课程文献中心 更多>>

关键词： 网络药理学   四物汤   白芍   川芎   当归   熟地黄   胆汁淤积性肝损伤   肝纤维化   肿瘤坏死因子通路   血管生成因子通路   氧化芍药苷   洋川芎内酯A   阿魏酸   5-羟甲基糠醛  

摘要： 目的基于网络药理学整合体内实验对比四物汤中4种单味药(川芎Chuanxiong Rhizoma、白芍Paeoniae Radix Alba、当归Angelicae Sinensis Radix、熟地黄Rehmanniae Radix Praeparata)治疗胆汁淤积性肝损伤(cholestatic liver injury,CLI)的药效差异,并探讨各单味药的作用机制。方法利用TCMSP数据库获取川芎、白芍、当归、熟地黄的主要活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库获取CLI靶点,使用Cyctoscape 3.10.1软件分析并构建“单味药-活性成分-作用靶点”网络,借助在线网站获取各单味药与CLI之间的交集靶点,并绘制韦恩图。将靶点基因导入DAVID数据库进行基因富集分析。构建胆总管结扎(bile duct ligation,BDL)动物模型,给予各单味药水提物后,检测血清肝功能相关生化指标,并对肝组织进行病理染色对比药效作用。同时结合qRT-PCR检测CLI相关靶点的基因表达。结果网络药理学结果显示,四物汤中川芎、白芍、当归、熟地黄与CLI之间均存在3个交集靶点[核受体亚家族3C组成员2(nuclear receptor subfamily 3 group C member 2,Nr3c2)、类视黄醇X受体(retinoid X receptor alpha,Rxra)、前列腺素内过氧化物合成酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,Ptgs2)]。通过体内验证实验表明白芍、川芎、当归、熟地黄水提物均可显著改善CLI以及相关的肝纤维化情况,且均能下调上述3个共同靶点表达(P<0.05、0.01、0.001)。此外,白芍、川芎的体内抗CLI疗效优于当归、熟地黄提取物。结果还显示白芍与CLI有18个、川芎与CLI有4个与其他单味药不同的独立交集靶点,而当归、熟地黄与CLI之间不存在独立的交集靶点。进一步生信分析发现,白芍作用靶点基因富集于血管生成、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路;川芎作用靶点富集于血管内皮、血管生成、血管生成因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)通路。进一步验证结果显示白芍通过下调肝脏中血管细胞黏附分子(vascular cell adhesion molecule 1,Vcam1)、Tnf、有丝分裂原激活蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase 8,Mapk8)、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT serine/threonine kinase 1,Akt1)表达改善CLI,川芎通过下调肝脏激酶插入结构域受体(kinase insert domain receptor,Kdr)、Mapk14表达改善CLI。结论四物汤中川芎、白芍、当归、熟地黄均能不同程度地改善胆汁淤积引起的肝损伤及纤维化,它们通过靶向Nr3c2、Rxra、Ptgs2共同改善CLI。白芍、川芎改善CLI疗效优于当归、熟地黄,前者可基于TNF信号通路而后者则是通过调控VEGF信号通路分别特异性改善CLI。

关键词： 朴炳奎   肺癌   网络药理学   分子对接   益金方  

摘要： 目的:基于前期研究成果并结合网络药理学及分子对接技术,探讨益金方治疗肺癌的作用机制。方法:从多个开放数据平台获取益金方药物作用基因和肺癌相关基因。基于Cytoscape探索药物成分-靶点关系谱,探寻关键化合物。基于STRING平台完成蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的建立,采用Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点。通过R-ClusterProfiler对靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析。最后,利用AutoDock对关键有效成分与肺癌通路相关核心靶点进行对接验证。结果:益金方的主要药物有效成分有157个,其包含潜在治疗靶点235个。通过5个数据平台共获得了8585个肺癌相关靶点。药物潜在治疗靶点和数据平台的共享靶点为215个。从PPI核心网络中筛选核心靶点18个。GO功能富集分析结果显示,相关靶点在各种生物过程、细胞功能方面富集显著,靶点与肺癌信号通路关系密切。根据分子对接结果,紫杉叶素、槲皮素、柚皮素、木犀草素、甘草查尔酮A、山柰酚、异鼠李素、薯蓣皂苷元和刺槐素能够与肺癌通路相关的核心靶点紧密结合。结论:益金方的主要药物有效成分可能通过多个靶点和信号通路干预肺癌,这可能是该方产生治疗效果的机制之一。

