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关键词： 金银花   大血藤   类风湿关节炎   网络药理学   清痹汤  

摘要： 目的分析金银花—大血藤药对治疗类风湿关节炎(RA)的机制。方法通过TCMSP、Genecards、OMIM、TTD等数据库获取金银花、大血藤药物作用及RA疾病靶点;基于Venny平台寻找药物靶点与疾病靶点交集;通过Cytoscape软件及VLOOKUP函数建立“药物—成分—关键靶点—疾病”网络;运用String数据库构建关键靶点的蛋白相互作用网络;对关键靶点进行GO分析和KEGG分析;将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果金银花—大血藤药对靶点共323个,RA疾病靶点5093个,“药物—成分—关键靶点—疾病”网络中筛选出核心靶点PTGS1、PTGS2,核心成分包括丁香酚、大黄素、β-谷甾醇、熊果酸、山萘酚、木樨草素、三羟黄酮、槲皮素;金银花—大血藤药对主要通过AGE-RAGE信号通路、滑膜细胞凋亡信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路及RAS信号通路等参与细胞对氮化合物的反应、淋巴细胞分化、生长因子调控、LPS诱导的炎症反应等过程的调控;分子对接结果显示,8个核心成分与2个核心靶点之间亲和作用较好。结论金银花—大血藤可能通过调节PTGS1、PTGS2表达从而减轻RA患者自身免疫紊乱导致的炎症反应。

关键词： 银花甘草汤   网络药理学   放射性肺炎  

摘要： 目的:探讨银花甘草汤治疗放射性肺炎的有效成分及其靶点的作用机制。方法:利用TCMSP数据库筛选出银花甘草汤的有效成分及相关靶点蛋白,Uniport数据库对靶点蛋白进行基因标准化处理,结合Genecard数据库中放射性肺炎的疾病靶点进行映射,将筛选得到的中药活性成分和映射得到的作用靶点导入Cytoscape软件中进行活性成分-靶点网络图的构建,并运用Enrich数据库进行GO生物学过程及KEGG信号通路富集分析。结果:获得银花甘草汤有效成分115个,映射得到59个治疗放射性肺炎的靶点,富集到相关生物学过程13个、信号通路61条,山萘酚、木樨草素、β-胡萝卜素、槲皮素等13化合物可能是银花甘草汤治疗放射性肺炎的重要有效成分,PTGS2、NOS2、AKT1、PRARG、MAPK14等5个核心作用靶点是其可能的作用靶点,这些靶点与MAP激酶活性、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性、丝裂原活化蛋白激酶结合、氧化还原酶活性等13条生物过程有关,通过血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、小细胞肺癌、C型凝集素受体信号通路、TNF信号通路等61条信号通路进行调节。结论:银花甘草汤对放射性肺炎具有一定的治疗效果,其机制可能通过调节PTGS2、NOS2、AKT1、PRARG、MAPK14等靶点,调控VEGF信号通路、小细胞肺癌、C型凝集素受体信号通路、TNF信号通路等多种途径有关。

关键词： 中医药   高血压病   网络药理学  

摘要： 长期的临床实践表明,中医药在高血压病的治疗方面具有显著优势,既能降低患者血压,减轻临床不适症状,还能够增强患者体质,提高生活质量。中医药降压有效成分复杂、作用靶点广泛,其干预疾病的具体靶点和作用机制在分子生物学层面的研究尚不够深入。网络药理学是近年来中医药方面的研究热点,其以网络生物学与系统生物学理论为基础,通过对现有数据的挖掘与利用构建药物与疾病的相互作用网络,得到药物的关键活性成分,预测药物的作用靶点和可能的作用机制。文章以近年来相关领域文献为基础,总结单味中药、配伍药对、中药复方治疗高血压病的网络药理学研究进展,发现常见的中医药活性成分有山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇、木犀草素和槲皮素等,常见的核心靶点有前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白蛋白(Albumin,ALB)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)、细胞肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)和白细胞介素家族等,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析多集中在缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、钙信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinases,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)通路和流体剪应力与动脉粥样硬化等信号通路,表明中医药治疗高血压病多与抑制炎症反应、舒张血管、降低血液黏稠度等机制密切相关,也与抗氧化应激、调节内分泌有关。对既往文献进行总结,以期为后续开展中医药治疗高血压病的机制研究提供相关参考。

