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关键词： 网络药理学   金水六君煎   恶性黑色素瘤   增殖   自噬   分子机制  

摘要： 目的网络药理学方法联合体外实验初步探索金水六君煎辅助放化疗治疗恶性黑色素瘤(malignant melanoma,MM)的分子机制。方法在TCMSP数据库中获取金水六君煎的活性成分及靶点,以“malignant melanoma”为关键词在GeneCards、TTD、OMIM数据库中获得MM相关靶点,得到金水六君煎有效成分-MM交集靶点;通过STRING数据库获取蛋白质互作(PPI)网络,利用Metascape数据库进行基因本体论分析(GO)和基因组的京都基因与基因组百科全书富集分析(KEGG)并在AutoDockTools软件中进行分子对接;MTT法检测金水六君煎含药血清对小鼠B16黑色素瘤细胞增殖活性影响;蛋白免疫印迹法(Western blotting)检测金水六君煎含药血清对P38、p-P38、JNK、p-JNK、Beclin1、P62、LC3蛋白表达调控;透射电镜观察金水六君煎含药血清对B16细胞自噬影响。结果共获得金水六君煎相关靶点248个,MM相关靶点2147个,交集靶点149个。GO显示主要生物过程是DNA结合转录因子、激酶结合、细胞因子受体结合等;KEGG显示主要是癌症通路和MAPK信号通路,网络拓扑分析显示金水六君煎治疗MM的主要有效活性成分是槲皮素、山奈酚、柚皮素等,主要核心靶点为AKT1、TP53、JUN等;核心靶点与有效活性成分分子对接显示结合活性较好。MTT结果显示,与空白组比较,金水六君煎含药血清能有效抑制B16细胞的增殖且呈浓度依赖性。Western blotting实验表明,较空白组,中高剂量组能下调B16细胞中p-P38、p-JNK、P62蛋白表达,上调LC3Ⅱ、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、Beclin1蛋白表达。透射电镜下显示金水六君煎含药血清能促进B16细胞中自噬体生成,减少黑素体生成。结论金水六君煎的有效成分和药物靶点很多,其治疗MM的作用靶点与通路众多,分子机制可能是通过下调p-P38、p-JNK、P62的蛋白表达,上调Beclin1、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ的蛋白表达,抑制P38通路和JNK通路的激活,从而抑制B16细胞增殖;同时促进细胞凋亡,激活细胞自噬,发挥抑癌作用。

关键词： 半枝莲   二萜类   肝癌   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨半枝莲二萜类成分抗肝癌的作用机制。方法 根据文献调研(1987年1月至2022年7月)获得的155个半枝莲二萜类化合物,通过SwissADME平台筛选后得到符合条件的93种活性成分,并通过Swiss Target Prediction网络平台预测得到其中65个化合物可能的作用靶点;通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank以及GEO、TCGA数据库获取与肝癌有关的靶点,利用Cytoscape软件构建可视化“活性成分-靶点-肝癌”网络作用图,并通过度值筛选主要活性成分;使用String平台进行蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络功能富集分析,利用Cytoscape软件构建PPI可视化网络图,通过cytoHubba插件的评分规则筛选出核心靶点和关键靶点;采用R语言软件包对半枝莲二萜抗肝癌的作用靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;使用AutoDock vina软件对主要活性成分与关键靶点进行对接分析。结果 筛选出半枝莲二萜中6种活性成分包括Scutebarbolide I、Scutebata O、Scutelinquanine D、Scutellone F、Scutellone H和Scutebarbatine J,预测得到10个抗肝癌核心靶点,其中蛋白STAT3、MAPK1、MAPK3、HSP90AA1、PIK3R1和PIK3CA为关键靶点。基因富集分析得到953个GO功能条目和137条通路(P<0.05);分子对接结果显示,半枝莲二萜活性成分与关键靶点间存在潜在结合位点;网络药理学分析表明半枝莲二萜成分可能通过肽基-丝氨酸磷酸化、肽基-丝氨酸修饰、磷酸酶结合、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性等生物学过程,作用于STAT3、MAPK1、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA等关键蛋白的表达,进一步调控癌症中蛋白多糖、化学致癌受体激活、催乳素信号通路、癌症程序性死亡受体配体1(PD-L1)表达和程序性死亡受体1(PD-1)检查点通路等信号通路,发挥治疗肝癌作用。结论 半枝莲二萜类化合物能够通过多分子、多靶点、多通路、多作用机制达到治疗肝癌作用。

