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关键词： 慢性胆囊炎   消炎利胆片   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的:通过网络药理学方法预测消炎利胆片治疗慢性胆囊炎的核心有效成分和靶点,并通过分子对接初步验证结果的稳健性。方法:利用TCMSP、CancerHSP、BATMAN-TCM数据库检索消炎利胆片有效成分及对应靶点,借助UniProt数据库对靶点进行规范化。通过GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库检索慢性胆囊炎相关靶点。运用R软件筛选药物与疾病交集靶点;分别通过Bioconductor平台、STRING数据库对交集靶点进行富集分析和蛋白相互作用分析。通过Cytoscape软件筛选出核心有效成分和靶点,将核心有效成分与核心靶点进行分子对接评估结合活性以验证结果稳健性。结果:共获得23种有效成分,对应190个药物作用靶点,从数据库中获取723个疾病相关靶点,药物与疾病之间有48个交集基因;富集结果显示多与细胞对炎症反应相关,筛选得到槲皮素、汉黄芩素、非瑟酮等核心有效成分,白细胞介素-1β(IL-1β)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等核心靶点;分子对接结果显示核心有效成分与核心靶点之间均有较好的结合活性。结论:消炎利胆片中的槲皮素、汉黄芩素、非瑟酮等核心有效成分可能通过参与调控炎症相关信号通路作用于IL-1β、MMP9、VEGFA等核心靶点,从而发挥治疗慢性胆囊炎的作用。

关键词： 健脾养血排毒方   慢性肾脏病   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。

关键词： 升降龙莲汤   子宫内膜癌   GEO芯片   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 研究基于网络药理学、基因芯片和分子对接探讨验方升降龙莲汤治疗子宫内膜癌的作用机制。方法 通过口服生物利用度和类药性在TCMSP数据库中挖掘升降龙莲汤的有效成分,利用GEO中GSE115810数据集、OMIM和GeneCards数据库获取子宫内膜癌的靶基因。对活性成分和Endometrial cancer的共同靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用STRING建立蛋白相互作用PPI网络,导入Cytoscape后根据度值筛选核心靶点,然后整合差异基因的上调和下调,通过Kaplan Meier-Plotter生存曲线分析,进一步筛出与子宫内膜癌预后关系更紧密的靶基因。最后,利用AutoDock对关键成分与核心靶基因进行分子对接验证。结果 从升降龙莲汤中获取成分66种和289个潜在治疗靶点。通过3个数据平台共获取1048个子宫内膜癌相关靶点,其中交集靶点97个。从PPI网络中获得靶基因12个,经K-M生存曲线进一步筛选得到靶基因7个。GO和KEGG富集结果显示,生物进程方面,尤以细胞迁移的正调控最显著,癌症信号通路富集最多。分子对接验证发现槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、山柰酚、黄芩素与靶基因结合较紧密。结论 升降龙莲汤干预子宫内膜癌主要机制是通过多靶点、多信号通路,抑制或提高关键基因的表达,阻滞癌细胞增殖与侵袭,促进肿瘤细胞凋亡。

关键词： 舒肝宁注射液   乙型病毒性肝炎   网络药理学   作用机制   腺苷   异绿原酸C   栀子苷  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探究舒肝宁注射液治疗乙型病毒性肝炎的网络调控机制。方法选取舒肝宁注射液中19个代表性化学成分为研究对象,通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库,获得化合物潜在作用靶点。利用DisGeNET、GeneCards数据库检索乙型病毒性肝炎的疾病相关靶点,利用Venny平台获取化合物作用靶点与疾病靶点的交集靶点为舒肝宁注射液治疗乙型病毒性肝炎潜在作用靶点。进一步对靶蛋白进行蛋白相互作用(PPI)网络分析、Cluster模块分析、基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。在PPI核心靶点网络分析基础上进一步通过分子对接方法验证网络药理结果。结果获得19个成分的173个舒肝宁注射液治疗乙型病毒性肝炎的潜在作用靶点,并可作用于SRC、HSP90AA1、ERS1、PIK3CA、HRAS等核心靶点,调节乙型病毒性肝炎、丙型病毒性肝炎、VEGF、TNF、PI3K/Akt等信号通路。分子对接结果表明,舒肝宁注射液与乙型病毒性肝炎信号通路关联的活性成分与相关靶点可自发结合。结论舒肝宁注射液治疗乙型病毒性肝炎的机制可能是通过多组分多靶点干预乙型肝炎信号通路起作用。