关键词： 天麻   丹参   药对   高血压   血管内皮   网络药理学   实验验证   大鼠  

摘要： 目的基于网络药理学方法及动物实验验证探讨天麻-丹参药对治疗高血压的作用机制。方法(1)通过TCMSP、BATMAN及TCMIP数据库筛选天麻-丹参药对活性成分及其作用靶点;通过Drugbank、Genecard、TTD、Disgenet数据库检索获得高血压疾病相关靶点;对药对的活性成分作用靶点与高血压疾病相关靶点取交集(共同靶点),所得交集靶点即为天麻-丹参药对治疗高血压的潜在作用靶点。将天麻-丹参药对活性成分及其作用靶点导入Cytoscape 3.9.1软件,构建“中药-活性成分-靶点”网络,筛选关键活性成分;构建潜在作用靶点的蛋白互作(PPI)网络,筛选潜在核心靶点;使用Metascape平台对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。选择关键活性成分与潜在核心靶点进行分子对接验证。(2)将30只雄性自发性高血压大鼠(SHR)随机分为模型组、西药组(坎地沙坦酯,0.72 mg·kg^(-1))及天麻-丹参药对低、中、高剂量组(2.25、4.50、9.00 g·kg^(-1)),另选雄性WKY大鼠为空白组,每组6只,每日1次,连续灌胃给药8周。分别在给药前及药物干预2、4、6、8周后检测大鼠尾动脉收缩压;采用HE染色法观察胸主动脉组织病理变化;Western Blot法检测腹主动脉中GRP78、CHOP、Caspase-12蛋白表达水平。结果(1)共得到天麻-丹参药对活性成分83个,筛选出天麻-丹参药对治疗高血压的潜在作用靶点(交集靶点)158个;5个关键活性成分:对羟基苯甲酸、4-羟基苄胺、丹参酮Ⅰ、丹参酮、γ-谷甾醇;6个潜在核心靶点:IL6、TNF、CASP3、JUN、PTGS2、IL1B;GO功能富集分析得到1826条生物学过程条目、89条细胞组分条目、199条分子功能条目;KEGG通路富集分析获得186条通路,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、炎症应答(如TNF和MAPK信号通路)、血管保护(如HIF-1和cAMP信号通路)、氧化应激(如PI3K-Akt信号通路)等信号通路;丹参酮Ⅰ、丹参酮对6个潜在核心靶点均有较强的结合力,γ-谷甾醇对IL6、CASP3、JUN、PTGS2、IL1B具有较强的结合力。(2)与空白组比较,模型组大鼠的收缩压显著升高(P<0.01);胸主动脉内皮损伤明显,内皮细胞形态异常,可见肿胀、脱落细胞,组织内膜排序紊乱,内膜结构不完整,出现内膜增厚;腹主动脉中GRP78、CHOP、Caspase-12蛋白表达量显著升高(P<0.01)。与模型组比较,给药组大鼠的收缩压均显著下降(P<0.01);胸主动脉损伤减轻,内皮细胞形态、内膜结构及厚度等均得到不同程度改善;腹主动脉中GRP78、CHOP、Caspase-12蛋白表达量显著降低(P<0.01)。结论天麻-丹参药对可能是通过对羟基苯甲酸、丹参酮、γ-谷甾醇等关键活性成分,作用于IL6、TNF、CASP3、JUN、PTGS2、IL1B等核心靶点,调控TNF信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、PERK信号通路等关键信号通路,发挥改善血管内皮功能障碍、抑制内质网应激及降血压的作用。

关键词： 继续教育   课程思政   兽医药理学   教学改革  

摘要： 新时代背景下,高校落实立德树人要求,就需要将课程思政融入教育的各个环节。继续教育直接关系到人才培养质量,分析了高校继续教育课程思政教育的现状、必要性,以广东海洋大学继续教育学院兽医药理学课程为例,从课程目标、教学模式、教学内容及考核机制等方面,将思政元素有机融入课程体系,旨在培养一批思想觉悟高、专业技术强的高素质应用性人才。

