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关键词： 自拟参藤三黄汤   糖尿病肾病   网络药理学研究  

摘要： 目的:基于网络药理学研究方法,探究自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病的可能作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台筛选自拟参藤三黄汤的生物活性成分,并预测其靶点,应用Genecards数据库分别收集糖尿病肾病的疾病靶点,利用在线韦恩图绘制平台对自拟参藤三黄汤与糖尿病肾病的靶点进行映射,运用STRING平台及Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络,筛选获得核心靶点;进一步进行京都基因与基因组百科全书通路富集和基因本体富集分析,探究可能的生物过程与信号通路;应用Cytoscape软件筛选自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病的关键成分,并构建“药物-成分-靶点-通路”网络。结果:预测得到自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病的关键成分是钙、酪氨酸、谷胱甘肽、丝氨酸、类黄酮类物质等;核心靶点是ESR1、TP53、SP1、STAT3等19个靶点。GO和KEGG富集分析结果显示,自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病主要涉及蛋白质摄取、紫外线反应、细胞对氧化应激的反应、转录调节复合体、周期蛋白依赖性蛋白激酶全酶复合体、磷酸酶绑定、蛋白磷酸酶结合、HIF1信号通路、甲状腺激素信号通路、HIF1信号通路等多个信号通路和靶点。结论:自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病具有“多成分-多靶点-多途径”的特点与优势,本研究为进一步研究自拟参藤三黄汤治疗糖尿病肾病的物质基础与分子机制提供了理论依据。

关键词： 当飞利肝宁胶囊   慢性乙型肝炎   HBV DNA   肝脏硬度值   网络药理学  

摘要： 目的观察当飞利肝宁胶囊治疗慢性乙型肝炎(CHB)患者的临床疗效,并预测其作用机制。方法收集2019年8月-2020年12月昆明市第三人民医院诊治的98例CHB患者,按随机数字表法分为对照组和观察组各49例,对照组给予恩替卡韦进行治疗,观察组给予当飞利肝宁胶囊联合恩替卡韦治疗,疗程为24周。观察两组患者治疗前后肝功能指标如总胆红素(TBIL)、血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、谷氨酰基转移酶(GGT)、乙肝e抗原(HBeAg)转阴率、HBV DNA载量及肝脏硬度值(LSM)值的变化;再基于网络药理学的方法,对当飞利肝宁胶囊治疗CHB的作用进行理论论证。结果治疗后,对照组TBIL、ALT、AST和GGT分别为(20.61±10.17)μmol/L、(53.28±17.90)U/L、(49.32±15.24)U/L和(41.97±13.34)U/L,HBeAg转阴率为24.49%,HBV DNA载量为(3.34±1.25)log10copies/mL,LSM值为(8.95±1.14)k Pa;观察组TBIL、ALT、AST和GGT分别为(18.75±9.76)μmol/L、(49.74±18.25)U/L、(46.19±17.63)U/L和(39.28±14.11)U/L,HBeAg转阴率为30.61%,HBV DNA载量为(2.07±1.18)log10copies/mL,LSM值为(7.43±1.06)k Pa;与对照组比较,观察组肝功能指标TBIL、ALT、AST和GGT较对照组降低,但差异均无统计学意义(t=0.924、0.969、0.940、0.970,P均>0.05)。观察组HBV DNA载量和LSM值均明显低于对照组,差异均有统计学意义(t=5.172、6.835,P均<0.05)。当飞利肝宁胶囊筛选得到40个活性成分,可能通过作用于信号传导与转录激活因子3(STAT3)、转录因子JUN、促分裂素原活化蛋白激酶1(MAPK1)等靶点调控CHB相关通路而发挥临床疗效。结论当飞利肝宁胶囊联合恩替卡韦治疗慢性乙型肝炎患者,可以有效改善患者肝功能,降低HBV DNA载量,还可以明显降低LSM值,改善肝脏纤维化程度,这可能是其起效的作用机制。

关键词： 尿毒清颗粒   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:探讨尿毒清颗粒治疗糖尿病肾病的潜在机制。方法:利用TCMSP数据库及文献收集筛选UCG活性成分及作用靶点,通过TTD、OMIM、GeneCards、drugbank及DisGeNET平台筛选DN相关靶点,并与UCG作用靶点取交集;通过STRING平台获得蛋白互作关系,借Cytoscape3.8.0可视化并分析提取UCG治疗DN的关键靶点;通过DAVID 6.8进行GO和KEGG富集分析;运用AutoDock Tools和Pymol对主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:共获得UCG活性成分248个,其中主要活性成分有槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山奈酚等,DN潜在靶点1813个,二者交集靶点156个,网络拓扑分析获得17个关键靶点,选取JUN、SRC、MAPK1作为核心靶点。GO功能富集分析的生物过程主要涉及细胞对信号转导、活性氧的调控、凋亡过程的调控等;KEGG通路富集分析包括流体剪切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号转导通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、MAPK信号通路等。分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山奈酚与3个核心靶点均具有较好的结合活性。结论:UCG可能通过槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、山奈酚等多种活性成分作用于多个靶点,参与调节多信号通路,发挥抗炎、抗氧化应激、抑制细胞凋亡等作用,发挥保护肾功能治疗DN的作用。

