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关键词： 网络药理学   丹栀逍遥散   抑郁伴干眼   靶点预测   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学方法和分子对接技术探讨丹栀逍遥散治疗抑郁伴干眼的作用机制。方法:首先借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取并筛选丹栀逍遥散的成分靶点,结合OMIM数据库、DRUGBANK数据库、TTD数据库和GeneCards数据库获取疾病靶点,得到丹栀逍遥散治疗抑郁症和干眼的靶点,再用Cytoscape 3.7.1软件绘制丹栀逍遥散“单一药物-有效成分-共同靶点”网络图,寻找治疗抑郁伴干眼的关键靶点,然后对两种疾病的共同靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体论(GO)富集分析,最终将关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:本研究共收集到丹栀逍遥散“异病同治”抑郁伴干眼有效成分128种,丹栀逍遥散“异病同治”靶点52个。关键的生物学通路涵盖癌症通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Product,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Advanced Glycation End Product Receptor,RAGE)信号通路等。丹栀逍遥散治疗抑郁伴干眼的核心靶蛋白为肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、IL-1B、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)A、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、信号转导和转录激活因子3(Signal Transducers and Activators of Transcription 3,STAT3)等,关键活性成分涵盖山柰酚、槲皮素、柚皮素、芍药苷、木犀草素、芦荟大黄素等,分子对接的结果显示丹栀逍遥散中的关键活性成分与对应的靶点结合效果良好。结论:丹栀逍遥散可通过控制炎症反应治疗抑郁伴干眼。本研究结果为深入了解丹栀逍遥散治疗抑郁伴干眼的作用机制和探索其新的药理作用提供理论依据,也为中医科学内涵的解读指明新的思路和方向。

关键词： 葛根芩连汤   腹泻型肠易激综合征   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学方法及分子对接技术探究葛根芩连汤治疗腹泻型肠易激综合征(Diarrhea Irritable Bowel Syndrome,IBS-D)的可能潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索葛根芩连汤中4味中药的有效成分和对应靶点,通过GeneCards数据库等获取IBS-D的相关疾病靶点,将药物作用靶点和相关疾病靶点进行映射,得到该方治疗IBS-D的共同作用靶点。利用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络,并得到核心作用靶点。通过DAVID数据库对共同作用靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用分子对接技术进行初步验证。结果:葛根芩连汤有效活性成分包括槲皮素、葛根素等144个,葛根芩连汤与IBS-D共同作用靶点135个,核心作用靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)A、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等。KEGG通路富集分析得出葛根芩连汤可能通过调节磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinases,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、TNF等信号通路而对IBS-D起治疗作用。分子对接验证结果提示核心成分与靶点之间有较强的结合活性。结论:葛根芩连汤中多种成分可通过多靶点、多通路机制治疗IBS-D,其可能通过PI3K-Akt、MAPK等信号通路降低炎症反应、改善内脏高敏感性,从而发挥治疗作用。

关键词： 股骨头坏死   恒古骨伤愈合剂   网络药理学  

摘要： 目的:研究恒古骨伤愈合剂(Osteoking)治疗股骨头坏死(osteonecrosis of the femoral head, ONFH)的有效成分、作用靶点及作用机制。方法:通过TCMSP数据库,挖掘Osteoking的主要成分和作用靶点;通过GEO、DisGeNET、GeneCards等数据库获取ONFH疾病相关基因。利用Venny 2.1.0在线工具将主要成分作用靶点和疾病靶点取交集,通过DAVID在线工具对交集基因进行蛋白质组学基因结构功能通路分析;使用Cytoscape 3.9.1软件构建药物成分-化合物-靶点相互作用图,并利用STRING网络平台制作蛋白互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)。运用R语言软件包,开展GO功能及KEGG通路的富集分析。结果:筛选得到Osteoking 17个主要活性成分和75个作用靶点,主要活性成分包括常春藤苷、豆甾醇等;作用靶点包括雌激素受体(ESR1)、凝血因子(F3)等。Osteoking通过调控机体代谢、雌激素受体/配体等信号通路改善ONFH;Osteoking主要活性成分与靶点进行分子对接后的结合能均小于-5 kJ/mol,具有较好的结合活性。结论:Osteoking能够通过修复ONFH坏死组织血管,改善骨组织血运障碍,提高成骨细胞的分化能力,从而治疗ONFH,为进一步研究Osteoking治疗ONFH的作用机制提供线索。

