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关键词： 知葛通脉颗粒   网络药理学   分子对接   糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变  

摘要： 目的借助网络药理学研究方法,初步探索知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变的靶点和机制,为进一步研究提供相关理论支持和线索。方法通过TCMSP数据库检索、文献补充,筛选知葛通脉颗粒有效成分及效用靶点,通过GeneCards、OMIM等数据库挖掘2型糖尿病LEAD靶点,取药物与疾病的交集靶点;利用STRING11.5制作PPI网络图,并通过PPI网络拓扑关系分析知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病LEAD的关键靶点;构建“药物-成分-靶点”关系图,筛选中药颗粒核心成分。在Metascape平台进行GO、KEGG富集分析,探索药物治疗疾病的潜在机制,构建“成分-靶点-通路”图。最后,通过AutoDockTools 1.5.6进行分子对接,验证药物活性成分与疾病靶点之间的反应活性。结果研究获得知葛通脉颗粒有效成分71种,潜在靶点261个,与DLEAD交集靶点107个,筛选出核心成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、去水淫羊藿黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇、金圣草素、豆甾醇,关键靶点AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA、IL-1B。相关作用通路有183条,作用通路主要涉及MAPK、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、HIF-1信号通路等。对接结果显示中药成分与疾病靶点之间可较好地结合。结论知葛通脉颗粒可通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、去水淫羊藿黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇、金圣草素、豆甾醇等关键有效成分作用于AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA、IL-1B等关键靶点,调节MAPK、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、HIF-1等信号通路,多靶点、多通路协同发挥对DLEAD的治疗作用。

关键词： 淫羊藿   保健品   数据挖掘   网络药理学   缓解体力疲劳   增强免疫力   改善骨密度   淫羊藿苷   朝藿定A  

摘要： 目的通过数据挖掘、网络药理学及分子对接技术分析含淫羊藿的保健食品的组方规律并对其潜在的机制进行研究。方法通过检索国家市场监督管理总局及药智网含淫羊藿的保健食品,采用频数统计和关联规则等方法分析基本信息及组方规律。通过检索TCMSP等数据库、整理相关文献获得淫羊藿相关化学成分及潜在靶点;根据保健功能频次分析结果,从GeneCards等数据库中筛选相关的潜在靶点信息;借助R语言相关软件包、String数据库、Cytoscape软件等筛选出关键成分和关键靶点。随后进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,根据度(degree)值筛选出核心靶点,并进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。最后,利用分子对接技术验证核心靶点和关键成分的作用亲和力。结果筛选纳入501种含淫羊藿保健食品。剂型以胶囊剂为主;保健功能频次排名前3的分别为缓解体力疲劳(343次)、有助于增强免疫力(140次)、有助于改善骨密度(87次);涉及116种中药,以补虚药为主,四气以温为主,五味以甘为主,归经以肾经为主。获得淫羊藿有效成分139个、靶基因1677个,获得体力疲劳相关潜在靶点849个、免疫力相关潜在靶点2076个、骨质疏松相关潜在靶点1440个;将淫羊藿和主要保健功能的靶基因取交集,得到淫羊藿缓解体力疲劳关键靶点227个、有助于增强免疫力关键靶点358个、有助于改善骨密度关键靶点332个;淫羊藿通过激酶活性的正向调节等过程及磷脂酰肌醇-3-羟激酶(phosphatidylinositol-3-hydroxykinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路起到缓解体力疲劳的作用,通过细胞因子产生的正向调节等过程及Th17细胞分化等信号通路起到增强免疫力的作用,通过对肽的反应等过程及PI3K/Akt等信号通路起到改善骨密度的作用。分子对接结果提示淫羊藿的关键成分与核心靶点能自发稳定地结合。结论通过数据挖掘、网络药理学和分子对接研究,分析了含淫羊藿的保健食品相关信息,初步揭示淫羊藿主要保健功能的潜在靶点与机制通路,为淫羊藿后续产品的研发提供了理论依据。