关键词： 乳腺癌   三物黄芩汤   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨三物黄芩汤治疗乳腺癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选三物黄芩汤有效活性成分及潜在靶点,在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找乳腺癌相关靶点基因,取三物黄芩汤靶点基因与乳腺癌相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“三物黄芩汤活性成分-潜在靶点-乳腺癌”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作(PPI)网络图。对潜在靶点基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:TCMSP数据库筛选得到三物黄芩汤有效活性成分83个,主要包括有木犀草素、槲皮素、菜豆素、汉黄芩素、黄芩素、黄芩苷以及地黄多糖等。与乳腺癌相关潜在作用靶基因99个,KEGG富集通路分析主要包括脂质-动脉粥样硬化信号通路、化学致癌作用-受体激活通路、PI3K/Akt信号通路以及IL-17信号通路等。结论:三物黄芩汤具有多活性成分,能通过多靶点、多通路发挥乳腺癌治疗作用。

关键词： 一流课程建设   临床医学专业   药理学   四维融合   混合教学模式  

摘要： 面对医学教育变革及复合创新人才培养的需求,在河北大学临床医学专业获批国家级一流本科专业背景下,进行药理学一流课程的建设与实践。教学团队通过分析教学现状与痛点问题,进行教学内容的优化设计,以“思政融合、科教融合、多学科交叉融合、实践融合”四维一体进行课程内容整合;采用混合教学模式;运用多维度的评价方式进行课程的改革建设。通过成绩分析及调查问卷对教学效果进行评价,综合成绩显著提升,对教学改革创新满意度高,学生与教师能力素养显著增强,一流课程建设效果显著。

关键词： 鹅不食草   胃癌   网络药理学   中西医结合  

摘要： [目的 ]运用网络药理学方法探讨鹅不食草治疗胃癌的作用机制.[方法 ]基于中药系统药理学数据库中鹅不食草的相关研究,分析预测其主要活性成分.检索SwissTargetPrediction和SEA数据库获得鹅不食草相关靶点基因;检索中药系统药理数据库(TCMSP)获得胃癌靶点基因.在Venny2.1.0数据库中比对鹅不食草的主要活性成分与胃癌的相同靶点,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-成分-靶点-疾病网络图,结合STRING数据库对共同靶点进行蛋白-蛋白相互作用分析并构建PPI网络,确定核心靶点;利用Metascape平台对核心靶点进行GO富集分析与KEGG信号通路富集分析,在微生信在线绘图平台中绘制柱状图及气泡图反映研究结果 .[结果 ]探索TCMSP数据库共获得化学成分108个,筛选后确定17个有效化学成分及757个成分靶点,与225个胃癌相关靶点取交集,得到36个共同靶点,涉及18条信号通路.[结论 ]Ras、Rap1、PI3K-Akt及MAPK 4个信号通路上的PDGFRB、PLAU、PLA2G1B及CDC25B基因与鹅不食草治疗胃癌的分子机制具有较强的联系.

关键词： 益脑通络方   缺血性中风   分子机制   整合药理学  

摘要： 目的龙江医派知名医家陈景河先生的益脑通络方在临床上治疗缺血性中风效果明显,但是其治疗机制方面的研究尚浅。文章基于中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)探讨益脑通络方治疗缺血性中风的分子机制。方法利用该平台筛选方剂的活性成分并预测其靶点;基于方剂靶点与疾病靶点的匹配结果筛选方剂-疾病的关键靶点,并对关键靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能、生物过程(Reactome)富集分析;通过构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI)、构建“中药-成分-靶点-通路”网络,分析并筛选益脑通络方治疗缺血性中风的主要活性成分和核心靶点;进一步对核心靶点与主要活性成分进行分子对接,以虚拟验证其结合能力并分析其结合模式。对核心活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果获得益脑通络方治疗缺血性中风的主要活性成分40种,关键靶点18个,包括了APP、PIK3CA等,GO功能分析主要富集在对凋亡的调控上,Reactome信号通路涉及了凋亡途径、炎症途径、基因调控、血管通路、神经再生、突触传导、细胞自噬等多途径。分子对接结果显示主要活性成分与核心靶蛋白具有结合力,川芎的萘呋内酯结合能力最强。结论益脑通络方中的萘呋内酯等多种活性成分能够作用于APP、PIK3CA等多靶点、通过促红细胞生成素(erythropietin,EPO)激活的PI3K等多通路,在缺血性中风中主要发挥抗凋亡等作用。

