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关键词： 桂枝   甘草   窦性心动过缓   网络药理学   槲皮素   山柰酚   炎性反应   心肌损伤   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探讨桂枝-甘草药对治疗窦性心动过缓(SB)的分子机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得桂枝-甘草药对的化学成分;运用本草组鉴平台(HERB)预测药物相关靶点;检索人类基因数据库(GeneCards)获得SB疾病靶点;绘制VENN图获得两者交集靶点,将交集靶点导入STRING数据库,构建蛋白质与蛋白质相互作用网络;通过Metascape数据库对所得交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Cytoscape3.9.1构建桂枝-甘草药对成分-交集靶点-通路网络图,筛选核心成分、作用靶点和通路。结果:获得桂枝-甘草药对化学成分98种,对应靶点245个,SB疾病靶点570个,交集靶点52个,GO富集分析获得生物过程20项,细胞组分11项,分子功能12项。与SB密切相关的KEGG通路主要包括流体剪切应力与动脉粥样硬化、钙信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路等。结论:桂枝-甘草药对中的槲皮素、山柰酚等活性成分作用于ESR1、AR、NOS2等相关靶点,调控多种信号通路,通过减轻炎性反应、避免心肌损伤等方式发挥对SB的治疗作用。

关键词： 麻黄   挥发油   GC-MS   网络药理学   化学成分  

摘要： 研究麻黄不同产地的挥发油化学成分组成及含量变化,结合网络药理学方法探讨麻黄挥发油成分干预支气管哮喘可能的作用机制。从吉林麻黄、内蒙古麻黄、四川麻黄的挥发油中分别鉴定得到13、6、6个成分。Venny分析得到交集靶点95个,PPI分析筛选出20个核心靶点。GO分析得到1377个功能条目,KEGG富集分析得到151条相关通路。“成分-交集靶点”网络分析得到1-苯基-1,2-丙二酮、4-甲氧基苯乙烯、香叶醇等核心成分,可能为治疗支气管哮喘的潜在活性成分。本研究为进一步探究麻黄挥发油治疗支气管哮喘潜在作用机制提供了一定的参考依据。

关键词： 网络药理学   苍术抗血   管性痴呆  

摘要： 基于网络药理学研究苍术抗血管性痴呆的作用机制。方法 通过TCMSP数据库和Uniprot数据库筛选苍术的活性成分及作用靶点,通过OMIM数据库和Gene cards数据库筛选VaD作用靶点,用jvenn工具软件获取苍术和VaD的交集靶点,利用STRING构建中药-疾病靶点蛋白相互作用网络与筛选核心基因;结合两者的数据用Cytoscape 3.9.1建立与血管性痴呆相关的苍术对活性成分—潜在靶点网络,利用DAVID平台对网络进行GO富集分析、KEGG通路注释分析,研究苍术抗血管性痴呆的作用机制。经过研究,苍术中发现了9种有效的化学成分,而且这些成分对血管性痴呆的治疗有着重要的作用,共计发现了49个潜在靶点,其中包括AKT1、TNF、IL6、CASP3和TP53等核心基因。经GO功能富集分析,共收录了419个条目,包括314个生物过程、40个分子功能和65个细胞成分。经KEGG通路注释分析,共检索到44条通道,包括有癌症信号通路、糖尿病并发症的AGE-RAGEA信号通路等。结论 初步验证和预测苍术主要通过抑制炎症的途径抗血管性痴呆,为研发治疗血管性痴呆的药物提供一定的理论数据和开发方向。

