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关键词： 网络药理学   肿瘤   血栓   信号通路  

摘要： 目的利用网络药理学探讨肿瘤与血栓的相互关系。方法从GeneCards、OMIM、CTD、TTD、DisGeNET和Drugbank等相关疾病数据库中获取了血栓和肿瘤的相关靶点信息。利用Venn在线网址构建了肿瘤与血栓的交集靶点,确定了它们之间共同的靶点集合。通过STRING在线平台获取了这些共同靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络图,并运用Cytohubba插件对网络进行筛选,识别了核心靶点。借助DAVID数据库,对这些共同靶点进行了基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析。这一系列分析有助于深入了解肿瘤与血栓之间的共同调控机制,为未来的治疗策略提供理论支持。结果从疾病数据库筛选得到680个血栓靶点和606个肿瘤靶点,其中89个是共同的。这些共同靶点,如TP53、EGFR、MYC、AKT1、VEGFA、STAT3、EGF、IL6、PTEN等,可能是肿瘤与血栓共同调控的关键靶点。这些靶点参与了522条生物学过程通路,主要富集在PI3K-AKT、Rap1、MAPK、Ras、癌症MicroRNA、FoxO等信号通路中,这为深入了解肿瘤与血栓调控机制提供了重要信息。结论肿瘤可能通过调节TP53、EGFR、EGF、MYC、AKT1、VEGFA、STAT3、IL6、PTEN等靶点,激活Rap1、MAPK、Ras、癌症MicroRNA、FoxO等信号通路,促进血栓形成;本研究分析了肿瘤与静脉血栓形成的分子机制,为药物的精准防治提供了理论支持。

关键词： 认知障碍   山茱萸   菟丝子   补肾填髓   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 利用网络药理学和分子对接方法探讨山茱萸-菟丝子治疗认知障碍的潜在作用机制。方法 利用TCMSP筛选山茱萸、菟丝子活性成分,并预测潜在靶点,从UniProt数据库获得药物成分对应靶点,通过TTD、GeneCards和OMIM数据库获取认知障碍相关靶点,利用R4.2.2软件获取山茱萸-菟丝子与认知障碍的共同靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点”网络,通过STRING11.5数据库构建共有靶点蛋白相互作用网络,利用R4.2.2软件进行GO功能及KEGG通路富集分析,利用AutoDock1.5.6、PyMoL2.4.0软件进行分子对接验证。结果 经过筛选共得到30个药物活性成分,184个药物-疾病交集靶点,通过GO功能和KEGG通路富集分析得到2 678个GO条目和179条信号通路。共同靶点的通路富集分析显示主要与PI3K-Akt、HIF-1α/VEGF等信号通路相关,分子对接结果显示,认知障碍核心靶点与山茱萸-菟丝子主要成分亲和力较好,可能有效自由结合。结论 山茱萸-菟丝子中槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇、四氢鸭脚木碱等成分可能通过抗氧化应激、抗炎及免疫调节、糖脂调节等作用治疗认知障碍。