关键词： 秦艽   蚕沙   类风湿性关节炎   网络药理学   靶点基因   富集分析  

摘要： 目的:运用网络药理学方法探讨秦艽-蚕沙药对治疗类风湿性关节炎(RA)的物质基础及其作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选秦艽-蚕沙药对的活性成分,结合人类基因组注释数据库Genecards筛选治疗类风湿性关节炎的潜在疾病靶点。利用Venny 2.1.0绘制秦艽、蚕沙、疾病的韦恩图,通过药对与疾病的共有交集,基于Cytoscape 3.8.2软件构建成分-靶点-疾病然网络图,利用Cytoscape 3.8.2软件和String数据库构建成分-靶点-疾病网络图和靶点间的蛋白互作网络,使用CytoNCA插件利用BC值筛选出核心靶点,采用Metoscape平台对靶点进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书通路与基因功能富集分析。结果:经过筛选,共获得秦艽-蚕沙的10个有效成分,与类风湿性关节炎(RA)相关的关键化学成分9个,药对-类风湿性关节炎疾病的共同靶点82个,PPI关键靶点21个,GO富集分析结果包括生物过程、细胞组分、分子功能,各筛选出了10条柱状图;KEGG富集分析发现相关信号通路14条。结论:秦艽-蚕沙药对治疗类风湿性关节炎具有多组分、多靶点、多途径的调控特点,本研究为深入探索秦艽-蚕沙药对干预治疗类风湿性关节炎提供了新的思路。

关键词： 麻射安金丸   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   基因   核心靶点  

摘要： 目的基于网络药理学分析麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的潜在机制。方法应用TCMSP中药系统药理学数据库及相关文献资料等检索麻射安金丸中的生物活性成分,筛选出作用靶点,构建麻射安金丸的药物-有效成分-作用靶点网络。根据Drugbank和Genecards等数据库建立其与COPD的相关疾病靶点,并与麻射安金丸的有效成分靶点相匹配获得潜在治疗靶点。基于Metascape数据库和DAVID数据库对潜在治疗靶点进行GO生物过程、KEGG信号通路分析,并分析蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI),用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析。结果麻射安金丸中有效化学成分有1525种,包括半夏22种、赤芍18种、川芎22种、甘草95种、僵蚕3种、苦杏仁26种、麻黄43种、牡蛎1种、木香29种、砂仁23种、射干12种和浙贝母5种,有效成分作用靶点基因298个。在药物-有效成分-靶点网络内重要性前10的有效成分中,来源自麻黄6种,赤芍、苦杏仁、僵蚕3种,射干、甘草、半夏、川芎、砂仁2种,浙贝母1种。KEGG富集分析显示,在得出的全部20调信号通路中,得到10条靠前的信号通路。GO功能富集分析显示,前10个生物过程包括酶结合、DNA依赖的转录正调控等;前10个分子功能包括核质、细胞质等;前10个细胞定位包括蛋白质变性调节、蛋白质代谢调节等。PPI网络经提取后获得了包含21个节点的核心网络,其中JUN、MAPK1、MAPK3、TNF、RELA、MYC、STAT3、TP53、AKT1、MAPK8、EGFR、MAPK14和PRKCA基因是核心靶点。动物实验显示:模型组和对照组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。模型组和对照组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论麻射安金丸通过多成分、多靶点和多通路治疗COPD,其中麻射安金丸的潜在有效成分主要来源于麻黄、射干、柴胡、白芍、白术和甘草,麻射安金丸治疗作用的核心靶点主要有JUN、MAPK1、MAPK3等基因。

关键词： 老年便秘   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨宫毅教授临床治疗老年便秘核心用药的作用机制。方法:在TCMSP、Drugbank、TTD、Disgenet和GeneCards数据库中检索核心药物白术、党参、黄芪、当归、紫菀以及疾病的靶点;运用Venny 2.1获取交集靶点,继而于String中进行PPI分析;通过Cytoscape 3.7.1以及Metascape数据库完成可视化以及GO、KEGG富集分析。结果:得到41个活性成分、217个药物靶点、1079个疾病靶点以及94个交集靶点。其中41个活性成分中含有木犀草素、山奈酚和槲皮素等;217个核心靶点含有AKT1、IL6、TNF等;信号通路以癌症通路、MAPK通路、PI3K-AKT通路和AGE-RAGE通路为主。结论:宫毅教授治疗老年便秘以白术、党参、黄芪、当归和紫菀为核心药物,其可能通过多靶点、多通路协同交互发挥作用,需进一步实验验证。

关键词： 补中益气丸   网络药理学   UPLC-QE-MS   溃疡性结肠炎   KEGG  

摘要： 目的:在网络药理学和实验验证的基础上,探讨补中益气丸在治疗溃疡性结肠炎中的作用机制。方法:采用UPLC-QE-MS对补中益气丸进行定性分析。从GeneCards中检索到化学成分和疾病的靶点,然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI),从GO term分析和KEGG通路分析中筛选核心靶点,建立溃疡性结肠炎小鼠模型,验证其关键靶点。结果:共筛选出123个交集靶点和24个核心靶点,共鉴定出补中益气丸的41种化学成分。KEGG分析和PPI网络分析表明,补中益气丸可能通过Akt、PI3K等途径在溃疡性结肠炎的治疗中发挥作用。动物实验结果显示,补中益气丸可显著改善溃疡性结肠炎的症状,降低血清中IL-6和TNF-α水平(P<0.01),抑制Akt-PI3K信号通路,降低PI3K蛋白表达(P<0.05)。结论:补中益气丸可能通过抑制AktPI3K信号通路,抑制PI3K表达,降低IL-6和TNF-α水平,在溃疡性结肠炎中发挥作用。

