课程文献中心 更多>>

关键词： 红花   网络药理学   心肌损伤   冷保存   PI3K-Akt  

摘要： 目的探索红花对低温冷保存的小鼠心脏的保护机制,分析红花潜在的作用靶点,为中药红花改善离体心肌损伤提供参考。方法借助TCMSP、TCMID、Swiss Target Prediction等数据库检索红花的化学成分和作用靶点。通过OMIM、TTD、Genecards等数据库筛选出缺血性心肌病(Ischemic cardiomyopathy,ICM)的疾病靶点。使用Cytoscape构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,富集分析红花作用机制。构建小鼠离体心脏冷保存模型,采用ELISA检测、qPCR、Western blot等技术手段验证网络药理学的预测靶点。结果共获得红花活性成分22个、药物靶点421个;ICM 1812个疾病靶点,得到药物-疾病共同靶点117个,GO富集分析共得到条目1906个,KEGG通路富集筛选出包括Akt信号通路在内的共计137条信号通路。实验验证红花可能通过调节PI3K-Akt通路调控细胞凋亡过程、炎症进程从而减轻小鼠心脏在低温冷保存过程中受到的损伤。结论运用网络药理学揭示了红花对小鼠低温冷保存心脏的保护作用靶点和通路,并进行了相关实验验证,为深入探讨红花减轻低温冷保存心脏心肌损伤的作用机制提供了依据,为红花的临床应用和药理研究提供理论基础。

关键词： OBE理念   中职卫校   “药理学”课程   项目式教学  

摘要： 在当今教育环境下,基于成果的教育理念已经成为教育改革的重要方向之一。中职卫校“药理学”课程作为医学类专业的重要组成部分,其教学模式的改革和创新对于培养具有实践能力和综合素质的医学人才具有重要意义。本文旨在探讨基于OBE理念的中职卫校“药理学”课程项目式教学的设计与实施。在介绍相关概念、中职卫校“药理学”课程现状和问题分析的基础上,重点分析了项目式教学在“药理学”课程中的设计与实施过程,并结合学生学习成绩、问卷调查、教师观察记录等多种评价方法,对项目式教学的效果进行评估与分析。结果表明,项目式教学能够有效提升学生的学习成绩、学习兴趣和团队合作能力,相关结论可为中职卫校“药理学”课程教学改革和提升提供有益的借鉴和参考。

关键词： 酸枣仁汤   网络药理学   分子对接   失眠   抑郁  

摘要： 目的:运用网络药理学方法和分子对接技术探讨酸枣仁汤治疗失眠伴抑郁“异病同治”的作用机制。方法:运用TCMSP数据库筛选酸枣仁汤的活性成分,通过Pubchem及SEA数据库获得对应靶点,Uniprot数据库校正靶点名称。从DisGNET、GeneCards数据库获取失眠和抑郁相关靶点,取交集靶点,构建“药物—活性成分—靶点”网络。运用STRING及Cytoscape建立蛋白间相互作用网络并筛选关键靶点,利用David数据库进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。通过AutoDockTools进行分子对接预测。结果:筛选后得到酸枣仁汤活性成分138个,作用靶点872个;与失眠及抑郁相关且排序靠前的通路有血清素突触通路、神经活性配体—受体相互作用、多巴胺能神经突触的信号通路等,主要与炎症反应、化学突触传递等生物学过程相关。本方中主要活性成分Cis-N-阿魏酰酪胺、灰绿曲霉酰胺、甘草黄酮与白细胞介素-1β、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ结合较好。结论:基于网络药理学的方法发现酸枣仁汤通过多靶点、多途径治疗失眠与抑郁,且多个成分与靶点的对接表现出良好活性;可能通过抗炎、抑制神经元凋亡、调节化学突触递质传递等发挥“异病同治”作用。

