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关键词： 高血压肾损伤   中药药理学   怀牛膝   菟丝子  

摘要： 目的:通过使用网络药理学方法探讨怀牛膝-菟丝子药治疗高血压肾损伤的潜在作用机制。方法:使用TCMSP、Uniprot数据库分别获取怀牛膝、菟丝子的活性成分和靶点基因,高血压肾损伤的疾病相关靶点是通过GenenCards、Omim数据库获取。在Venny在线工具中获取药物与疾病的交集基因,使用STRING数据库、Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质相互作用网络。通过Metascape数据库和微生信网站获取的数据构建GO和KEGG通路富集分析,建立活性成分-靶点-关键通路网络。结果:在TCMSP数据库中共筛选出怀牛膝、菟丝子符合条件的有24种活性药物成分,活性成分靶点及疾病靶点分别为206、1762个。Venny在线工具中获得了药物和疾病的113个共同基因。PPI网络显示怀牛膝、菟丝子药对发挥重要作用的靶点有:丝裂原活化蛋白激酶1、肿瘤抑制蛋白P53、蛋白激酶B1、肿瘤坏死因子、原癌基因、白细胞介素6等。从GO和KEGG通路富集分析结果中可得到,药物和疾病的交集基因与无机物、氧化应激、化学应激、活性氧、金属离子等分子生物进程关系密切,相关信号通路包括有:癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE信号通路等。结论:怀牛膝-菟丝子治疗高血压肾损伤具有基本药理活性,可能通过AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等作用于肿瘤抑制蛋白P53、蛋白激酶B1等靶点改善高血压肾损伤。

关键词： 血清药物化学   网络药理学   代谢物   荜茇   胃溃疡  

摘要： 荜茇(PL)是具有药食两用性的常用中药,中医临床多生用,具有温中散寒、行气止痛的功效,用于胃脘冷痛、胃寒呕吐等,同时也是蒙医、藏医和印度传统常用药物。在本研究中,首先建立大鼠胃溃疡动物模型,考察荜茇对胃粘膜的保护作用,进而将血清药物化学与网络药理学相结合,挖掘荜茇药效物质基础,从荜茇中筛选药效物质和潜在作用靶点。研究结果表明,荜茇对乙醇诱导的胃溃疡具有显著的保护作用;网络药理学预测了潜在的药物-疾病共同靶点后,GO富集分析预测荜茇可能影响多种生物过程,如脂质代谢和炎症反应。KEGG富集分析提示TNF和AGE-RAGE信号通路可能参与其中,分子对接预测芝麻素与胡椒碱等可能是荜茇抗炎和抗菌作用的主要成分。此外,荜茇的血清药物化学揭示了入血成分中有23种原型成分和17种代谢物。本研究整合了血清药物化学和网络药理学,为荜茇在胃溃疡治疗中的药效物质研究提供了实验依据。

关键词： 亚健康   黄萸斛颗粒   酒黄精   酒萸肉   铁皮石斛   药理学  

摘要： 亚健康是机体介于健康与疾病之间的一种状态,机体阴阳气血发生轻度的偏衰失衡,表现出肝肾阴虚和脾胃虚弱的症状。滋补肝肾、补脾益气及提高机体免疫力是亚健康干预的重点。黄萸斛颗粒由酒黄精、酒萸肉、铁皮石斛组成,功效是健脾润肺、益胃生津、补益肝肾,常用于虚弱之人,尤其是阴虚的调理治疗与恢复。现代药理研究发现酒黄精、酒萸肉、铁皮石斛均能提高人体免疫力,具有养生、保健、康复功效,能干预亚健康状态,做到未病先防。

关键词： 乳腺癌   小金丹   凋亡   转移   网络药理学   MAPK信号通路   PI3K-AKT信号通路  

摘要： 目的采用网络药理学方法结合实验验证探究小金丹治疗乳腺癌的作用及分子机制。方法通过TCMSP、TCM-ID、ETCM及SwissTargetPrediction数据库筛选小金丹的化学成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、KEGG数据库收集乳腺癌相关靶点,将药物与疾病共同靶点导入STRING数据库分析蛋白相互作用(PPI),通过Cytoscape3.8.0根据节点拓扑参数值筛选PPI网络的关键靶点,采用DAVID数据库进行KEGG通路和GO富集分析,构建药物-化学成分-关键靶点-信号通路网络。采用人乳腺癌细胞株MDA-MB-231和SK-BR-3研究小金丹提取物对细胞凋亡、迁移和侵袭能力的影响,并对富集得到的关键通路进行验证。结果筛选得到小金丹中槲皮素、杨梅素、乔松素、β-谷甾醇等181个化学成分,小金丹治疗乳腺癌作用的潜在靶点615个。通过PPI网络节点拓扑参数值筛选得到170个关键靶点,涉及SRC、ERK1/2、AKT1、EGFR等核心靶点。KEGG通路富集分析显示,癌症中的通路、MAPK信号通路、内分泌抵抗信号通路、PI3K-AKT信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路、细胞凋亡信号通路、HIF-1信号通路等可能在小金丹治疗乳腺癌的过程中起关键作用。GO富集分析显示,细胞功能涉及蛋白质磷酸化、炎症反应、细胞凋亡过程的负调节、ERK1和ERK2级联的正向调节等。细胞实验表明,小金丹通过抑制MAPK、PI3K-AKT通路激活,进一步诱导线粒体依赖的细胞凋亡;同时增加上皮性标志物ZO-1、β-catenin表达,逆转上皮-间充质转化过程,抑制乳腺癌细胞转移。结论本研究通过网络药理学结合体外实验得到小金丹治疗乳腺癌的关键靶点和涉及的信号通路,可为深入研究其药效物质基础、作用机制及临床应用提供依据。

