课程文献中心 更多>>

关键词： 桑葚   酒精性肝炎   酒精性肝病   网络药理学   分子对接  

摘要： 本研究采用网络药理学方法和分子对接技术,探讨桑葚在防治酒精性肝炎的作用机制。方法 我们首先使用了TCMSP和BAT-MAN数据库来获得桑葚的有效活性成分;使用SwissTargetPrediction数据库来预测这些成分可能作用的生物靶标;通过GeneCards和OMIM数据库,查询与酒精性肝炎相关的靶点,并找到了与桑葚活性成分相关的交集;利用Cytoscape 3.7.2软件构建了蛋白质互作的网络图以及“药物-成分-疾病-靶标”网络图;采用了R语言进行了靶点的GO和KEGG通路富集分析;最后,使用AutoDockTools-1.5.6和Pymol软件进行了分子对接,结果筛选出20种活性成分和861个有效靶点,这些靶点与461个酒精性肝炎相关的疾病靶点有119个交集,基于KEGG富集分析的结果,我们确定了四个核心靶点:IL-1B、IL-6、SOD2和CYP2E1。结论 研究表明,桑葚对于由酒精引起的肝脏损伤具有显著防治作用。这主要得益于其中的活性成分,如槲皮素、桑色素、白藜芦醇和蜕皮激素等。这些成分通过作用于多个关键分子靶点,如IL-1B、IL-6、SOD2和CYP2E1,有效调控了TNFα信号途径、脂质代谢,动脉粥样硬化过程以及非酒精性脂肪肝病的发展。通过这些途径,能够减轻炎症反应,调整脂质代谢,并优化免疫功能,从而保护肝脏免受酒精的伤害。这项研究不仅揭示了桑葚防治酒精性肝炎的潜在机制,也为进一步的研究和治疗策略提供了新的视角和方法。

关键词： 菟丝子   胰岛素抵抗   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗(IR)的分子机制。方法运用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,筛选菟丝子的化合物和有效靶点;使用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库预测IR的相关靶点,并利用Uniprot数据库转换成相应的基因名称;选取Cytoscape软件构建菟丝子—活性成分—靶点网络关系图、String数据库构建靶点蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络;利用David数据库进行GO生物学功能富集分析和KEGG通路富集分析,并绘制柱状图和气泡图;使用Autodocktools软件对活性成分与核心靶点进行分子对接分析。结果获得菟丝子的关键化合物10个、药物靶点207个、疾病靶点1279个、交集靶点122个,得到JUN、AKT1、TP53、RELA、MAPK1和TNF 6个PPI网络核心分子,网络药理学结果提示菟丝子可能通过TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路等121条信号通路参与调控IR。分子对接结果显示,菟丝子中活性成分槲皮素、苦参碱、β-谷甾醇与核心靶点JUN、TP53、MAPK1和RELA间存在结合位点。结论菟丝子具有多成分—多靶点—多途径协同治疗IR的作用,为后续的分子机制研究及临床应用奠定了理论基础。

关键词： 网络药理学   异病同治   加味二至丸   绝经综合征   原发性失眠   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学研究方法探究加味二至丸“异病同治”绝经综合征和原发性失眠的作用机制。方法通过TCMSP(traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)数据库获取女贞子、墨旱莲、淫羊藿的主要化学成分及其靶点,根据ADME筛选中药活性组分,通过GeneCards、OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库分别获取绝经综合症和原发性失眠主要靶点,采用Cytoscape3.9.0软件构建“加味二至丸-成分-靶点-疾病”网络,利用STRING11.5平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并筛选网络中得分较高基因探析。最后采用Metascape平台进行生物过程及通路分析。结果加味二至丸调治绝经综合征和原发性失眠的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、熊果酸等,核心靶点有PTGS2、ESR1、NOS2、ADRB2、GABRA1等,加味二至丸调治绝经综合征和原发性失眠的生物学通路主要作用于AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、神经活性配体受体相互作用等通路。结论加味二至丸可能通过调节神经-内分泌-免疫系统、炎症反应、雌激素代谢等多种途径发挥治疗绝经综合征和原发性失眠的作用。

关键词： PBL教学法   药理学   教学效果  

摘要： 研究以问题为导向的教学法(PBL)在药理学教学中的应用以及实践效果。方法 选择2022年1月至2022年12月期间在我院药学专业某班学习的50名学生,随机分组,比较两组实习生带教效果。结果 观察组实习生带教效果均优于对照组(P<0.05)。结论 在药理学教学中,应用PBL教学法进行教学,可提升带教效果,应用价值高,值得推广。