关键词： 网络药理学   丹参   葛根   心肌纤维化   作用机制  

摘要： 目的采用网络药理学探讨丹参-葛根药对治疗心肌纤维化的活性成分及作用机制。方法从中药系统药理学分析平台获取丹参-葛根药对活性成分和作用靶点,通过GeneCards数据库获取心肌纤维化的相关靶点,使用Venny 2.1软件获取两者共同靶点;运用STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件构建共同靶点的蛋白-蛋白互作(PPI)网络并进行拓扑学分析;采用ClusterProfiler R功能包对共同靶点进行基因本体(GO)功能和KEGG通路富集分析;最后使用Cytoscape 3.7.1软件构建“活性成分-靶点-通路”网络并分析。结果筛选得到丹参-葛根药对候选活性成分30个,活性成分和心肌纤维化共同靶点41个。共同靶点PPI网络的平均点度值为19.7,平均介数为19.1,度值和介数均超过平均值的靶点共有14个。KEGG显著富集到73条通路,其中与心肌纤维化相关的通路有6条。“活性成分-靶点-通路”网络显示,丹参中的木犀草素、丹参酮IIA和葛根中的葛根素、β-谷甾醇等活性成分通过共同调控脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、血流剪切力与动脉粥样硬化、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介数-17(IL-17)等信号通路起到抗心肌纤维化的功效。结论揭示了丹参-葛根药对多成分、多靶点、多通路治疗心肌纤维化的作用特点,为进一步研究丹参-葛根药对治疗心肌纤维化的作用机制提供理论依据和新的思路。

关键词： 骨质疏松性骨折   续断   网络药理学   分子机制   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学及分子对接技术探讨续断治疗骨质疏松性骨折(OPF)的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选续断具有高活性的潜在有效成分,通过GeneCards和OMIM数据库筛选OPF的相关靶标,运用Metascape数据库对OPF相关靶标进行映射,确定续断对OPF的可能靶标。利用Cytoscape软件搭建续断治疗OPF的药物-成分-疾病-靶点网络;通过STRING平台构建蛋白质互作网络;利用David数据库提供的续断相关靶标进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后通过分子对接验证核心靶点和续断活性成分的结合能力。结果:续断治疗OPF的主要活性成分主要有龙胆碱(Gentisin)、β-谷甾醇(β-sitosterol)、谷甾醇(Sitosterol)、(E,E)-3,5-二邻咖啡酰奎宁酸[(E,E)-3,5-Di-O-caffeoylquinic acid]和林生续断苷Ⅲ-qt(SylvestrosideⅢ-qt)等成分,其作用于半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3 (CASP3)、β2-肾上腺素受体基因(ADRB2)、Bcl-2相关X蛋白(BAX)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶8 (CASP8)、雌激素受体2 (ESR2)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶9 (CASP9)、二肽基肽酶-4 (DPP4)、糖原合成酶激酶3 (GSK3β)、异常凝血酶原(F2)等靶点。续断能够通过参与转录调控和细胞凋亡执行阶段的半胱氨酸型内肽酶、G蛋白偶联胺受体、缩氨酸酶活性等生物过程,调控癌症通路、弓形体病、卡波西肉瘤相关的疱疹病毒感染、乙型肝炎、大肠癌、小细胞肺癌脂质与动脉粥样硬化、雌激素信号通路来发挥治疗OPF的作用。分子对接结果显示,续断的活性成分(E,E)-3,5-二邻咖啡酰奎宁酸、龙胆碱、威岩仙皂苷A_qt、β-谷甾醇与CASP3、ADRB2、CASP8有较好的亲和力。结论:续断可通过直接作用骨代谢相关途径和参与调节上下游多个信号通路对OPF进行治疗,CASP3及癌症通路可能是其治疗OPF的关键靶点及通路。