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关键词： 甘松   心房颤动   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨甘松治疗心房颤动的作用靶点及通路,探讨甘松治疗心房颤动的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索甘松的活性成分,预测其作用靶点。检索DrugBank、GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库,收集心房颤动治疗相关靶点,并得到甘松与心房颤动交集靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-潜在作用靶点网络,得到甘松治疗心房颤动的关键成分。运用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,然后进行可视化分析,并筛选关键靶点。应用Metascape数据库进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后使用PyMOL、AutoDock4.2.6和AutoDockTools1.5.7软件将关键成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:甘松治疗心房颤动的关键成分有熊果酸、隐丹参酮、金合欢素等。通过蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选获得半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、细胞肿瘤抗原p53、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等为重要靶点,KEGG富集分析结果提示甘松治疗心房颤动主要通过癌症通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、TNF信号通路以及IL-17信号通路等通路发挥作用。分子对接表明,甘松的主要活性成分能够很好地与关键核心靶点结合。结论:甘松基于多成分、多靶点、多通路治疗心房颤动,为后续开展实验研究进一步阐述其作用机制提供了科学依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   特异性皮炎   绿原酸   TNF信号通路   机制  

摘要： 目的结合网络药理学、分子对接技术和实验验证,探讨绿原酸(chlorogenic acid,CGA)治疗特异性皮炎(atopic dermatitis,AD)的作用靶点及潜在机制。方法利用STITCH、SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库预测和筛选出CGA的相应作用靶点。从DisGeNET、OMIM和GendCards数据库中收集并筛选出与AD相应的靶点。采用Venny 2.1.0在线工具获取CGA和AD的交集靶点。将交集靶点通过STRING 11.5数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,并将PPI网络图通过Cytoscape3.10.0软件进行可视化分析,利用CytoNCA插件筛选出核心靶点。采用DAVID平台进行GO和KEGG富集分析,探讨CGA治疗AD的关键途经,并用分子对接评估CGA与核心靶点结合亲和力。建立2,4-二硝基氯苯(DNCB)诱导小鼠构建AD模型,通过皮炎评分、脾脏指数、病理染色和RT-qPCR验证网络药理学预测的结果。结果共筛选出了CGA的241个靶点和AD的1450个靶点,将两者做交集,共获得69个交集靶点。其中,通过PPI网络拓扑分析确定了13个核心靶点,关键靶点包括MMP9、HSP90AA1、HRAS、NOS2和RHOA,分子对接表明CGA与这些核心靶点结合较强。KEGG通路富集分析表明,TNF信号通路、脂质和动脉粥样硬化、VEGF信号通路等交集靶点均显著富集。体内实验研究结果显示,与模型组相比,CGA能有效降低小鼠表皮厚度、皮炎评分以及脾脏指数。RT-qPCR结果显示,CGA可明显降低MMP9和HSP90AA1 mRNA的表达,减少TNF信号通路相关基因TNF-α、TNFR1和AKT1的表达。结论CGA可通过调节TNF信号通路来有效改善AD症状,为后续的研究开发提供参考依据。

关键词： 肉苁蓉苯乙醇苷   糖尿病肾病   UHPLC-QE-MS   网络药理学   动物实验   JAK2/STAT3信号通路  

摘要： 目的 基于网络药理学和动物实验探讨肉苁蓉苯乙醇苷(CPhGs)对糖尿病肾病(DKD)的作用。方法 UHPLC-QE-MS法分析CPhGs化学成分,TCMSP、Swiss Target Prediction数据库筛选核心成分,OMIM、GeneCards数据库获取DKD相关靶点,获得共同靶标后使用STRING网站构建蛋白互作网络,DAVID数据库进行GO、KEGG通路分析,Cytoscape软件构建“CPhGs核心成分-靶点-通路”网络。随机选取10只大鼠作为正常组,其余大鼠用高糖高脂饲料喂养及单次腹腔注射STZ建立DKD模型,分为模型组、达格列净(1 mg/kg)组和CPhGs高、中、低剂量(500、250、125 mg/kg)组,每组10只,药物干预6周,观察一般情况,每周称定体质量并检测血糖;末次给药后收集24 h尿液,检测24 h尿蛋白总量(24-UTP);腹主动脉取血并处死,分离血清,检测尿素氮(BUN)、尿酸(UA)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)水平,HE染色及Masson染色观察肾组织病理变化,ELISA法检测血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平,Western blot法检测肾组织JAK2、p-JAK2、STAT3、p-STAT3、SOCS3蛋白表达。结果 UHPLC-QE-MS技术共检测得到699种成分,经筛选后获得CPhGs核心成分16种,相关靶点323个,CPhGs与DKD共有靶点99个,关键靶点为STAT3、SRC、EGFR等。KEGG通路分析筛选了151条信号通路,显示IL-17信号通路、PI3K/Akt信号通路、TNF信号通路等可能在CPhGs治疗DKD的过程中发挥关键作用。CPhGs能增加DKD大鼠体质量(P<0.01),减少饮水量(P<0.01),调节糖脂代谢,降低24-UTP、BUN水平(P<0.01),改善肾脏组织病理损伤,降低肾组织p-JAK2/JAK2、p-STAT3/STAT3蛋白表达(P<0.01),提高SOCS3蛋白表达(P<0.01)。结论 CPhGs通过多成分、多靶点、多途径干预DKD,可能通过抑制DKD大鼠肾脏JAK2/STAT3信号通路来发挥作用。

