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关键词： 网络药理学   分子对接   脓毒症   刺梨  

摘要： 目的:借助网络药理学及分子对接技术探讨刺梨干预脓毒症的作用机制,为扩大刺梨用药范围提供依据.方法:通过文献研究及Swiss数据库筛选刺梨活性成分并分析相关作用蛋白靶点,借助OMIM、Gene Cards、DRUG BANK、DisGeNet等数据库分析脓毒症基因靶点并取交集;借助STRING数据库及CytoScape软件构建PPI网络关系并得到刺梨干预脓毒症关键靶点;借助Metascape数据库进行生物富集分析;使用Schrödinger软件进行核心化合物-蛋白分子对接.结果:得到刺梨核心化合物为57个,涉及132个蛋白靶点,其中与脓毒症相关核心靶点为AKT1、PIK3R1、SRC等;在60组分子对接结果中,所有对接分数均<-4,表明多数化合物-蛋白有较大结合能;KEGG富集分析结果显示关键通路为Phospholipase D signaling pathway和Endocrine resistance pathway.结论:刺梨干预脓毒症依靠多通路、多靶点协调作用,其主要活性成分为槲皮素、鞣花酸、木犀草素,通过AKT1、PIK3R1、SRC等蛋白作用与Phospholipase D signaling pathway和Endocrine resistance pathway等通路发挥治疗脓毒症的干预作用.

关键词： 散结通脉方化裁方   动脉粥样硬化   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学方法探讨散结通脉方化裁方治疗动脉粥样硬化潜在作用机制。方法 从TCMSP数据库检索散结通脉方化裁方活性成分及其靶点;通过GeneCards、OMIM和DrugBank数据库收集动脉粥样硬化相关靶点;将药物与疾病靶点取交集;使用STRING数据库构建交集靶点蛋白相互作用(PPI)网络并通过Cytoscape3.7.2软件筛选关键靶点。利用在线软件DAVID进行GO功能和KEGG富集分析。结果 检索并筛选获得散结通脉方化裁方活性成分85个,潜在靶点648个,动脉粥样硬化疾病相关靶点1 439个,获得交集靶点131个;筛选得到散结通脉方化裁方治疗动脉粥样硬化疾病的关键成分5个,包括槲皮素、木犀草素、人参皂苷Rg2、丹参酮ⅡA、隐丹参酮等;PPI网络显示关键靶点为VEGFA、AKT1、STAT3、TNF、IL6等;GO富集共得出631条生物过程,104条分子功能和61条细胞组分;KEGG通路富集分析共得出153条,包括癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体切应力和动脉粥样硬化等。结论 本研究初步揭示了散结通脉方化裁方多成分、多靶点、多途径治疗动脉粥样硬化的科学内涵,为该方的临床开发利用提供了依据,并进一步深化“瘀能化水”理论认识。

关键词： 阿尔茨海默病   丁苯酞   多奈哌齐   网络药理学   药物靶点   疾病基因靶点   潜在作用机制  

摘要： 目的研究多奈哌齐联合丁苯酞治疗阿尔茨海默病(AD)的疗效与潜在作用机制。方法采用网络药理学方法,利用疾病及药物数据库中获取AD和丁苯酞、多奈哌齐的作用靶点,将其导入到STRING11.0数据库中,得到潜在作用靶点的PPI网络图,并结合Cytoscape3.8.1软件和cytoHubba插件筛选排名前10的核心基因,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,以深入研究多奈哌齐联合丁苯酞在治疗AD中的潜在作用机制。结果共获得联合药物靶点249个;1236个疾病基因靶点,获得77个药物-疾病交集靶点,排名前10的Hub基因为IL1B、PTGS2、STAT3、EGFR、MMP9、CCL2、IGF1、GSK3B、JAK2、ICAM1。GO富集和KEGG富集分析发现,这些靶点主通过抗炎、抗氧化应激、调节受体活性,改善神经信号传递、调节酶活性、保护血脑屏障、逆转突触可塑性、抑制神经细胞凋亡等多种途径来达到协同多奈哌齐有效治疗AD。结论多奈哌齐联合丁苯酞有效治疗AD的主要机制包括协同作用以及通过更多作用靶点和信号通路来实现抗炎、抗氧化应激、改善血管储备功能、抑制细胞凋亡等多重机制。

关键词： 丹参   活血祛瘀   胸肋胁痛   临床应用  

摘要： 活血调经药物丹参具有活血祛瘀、通经止痛、清心除烦、凉血消痈的功效。其临床主要应用于胸肋胁痛,心烦不眠、月经不调,产后瘀痛。现代药理研究发现,丹参有效成分可分为丹参酮、丹参醇、丹参酚等脂溶性成分及丹参素、丹参多酚酸等水溶性成分,其有效成分具有抗血小板聚集、降脂、抗血栓、抗肿瘤、抗炎、抗肝纤维化等多种功效。对心脑血管系统、呼吸系统、消化系统等具有一定作用。《药典》丹参用量为10 g~15 g,孕妇、月经过多者、无瘀血者禁用,脾胃虚弱者不宜长期使用。此外,丹参也不宜与藜芦配伍使用。本文通过总结丹参的临床应用和药理学研究,以期为丹参的进一步研究提供参考。