关键词： 骨关节炎   网络药理学   分子对接   太子参   活性成分   作用靶点   信号通路  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接研究太子参对骨关节炎(OA)关键靶蛋白的作用机制。方法 使用TCMSP平台检索太子参的活性成分并预测作用靶点,筛选Gene Cards、Drug Bank、Pharm Gkb、OMIM数据库中OA的相关基因并进行合并。得到的疾病共有靶点通过STRING数据库将疾病与药物交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,并将结果输入Cytoscape 3.8.2软件进行分析,然后,使用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-活性成分-靶点网络图,以获得药物-其他疾病交叉靶点中的核心关键蛋白。将绘制的PPI网络导入Cytoscape 3.8.2软件中,并使用CytoNCA插件对网络进行筛选。利用R语言对OA与太子参药物的交集进行基因本体(GO)功能分析和京都基因组和基因组学百科全书(KEGG)通路分析,得到GO及KEGG富集分析结果。通过PubChem数据库下载PPI网络核心靶标对应的小分子配体3D结构的SDF文件,利用“1-CLICK DOCKING”在线工具进行分子对接,下载PDB结果文件再用Discovery Studio软件绘制残基-配体交互情况。结果 本研究预测太子参治疗OA的活性成分25个,靶点57个,关键活性成分包括木犀草素等5个活性成分,经过两次筛选得到核心靶点为MAPK1、CCND1、JUN、TP53、CASP3、BCL2L1、AKT1、EGFR;GO和KEGG分析结果显示,太子参通过以上关键靶点,影响PI3K-Akt、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等6个主要通路,在预防和治疗OA中发挥作用;分子对接验证木犀草素与关键靶点EGFR、CAP3、AKT1、TP53的结合性最好。结论 本研究揭示了太子参通过多途径、多靶点防治OA的作用,为进一步研究其防治OA作用提供了基础。

关键词： 定喘汤   慢性阻塞性肺疾病   网络药理学   磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B   炎症反应   分子对接   细胞实验   靶点  

摘要： 目的:分析定喘汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的分子机制,并通过细胞实验验证定喘汤的药理学作用。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库中,对定喘汤9味中药进行有效成分筛选,利用UniPort数据库得到中药活性成分相关靶点。随后在五大疾病数据库中以COPD作为关键词进行检索,收集疾病对应的靶点基因。对有效成分-交集靶点网络进行拓扑分析,根据中药有效成分与交集靶点之间连接情况筛选定喘汤治疗COPD关键成分。最后通过基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析确定定喘汤治疗机制并进行分子对接,从整体生物网络角度阐述定喘汤治疗COPD的免疫炎症机制,并通过细胞实验加以验证。结果:本实验筛选得到定喘汤274个活性成分,与疾病交集靶点262个。KEGG富集分析表明核心靶点作用于白细胞介素-17(IL-17)信号通路、NOD样受体信号通路及趋化因子信号通路等多种免疫和炎症反应相关的信号通路,分子对接显示核心化合物与靶点具有良好的对接活性。细胞实验表明,定喘汤能通过磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路,抑制人Ⅱ型肺泡上皮细胞炎症反应,证实了网络药理学的作用靶点。结论:通过网络药理学的初步筛选与预测,已经初步明确定喘汤治疗COPD靶点,确定了定喘汤多通路作用机制,其有效成分可以通过PI3K/AKT信号通路调控炎症反应,从而达到治疗COPD的目的,可为后续的深入研究提供方向。

关键词： 苇茎汤   肺系疾病   研究进展   经方   药理学   临床研究  

摘要： 环境问题导致肺系疾病当下备受关注,现代临床研究证明苇茎汤对肺脓肿、慢性阻塞性肺疾病、肺癌、重症肺炎等肺系疾病具有良好的治疗作用。苇茎汤具有清热化痰、逐瘀排脓的功效。现主要围绕该方主治的肺系疾病进行整理归纳。临床研究显示苇茎汤在提高临床有效率的同时,可显著缩短炎症指标降低的时间、减少抗生素的使用,并减少不良反应的发生;现有药理研究表明该方主要功效成分为豆甾醇、β-谷甾醇、常春藤皂苷元、金色酰胺醇酯、阿魏酸等;基础研究显示其作用机制可能与诱导细胞凋亡、调节免疫平衡有关。