关键词： TCGA数据库   网络药理学   胶质母细胞瘤   卤泛群   分子对接   作用机制  

摘要： 目的运用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)基因组学数据挖掘潜在治疗胶质母细胞瘤的药物卤泛群(halofantrine),通过网络药理学方法探讨卤泛群防治胶质母细胞瘤的作用机制,并结合细胞实验对卤泛群防治胶质母细胞瘤的机制进行验证。方法通过癌症临床公开数据库TCGA挖掘胶质母细胞瘤发生发展的关键基因,利用CMAP数据库寻找潜在治疗胶质母细胞瘤的药物,借助STITCH、Drug bank、Binding DB、BATMAN-TCM、TargetNet、SwissTarget、PubChem检索药物靶点信息,利用Drug bank、DisGeNET、GeneCards,TDD筛选胶质母细胞瘤靶点。通过Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点”可视化网络图,通过进行GO、KEGG和分子对接分析,预测其作用机制。利用CCK-8及qPCR等方法验证卤泛群对胶质母细胞瘤细胞及治疗靶点的作用。结果筛选出潜在治疗胶质母细胞瘤的药物卤泛群,卤泛群有150个作用靶点,胶质母细胞瘤治疗靶点有173个,和药物交集靶点有12个,获得3个核心靶点:EGFR、MAPK14、IGF1R。分子对接结果显示,卤泛群与核心靶点结合的潜能和活性良好。CCK-8和qPCR实验结果表明卤泛群可通过EGFR、MAPK14、IGF1R靶点抑制胶质母细胞瘤细胞增殖。结论卤泛群通过EGFR、MAPK14、IGF1R靶点发挥治疗胶质母细胞瘤的作用。

关键词： 药理学实验   教学改革   人才培养  

摘要： 当前药理学实验教学中尚有亟待完善之处,该文提出了“由点成面”的药理学实验教学改革策略:通过更新实验教学内容,借助线上信息化教学平台,采取翻转课堂教学模式,改革实验教学评价体系,采用多元化的教学方法,从而提高药理学实验教学效果。

关键词： 中药药理学   贯通性实验   设计   应用   凉膈散  

摘要： 目的 中药药理学是以传统中药学与现代药理学为主体的新兴交叉学科,迄今国内尚未有完善的中药药理学贯通性实验教学方案。方法 结合现有基础教学条件及中药药理学教学团队的教学改革实践经验,选择凉膈散(LGS)进行实验设计。结果 建立了完善的贯通性实验教学方案,并选取中药学和中药制药2个专业学生进行教学实践。结论 此研究为中医药院校及综合性院校的中药学专业进行实验教学改革提供模板及思路。

关键词： 芩蓟凉血合剂   便秘   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学方法研究芩蓟凉血合剂治疗便秘的作用机制。方法通过TCMSP、TCMID数据库获取芩蓟凉血合剂活性成分及对应靶点,再通过GeneCards、TTD、DrugBank、OMIM、DisGeNET数据库获取便秘相关靶点,将共有靶点导入STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape3.8.1软件构建芩蓟凉血合剂治疗便秘中药-活性成分-靶点网络,筛选关键成分与核心靶点,并利用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果从芩蓟凉血合剂中筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、豆甾醇共5个关键成分,HSP90AA1、STAT3、MAPK3、TP53、AKT1、MAPK1、RELA、TNF、FOS及IL6共10个核心靶点。KEGG通路富集分析结果显示,芩蓟凉血合剂治疗便秘主要涉及癌症通路、HIF-1信号通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路。结论芩蓟凉血合剂可能通过HIF-1信号通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路,调控HSP90AA1、STAT3、MAPK3等靶点治疗便秘。