关键词： 动脉粥样硬化   网络药理学   分子对接   脉管复康片   机制研究  

摘要： 目的:利用网络药理学方法及分子对接技术探析脉管复康片治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选脉管复康片(丹参、鸡血藤、没药、乳香、郁金)活性成分和靶基因。使用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、遗传药理学与药物基因组学数据库(pharmacogenetics and pharmacogenomics knowledge base,PharmGKB)、DrugBank疾病数据库获得AS相关基因。使用Cytoscape 3.8.2构建“成分-靶点”网络。使用STRING数据库下载蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)数据,导入Cytoscape,使用CytoNCA插件获取核心靶基因。使用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。对活性成分及核心基因做分子对接。结果:从脉管复康片中共筛选出157个活性成分,对应AS靶基因238个,PPI核心靶基因共20个。GO功能富集显示生物学功能主要涉及脂多糖反应、细菌来源分子反应、金属离子反应、氧化应激反应等;KEGG通路富集显示主要涉及流体剪切应力和AS、AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果提示槲皮素、木犀草素、柚皮素、丹参酮ⅡA、刺芒柄花素、甘草查尔酮A与4个核心蛋白JUN、MAPK1、TP53、STAT3结合稳定。结论:脉管复康片可通过槲皮素、木犀草素等活性成分作用于多种信号通路及多个基因靶点治疗AS。

关键词： 丹参   缺血性脑卒中   药理作用   治疗效果  

摘要： 缺血性脑卒中是临床中的高发病,并在近些年表现出发病率增高的情况,对人们的健康威胁性较大,需要临床给予积极治疗。从当前发展情况来看,有研究显示丹参在患者中的治疗作用显著,能够改善患者不良情况,促进患者缺血再灌注,有利于患者恢复,当前已经受到临床的广泛关注。基于此,本研究以药理学为基础,探究丹参对缺血性脑卒中的治疗作用,做出具体分析如下。

关键词： 数据挖掘   网络药理学   重症肌无力   用药规律   作用机制   中医药  

摘要： [目的]基于国家专利、中国知网及万方数据库探究中药复方治疗重症肌无力的用药规律,同时分析核心药对的作用机制,以期为中药复方治疗重症肌无力提供理论依据。[方法]检索国家知识产权局中国专利公布公告数据库、中国知网及万方数据库,获取中药复方治疗重症肌无力的处方数据,利用R语言、SPSS、IBM SPSS Modeler软件对专利复方进行频数统计、关联规则分析及系统聚类分析,分析专利中药复方治疗重症肌无力的用药规律。基于网络药理学方法对筛选出的核心药对的潜在靶点及通路进行预测,构建“中药-成分-靶点”及蛋白质互作网络(PPI),利用Autodock进行分子对接预测。[结果]数据挖掘共纳入中药复方151条,中药352味,其中高频中药共26味,关联规则分析共筛出核心药对76项,包括中药7味,聚类分析共得到7类,包括3个聚类方,3个聚类药对及1个单药,选取核心药物组合“柴胡-当归-黄芪-党参-白术-升麻”进行网络药理学分析,得到药物组合核心活性成分10个,包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、异鼠李素、甲氧异黄酮、β-谷甾醇、豆甾醇及毛蕊异黄酮,核心作用靶点14个,包括蛋白激酶B1(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、原癌基因FOS(FOS)、原癌基因JUN(JUN)、原癌基因MYC(MYC)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-1β(IL-1β)、C反应蛋白(CRP)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、雌激素受体(ESR1)、酪氨酸激酶受体2(ERBB2),分子对接结果提示核心成分与核心靶点结合稳定,平均最低结合能为-6.23 kcal/mol。[结论]中药复方治疗重症肌无力用药多以补益虚损为法,辅以活血通经、舒筋通络等,其核心药物组合“柴胡-当归-黄芪-党参-白术-升麻”主要通过参与调节免疫,炎症反应等机制,作用于突触后膜等细胞成分,影响G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性等分子功能发挥重症肌无力的治疗作用,并可能通过靶向EGFR治疗胸腺相关型重症肌无力,可为中药复方治疗重症肌无力的机制研究及临床用药提供参考。