关键词： 参芪白石汤   胃癌   GO富集分析   KEGG富集分析   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学方法、GEO数据库与分子对接,探讨参芪白石汤(SBD)治疗胃癌(gastric cancer,GC)的作用机制。方法SBD有效成分及相应靶点通过TCMSP数据库、Pubchem获取,根据《中药大辞典》补充成分,GC差异表达基因从GEO数据库搜索,筛选出GSE118916探针芯片数据集,采用STRING数据库构建PPI蛋白-蛋白互作网络,借助Metascape数据库对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析,利用THPA数据库获得核心基因的免疫组化结果及基因蛋白表达,再运用AutoDock分子对接软件对主要活性成分与核心靶点间的相互作用进行验证。结果获得参芪白石汤9味中药,经OB、DL初步筛选得到63种活性成分,对应930个潜在靶点。GO和KEGG功能富集分析显示,SBD通过平滑肌细胞增殖的调节、对肽的反应、凋亡过程的正向调节、血管相关平滑肌细胞增殖的调节等14个生物过程发挥作用,涉及癌症通路、肿瘤坏死因子信号通路、脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。核心基因蛋白的免疫组化显示ICAM1、PTGS2、PPARG在GC组织中呈强阳性表达,分子对接验证发现3-表齐墩果酸和槲皮素与核心靶点对接良好。结论多靶点药物SBD可能是一种很有前景的GC治疗候选药物,但还需要进一步的体内体外实验。

关键词： 扶阳解表颗粒   网络药理学   药效学   病毒性肺炎   分子对接   经方扶阳  

摘要： 目的:本研究旨在探究扶阳解表颗粒(FYJBKL)对病毒性感染肺炎的治疗作用机制。方法:利用网络药理学所建立的网络模式,研究FYJBKL病毒性肺炎的目标表达点,从而确定治疗病毒性肺炎的主要靶点和重要的信号传递途径。其次,将药品中的主要组成部分和主要靶点进行对接;然后,建立发热、发汗和炎症大鼠模型以探索FYJBKL的解热、发汗和抗炎作用机制;最后,采用ELISA法分析大鼠的血液样本IL‐17、IL‐1β、TNF‐α和IL‐6的含量;HE染色观察肺组织形态的变化。结果:173个节点、456条边,其中发挥成分有槲皮素、木犀草素、山奈酚等,主要机制靶点有IL‐17、IL‐1β、TNF‐α、IL‐6等。KEGG富集分析发现了30条信号路径(P<0.05),涵盖了白细胞介素17信号路径、人类巨细胞病毒感染路径、卡波氏肉瘤相关疱疹病毒感/染路径等。经过分子对接的研究,发现活性物质和可能的关键目标的联系效率良好。FYJBKL的高、中浓度组明显减少了炎症模式下大鼠血液中IL‐17、IL‐1β、TNF‐α、IL‐6的表达(P<0.05)。显著减轻蛋清所致的大鼠足肿胀,明显抑制酵母所致大鼠升高的体温;与正常组相比,FYJBKL使大鼠足跖部汗点数显著增高(P<0.05);HE染色显示FYJBKL均不同程度地改善肺组织纤维化及炎症渗出现象。结论:推测扶阳解表颗粒在抗病毒、抗免疫、抗炎症的相关信号通道以及生物细胞过程中的作用,很可能是由槲皮素、木犀草素、山奈酚等活性成分与其共享靶点的结合所引起的;扶阳解表颗粒可以改善病毒性肺炎引起的相关症状,其机制可能与炎症调节的多个靶点TNF、IL‐17以及IL‐6等相关通道的活性有关。

关键词： 雷公藤   关节病型银屑病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接的方法,研究雷公藤治疗关节病型银屑病的作用机制。方法 计算机检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取中药雷公藤的活性成分和对应靶点;应用GeneCards、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)、DrugBank数据库检索关节病型银屑病的疾病靶点,利用Venn软件获取药物与疾病共同靶点;采用Cytoscape3.7.2软件构建活性成分-靶点网络图;采用STRING数据库和Cytoscape3.7.2软件对交集靶点构建蛋白互作网络图(PPI)进行分析;应用DAVID蛋白数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析;最后采用AutoDock1.5.6软件对核心靶点及核心成分进行对接验证。结果 在中药雷公藤中获取了51个活性成分,414个有效作用靶点,疾病获取1 393个靶点,药物疾病共同靶点70个。PPI中有11个关键靶点包括信号转导和转录活化因子3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)和二聚体转录因子(JUN)等。GO功能富集发现356个条目,KEGG通路富集分析作用通路105个,主要涉及癌症的途径、TNF信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路等。分子对接验证显示核心靶点与核心活性成分有较强结合活性。结论 初步揭示了雷公藤治疗关节病型银屑病多成分、多靶点、多途径的作用机制,有助于为进一步研究提供依据。