关键词： 小儿感冒舒颗粒   鼻病毒   分子机制   生物信息学   网络药理学  

摘要： 目的利用生物信息学及网络药理学预测分析小儿感冒舒颗粒治疗儿童鼻病毒(RV)感染的分子机制。方法从GEO数据库中下载RV感染的基因表达数据集,使用NetworkAnalyst数据库获得差异表达基因(DEGs)。在TCMSP及BATMAN-TCM数据库中筛选小儿感冒舒颗粒的活性成分和作用靶点,将药物靶点与疾病DEGs取交集以获得小儿感冒舒颗粒治疗儿童RV感染的潜在靶点,并通过STRING数据库构建蛋白互作网络。利用DAVID数据库进行富集分析。最后,使用AutoDock软件进行分子对接验证。结果共获得RV相关DEGs 619个。小儿感冒舒颗粒有效活性成分275种,作用靶点1847个。小儿感冒舒颗粒治疗儿童RV感染的潜在靶点88个,主要涉及钙信号通路和丝裂原活化蛋白激酶(MEK-ERK)信号通路。分子对接结果表明,小儿感冒舒颗粒中多个成分可与关键靶点电压门控钙离子通道亚基α1a(CACNA1A)、基质金属蛋白酶9(MMP9)及MEK-ERK通路上关键蛋白丝裂原活化蛋白1(MEK1)、丝裂原活化蛋白激酶2(MEK2)、细胞外调节蛋白激酶1(ERK1)、细胞外调节蛋白激酶2(ERK2)形成稳定的构象。其中,延胡索乙素、槲皮素和18β-甘草次酸与6个靶蛋白的结合力最强。结论恢复细胞内钙离子平衡、抑制MEK-ERK信号通路,进而抑制炎症反应、保护气道上皮细胞、预防并发症可能是小儿感冒舒颗粒抗RV的主要机制。延胡索乙素、槲皮素和18β-甘草次酸可能是小儿感冒舒颗粒发挥作用的主要活性成分。

关键词： 黄芪多糖   代谢相关脂肪性肝病   TNF-α   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的基于网络药理学方法推测黄芪多糖(astragalus polysaccharides,APS)治疗代谢相关脂肪性肝病(metabolic-associated fatty liver diseases,MAFLD)相关机制并开展动物实验进行验证。方法采用网络药理学方法找到APS的活性成分并利用数据库挖掘APS及MAFLD相关靶点并对以上靶点取交集,绘制交集靶点蛋白质相互作用网络图和核心靶点网络图。进行动物实验验证,将21只小鼠随机平均分为3组,分别为正常对照组、MAFLD模型组及MAFLD模型+APS干预组。MAFLD模型+APS干预组小鼠予以高脂饲料喂养8周,同时将APS以剂量为50 mg·kg^(-1)·d^(-1)对小鼠连续灌胃8周;MAFLD模型组及正常对照组小鼠分别以高脂饲料、标准维持饲料喂养8周,同时用等体积生理盐水对小鼠连续灌胃8周。给药结束后观察小鼠一般情况,计算肝指数,取小鼠肝脏组织进行HE染色,酶联免疫吸附实验测定小鼠血清及肝脏组织中TNF-α的含量,免疫组织化学方法分析小鼠肝脏组织中TNF-α的表达情况。结果通过网络药理学方法获得APS相关作用靶点292个,获得MAFLD相关作用靶点2254个,二者交集靶点104个。经过分析后筛选出22个APS治疗MAFLD的核心靶点,TNF为其中之一且节点大、颜色深,提示TNF是APS治疗MAFLD过程中重要的靶点之一。动物实验结果显示,与MAFLD模型组小鼠相比,APS的干预可以显著降低MAFLD小鼠的体质量、肝湿重及肝指数(P<0.01)。APS可以在组织病理学上改善MAFLD小鼠的肝脏组织。APS的干预还可以降低MAFLD小鼠血清及肝脏组织中TNF-α的浓度(P<0.05)。小鼠肝脏组织免疫组化实验结果显示,APS干预组小鼠阳性表达区域面积显著低于MAFLD模型组(P<0.001)。结论基于网络药理学及动物实验结果可知TNF是APS治疗MAFLD的重要靶点之一,APS可以通过拮抗TNF-α表达来减轻小鼠MAFLD。

关键词： 吐酸   胃食管反流病   抑酸护胃方   网络药理学  

摘要： 目的 分析抑酸护胃方治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制。方法 基于网络药理学,通过在线数据库获得抑酸护胃方的活性成分和靶点以及GERD的靶点,将二者的交叉靶点作为潜在靶点,通过STRING数据库构建蛋白互作关系,通过Metascape数据库进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果 抑酸护胃方共有429个活性成分和2005个靶点,GERD有949个靶点,潜在靶点320个;通过GO分析得到生物过程3049个、细胞组分183个、分子功能298个;通过KEGG富集分析得到223条信号通路。结论 抑酸护胃方可能是通过丁香酚、肉桂醛等活性成分,作用于β-肌动蛋白(ACTB)、蛋白激酶B(AKT1)等多个靶点,参与多条信号通路,通过抑菌消炎、抗氧化、保护胃黏膜、抗癌等药理作用治疗GERD,为临床应用抑酸护胃方治疗GERD提供了一定的数据支撑,同时也为治疗GERD的新药开发提供了一些参考。