关键词： 稿件署名   授权书   journal   通讯作者   单位公章   投稿   温馨提示   版权  

摘要： 结合本刊的稿约及平时常见的问题,编辑部温馨提示:1.在线(http://***)投稿成功后,请尽快在线上传“版权专有使用授权书”,编辑部收到全部材料后方开始稿件的处理工作。2.“版权专有使用授权书”可在本刊网站的“投稿指南”下载;签名作者的顺序一定要与稿件署名顺序一致;不方便签字者,可由第一作者或通讯作者代签;加盖单位公章。

关键词： 数据图表   复制粘贴   化学结构式   图数据   作图软件   典型病变   电泳图   双击  

摘要： 1.论文中的病理照片、电泳图及化学结构式图等要求以“插入”→“图片”方式插入word文档,不要使用复制粘贴。病理照片必须加标尺,并以箭头指示典型病变位置。除照片外,其他图尽量不用彩色。2.统计的数据图表(包括线图和柱图等)一般通过“插入”→“图表”方式插入word文档,双击该图即可直接进入此图的作图软件,看到作图数据。

关键词： 口腔鳞状细胞癌   改良增生平   网络药理学   凋亡  

摘要： 目的 探究改良增生平(Modified Zeng-Sheng-Ping,ZSP-M)抑制口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的作用机制。方法 利用网络药理学分析获得ZSP-M与OSCC的交集靶点,进行GO和KEGG富集分析;通过细胞实验研究ZSP-M对OSCC细胞增殖、克隆形成、迁移、侵袭、凋亡等生物学行为的影响,Western blot验证相关靶点蛋白的表达。结果 ZSP-M与OSCC交集靶点168个,在肿瘤和炎症-免疫相关通路富集;ZSP-M呈剂量依赖性抑制SCC7和CAL27细胞克隆形成、迁移和侵袭,促进凋亡和Caspase-3酶释放,对增殖抑制作用不明显;ZSP-M呈剂量依赖性抑制SCC7和CAL27细胞AKT、ERK1/2和P65蛋白的磷酸化。结论 ZSP-M对OSCC的抑制作用呈现多靶点、多途径的特点,本研究为中西医结合防治口腔癌提供了科学依据。

关键词： 王浆酸   结肠肿瘤   SW620细胞   细胞凋亡   糖原合成酶激酶3β   β-连环蛋白  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨王浆酸(10-HDA)对人结肠癌SW620细胞增殖和迁移的影响,阐明其相关分子机制。方法:利用中药系统药理学(TMSCP)数据库和中医药综合数据库(TCMID)以关键词“蜂王浆”进行检索得到10-HDA等活性成分及对应靶点,采用Swiss Target Prediction数据库预测小分子靶点。采用Gene Cards数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库以关键词“Colon Cancer”获得靶点,利用String数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,筛选核心靶点;利用Metascape数据库对基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集分析,筛选特有成分10-HDA进行体外活性实验。将生长状态良好的人结肠癌SW620细胞分为对照组和不同剂量(1、5、10、15和20 mmol·L^(-1))10-HDA组,采用MTT法检测各组细胞活性并计算细胞存活率。SW620细胞分为对照组、低剂量(5 mmol·L^(-1))10-HDA组、中剂量(10mmol·L^(-1))10-HDA组和高剂量(15mmol·L^(-1))10-HDA组,Hoechst33342染色法观察各组细胞形态表现,细胞划痕实验检测各组细胞划痕愈合率,流式细胞术检测各组不同细胞周期细胞百分率,生化法检测各组细胞中总抗氧化能力(T-AOC)和超氧化物歧化酶(SOD)活性,Western blotting法检测各组细胞中B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase-3)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶9(Caspase-9)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、β-连环蛋白(β-catenin)和细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)蛋白表达水平。结果:TCMSP数据库筛选得到蜂王浆6种活性成分,10-HDA治疗结肠癌核心靶点28个。GO功能富集分析主要涉及细胞增殖和细胞凋亡等信号通路;KEGG信号通路富集分析涉及细胞周期、前列腺癌、细胞衰老和p53等信号通路,GSK3β/β-catenin信号通路与细胞周期有密切关联。与对照组比较,5、10、15和20 mmol·L^(-1)10-HDA组细胞存活率呈剂量依赖性降低(P<0.05或P<0.01)。与对照组比较,不同剂量10-HDA组细胞中凋亡细胞数明显增多,细胞划痕愈合率明显降低(P<0.05或P<0.01),中和高剂量10-HDA组细胞中S期细胞百分率明显升高(P<0.05或P<0.01),不同剂量10-HDA组细胞中T-AOC和SOD活性明显降低(P<0.05或P<0.01)。与对照组比较,低剂量10-HDA组细胞中Bcl-2蛋白表达水平明显降低(P<0.01),GSK3β蛋白表达水平明显升高(P<0.05);与对照组比较,中和高剂量10-HDA组细胞中Bax、Caspase-3、Caspase-9和GSK3β蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01),Bcl-2、β-catenin和Cyclin D1蛋白表达水平明显降低(P<0.01)。结论:10-HDA可明显抑制结肠癌细胞增殖和迁移,并可促进结肠癌细胞的凋亡和氧化水平,其作用机制可能与激活GSK3β/β-catenin信号通路有关。