关键词： 慢性鼻窦炎   黄芩   有效成分   靶标   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法预测黄芩治疗慢性鼻窦炎(chronic rhinosinusitis,CRS)的有效成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集黄芩有效成分,通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库搜索并收集黄芩潜在靶点;通过人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)等疾病数据库获取黄芩治疗CRS的作用靶点;运用Cytoscape软件构建黄芩治疗CRS的“药物-活性成分-疾病-靶点”网络,通过STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)并进行关键靶点的基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。结果:从黄芩中筛选出36个活性成分,得到黄芩与CRS共同靶点129个,涉及PI3K/Akt、RAS、Rap1、趋化因子等48条信号通路。结论:黄芩可通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗CRS的作用。

关键词： 药理学   健康管理专业   高职   岗课赛证  

摘要： 目前,我国健康管理专业人才岗位需求量逐年提升,为了能够顺应社会的需求,为社会培养健康服务方面的高素质管理人才。文章以药理学为例,从分析学情问题、构建课程体系、重构教学内容、开发课程资源和开展多元评价等方面对课程进行改革,将“岗课赛证”进行有机融合,使学生获得实际岗位能用得上的专业知识与技能,提高健康管理专业人才培养质量。

关键词： 草乌   2型糖尿病   系统药理学   生物信息学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的基于系统药理学、生物信息学、分子对接及体内外实验探讨草乌影响2型糖尿病(diabetes mellitus type 2,T2DM)的潜力及对T2DM相关症状的潜在机制。方法利用数据库检索草乌相关化学成分、预测潜在作用靶点以及干预相关疾病;GEO数据库检索T2DM相对健康人的差异基因,与草乌作用靶点映射后置于DAVID数据库进行生物功能富集,利用单因素方差分析、二元Logistic回归分析及ROC曲线分析目标基因对于T2DM的敏感性。借助分子对接技术分析草乌化学成分与靶蛋白的结合位置及相互作用力。通过体内外T2DM模型验证草乌及其化学成分对目标蛋白表达的影响。结果通过数据库检索与分析得到草乌干预靶点相关疾病304种(P<0.05,FDR<0.05),选取度值最高的T2DM(Degree=59)进行分析。T2DM相对健康人差异基因与草乌潜在作用靶点取交集得到43个目标基因,进行单因素方差分析得到有显著性差异的基因共9个,二元Logistic回归分析得到5个有意义基因,ROC曲线下面积AUC>0.5的基因共3个。分子对接得到草乌化学成分异波尔定碱[(+)-Isoboldine]与蛋白APEX1、CASP1、CBFB,欧乌头碱(Napelline)与蛋白CBX1、EHMT2结合,通过氢键相互作用、疏水相互作用、可电离性和静电相互作用等不同作用力结合,从而增加配体靶向作用蛋白的能力。T2DM大鼠经草乌水提物治疗2周后,草乌可能通过改善周围神经病变进而缓解T2DM症状。并且草乌可以影响大鼠肝组织中APEX1、CASP1、CBFB、CBX1、EHMT2的蛋白表达。草乌中(+)-Isoboldine和Napelline化学成分对体外模型的目标蛋白的影响与体内实验一致。结论本研究初步揭示草乌可作为改善T2DM周围神经病变的潜在治疗药物,为中蒙药研发以及挖掘治疗T2DM新靶标药物奠定理论基础。

关键词： 丹参   赤芍   益母草   慢性心力衰竭   作用机制   网络药理学  

摘要： 目的 采用网络药理学方法研究丹参、赤芍、益母草治疗心力衰竭(CHF)的药用成分、作用靶点及作用机制。方法 在GeneCard和OMIM数据库中列出了疾病目的靶点。TCMSP和SwissTargetPrediction数据库列出药物成分和靶点。使用Venny软件得出其交叉靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质关系,通过图像处理得到PPI网络关系图。借助Cytoscape生成“CHF-交叉靶点-药物成分”网络图。利用HIPLOT平台对位点进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果 文章预测了102个活性成分和101个交叉靶点,其中主要靶点为:MAP激酶、信号转导和转录激活子3、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等。GO分析结果表明,其与信号传导受体激活物活性、受体配体活性、生长因子受体结合等的发生有关。KEGG通路富集分析:与AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌蛋白多糖等相关。结论 本文初步阐述了丹参-赤芍-益母草治疗CHF的主要作用靶点和作用途径,为今后治疗CHF提供临床参考价值。