关键词： 帕金森病   网络药理学   丹星止颤方   小鼠  

摘要： 目的通过网络药理学与动物实验相结合的方法,探讨丹星止颤方治疗帕金森病的作用机制。方法检索TCMSP、BATMAN数据库获得丹星止颤方活性成分及作用靶点,检索GeneCards、OMIM数据库获得帕金森病作用靶点;通过Venny 2.1.0对药物靶点和帕金森病相关靶点取交集,采用STRING 12.0数据库构建交集靶点PPI网络,采用Cytoscape 3.10.0软件进行拓扑分析,得到丹星止颤方作用于帕金森病的关键靶点;利用微生信平台对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过AutoDockTools 1.5.7进行分子对接验证。采用随机数字表法将小鼠分为空白对照组、模型组和丹星止颤方组,每组20只;除空白组外,其余各组小鼠灌胃鱼藤酮制备帕金森病模型;丹星止颤方组灌胃丹星止颤方浓缩液10.5 g/kg,空白组、模型组灌胃生理盐水0.2 ml,连续灌胃21 d;采用Western blot法检测脑组织Akt1、Bcl-2、Bax、α-突触核蛋白(α-Syn)表达。结果获得丹星止颤方靶点和帕金森病靶点的交集靶点359个,核心靶点69个,活性成分185个,主要活性成分包括槲皮素、山柰酚、苯丙氨酸等,关键靶点为AKT1、TP53、TNF、ESR1等。KEGG通路富集分析主要涉及AGE-RAGE、PI3K-Akt及流体剪刀应力与动脉粥样硬化信号通路等。验证实验结果显示,与模型组比较,中药组Bcl-2蛋白表达上调(P<0.01),Bax、Akt1和α-Syn蛋白表达下调(P<0.01)。结论丹星止颤方具有多靶点、多途径治疗帕金森病的作用特点,其机制可能与下调Bax、Akt1、α-Syn蛋白表达,改善脑部供血、调节神经递质平衡、抑制氧化应激反应和促进神经再生等方面有关。

关键词： 参乌益智胶囊   卒中后认知障碍   网络药理学   分子对接   核心靶点   炎症因子  

摘要： 【目的】运用网络药理学方法及临床试验验证,探讨参乌益智胶囊治疗卒中后认知障碍(PSCI)的作用机制。【方法】前瞻性纳入2022年8月~2024年2月安徽中医药大学附属太和中医院收治的90例PSCI患者,采用随机数字表法将患者随机分为对照组和试验组,每组各45例。对照组予以PSCI常规治疗,试验组在对照组的基础上加用参乌益智胶囊治疗,疗程为28 d。观察2组患者治疗前后简易精神状态检查量表(MMSE)评分、蒙特利尔认知评估量表(MoCA)评分及血清肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)等炎症因子的变化情况,并记录2组患者不良事件发生情况,评价2组治疗方案的安全性。基于网络药理学方法,运用TCMSP及查阅文献获得参乌益智胶囊有效活性成分,运用GeneCards等数据库得到PSCI疾病靶点,将共同靶点输入至STRING数据库构建PPI网络,通过Cytoscape 3.9.0构建参乌益智胶囊-PSCI-靶点网络图,运用DAVID进行GO及KEGG通路富集分析,再通过分子对接验证结合活性。【结果】(1)临床研究方面,治疗28 d后,2组患者的MMSE、MoCA评分均较治疗前升高(P<0.05),且试验组的升高幅度均明显优于对照组(P<0.05);血清TNF-α、IL-6水平均较治疗前降低(P<0.05),且试验组的降低幅度均明显优于对照组(P<0.05);同时,2组患者在试验过程中均未见明显不良反应,具有较高的安全性。(2)网络药理学方面,参乌益智胶囊活性成分共92个,靶点803个,疾病靶点5209个,交集靶点556个,核心靶点为AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1B,关键化合物为脱氧三尖杉酯碱、洋川芎醌、芫花素等,富集得到1812个GO条目,其中细胞成分(CC)154个,生物学过程(BP)1332个,分子功能(MF)326个,富集到195条KEGG信号通路;分子对接结果显示,参乌益智胶囊关键化合物与核心靶点间具有良好的结合活性。【结论】参乌益智胶囊治疗PSCI临床疗效显著,多成分可能通过AKT1、TNF、IL-6等靶点作用于信号通路而发挥治疗PSCI的作用。