关键词： 槲皮素   阿尔茨海默病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对技术探究槲皮素治疗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、PubChem数据库和Swiss Target Prediction平台预测槲皮素潜在靶点,利用Disgenet数据库获得AD的潜在靶点。通过维恩图对槲皮素潜在靶点和AD潜在靶点取交集得到共同靶点,将共同靶点导入DAVID数据库,以P<0.05进行筛选,进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,通过Cytoscape 3.6.0软件的centiscape 2.2插件对PPI网络进行分析,得到槲皮素治疗阿尔茨海默病的关键靶点。将关键靶点按照Degree从大到小排序取前5为核心靶点,使用SailVina final软件对筛选出的核心靶点进行分子对接。结果:三个数据库得到槲皮素潜在靶点有319个、阿尔茨海默病潜在靶点有673个,交集靶点有92个,筛选出的关键靶点有23个,GO分析中生物过程主要有基因表达正调控、细胞凋亡过程的正调控、对外源性刺激的反应、细胞凋亡过程的负调控等。KEGG通路分析主要富集在IL-17、HIF-1、FoxO、TNF、PI3K-Akt、MAPK等信号通路。槲皮素与核心靶点IL-6、AKT、TP53、TNF、IL-1β分子对接的平均对接亲和力为-7.92 kcal·mol^(-1),结合活性较好。结论:利用网络药理学和分子对接技术预测了槲皮素治疗AD的潜在靶点及信号通路,为后续实验研究提供理论基础。

关键词： 慢性萎缩性胃炎   陈皮   半夏   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 运用网络药理学及分子对接技术探讨陈皮-半夏治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的潜在作用机制。方法 利用TCMSP平台筛选陈皮-半夏的有效成分及药物靶点,并利用Cytoscape 3.9.1软件构建中药-有效成分-药物靶点可视化网络;通过GeneGards、OMIM数据库筛选CAG疾病靶点,与药物靶点绘制韦恩图,获取陈皮-半夏与CAG的交集靶点;在STRING数据库中构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,根据度中心性(DC)、中介中心性(BC)、接近中心性(CC)结果筛选出核心靶点;通过Metascape数据库对交集靶点进行GO生物功能分析及KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.9.1软件构建有效成分-交集靶点-信号通路-CAG网络并筛选出关键有效成分;最后选取关键有效成分与核心靶点在DockThor网站中进行分子对接,验证其结合的稳定性。结果 获取陈皮-半夏有效成分18个,药物靶点126个,CAG疾病靶点892个,交集靶点39个;柚皮素、川陈皮素、黄芩素、β-谷甾醇为关键有效成分;Akt1、TP53、Jun、VEGFA等是陈皮-半夏治疗CAG的核心靶点;GO生物功能分析提示陈皮-半夏参与氧化应激反应、对活性氧的反应、分泌颗粒腔、转录因子结合等生物过程,KEGG通路富集分析共获得信号通路146条,包括癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化以及IL-17、TNF、MAPK、PI3K-Akt等信号通路;分子对接结果显示关键有效成分与其相关的核心靶点结合能均<-5 kcal/mol,表明二者结合稳定。结论 陈皮-半夏药对可能通过柚皮素、川陈皮素、黄芩素、β-谷甾醇等有效成分作用于Akt1、TP53、Jun、VEGFA等核心靶点,涉及或参与癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化以及IL-17、TNF、MAPK、PI3K-Akt等信号通路调控细胞凋亡、抑制炎症反应,从而达到治疗CAG的目的。

关键词： 纳豆激酶   溶栓   药理作用   研究进展  

摘要： 纳豆激酶是一种源自日本传统发酵食品纳豆的丝氨酸蛋白酶,具有多种生物学活性和药理作用。因其具有强大的溶解血栓的能力,受到广大研究者的关注,有望成为新一代溶栓药物。本文首先介绍了纳豆激酶的来源、提取方法和生物学活性,包括其对特定蛋白质的分解能力和在生物体内发挥的溶栓作用。接着,文章详细讨论了纳豆激酶的多种药理作用,包括其在溶栓、抗炎、神经保护、抗动脉粥样硬化以及改善视网膜健康等方面的潜在应用。此外,文章还展望了纳豆激酶未来的研究方向,强调了继续探索和优化提取纯化方法的重要性,并指出深入了解其分子作用机制对于开发更有效的治疗策略至关重要。