山奈酚;UALCAN分析交集基因的表达与Gleason分级有明显相关性,GEPIA数据库验证显示VEGFA、PGR、AKR1B1、GSTM1基因在前列腺癌组织中表达降低。结论VEGFA、PGR、AKR1B1、GSTM1基因是淫羊藿抗前列腺癌的主要靶点,淫羊藿治疗前列腺癌的核心活性成为槲皮素、木犀草素和山奈酚,其中可能是通过VEGF信号通路等发挥治疗前列腺癌的作用。

关键词： 独活寄生汤   腰椎间盘突出症   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学研究独活寄生汤治疗腰椎间盘突出症的作用机制。方法通过TCMSP中药系统药理学数据库搜索有关于独活寄生汤中中药的有效成分,然后分析成分靶点,利用UniProt蛋白质数据库将有效成分靶点蛋白转换为靶点基因信息,然后以腰椎间盘突出症的医学英文全称在OMIM、Gene Cards、DisGeNET等疾病基因数据库搜索其的基因靶点。利用绘图软件venny绘制韦恩图,将获得的靶点与腰椎间盘突出症的靶点汇总并且取交集,获得两者共有靶点。运用String蛋白质相互作用数据库和Cytoscape绘图软件,绘制出核心靶点蛋白质相互作用图,以及中药-有效成分-交集靶点-疾病通路-疾病的网络结构图。查找独活寄生汤治疗腰椎间盘突出的核心靶点基因,并且对其分别进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果筛选出中药有效成分180个,成分靶点290个,腰椎间盘突出症靶点2681个,交集靶点54个,在PPI蛋白互作分析中占关键的靶点为:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、白蛋白(ALB)、半胱氨酸蛋白酶(CASP3)、白细胞介素6(IL6)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等;GO通路富集分析最终得出了463条结果,结果中分别有生物过程364条,分子功能69条,细胞成分30条,主要涉及内容有RNA聚合酶II转录因子活性,炎症、药物反应,细胞生长凋亡等。KEGG通路富集分析显示出了112条信号通路,这些信号通路中涉及到了各种肿瘤相关通路、乙型肝炎、丙型肝炎相关通路、炎症产生相关通路以及脂质生成与代谢等通路。结论网络药理学研究显示了独活寄生汤中各种药物成分,通过多靶点相互联系、多通路共同调控,协同治疗腰椎间盘突出症,利用已证实的药物数据为基础分析了其药物中的活性成分、关键靶点、蛋白质的相互作用关系和潜在通路,进一步阐明独活寄生汤治疗腰椎间盘突出症的作用机制。

关键词： 干眼   金珍滴眼液   网络药理学   分子对接   靶点   信号通路   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接研究金珍滴眼液治疗干眼的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药综合数据库(TCMID)筛选出金珍滴眼液的所有化学成分及作用靶点;通过人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选出干眼的相关靶点;使用RGUI软件绘制韦恩图,得到金珍滴眼液治疗干眼的潜在靶点,利用STRING数据库和合Cytoscape软件构建蛋白互作网络;利用RGUI软件ClusterProfiler库进行GO功能和KEGG富集分析;使用AutoDockTools和Vina软件对关键靶点和活性成分进行分子对接,使用Pymol软件绘制对接结果。结果:金珍滴眼液中共挖掘出治疗干眼的主要活性成分34种,药物和疾病共同靶点221个。治疗干眼的重要靶点涉及AKT1、TP53、HSP90AA1、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、表皮生长因子受体(EGFR)等,主要作用于PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、MAPK信号通路、表皮生长因子受体信号通路。分子对接结果显示金珍滴眼液的主要活性成分与核心靶点间有较强的结合活性。结论:金珍滴眼液可能通过PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、MAPK信号通路、表皮生长因子受体信号通路,作用于AKT1、TP53、HSP90AA1、MAPK3、TNF、IL-6、EGFR等靶点,发挥抗炎、抗氧化、抗菌、缓解眼表微环境失衡及神经感觉异常等功能,起到治疗干眼的作用。