关键词： 滋肾育胎丸   早发性卵巢功能不全   网络药理学   生物信息学分析   分子对接   作用机制  

摘要： 【目的】联合网络药理学、生物信息分析学、分子对接技术,探究滋肾育胎丸治疗早发性卵巢功能不全(POI)的机制。【方法】通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴数据库(HERB)、中医药信息数据库(TCM-ID)查询并筛选滋肾育胎丸中中药的活性成分;使用有机小分子生物活性数据库(PubChem)、小分子药物靶点预测在线平台(Swiss Target Prediction)预测药物作用的靶点;运用人类基因数据库(GeneCards)、比较遗传毒理学数据库(CTD)获取POI相关靶点;借助R语言进行差异表达分析(DEGs)及加权基因共表达网络分析(WGCNA)GEO数据库中POI的转录组数据,得到POI的特征表达基因,与POI相关靶点映射后得到最终POI疾病靶点;药物靶点与疾病靶点交集后初步获得药物作用于疾病的靶点;借助注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)功能富集与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用STRING数据库进行蛋白质互作分析;使用Cytoscape 3.9.1构建“药物-成分-靶点”筛选药物核心成分及核心靶点;最后利用MOE2019分子对接,检验核心成分与靶点的效应关系。【结果】滋肾育胎丸中共筛选出111个有效成分,核心成分3个,36个作用于POI的靶点,其中核心靶点3个。GO生物功能分析包含92条富集结果,主要涉及炎症反应、正向调节钙信号通路、类固醇激素生成等。KEGG富集得到15条通路,主要包括病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用、色氨酸代谢、钙信号通路、卵巢类固醇生成、类固醇激素生物合成、趋化因子等信号通路。分子对接结果显示花生四烯酸、异鼠李素、槲皮素与CYP19A1、ESR2、PI3K均可较好结合。【结论】滋肾育胎丸可能通过花生四烯酸、异鼠李素、槲皮素等核心成分作用于CYP19A1、ESR2、PI3K等靶点,通过钙信号通路、卵巢类固醇激素生成、细胞色素P450对异生素的代谢作用、趋化因子等信号通路,通过抑制炎症,调节氧化应激,调节类固醇激素生成与代谢等生物学过程发挥对POI的治疗作用。

关键词： 仙鹤草   糖皮质激素性骨质疏松症   斑马鱼   网络药理学   分子对接   槲皮素   木犀草素   鞣花酸   芹菜素   山柰酚  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接技术和斑马鱼实验探究仙鹤草治疗糖皮质激素性骨质疏松症可能的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和本草组鉴(HERB)数据库初步筛查出仙鹤草相关的活性成分;利用SEA和SwissTargetPrediction平台预测活性成分的相关靶点;利用OMIM、GeneCards数据库检索糖皮质激素性骨质疏松症相关的疾病靶点;利用韦恩图绘制平台获取共有的关键作用靶点,并将信息导入Cytoscope 3.7.2软件和STRING在线分析平台,进行可视化分析;使用DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;然后通过Autodock Tools 1.5.6软件对有效成分–核心作用靶点进行分子对接验证。通过斑马鱼幼鱼骨形成抑制模型探讨仙鹤草水提液对糖皮质激素所致的斑马鱼幼鱼骨形成抑制的影响及机制。结果通过TCMSP和HERB数据库筛选出仙鹤草的32种潜在活性成分,通过SEA和SwissTargetPrediction平台预测并筛选后得277个药物靶点;通过OMIM和GeneCards数据库检索糖皮质激素性骨质疏松症相关的潜在疾病靶点共654个。将药物–疾病的36个交集靶点进行富集分析,GO功能富集主要包括通过RNA聚合酶Ⅱ的转录正调控、信号转导、DNA模板的正向调控等;KEGG富集通路主要富集在磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路等信号通路。将degree值前5个的有效成分(槲皮素、木犀草素、鞣花酸、芹菜素和山柰酚)与核心靶点[丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt1)、非受体酪氨酸激酶(SRC)、雌激素受体1(ESR1)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)、核因子κB亚基1(NFKB1)、糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)和Jun原癌基因]进行分子对接,结果显示仙鹤草的5种活性成分与糖皮质激素性骨质疏松症核心靶点的结合活性均较好。通过斑马鱼幼鱼骨形成抑制模型验证仙鹤草水提液可部分通过PI3K/Akt信号通路缓解糖皮质激素所致的斑马鱼幼鱼骨形成抑制的现象。结论揭示了仙鹤草治疗糖皮质激素性骨质疏松症的有效成分和作用机制,为仙鹤草治疗糖皮质激素性骨质疏松症的临床实践及后续研究提供参考。