关键词： 三物黄芩汤   肝癌   网络药理学   分子对接   IL-6  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接技术分析三物黄芩汤治疗肝癌的潜在作用机制,并通过动物实验进行初步验证。方法运用TCMSP数据库筛选三物黄芩汤的有效化合物,运用Drug bank、Pharm mapper、Uniport、PubMed等数据库获得三物黄芩汤的作用靶点,运用Gene cards和TCGA数据库获得肝细胞癌相关靶点,与上述三物黄芩汤作用靶点取交集后得到“药物-疾病”靶点,运用String数据库构建蛋白相互作用网络,运用David和KEGG数据库进行GO、KEGG富集分析,运用Cytoscape软件构建相应网络。运用Discovery studios软件进行分子对接,对上述网络药理学结果进行验证。采用C57小鼠肝脏原位荷瘤模型,观察三物黄芩汤干预对肝癌细胞增殖、转移的影响,并观察肝癌细胞IL-6分子表达的变化。结果三物黄芩汤有效成分81个,核心成分10个,作用靶点249个,肝癌样本与正常样本差异靶点1420个,两者交集59个。蛋白相互作用网络频数分析显示,三物黄芩汤治疗肝细胞癌的机制与ESR1、MYC、JUN、IL-6、MMP9、EGF等靶点有关。GO和KEGG富集分析表明以IL-6为核心的IL-17 signaling pathway、TNF signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway等多条信号通路可能发挥重要作用。分子对接结果显示,药效分子Acacetin、Wogonin、Baicalein、Oroxylina、Beta-sitosterol、8-Isopentenylkaempferol、Formononetin、Luteolin、Quercetin、Stigmasterol可与IL-6蛋白结合,进一步证实了上述结果。动物实验表明,三物黄芩汤可抑制肝种植瘤的大小和肺部转移,癌细胞IL-6含量降低,初步验证了三物黄芩汤的抗肝癌作用和机制。结论本研究通过网络药理学和分子对接技术发现IL-6是三物黄芩汤治疗肝癌的关键靶点,进一步通过动物实验表明三物黄芩汤可降低肝癌组织IL-6表达量发挥治疗肝癌作用,为三物黄芩汤的抗肝癌应用提供理论依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   艾迪注射液   结直肠癌  

摘要： 目的运用网络药理学及分子对接技术探讨艾迪注射液治疗结直肠癌(CRC)的有效活性成分及潜在作用机制。方法从TCMSP、TCM-ID数据库及文献检索中提取艾迪注射液的主要活性物质,并使用SwissTargetPrediction数据库进一步确定其可能的作用靶标;从GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库中获取CRC疾病基因靶点。运用STRING数据库及Cytoscape 3.9.1制作“药物活性成分靶点”及PPI网络图。运用Metascape数据库对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。运用分子对接验证关键成分与疾病分子间的联系。结果共筛选出39个艾迪注射液有效成分,684个疾病分子,与CRC共有169个靶点。GO功能富集结果显示有188个分子功能、108个细胞组成、1845个生物过程。KEGG分析得到200条通路途径。分子对接结果显示,艾迪注射液核心成分华良姜素、山柰酚、槲皮素等,与疾病分子TP53、BCL2、AKT1、CCND1、CASP3对接良好。结论艾迪注射液可能通过华良姜素、山柰酚、槲皮素等活性成分调节TP53、BCL2、AKT1、CCND1、CASP3等核心靶点从而治疗CRC。

关键词： 网络药理学   甲亢   作用机制   夏枯草   海藻   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学与分子对接探索夏枯草-海藻治疗甲状腺功能亢进症(甲亢)的机制。方法:TCMSP数据库收集夏枯草、海藻的活性成分与作用靶点,GeneCards数据库、OMIM数据库收集甲亢疾病靶点。药物与疾病的相交靶点为共同作用靶点。对共同作用靶点进行蛋白互作网络分析、GO功能和KEGG通路富集分析。筛选重要活性成分和关键靶点,使用Autodock Dock 1.5.7进行分子对接。结果:夏枯草-海藻作用靶点1025个,疾病靶点65个,相交靶点34个。重要活性成分:槲皮素、木犀草素、山奈酚,关键靶点:HIF1A、IL6、VEGFA、EGFR、CCND1、FOS、NOS3、ERBB2。GO分析结果显示夏枯草-海藻能够作用于核激素受体结合等生物过程。KEGG分析结果表明夏枯草-海藻主要作用于PI3K-Akt信号通路发挥治疗作用。分子对接结果显示,山奈酚与HIF1A、CCND1、NOS3、ERBB2的结合较为稳定。结论:海藻-夏枯草可能作用于HIF1A、CCND1、NOS3、ERBB2等靶点,以及核激素受体结合、PI3K-Akt信号通路发挥治疗作用。