关键词： 鼻咽癌   网络药理学   分子对接   白屈菜   MAPK信号通路   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术预测白屈菜抗鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)的作用靶点和机制,并通过实验验证主要活性成分对NPC细胞增殖和凋亡的影响。方法借助在线数据平台TCMSP、ETCM和BATMAN-TCM检索白屈菜的化学成分和作用靶点。通过GEO数据库检索NPC相关靶点,生信在线工具分析白屈菜与NPC的交集靶点。使用STRING构建共同靶点的PPI网络,运用Cytoscape 3.7.1获得核心靶点。通过R软件编程进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。分子对接分析核心靶点与主要活性成分之间的结合情况。实验验证:(1)将5-8F细胞分为溶剂对照组、血根碱(2.5μmol·L^(-1)、5μmol·L^(-1))组、白屈菜红碱(2.5μmol·L^(-1)、5μmol·L^(-1))组、顺铂4μg·mL^(-1)组。MTT检测白屈菜主要活性成分对NPC细胞增殖的影响。(2)将5-8F细胞分为溶剂对照组、血根碱5μmol·L^(-1)组、白屈菜红碱5μmol·L^(-1)组、顺铂4μg·mL^(-1)组;Annexin-V FITC/PI双荧光染色法检测细胞凋亡;Western blot检测白屈菜主要活性成分对NPC细胞增殖、凋亡、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)和磷脂酰肌醇三激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)信号通路关键蛋白的影响。结果检索得到白屈菜37个主要活性成分和1419个作用靶点。检索GEO数据库共收集到7852个NPC疾病基因,白屈菜与NPC共有327个交集靶点,其中核心靶基因共10个,分别是EGFR、TP53、VEGFA、TNF、FN1、MMP9、JUN、FGF2、LYN、F2。GO分析主要涉及泛素蛋白连接酶结合、硫化物结合、整合素结合、肝素结合和糖胺聚糖结合,KEGG分析主要涉及MAPK、PI3K/AKT信号通路等,分子对接结果显示核心靶点与对应的活性成分具有良好的结合能力。实验验证显示,与溶剂对照组相比,血根碱和白屈菜红碱均明显降低NPC细胞相对增殖率(P<0.01),并提高细胞凋亡率(P<0.01),且血根碱和白屈菜红碱降低5-8F细胞中XIAP、PCNA、ERK1/2、AKT的蛋白表达水平(P<0.05或P<0.01)。结论白屈菜可通过多成分、多靶点和多通路发挥抗NPC的作用,且经实验验证,血根碱和白屈菜红碱均可抑制NPC细胞增殖并诱导凋亡,其机制可能与MAPK信号通路、PI3K/AKT信号通路有关。

关键词： 聚精助育汤   不育症   网络药理学  

摘要： 目的聚精助育汤为临床治疗不育症的自拟复方,疗效确切,其药效机制尚未阐明。方法利用TCMSP数据库收集聚精助育汤的化合物及其靶点,利用Gencards数据库收集不育症相关疾病靶点,利用STRING11.0数据库分析聚精助育汤-不育症共同靶点的蛋白质相互作用(PPI),应用Cystoscape 3.8.0软件进行核心基因的筛选,GO的生物过程(biological process,BP)、分子功能(molecular function,MF)、细胞组分(cell component,CC)富集分析,使用String数据库,使用R 4.0.3软件,绘制气泡图、柱状图。将成分-疾病-通路-靶点等导入系统进行通路网络图的绘制。结果经过检索、筛选,共获得聚精助育汤化合物248个,化合物潜在靶点2238个,不育症相关疾病基因1369个,聚精助育汤-不育症共同靶点185个。网络药理学分析结果表明,槲皮素、木犀草素、山奈酚、γ-氨基丁酸等是聚精助育汤的主要活性成分,ESR1、IL2、FOS、NFE2L2等是聚精助育汤治疗不育症的主要靶点,共同靶点富集于PI3K-AKt等多个信号通路,调节细胞、凋亡、基因转录等生物学过程。结论初步确定了聚精助育汤治疗不育症的机制及作用靶点,为后续研究提供参考。