关键词： 系统性红斑狼疮   健脾滋肾方   网络药理学   足细胞   自噬  

摘要： 目的 基于网络药理学结合分子对接,通过临床验证,探讨健脾滋肾方从足细胞自噬途径治疗系统性红斑狼疮(SLE)潜在机制。方法 运用TCMSP、GeneCards、OMIM及TTD数据库获取健脾滋肾方及SLE、足细胞自噬相关靶点;取三者交集得到健脾滋肾方经足细胞自噬途径治疗SLE的潜在作用靶点。Cytoscape3.9.1构建“复方-成分-疾病-潜在靶点”网络及蛋白质互作网络,筛选出关键活性成分和靶点,进行分子对接。并临床纳入46例SLE患者和10例健康人,将SLE患者随机分为观察组(n=22)和对照组(n=21)。对照组口服醋酸泼尼松及吗替麦考酚酯,观察组在其基础上加用健脾滋肾方,疗程均为12周。运用ELISA检测SLE组及健康人群尿液中nephrin、synaptopodin水平;使用Western blot检测外周血内p-JAK1/JAK1、pSTAT1/STAT1、LC3II/LC3I、p62蛋白水平,并观察经健脾滋肾方干预后对SLE患者足细胞相关蛋白(nephrin、synaptopodin)、自噬水平(LC3II/LC3I、p62)及p-JAK1/JAK1、p-STAT1/STAT1表达影响。结果 经筛选得到健脾滋肾方经足细胞自噬途径治疗SLE的关键活性成分4种,核心靶点基因5个(STAT1、PIK3CG、MAPK1、PRKCA、CJA1);富集分析显示可能涉及AGERAGE、JAK/STAT、EGFR、PI3K/Akt等信号通路。分子对接结果显示关键活性物质和核心靶点均有较好的结合活性。其中STAT1是结合活性最好的靶蛋白。临床试验证实健脾滋肾方能够显著降低血清中p-JAK1/JAK1及p-STAT1/STAT1、LC3II/LC3I蛋白表达水平(P<0.05或P<0.01),升高p62蛋白表达水平(P<0.05),降低尿液中nephrin、synaptopodin水平(P<0.05)。结论 健脾滋肾方经足细胞自噬治疗SLE具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,其可能通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、异鼠李素等关键活性成分作用于STAT1靶基因,抑制JAK/STAT通路相关基因表达,调控自噬减轻SLE足细胞损伤。

关键词： 痤疮   清痘汤   生信分析   信号通路  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接技术,探讨清痘汤治疗痤疮的作用机制。方法:利用TCMSP综合性中药数据库获取清痘汤活性成分及潜在作用靶点,同时在DisGeNET、GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索痤疮的疾病靶点;采用Cytoscape软件构建“活性成分-作用靶点”网络,最后进行GO和KEGG富集分析与分子对接。结果:获得清痘汤活性成分77个,潜在作用靶点78个;PPI网络显示PTGS2、IL-6、TNF、CAT、PPARG、AKT1等为核心基因;核心靶点主要分布在膜微区、膜筏、过氧化物酶体基质等,与核受体活性、氧化还原酶活性功能、血红素结合等相关,参与脂多糖、细菌来源分子、外来生物刺激、细胞外刺激反应等生物过程。活性成分主要通过干预TLR信号通路、NF-κB信号通路、TNF信号通路及AGE-RAGE信号通路传导发挥作用。分子对接结果显示,清痘汤中主要活性化合物槲皮素、汉黄芩素、木犀草素与PPI网络中核心靶点能较好地结合。结论:该研究初步阐释清痘汤的潜在作用机制,为进一步研究提供参考。

关键词： 金线莲液(喷雾用)   COVID-19   网络药理学   分子靶点对接   作用机制  

摘要： 金线莲液(喷雾用)在COVID-19大流行期间表现出良好的临床治疗效果,但其物质基础及作用机制尚不明确。本研究拟通过网络药理学及分子对接的方法预测金线莲液防治新冠的分子机制,结合体外药效学实验对当前具有明确新冠防治效果的靶点与金线莲液重点成分的相互作用进行研究。首先运用UPLC-MS结合数据库比对分析金线莲液中活性成分,经SwissADME数据库体内药代动力学过程筛选得到类药性较好的潜在活性成分17个,SwissTargetPrediction、GeneCards检索获得化合物疾病共有靶点93个。随后运用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分−靶点”网络图,以Metascape平台进行基因功能注释和富集通路分析,发现金线莲液主要通过异鼠李素、山柰酚、木犀草素、槲皮素、芹菜素等活性成分与共有靶点(NOS3、MPO、MMP3等)结合,调节对外部刺激的积极反应、炎症反应、细胞因子产生等生物过程,发挥抗COVID-19的作用。血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)活性测定实验表明金线莲液(喷雾用)原液及除去多糖后的上清液(主要为黄酮类成分)对ACE2酶活性有一定的抑制作用。最后,采用2019-nCOV-S蛋白假病毒感染HEK-293T-ACE2细胞,发现金线莲液可能主要通过阻断新冠病毒S蛋白与ACE2的结合发挥抗病毒作用。