关键词： 扶肾颗粒   腹膜透析   腹膜炎   网络药理学   TLR4/NF⁃κB通路  

摘要： 基于网络药理学与动物实验探究扶肾颗粒(Fushen Granules,FSG)抑制腹膜透析(peritoneal dialysis,PD)大鼠炎症状态,防治腹膜透析相关性腹膜炎(peritoneal dialysis⁃related peritonitis,PDRP)的机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选扶肾颗粒主要活性成分并进行靶点预测,通过DisGeNET等数据库筛选PDRP相关靶点,利用在线软件作图工具平台获得药物与疾病靶点的交集靶点,并构建可视化扶肾颗粒⁃PDRP核心靶点蛋白⁃蛋白互作(PPI)网络,将得到的276个扶肾颗粒⁃PDRP的“药物⁃疾病”共同靶点导入DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,筛选出扶肾颗粒治疗PDRP的主要信号通路为TLR4/NF⁃κB;创建5/6肾切除尿毒症大鼠模型,术后2周起,每日定时给予实验大鼠腹腔注射20 mL 1.25%葡萄糖透析液建立PD大鼠模型,假手术组、模型组每日灌胃2 mL生理盐水,扶肾颗粒低(0.54 g·kg^(-1))、中(1.08 g·kg^(-1))、高(2.16 g·kg^(-1))剂量组每日灌胃2 mL,培菲康组每日灌胃2 mL(113.4 mg·kg^(-1))培菲康溶液,干预8周。试剂盒检测大鼠肾功能指标[血肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)]含量,ELISA检测血清炎症因子[超敏C反应蛋白(hs⁃CRP)、肿瘤坏死因子⁃α(TNF⁃α)、白细胞介素(IL)⁃6]、脂多糖(LPS)、脂多糖结合蛋白(LBP)含量,苏木精⁃伊红(HE)染色观察结肠组织病理形态,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测结肠组织TLR4/NF⁃κB信号通路关键因子LBP、Toll样受体4(TLR4)、NF⁃κB p65蛋白(NF⁃κB p65)、核因子抑制蛋白(IκBα)、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达。结果显示,与假手术组比较,模型组结肠组织各层结构异常,肠绒毛稀疏、变短,黏膜层可见水肿,间隙变宽,局部发现炎症细胞明显浸润,体质量显著下降(P<0.01),肾功能指标(Scr、BUN)含量均显著升高(P<0.01),血清炎症因子(hs⁃CRP、TNF⁃α、IL⁃6)、LPS、LBP含量均显著升高(P<0.01),LBP、TLR4、NF⁃κB p65、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达显著升高(P<0.01),IκBα蛋白表达显著降低(P<0.01);与模型组比较,扶肾颗粒低、中、高剂量组与培菲康组大鼠结肠组织肠绒毛受损有不同程度减轻,黏膜下层水肿减轻,间隙变窄,固有层炎症细胞浸润减少,扶肾颗粒中、高剂量组及培菲康组肾功能指标(Scr、BUN)含量均显著降低(P<0.05或P<0.01),血清炎症因子(hs⁃CRP、TNF⁃α、IL⁃6)含量均显著降低(P<0.05或P<0.01),扶肾颗粒组与培菲康组血清LPS、LBP含量显著降低(P<0.01),扶肾颗粒组LBP、TLR4、NF⁃κB p65、TNF⁃α、IL⁃1β蛋白表达显著降低(P<0.05或P<0.01),IκBα蛋白表达显著升高(P<0.01),培菲康组LBP蛋白表达显著降低(P<0.01)。结果提示,扶肾颗粒可保护PD大鼠残余肾功能,减轻炎症反应,保护结肠组织。基于网络药理学筛选出TLR4/NF⁃κB通路可能是扶肾颗粒治疗PDRP的主要信号通路。结果表明,扶肾颗粒通过调节PD大鼠结肠TLR4/NF⁃κB通路关键因子蛋白表达,改善肠道炎症反应、保护肠屏障防治PDRP。