关键词： 没食子   质量标志物   多酚类   鞣质   没食子酸  

摘要： 没食子为没食子蜂科(瘿蜂科)昆虫没食子蜂的幼虫寄生于壳斗科植物没食子树幼枝上产生的一种虫瘿。药用历史悠久,具有涩肠、固精、止咳、止血、敛疮之功效,用于久泻久痢、遗精、盗汗、咳嗽、创伤出血、口疮等病症。基于中药质量标志物(Q-Marker)核心理论,从没食子中医药理论中药性和功能主治、现代医学药效和药理作用、化学成分三个方面进行Q-Marker初步预测。通过文献的收集、整合和分析,对没食子Q-Marker的来源进行定位,基于网络药理学对成分进行有效性分析,确定多酚类、酚酸酯类成分中鞣质、没食子酸、鞣花酸、没食子酸甲酯、没食子酸乙酯等化合物可作为没食子的主要Q-Marker,为临床前实验研究建立科学标准的质量控制体系提供参考依据。

关键词： IgA肾病   尿C方   网络药理学   分子对接技术   信号通路  

摘要： 目的:通过网络药理学探讨尿C方治疗IgA肾病(IgAN)的关键成分和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubChem、Swiss ADEM和SwissTargetPrediction获得尿C方作用靶点;应用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;通过GeneCards、OMIM和DisGeNET平台获得IgAN作用靶点;通过Venn 2.1制作韦恩图获得尿C方和IgAN之间的交叉靶点并进行鉴定和可视化,并利用STRING数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);借助DAVID数据库对交集靶点进行GO和KEGG富集分析并运用微生信在线平台对交集靶点进行GO和KEGG富集分析可视化;使用Autodock Vina软件进行分子对接验证,并利用PyMol软件得出对接结果。结果:共筛选得到尿C方有效成分70种及对应1 363个作用靶点,其中确定了10个关键活性成分。IgAN相关靶点1 593个,除重复项后获得823个疾病靶点,交集靶点111个。GO富集分析得到706个BP条目,63个CC条目,123个MF条目。KEGG富集分析得到161条与IgAN显著相关的通路。分子对接结果表明,核心活性成分与核心靶点之间存在较强的结合活性。结论:尿C方治疗IgAN的作用机制可能是通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、黄芩素等调控AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、脂质和动脉粥样硬化等发挥治疗作用。

关键词： 扶正感康丸   网络药理学   流行性感冒  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨扶正感康丸治疗甲型流行性感冒、乙型流行性感冒的有效成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取扶正感康丸的有效成分及作用靶点。通过GeneCards、NCBI数据库检索甲型流行性感冒、乙型流行性感冒疾病基因,获取有效成分-疾病共同靶点,并通过STRING数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用网络,再使用Cytoscape软件绘制网络图并筛选核心靶点。其后,使用Metascape数据库对核心靶点进行富集分析,进一步获取通路关键靶点,并结合BioGPS、DisGeNET、GeneCards网站获取关键靶点的组织定位、亚细胞分布的相关信息。结果:获得扶正感康丸6味主要药物的有效成分85个,与甲型流行性感冒的交集靶点有41个,与乙型流行性感冒的交集靶点有106个,其中槲皮素、山柰酚等是核心成分,肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6等是甲型流行性感冒关键靶点,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、IL-6等是乙型流行性感冒关键靶点。基因本体论(GO)富集分析显示,扶正感康丸主要参与细胞死亡的正调控、细胞分化的负调控等生物过程,膜筏、膜侧等细胞组分,RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、蛋白质同源二聚化活性等分子功能。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,扶正感康丸治疗甲型流行性感冒主要参与了肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、小细胞肺癌等通路;扶正感康丸治疗乙型流行性感冒主要参与了肿瘤信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(Phosphatidylinositol 3-kinase-Akt,PI3K-Akt)信号通路、核因子-κB信号通路等相关通路。根据扶正感康丸治疗甲型流行性感冒和乙型流行性感冒的靶点分布情况,推测免疫细胞在提高机体免疫功能、治疗此类疾病中发挥较大作用。结论:扶正感康丸可以调节核因子-κB、PI3K-Akt等信号通路的AKT1、TNF、基质金属蛋白酶(Matrix Metallopeptidase,MMP)9、IL-10、IL-6等疾病靶点干预生物进程,从而治疗流行性感冒。