关键词： 猫爪草   网络药理学   冬凌草   分子对接   原发性肝癌  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接技术对猫爪草与冬凌草进行分析,探讨其治疗原发性肝癌的作用机制。方法基于对中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)与传统中药百科全书(ETCM)数据库的检索,掌握有关药物的有效成分与其作用靶点,借助有机小分子生物活性数据库(PubChem)以及小分子药物预测作用靶点平台(Swiss Target Prediction)的支持下,收集一系列肝癌的靶点。参照蛋白互作数据库(STRING)进行药物与肝癌的蛋白互作(PPI)网络的构建。在将网络系统应用于探索药物的抗癌过程和作用机理的同时,结合Cytoscope 3.9.1软件成功构建“成分-靶点-通路”体系,并借助Metascape功能实现对共同靶点和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集处理。此外,利用分子模拟软件AutoDock展开活性成分与关键靶点间分子对接情况的探究,获取所需的系列研究成果。结果筛选出冬凌草与猫爪草的有效活性成分分别有23、9个;两味药的药物靶点总共1020个,共同交集靶点299个;药物和肿瘤疾病共有26个常见靶点。KEGG通路的富集显示,药物靶点涉及的通路主要有癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路等。结论猫爪草与冬凌草相须配伍,具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,能协同发挥抗肝癌作用,为后续机制研究提供了切实可行的参考依据。

关键词： 益肾清利方   特发性膜性肾病   液相色谱-质谱分析   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的联合液相色谱-质谱(Liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)分析和网络药理学探讨益肾清利方治疗特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)的潜在靶点。方法通过BATMAN-TCM数据库和LC-MS定性分析确定益肾清利方药物活性成分,通过网络药理学的方法预测益肾清利方治疗特发性膜性肾病的生物过程及机制通路,并对筛选出的核心靶点进行分子对接及体外实验验证。结果益肾清利方共筛选出15个活性成分,其作用靶点与特发性膜性肾病疾病靶点取交集后得到72个核心基因。GO富集分析结果显示包含凋亡信号通路的调控、白细胞迁移、肽基酪氨酸磷酸化等的参与;KEGG通路富集分析结果显示益肾清利方治疗特发性膜性肾病涉及TNF、PI3K/AKT、MAPK等细胞凋亡相关信号通路。体外实验表明,益肾清利方可通过调控PI3K/AKT通路减少足细胞凋亡。结论益肾清利方通过多靶点、多通路治疗特发性膜性肾病,对C5b-9诱导的足细胞亚溶破模型有抗凋亡作用,其作用机制可能与TNF、PI3K/AKT、MAPK信号通路有关。

关键词： 衢枳壳   糖尿病   网络药理学   物质基础   作用机制  

摘要： 目的以入血成分为研究对象,基于网络药理学探究衢枳壳对糖尿病起效的物质基础及作用机制。方法采用高效液相色谱串联四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(high-performance liquid chromatography tandem quadrupole-electrostatic field orbitrap high resolution mass spectrometry,HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS/MS)对衢枳壳入血成分进行鉴定,在此基础上通过Swiss Target Prediction与SuperPred数据库预测入血成分作用靶点,同时在OMIM,GeneCards等数据库获取糖尿病靶点。采用Cytoscape 3.9.1绘制中药衢枳壳“活性成分-靶点-疾病”网络关系图,利用String数据分析平台进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,筛选关键靶点。通过DAVID数据库对关键靶点进行基因本体功能(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。应用Autodock 1.5.7软件进行分子对接验证。结果共鉴定衢枳壳入血成分20个,筛选出潜在靶点170个,核心靶点32个。GO功能富集和KEGG信号通路分析结果显示缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factor,HIF)-1信号通路、晚期糖基化终末产物(advanced glycation end products,AGE)-晚期糖基化终产物受体(receptor for advanced glycation end products,RAGE)信号通路、表皮生长因子(epidermal growth factor receptor,EGFR)信号通路、癌症蛋白聚糖通路等为衢枳壳降糖的关键通路,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC serine/threonine-protein kinase,AKT)1、白蛋白(albumin,ALB)、细胞肿瘤抗原p53(cellular tumor antigenp 53,TP53)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、EGFR为其中关键靶点,且衢枳壳中5个活性成分与核心靶点经分子对接后的结合活性较好。结论衢枳壳中的芦丁、新橙皮苷、橙皮苷、芸香柚皮苷、川陈皮素等可能为衢枳壳降糖的物质基础,可能是通过调控HIF-1、AGE-RAGE、EGFR等信号通路及AKT1、ALB、TP53等核心基因发挥降糖作用。