关键词： 高血压   老年人   时辰药理学   马来酸左旋氨氯地平片   血压  

摘要： 目的 分析时辰药理学运用于老年高血压患者治疗中的价值。方法 选取2020年1月—2021年1月北京市海淀医院收治的老年高血压患者120例,按随机数字表法分为研究组和对照组,每组60例。研究组采取时辰药理学用药措施,对照组实施常规给药,2组均连续用药6个月。比较2组患者临床疗效,用药前后24 h、日间、夜间平均收缩压(24 hSBP、dSBP、nSBP)与24 h、日间、夜间平均舒张压(24 hDBP、dDBP、nDBP)、血脂指标[总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)]、相关指标[颈动脉厚度(IMT)、超敏C反应蛋白(hs-CRP)、血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)、一氧化氮(NO)、血管紧张素转化酶(ACE)及胰岛素样生长因子-1(IGF-1)]、症状积分,以及不良反应。结果 研究组患者总有效率为91.67%,高于对照组的78.33%(χ^(2)=4.183,P=0.041)。用药6个月后,2组患者24 hSBP、dSBP、nSBP与24 hDBP、dDBP、nDBP较用药前下降,TC、TG、LDL-C水平较用药前降低,且研究组低于对照组(P<0.05或P<0.01);2组患者IMT较用药前缩小,hs-CRP、AngⅡ、ACE及IGF-1水平较用药前降低,NO水平较用药前升高,且研究组上述指标变化幅度大于对照组(P<0.05或P<0.01);2组患者头痛、眩晕、腰膝酸软积分较用药前下降,且研究组低于对照组(P<0.01)。研究组不良反应总发生率为5.00%,低于对照组的16.67%(χ^(2)=4.227,P=0.040)。结论 时辰药理学在老年高血压治疗中效果显著,能够快速控制患者血压、血脂,缓解疾病症状,同时减轻炎性反应,不良反应少,安全性高。

关键词： 复方鹿茸健骨胶囊   老年性骨质疏松   网络药理学   分子对接  

摘要： 通过网络药理学来预测复方鹿茸健骨胶囊(CLJC)治疗老年性骨质疏松(Senile Osteoporosis,SOP)的作用机制。通过中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)、TCMID数据库、中国知网、PubMed和Web of Science等途径查阅相关文献,中药系统药理学数据库(TCMSP)检索CLJC的主要活性成分,ADME功能以及Uniprot数据库检索筛选CLJC的主要活性成分靶点;通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)检索SOP主要作用靶点;通过Venny2.1.0软件对药物靶点与疾病靶点取交集,两者交集即为CLJC治疗SOP潜在靶点;用STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI),并且构建PPI网络图;用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并通过Cytoscape 3.9.2软件构建“药物成分-靶点-疾病-通路”网络图;最后,通过Auto Dock Tools 1.5.7软件将核心活性成分与核心靶点进行分子对接,并进一步验证CLJC治疗SOP以及网络药理学所得出的结论。CLJC共筛选到89种活性成分,相对应的药物靶点有463个;SOP共筛选到972个疾病靶点;CLJC与SOP共有81个靶点,核心靶点有AKT1、TP53、CTNNB1、SRC、RXRA、ITGB3、SP1、MMP3、TNF、MMP9、MMP2、TGFB1、PPARG、FOS、IGF2、VEGFA和IL10等;GO分析显示,BP有激素反应(Response to hormone)、肽反应(Response to peptide)、细胞对氮化合物的反应(Cellular response to nitrogen compound)等;MF有信号受体调节器活性(Signaling receptor regulator activity)、信号受体激活器活性(Signaling receptor activator activity)、受体配体活性(Receptor ligand activity)等;CC有隔膜筏(Membrane raft)、膜微结构域(Membrane microdomain)、质膜筏(Plasma membrane raft)等;KEGG富集分析共得到164条通路,主要有癌症通路(Pathways in cancer)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、癌症蛋白聚糖(Proteoglycans in cancer)以及脂质和动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)等;分子对接验证核心活性成分与核心靶点都表现出良好的对接活性。本研究证实了CLJC中的quercetin成分与AKT1和TP53靶蛋白相互作用,通过Pathways in cancer、MAPK signaling pathway等信号通路多成分、多靶点、多通路治疗SOP。