关键词： 贝赫切特综合征   甘草泻心汤   药理作用分子作用机制(中药)   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术研究甘草泻心汤治疗白塞病(BD)的分子机制,为今后的研究提供参考。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取甘草泻心汤中七味药材的有效成分与作用靶点,并利用UniProt数据库将作用靶点基因加以注释和整合。通过GeneCard、PharmGkb、TTD、OMIM、DrugBank数据库获得BD疾病靶点,并与药物作用靶点取交集。使用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-成分-疾病靶点网络图;使用STRING数据库构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape 3.8.0软件进行分析;使用R×644.0.5软件和脚本对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Tools对核心靶点及核心成分进行分子对接验证。结果共筛选出甘草泻心汤236个成分、3480个靶点,986个BD疾病靶点,63个药物与疾病交集靶点,筛选出槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、黄芩甙元、富马碱、汉黄芩素7个核心成分,前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素18(IL-18)、CC趋化因子配体2(CCL2)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)7个核心靶点。共得到1804个GO条目,106条KEGG通路,包含晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。分子对接结果显示,药物核心成分与疾病核心靶点之间有较强的结合能力。结论甘草泻心汤可通过多成分、多靶点、多通路治疗BD。

关键词： BOPPPS教学模式   药理学   教学效果   教学满意度  

摘要： 目的探讨BOPPPS教学模式在药理学教学中的应用效果。方法选取2023年1月—2024年1月永州市中心医院药学部的24名实习药师为研究对象,依据不同教学模式分为常规组与BOPPPS组,每组12名,两组分别采用常规教学模式、BOPPPS教学模式,对比两组实习药师的考核成绩、教学效果、教学满意度。结果BOPPPS组的理论考核成绩、实验操作成绩(90.13±4.86)分、(91.48±3.95)分高于常规组(82.47±5.61)分、(85.19±4.28)分,差异有统计学意义(t=3.575、3.741,P均<0.05)。BOPPPS组增加学习兴趣、提升学习效率、培养医学思维、加强知识运用、增加知识储备评分高于常规组,差异有统计学意义(P均<0.05)。BOPPPS组的教学满意度(100.00%)高于常规组(58.33%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论将BOPPPS教学模式应用于药理学教学中,不仅能够使实习药师更加深入地理解药理学知识,提高学习效果,增强其学习兴趣和动力,还能够提高药理学教学质量和水平。

关键词： 药理学   实验教学   微课   TBL教学模式  

摘要： 在“互联网+”背景下,微课已成为各大高校广泛运用的一种教学模式。TBL(Team-based learning)即以团队为基础的学习模式,在提高学生团队协作能力、自主学习能力方面发挥着重要作用。将微课结合TBL教学模式应用在安徽X学院药理学实验教学中并分析其实践成效。具体将学院2018级药学专业学生作为对照组,采用传统的教学模式进行实验教学,将2019级药学专业学生作为实验组,采用微课结合TBL教学模式进行实验教学。实践表明,将微课与TBL教学模式相结合融入药理学课程实验教学中有利于形成智慧学习生态,能为学生自主学习提供有效途径,提升了学生的自主学习能力、动手操作能力、团队协作能力、发现及分析解决问题的能力,课堂方式也实现了从传统到现代的转变。

关键词： 槐角丸   结肠癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 本文通过网络药理学和分子对接技术探讨槐角丸治疗结肠癌(colon cancer,CC)的有效活性成分及作用机制。利用TCMSP数据库检索槐角丸的活性化合物及靶点;OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库收集CC的相关靶点、运用STRING数据库和CytoScape软件构建“主要活性成分-靶点”网络以及药物与疾病共同靶点的PPI网络图。利用CytoScape筛选出关键靶点并使用Metascape数据库对其进行GO富集和KEGG通路注释分析,预测其作用机制。利用分子对接技术验证槐角丸与关键靶点之间的关系。最终共选出槐角丸中6种药材对应的230个靶点,其中CC有130个共表达靶点,核心靶点13个。核心靶点共涉及406条GO分析条目及127条KEGG信号通路。预测槐角丸治疗CC的关键活性成分可能为β-谷甾醇、山柰酚和汉黄芩素,过程主要涉及TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3、MAPK1、RELA等靶点,并通过介导癌症相关通路、PI3K-AKT信号通路、癌症中的蛋白多糖、TNF信号通路、IL-17信号通路等来发挥治疗CC的作用。分子对接显示,β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、川陈皮素与TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK3之间具有良好的结合力。生存分析结果显示,HSP90AA1、CAV1、ESR1、MAPK8高表达的患者总生存期显著低于低表达组,TP53、MAPK1、EGFR、RXRA高表达患者的总生存期则显著高于低表达组。本文通过网络药理学研究了槐角丸治疗CC的主要活性成分及其对应的靶点和作用通路,为槐角丸治疗CC提供了新思路。