关键词： 交叉融合   药理学   教学改革  

摘要： 多学科交叉融合已被认为是当今医学教育创新发展的重要教育策略。药理学本科教学改革以学习者为中心,重塑教育教学新形式,优化学科整合布局,构建现代知识体系,突出多学科协同;创新教学方法,体现相生共长优势;注重能力塑造,推进基础与临床及医理工文深度交叉融合的“新医科”建设。立足医学教育改革发展前沿,秉持“大科学”汇聚理念,厚基础、强实践,培养具有完善知识结构、交叉融合思维、广阔综合学科视野的高层次医学创新人才。

关键词： 温阳生肌膏   糖尿病创面   创面愈合   网络药理学   分子对接   缺氧诱导因子1A  

摘要： 目的从网络药理学角度探讨温阳生肌膏治疗糖尿病创面的作用机制,并通过动物实验进行验证。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及相关文献筛选温阳生肌膏(WYSJO)活性成分及对应靶点;通过Gene Cards、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)、Drug Bank、Pharm Gkb和Therapeutic Target(TTD)等数据库检索糖尿病创面的作用靶点;使用Cytoscape 3.9.0绘制出WYSJO活性成分-糖尿病创面靶标网络;应用检索相互作用基因/蛋白质的搜索工具(STRING)平台搭建蛋白互作网络(PPI);应用京都基因与基因组百科全书(KEGG)与基因本体(GO)富集分析WYSJO与糖尿病创面的信号通路;应用Auto Dock 1.5.6对核心成分与靶点进行分子对接;将18只大鼠随机分为对照组、模型组和WYSJO组(n=6),以模型组和WYSJO组制备糖尿病大鼠难治性创面模型。分别在处理第0、5、9、14天时观察创面愈合,苏木素-伊红(HE)染色观察创面组织形态,实时荧光定量聚合酶链式反应(q PCR)检测核心基因表达情况。结果网络药理学筛选出WYSJO药物有效成分76种,药物靶点206个,糖尿病创面疾病靶点3797个,以及WYSJO治疗糖尿病创面作用靶点167个;通过构建WYSJO活性成分-糖尿病创面作用靶标网络,发现槲皮素、大豆苷元、山奈酚、鼠李素、鼠李柠檬素、异长春花苷内酰胺和邻苯二甲酸二异丁酯(DIBP)7个核心靶点。GO富集分析表明温阳生肌膏治疗糖尿病创面可能涉及细胞对脂多糖、细菌来源分子、金属离子、外来刺激、化学应激、营养水平、缺氧及氧化应激等生物过程。KEGG富集分析表明温阳生肌膏治疗糖尿病创面可能涉及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、p53信号通路、白介(IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、细胞凋亡、脂质和动脉粥样硬化等相关通路发挥治疗糖尿病创面的作用。动物实验显示WYSJO可显著加快糖尿病创面的愈合速度(P<0.05),减轻炎症反应,促进肉芽组织生长,同时也可下调网络药理学预测的E1A结合蛋白p300(EP300)、Jun激酶(JUN)、骨髓细胞瘤癌基因(MYC)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、特异性蛋白1(SP1)、肿瘤蛋白p53(TP53)以及雌激素受体1(ESR1)等8个核心基因表达(P<0.05)。结论WYSJO治疗糖尿病创面的作用机制可能与AGE-RAGE、p53、HIF-1等通路密切相关,通过此研究可为WYSJO的药理学研究提供新思路,并为其进一步转化应用提供基础。

关键词： 健脾利湿养肝方   慢加急性肝衰竭   网络药理学   分子对接   信号通路   槲皮素  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接探究养肝方治疗慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)的作用机制。方法依托TCMSP及GeneCards等多种数据库,获得健脾利湿养肝方治疗ACLF疾病的相关靶点。应用String及Cytoscape构建作用靶点的PPI网络,筛选出核心作用靶点并采用DAVID进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。对健脾利湿养肝方重复出现的活性成分以生物利用度OB值≥30%,类药性DL≥0.18为筛选条件,分选出中药复方健脾利湿养肝方的主要活性成分,并对该主要活性成分与核心作用靶点亲和力进行分子对接及动物体内实验验证。结果共获得健脾利湿养肝方治疗ACLF的活性成分536个,交集靶点基因244个,并筛选出核心靶点基因7个。分子对接显示核心靶基因AKT1、SRC、VEGFA、STAT3、EGFR、MAPK3、HRAS与健脾利湿养肝方中的主要活性成分槲皮素亲和力较好,具有很强的结合活性。另外,体内实验验证健脾利湿养肝方能够降低HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA的表达,以延缓ACLF疾病进展。结论健脾利湿养肝方可能作用于HRAS、EGFR、STAT3、SRC、VEGFA等核心靶点,以达到治疗ACLF的作用。