关键词： 过敏性鼻炎   理中汤   网络药理学   信号通路   分子机制  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨理中汤在过敏性鼻炎治疗中的潜在靶点及其作用机制,为临床应用及今后研究提供方向与借鉴。方法:应用多个数据平台剖析理中汤治疗过敏性鼻炎的机制,从中药系统药理学数据库与分析平台中检索筛选理中汤的有效成分和相关靶点,采用全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行标准化靶点。利用基因卡片(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、比较毒理基因组学(CTD)、治疗靶点(TTD)等数据库查找过敏性鼻炎的相关基因。通过韦恩图获得两者交集治疗靶点并将其导入STRING数据库中分析,并建立蛋白相互作用(PPI)网络。最后对核心关键靶点进行基因本位(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果:理中汤治疗过敏性鼻炎的关键化学成分可能为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、α-香树素和柚皮素等;核心靶点包括肿瘤坏死因子(TNF)、丝/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤抑制基因P53(TP53)及IL-1β等;理中汤在过敏性鼻炎治疗中主要涉及IL-17信号通路、晚期糖基化终产物及其受体(AGERAGE)信号通路、脂质和动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路及Th17细胞分化通路等。结论:本研究初步揭示了理中汤治疗过敏性鼻炎的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为理中汤在临床应用及实验研究等方面提供了参考。

关键词： 藏成药   智托洁白丸   历史沿革   化学成分   药理学   质量控制  

摘要： 目的为智托洁白丸的合理、安全应用提供参考。方法采用计算机检索中国知网、维普、万方、PubMed、The Cochrane Library等数据库中自建库起至2023年5月收录的智托洁白丸相关文献,采用人工检索相关古籍,对智托洁白丸的历史沿革、中药材有效成分、现代药理学作用、质量控制方法等进行归纳总结。结果智托洁白丸为藏药经典名方,由寒水石、矮紫堇、诃子、兔耳草、木香、蜂蜜、渣驯膏7味药材组方,具有清胃热、抑酸、止咳等功效,对消化性疾病的疗效较好。组方药材的主要有效成分为硫酸钙、碳酸钙、氢氧化钙、锌、诃子酸、没食子酸、鞣花酸、诃子次酸、金缕梅单宁、原儿茶酚、木犀草素、毛蕊花糖苷、大车前苷、松果菊苷、鞭打绣球苷B、原阿片碱、盐酸小檗碱、齐墩果酸、异槲皮苷、梓醇、木香烃内酯、去氢木香内酯、黄腐酸、葡萄糖、香兰素等。现代药理学研究结果显示,智托洁白丸治疗胆汁反流性食管炎、乙酸性溃疡、消化性溃疡、低氧应激性胃溃疡有一定疗效。但对智托洁白丸质量控制的研究较少,法定标准仅收载于1995年版《卫生部药品标准·藏药(第一册)》。结论智托洁白丸对消化道疾病的临床疗效良好,建议采用多种现代科学技术对其药效学物质和药理学作用等进行深入研究,促进临床合理、安全应用。

关键词： 芍药苷   糖尿病视网膜病变   视网膜血管内皮细胞   网络药理学   分子对接  

摘要： 本研究通过体外实验与网络药理学相结合的方法分析芍药苷治疗糖尿病视网膜病变的相关作用机制。制备高糖环境下视网膜血管内皮细胞的体外模型,探究芍药苷对糖尿病视网膜病变的保护作用;从TCMSP、UniProt、PubChem、PharmMapper、SwisstargetPrediction、GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库获取芍药苷和糖尿病视网膜病变的作用靶点,使用韦恩图获取核心靶点;基于STRING数据库,采用Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用网络和“药物-靶点-疾病”网络;应用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,并用AutoDock软件将芍药苷与核心靶点进行分子对接验证。体外实验结果显示,芍药苷能显著抑制视网膜血管内皮细胞的增殖,降低其迁移能力并减少管腔形成长度。网络药理学结果显示共获取芍药苷治疗糖尿病视网膜病变的核心靶点154个,其中度值较高的靶点包括VEGFA、IL6等。GO功能共富集到705个GO条目,主要涉及细胞对药物的反应、血管内皮细胞迁移的调节、细胞增殖的调节等生物过程;KEGG通路富集分析共富集到137条通路,主要包括AGE-RAGE信号通路和PI3K-Akt信号通路。分子对接结果显示,芍药苷分子与核心靶点VEGFA、IL6的结合能力良好。本研究表明芍药苷可能通过多靶点、多通路调节视网膜血管内皮细胞的增殖、迁移能力及管腔形成长度等发挥治疗糖尿病视网膜病变的作用。