关键词： 西黄丸   含药血清   高效液相色谱−四极杆−飞行时间串联质谱   入血成分   脑胶质瘤  

摘要： 基于高效液相色谱−四极杆飞行时间串联质谱(HPLC-Q-TOF-MS/MS)技术对西黄丸的入血成分进行定性分析,采用网络药理学对入血成分抗脑胶质瘤的潜在作用机制进行探究,并通过分子对接和实验验证其具体机制。大鼠灌胃给予西黄丸后收集血清,根据色谱峰保留时间、精确分子质量、特征碎片离子,结合对照品及文献数据,鉴定西黄丸含药血清的化学成分;通过PharmMapper数据库和SwissTarget Prediction数据库获得成分靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库获得脑胶质瘤疾病靶点,利用Cytoscape3.9.1软件构建“成分−靶点”网络关系图;以STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络关系图并对靶点进行GO分析和KEGG分析;利用分子对接验证核心靶点与相对应的入血成分的结合能力;CCK-8、Western blot验证西黄丸含药血清中代表性成分11-羰基-β-乳香酸(KBA)抗脑胶质瘤的潜在作用机制。结果共鉴定出入血成分40个(原型成分28个,代谢产物12个)。网络药理学结果显示,β-榄香酮酸、3-乙酰基-β-乳香酸、KBA、α-乳香酸等9个成分可能是西黄丸含药血清抗脑胶质瘤的活性成分,其中谷胱甘肽还原酶(glutathione reductase,GSR)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase,G6PD)、ATP柠檬酸裂解酶(ATP-citrate lyase,ACLY)、醛酮还原酶1成员B1(AKR1B1)、谷氧还蛋白(glutaredoxin,GLRX)为关键靶点,涉及谷胱甘肽代谢(glutathione metabolism)通路、磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)等。进一步细胞实验结果表明,KBA显著抑制T98G细胞增殖(IC50为30.96μmol·L^(-1)),KBA(30μmol·L^(-1))显著下调T98G细胞中GSR蛋白表达水平。综上所述,西黄丸含药血清可能通过调控谷胱甘肽代谢通路相关靶点GSR和G6PD抗脑胶质瘤。研究结果可进一步为西黄丸抗脑胶质瘤的作用机制研究提供一个有价值的依据。动物福利和实验过程获得南京中医药大学实验动物伦理委员会标准(批准号:ACU221001)。

关键词： 牙周炎   溃疡性结肠炎   葛根芩连汤   作用机制   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学及分子对接技术探讨葛根芩连汤异病同治牙周炎和溃疡性结肠炎的作用机制。方法:通过TCMSP数据库挖掘葛根芩连汤化学成分及作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库获取两种疾病靶点,对上述预测所得活性成分作用靶点及疾病相关靶点利用微生信绘图工具绘制Venn图取交集,获得药物与疾病共同作用靶点;基于Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点网络,利用STRING数据库分析共有靶点,建立蛋白互作网络(PPI)并进行可视化分析,在DAVID数据库对共有靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用AutoDock Tools软件对药物核心成分及关键靶点进行分子对接。结果:葛根芩连汤通过槲皮素、β-谷甾醇等核心成分作用于肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等关键靶点,发挥抗氧化应激、抗细胞凋亡、调节糖脂代谢作用,涉及晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、癌症通路等;分子对接结果显示药物核心成分与关键靶点有良好的对接活性。结论:葛根芩连汤通过多靶点、多途径异病同治牙周炎和溃疡性结肠炎。

关键词： 定量药理学   生理药动学模型   群体药动学模型   药动学/药效学模型   中药-化学药相互作用  

摘要： 近年来,中药-化学药在临床实践中的联合应用非常广泛,其药物相互作用不容忽视。为优化药物的合理使用、拓宽药物的应用范围,定量药理学模型逐步被引入到药物相互作用的研究中,该模型种类涵盖较广,其中用于预测中药-化学药相互作用(herb-drug interaction,HDI)的模型主要包括药动学/药效学模型、群体药动学模型及生理药动学模型。通过对上述模型在HDI领域的应用进行概述,提炼定量药理学模型在HDI研究中的主要思路与方法,为中药和化学药的合理联用提供参考。