关键词： 余甘子   淋巴癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 利用网络药理学、分子对接方法探索余甘子治疗淋巴癌的潜在机制。通过TCMSP平台筛选余甘子活性成分,SEA及SWISS数据库筛选药物靶点;Genecards、OMIM、TTD数据库预测淋巴癌靶点;取交集基因录入STRING数据库构建“蛋白-蛋白”PPI网络图,应用Metascape平台对交集靶点进行GO/KEGG富集分析,并可视化结果,并将余甘子活性成分与关键靶点进行分子对接分析。从余甘子中筛选出中12个活性化学成分,其中潜在靶点293个,相关淋巴癌的疾病靶点有637个,交集靶点43个,GO富集以及KEGG富集分析得到PI3K-AKT等157条信号通路。分子对接结果表明余甘子主要成分中鞣花酸、山柰酚、木犀草素、间双食子酸、槲皮素与PI3K/AKT信号通路上AKT1、PI3Kp110α有较好的结合力,提示余甘子可能通过抑制PI3K/AKT通路治疗淋巴癌。

关键词： 川牛膝   高血压   网络药理学   化学成分   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学分析川牛膝治疗高血压的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选出川牛膝的活性成分及其作用靶点,采用OMIM数据库,Drugbank数据库,TTD数据库,CTD数据库和DISGENT数据库检索与高血压相关的靶点基因。将川牛膝及高血压的共同靶点导入STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析(PPI);利用METASCAPE数据库进行核心靶点GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果:川牛膝主要化学成分为槲皮素、杯苋甾酮、红苋甾酮、β-谷甾醇、齐墩果酸等;共筛选出关键共同靶点170个,包括AKT1、IL6、VEGFA、TP53、CASP3、TNF、JUN、EGF、MAPK1、EGFR、PTGS2、STAT3等;GO富集分析得到生物学进程主要涉及炎症反应、对伤害的反应、对脂多糖的反应、活性氧代谢过程、凋亡信号通路等;KEGG富集信号通路主要包含糖尿病并发症AGE-RAGE信号路径、肿瘤的途径、乙型肝炎、TNF信号通路、肿瘤中的蛋白质多糖等。结论:川牛膝治疗高血压存在多通路、多靶点的可能,揭示了川牛膝治疗高血压的潜在分子机制。

关键词： 左西孟旦   低氧肺动脉高压   动物实验   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的通过动物实验探究左西孟旦(levosimendan,LEVO)对低氧肺动脉高压(hypoxic pulmonary hypertension,HPH)的作用,使用网络药理学方法与分子对接技术进一步探索其潜在作用机制。方法构建HPH大鼠模型,检测右心收缩压及右心重构指数;通过HE、Masson和VG染色分析大鼠肺组织病理学变化。检索Swiss Target Prediction、DrugBank Online、BatMan、Targetnet、SEA、PharmMapper数据库,筛选药物靶点;从GeneCards、OMIM数据库中检索疾病靶点;确定二者交集靶点后,构建“药物-靶点-疾病”网络;构建蛋白互作网络并筛选出核心靶点;使用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析;用AutoDock软件对核心靶点进行分子对接。结果动物实验结果表明,LEVO对HPH具有明显治疗作用;网络药理学结果显示,SRC、HSP90AA1、MAPK1、PIK3R1、AKT1、HRAS、MAPK14、LCK、EGFR、ESR1等是发挥治疗作用的关键靶点;分子对接显示,LEVO与度值前5的核心靶点均对接良好。结论LEVO可能通过多靶点发挥对HPH的治疗作用。

关键词： 麻黄细辛附子汤   病态窦房结综合征   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接技术研究麻黄附子细辛汤治疗病态窦房结综合征(Sick sinus syndrome,SSS)的活性成分及其潜在作用机制。方法采用GeneCards、OMIM、Disgent等数据库内容,结合TCMSP数据库,获得麻黄附子细辛汤药效物质基础及相应的靶点。利用Uniprot数据库,对靶点展开基因注释,利用Cytoscape3.9.0软件,构建出一个网络图。再基于STRING数据库构建蛋白网络互作(PPI)图,根据“介数中心”、“紧密密度”、“结点链接”为筛选条件,筛选后获得麻黄附子细辛汤治疗SSS的核心靶点,结合DAVID数据库,采用GO、KEGG等技术,使用AutoDock软件对疾病核心靶基因与潜在活性成分进行分子对接,以Pymol软件为平台,实现“关键靶点”的可视化。结果获得麻黄附子细辛汤75种有效成分和646个作用靶点,SSS疾病靶点1287个,其中麻黄附子细辛汤与SSS的交集靶点108个,包括NR3C1、AKT1、ESR1、TNF、CASP3、EGFR 6个核心靶点。筛选结果显示,GO项有697个,KEGG信号通路有137个。通过分子对接,发现其与靶标蛋白的相互作用能力良好。结论本研究提出了“多组分-多靶点-多途径”的药效物质基础,为临床应用提供了依据。