关键词： 继发性闭经   川牛膝   槲皮素   ESR1   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨川牛膝治疗继发性闭经(secondary amenorrhea, SA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索川牛膝的活性成分及作用靶点,从GeneCards数据库获取SA的疾病靶点,采用R软件得到两者的交集靶点。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,通过Cytoscape 3.8.2软件进行聚类分析和拓扑分析从而筛选核心靶点。应用R软件进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析(P<0.05)。最后,采用Autodock Vina软件进行分子对接验证。结果:川牛膝活性成分4个,即槲皮素、β-谷甾醇、甜菜素、红苋甾酮;川牛膝作用靶点178个,SA相关靶点1 366个,两者的交集靶点56个;基于Network Analyzer插件的拓扑分析筛选得到9个核心靶点,包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threorine protein kinase, AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen activated protein kinase 1,MAPK1)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)等。GO功能分析主要涉及对类固醇激素的反应、活性氧代谢过程、上皮细胞增殖等;KEGG通路135条,主要包括HIF-1信号通路、内分泌抵抗、雌激素信号通路等。分子对接显示,活性成分(槲皮素、β-谷甾醇)与核心靶点(AKT1、MAPK1)具有较好的结合活性。结论:川牛膝治疗SA具有多成分、多靶点、多途径的特点,其可能通过槲皮素、β-谷甾醇等成分作用于AKT1、MAPK1、ESR1等靶点,调控雌激素信号通路、内分泌抵抗等通路。

关键词： 网络药理学   分子对接   肺力咳合剂   支原体肺炎  

摘要： 目的:肺力咳合剂是临床治疗支原体肺炎(mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)的中成药,但作用机制尚未被阐明。本研究基于网络药理学与分子对接研究肺力咳合剂治疗MPP的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)结合相关文献筛选出药材的活性成分和靶蛋白,利用DisGeNET、Genecards、比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenonmics Database,CTD)等数据库查找疾病相关基因。获得交集基因后构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络,针对PPI网络进行网络拓扑分析和靶点筛选,从而获得肺力咳合剂治疗MPP的关键靶点,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。综合上述信息,构建药材-成分-靶点-通路-疾病网络,以探讨肺力咳合剂治疗MPP的作用机制。最后,采用分子对接验证网络中的关键成分和关键靶点。选择60例MPP患儿为研究对象,随机分为观察组和对照组(各30例),2组均给予阿奇霉素治疗,观察组在此基础上给予肺力咳合剂治疗,观察治疗对白细胞介素(interleukin,IL)-17信号通路相关炎症因子的影响。结果:共获得肺力咳合剂成分73种,靶点364个,MPP靶点437个和交集基因92个。肺力咳合剂治疗MPP的52个主要靶点包括RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、IL-6、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factorα,TNF-α)、细胞肿瘤抗原p53(cellular tumor antigen p53,TP53)等,它们参与氧化应激反应与细胞增殖、分化、凋亡过程的调控,主要通过IL-17信号通路、TNF-α信号通路、Th17细胞分化等信号通路影响MPP的治疗。分子对接结果显示:大多数分子与蛋白质对接的结合能力较好,结合能力小于−7 kcal/mol(1 kcal/mol=4.184 kJ/mol),其中丹参酮IIA与AKT1的结合能力最强(−11.9 kcal/mol)。治疗前2组患儿IL-17、IL-6、TNF-α水平差异均无明显统计学意义(均P>0.05),而治疗后与对照组比较,观察组患者IL-17、IL-6、TNF-α水平差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论:肺力咳合剂治疗MPP具有多成分、多靶点、多途径的作用规律,可能通过槲皮素、汉黄芩素、丹参酮IIA、谷甾醇、阿魏酸等主要成分作用于AKT1、IL-6、TNF-α等靶点,从而作用于IL-17等信号通路发挥其多成分、多靶点、多通路的治疗优势。

关键词： 卒中后抑郁   柴胡   网络药理学   分子对接   机制  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁(Post-stroke Depression,PSD)的潜在活性成分和可能的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和蛋白质序列数据库(Uniprot)筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果:共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接结果显示,牵牛花色素与糖原合成酶激酶3β(Glycogen Synthase Kinase 3 Beta,GSK3B),异鼠李素与雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、GSK3B,山柰酚与半胱氨酸蛋白酶(Caspase 3,CASP3),槲皮素与白细胞介素-10(Interleukin-10,IL-10)、基质金属蛋白酶9(MatrixmetalloProteinase 9,MMP9)、胰岛素样生长因子结合蛋白3(Insulin Like Growth Factor Binding Protein 3,IGFBP3)、CASP9均结合稳定。结论:柴胡活性成分牵牛花色素、异鼠李素、山柰酚、槲皮素,可能通过脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等信号通路作用于GSK3B、ESR1、CASP3、IL-10、MMP9、IGFBP3、CASP9等核心靶点,发挥治疗PSD的疗效,初步预测了柴胡对PSD的作用机制。