关键词： 网络药理学   Survivin   BIRC5   瘢痕疙瘩  

摘要： 目的 采用网络药理方法来探究通过靶向抑制Survivin(BIRC5)的表达来靶向治疗瘢痕疙瘩的可能性,并寻找特异性的治疗药物。方法 自2021年1月至2023年10月,菏泽市立医院整形美容科搜索相关数据库,如PubMed、Oncomine、String、Uniprot、KEGG、Therapeutic Target Database(TTD)和Drugbank,通过网络药理方法研究Survivin(BIRC5)作为瘢痕疙瘩治疗的潜在靶点作用。结果 通过检索PubMed,发现了通过抑制Survivin(BIRC5)的表达来治疗瘢痕疙瘩的直接证据。通过检索Oncomine、String和KEGG,发现了通过抑制Survivin(BIRC5)的表达来治疗瘢痕疙瘩的间接证据。通过对TTD数据库和Drugbank的检索,发现了一些通过靶向抑制Survivin(BIRC5)的表达来治疗瘢痕疙瘩的药物,如抗人Survivin(BIRC5)反义寡核苷酸ISIS 23722和LY2181308、Berberine(黄连素)和Reserpine(利血平)等。结论 抑制成纤维细胞中Survivin(BIRC5)的表达,促进成纤维细胞的凋亡,是靶向治疗瘢痕疙瘩的有效方法。然而,这一结论尚需要进一步的研究来证实。

关键词： 蛇床子   阿尔茨海默病   网络药理学   分子对接   O-乙酰二氢欧山芹酯   邻-异戊酰基二氢山芹醇   蛇床子素  

摘要： 目的运用网络药理学结合分子对接技术探讨蛇床子治疗阿尔茨海默病的作用机制。方法借助TCMSP数据库获取蛇床子的活性成分及潜在作用靶点;检索GeneCards、OMIM、DisGeNET数据平台得到阿尔茨海默病的潜在作用靶点,筛选两者共同靶点;应用Cytoscape 3.7.1构建蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选发挥治疗作用的关键靶点,再借助R语言进行基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Vina软件,对核心靶点和药物主要活性成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果蛇床子包含主要活性成分20个,化学成分与疾病共同靶点56个,网络拓扑分析显示B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、雌激素受体α(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3B)、半胱氨酸蛋白水解酶3(CASP3)为关键靶点,通过调控神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、p53信号通路、多种细胞凋亡、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等发挥治疗作用。分子对接验证中受体与配体之间的结合能均≤−5.0 kcal/mol,结合性良好,其中O-乙酰二氢欧山芹酯、邻-异戊酰基二氢山芹醇、蛇床子素与核心靶点GSK3B、PTGS2、Bcl-2的对接亲合度较高。结论蛇床子可通过多成分、多靶点和多通路的方式起到治疗阿尔茨海默病的作用,为进一步探究蛇床子治疗阿尔茨海默病的理论研究提供参考。

关键词： 新止骨增生丸   膝骨关节炎   网络药理学   作用机制   槲皮素   β-谷甾醇   山柰酚  

摘要： 目的 运用网络药理学方法探索新止骨增生丸治疗膝骨关节炎(KOA)的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选新止骨增生丸的活性成分及其作用靶点;利用GeneCards、OMIM和DisGeNet数据库检索KOA疾病的相关靶点;通过Venny 2.1.0在线平台对新止骨增生丸的活性成分作用靶点与KOA疾病相关靶点映射取交集,得到新止骨增生丸治疗KOA的关键靶点(共同靶点);将共同靶点导入String平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,并将结果导入Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑分析,提取核心靶点;运用注释、可视化和集成发现(DAVID)数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.1软件构建“活性成分-关键靶点-通路”网络。结果 共获得活性成分54个,对应靶点262个,疾病靶点2459个,共同靶点142个,经过蛋白互作及拓扑分析,得到核心靶点13个, GO功能富集分析得到821个生物过程(BP), 94个细胞组分(CC), 139个分子功能(MF)和167条通路(P<0.05)。将“活性成分-核心靶点-通路”网络图进行拓扑分析,共筛选出槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、山柰酚等12个核心成分,以及肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)等16个关键靶点。结论 新止骨增生丸可能通过槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚等主要活性成分,作用于AKT1、TNF、VEGFA等核心靶点,通过高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、TNF等信号通路,协同发挥对KOA的治疗作用。