关键词： 缺血性心力衰竭   四君子汤   网络药理学   分子对接   微阵列数据分析   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学、微阵列数据分析和分子对接探讨四君子汤治疗缺血性心力衰竭的作用机制。方法:采用R软件对GEO数据库中下载的缺血性心力衰竭(HF)的微阵列数据进行分析;借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库获取四君子汤中4味中药的化学成分和作用靶点,利用网络药理学的方法获取四君子汤有效成分与心力衰竭的匹配靶点;通过Cytoscape(v 3.2.1)软件和STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;在R软件上使用clusterProfiler(v3.8)和DOSE(v3.6)软件包进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,借助AutoDockTool、PyMOL软件进行预处理及分子对接。结果:通过对微阵列数据的分析,获得关于心力衰竭的371个差异表达基因(DEGs)。共筛选出四君子汤有效成分136种,活性成分所涉及的相关靶点4 134个,对9个匹配靶点和5个重要化学成分进行后续分析,构建了“四君子汤-心力衰竭”PPI网络。通过GO生物过程、KEGG富集分析,得到细胞对酸性化学物质的反应、有机羟基化合物转运、轴突再生、神经元投影再生、内质网腔、胶原三聚体、蛋白结合和局灶性黏附途径等重要生物学过程。分子对接显示核心成分柚皮素与核心靶点载脂蛋白B(APOB)、补体C1q结合蛋白(C1QB)对接良好。结论:四君子汤治疗缺血性心力衰竭的机制可能是多靶点、多途径的直接或间接作用,为后续的四君子汤药理机制研究提供了生物学依据。

关键词： 中国药理学会   药效动力学   药物治疗学   新药研究   药物基因组学   定量药理学   征订启事   幅面尺寸  

摘要： 本刊为中国科学技术协会主管,中国药理学会主办的全国性、学术性刊物。月刊,幅面尺寸:280 mm×205 mm,120页,CN34-1206/R,ISSN1009-2501。以从事新药研究、临床药理学与治疗学工作的高中级医疗、科研、教学人员为主要读者对象。设有专论、综述与讲座、基础研究、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、临床药理学(包括药物基因组学及药物蛋白组学等)、药物治疗学、读者·作者·编者等栏目。

关键词： 山楂   高脂血症   网络药理学   分子对接   药食同源  

摘要： 本研究基于网络药理学和分子对接技术探讨药食同源食品山楂改善高脂血症的可能机制。借助ETCM、HIT等数据库及文献挖掘得到山楂的活性成分及潜在靶点。随后将山楂改善高脂血症的潜在靶点进行PPI蛋白互作分析以及KEGG富集分析,最后将关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果显示,山楂改善高脂血症的5种关键活性成分为亚油酸、亚麻酸、山楂酸、山奈酚、槲皮素,5个核心靶点为AKT1、RXRA、EGFR、AR、RXRB,可能通过作用于PPAR、甲状腺激素、AMPK、IL-17、AGE-RAGE等信号通路改善高脂血症。分子对接结果显示,核心靶点与关键活性成分之间具有较好的结合活性。研究初步验证了山楂可改善高脂血症并揭示了其可能机制,为进一步探究山楂改善高脂血症的机理提供了研究方向,同时也为研发山楂降血脂类保健食品提供了理论支撑。

关键词： 艾司氯胺酮   镇静   镇痛   小儿  

摘要： 艾司氯胺酮是N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)受体的拮抗剂,通过与NMDA受体、阿片受体、M胆碱受体、单胺受体、腺苷受体和其他嘌呤受体相互作用发挥抗焦虑、催眠、镇静和镇痛作用。作为氯胺酮更强效的S型异构体,效力大约是氯胺酮的2倍。与氯胺酮相比,艾司氯胺酮具有起效和代谢快、强镇痛、呼吸抑制轻微、认知功能恢复快、精神副反应发生率低等特点,成为小儿临床麻醉药物的新选择。本文就艾司氯胺酮的药理学特性和近年在小儿麻醉中的应用研究进展作一综述,为小儿围手术期安全用药提供参考。