关键词： 葛花   心肌缺血   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的探讨葛花治疗心肌缺血(MI)的潜在机制。方法在TCMSP数据库检索葛花的活性成分和靶点,使用Cytoscape构建葛花-活性成分-靶点网络图。通过DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库筛选MI的靶点。通过制作葛花靶点和MI靶点的韦恩图得到共同靶点,在STRING数据库中对其进行网络构建,然后将其可视化。使用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,将其可视化取KEGG富集分析的前20条信号通路,构建信号通路与靶点之间的网络图。选择前5个活性成分及其对应的前10个靶点进行分子对接。结果葛花的活性成分16个,成分靶点142个,MI的靶点2327个,取交集后共得到葛花治疗MI的靶点51个,其中核心靶点是INS、EDN1和IL10等,GO富集分析确定了171个与之发生发展密切相关的生物过程,KEGG富集分析确定了38条信号通路,GO和KEGG富集分析提示葛花主要通过补体和凝血级联反应通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、MAPK等信号通路发挥作用。分子对接表明葛花的活性成分与其相应靶点具有良好的结合力。结论本研究通过网络药理学初步揭示葛花多成分、多靶点、多通路治疗MI的作用机制,可能与细胞的增殖与凋亡、基因表达调控、氧化应激、炎症反应等途径相关,可为临床研究提供参考。

关键词： 毛菊苣   肝纤维化   网络药理学   分子对接   实验验证  

摘要： 目的采用网络药理学和实验验证的方法探究毛菊苣抗肝纤维化的作用机制。方法借助TCMSP、Pubchem、SwissTargetPrediction、Genecards等数据库构建“成分-靶点-通路”作用网,STRING数据库预测毛菊苣抗肝纤维化作用靶点,应用DAVID数据库进行KEGG和GO富集分析,AUTODOCK对活性成分和关键靶点进行分子对接。用PDGFBB诱导活化细胞,验证秦皮甲素、秦皮乙素、菊苣酸、咖啡酸、绿原酸和异绿原酸等6个化合物对HSC-T6细胞的增殖、凋亡以及对肝纤维化指标的影响,Western blotting检测各成分对HSC-T6细胞中Ras、ERK1、ERK2、C-fos、JNK蛋白表达。结果网络药理学筛选到成分与肝纤维化的共同靶点239个,PPI分析显示SRC、STAT3、HSP90AA1等靶点为关键靶点,KEGG分析结果显示毛菊苣影响的通路包括癌症通路、代谢通路等,GO分析预测毛菊苣主要影响信号转导等过程,分子对接结果显示与成分能够良好结合的靶点蛋白为MAPK1,与蛋白能够良好结合的成分为秦皮乙素、咖啡酸和绿原酸。6种化合物对PDGF-BB诱导HSC-T6细胞活化增殖的抑制作用均强于模型组,且均具有逆转肝纤维化指标的作用,其中秦皮乙素活性最强(P<0.01)。与模型组相比,6种化合物干预后HSC-T6细胞中的Ras、ERK1、ERK2、C-fos、JNK表达量均有所下降。结论毛菊苣中各成分均有不同的抗肝纤维化作用,其作用与抑制ERK/RAS通路激活的有关。

关键词： 药理学   课程思政   阿司匹林   对乙酰氨基酚  

摘要： 立德树人是高校办学的根本任务,如何将思政教育与专业知识教育有机融合,是当前高校教育改革的首要目标。本文以药理学课程中“解热镇痛抗炎药”章节教学为例,从教学内容、教学目标、教学设计、教学过程等方面入手,对药理学专业知识讲述与思政元素渗透相结合的问题进行初步探讨,以期为药理学课程思政建设提供参考。