关键词： 蛋鸡   肠道炎症   博普总碱散   网络药理学   转录组学   PI3K-Akt  

摘要： 为探究博普总碱散改善蛋鸡肠道炎症的作用机制,将试验鸡分为对照(Control)组和博普总碱散(BP)组,结合qRT-PCR检测十二指肠、空肠和回肠的TNF-α、IL-1β、NF-κB、IL-8和IL-10基因相对表达量,并结合网络药理学和转录组学联合分析。试验发现:BP组产蛋率显著升高(P<0.05),料蛋比显著下降(P<0.05);BP组十二指肠IL-8相对表达量显著下降(P<0.05),TNF-α、IL-1β、和NF-κB基因相对表达量极显著下降(P<0.01),IL-10基因相对表达量显著升高(P<0.05),空肠NF-κB基因相对表达量显著下降(P<0.05),TNF-α、IL-1β和IL-8基因相对表达量极显著下降(P<0.01),回肠IL-1β基因相对表达量显著下降(P<0.05),TNF-α、IL-8基因相对表达量极显著下降(P<0.01);十二指肠网络药理学和转录组学的KEGG通路富集结果均包含PI3K-Akt信号通路。结果表明:博普总碱散可通过抑制PI3K-Akt信号通路,改变肠道炎症因子的表达量从而改善蛋鸡肠道炎症。该研究可为博普总碱散在畜禽业的应用提供指导。

关键词： 三七   乳腺癌   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨三七治疗乳腺癌的机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查询三七的有效成分及作用靶点,通过DisGeNET平台查询乳腺癌靶点。对药物作用靶点和疾病靶点的交集进行蛋白质相互作用网络(PPI)分析、基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选出三七有效成分8种包括槲皮素、人参皂苷rh2和β-谷甾醇等,与其相对应的靶点有182个。乳腺癌相关靶点539个,药物与疾病交集靶点54个。PPI分析得出肿瘤蛋白P53(TP53)、蛋白激酶B1(AKT1)和雌激素受体1(ESR1)等可能是三七治疗乳腺癌的核心靶点。三七核心成分均能与上述核心靶点有较好的结合活性。GO富集分析和KEGG富集分析显示,三七通过518个GO条目、128条通路发挥乳腺癌的治疗作用。结论三七通过多种有效成分、多靶点、多通路发挥乳腺癌的治疗作用。

关键词： 心律失常   缓慢性   麻黄附子细辛汤   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨麻黄附子细辛汤治疗缓慢性心律失常的作用机制。方法:通过TCMSP数据库结合OB、DL、HL检索麻黄附子细辛汤中麻黄、附子、细辛的化学成分和作用靶点,并通过Uniprot数据库将靶点校正为基因名,运用GeneCards数据库获取缓慢性心律失常的相关靶点与基因。通过Venny图将缓慢性心率失常的靶点和药物靶点进行分析,筛选出交集靶点,并借助Cytoscape 3.6.1软件构建化合物靶点相互作用图;根据STRING数据库构建蛋白质相互作用的PPI网络图;利用David数据库对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:筛选出麻黄附子细辛汤治疗缓慢性心律失常的36个有效活性成分,关键化合物为槲皮苷和山柰酚;与治疗缓慢性心律失常相关的靶点65个,主要靶点有IL-6、TNF、VEGFA、CXCL8、IL-1B等,主要涉及腺苷酸环化酶激活肾上腺素能受体信号通路、一氧化氮生物合成过程的正向调节、去甲肾上腺素-肾上腺素血管收缩参与全身动脉血压的调节、血管生成的积极调节等生物工程,通过参与TNF、Toll样受体、钙、cGMP-PKG等信号通路治疗缓慢性心律失常。结论:该研究从多角度探索了麻黄附子细辛汤治疗缓慢性心律失常的可能作用机制,认为麻黄附子细辛汤通过多成分、多靶点、多途径治疗缓慢性心律失常,为临床上治疗该病提供了有力的依据。

关键词： 射麻止喘液   中性粒细胞型哮喘   网络药理学   NLRP3   CXCR2   mTOR信号通路   小鼠  

摘要： 目的基于网络药理学及体内实验探讨射麻止喘液治疗中性粒细胞型哮喘(NA)的分子机制。方法(1)利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、文献检索及Swiss ADME、Swiss Target Prediction数据库检索、筛选射麻止喘液的活性成分及其作用靶点。利用OMIM、Gene Cards、Dis Ge NET及Drug Bank数据库检索、筛选NA疾病相关靶点。通过微生信平台对射麻止喘液活性成分作用靶点与NA疾病相关靶点取交集,得到射麻止喘液治疗NA的潜在作用靶点(共有靶点)。采用Cytoscape 3.8软件构建“中药-活性成分-潜在作用靶点”网络。通过STRING数据库建立潜在作用靶点蛋白互作(PPI)网络,使用内置Mcode插件分析获得核心靶点。使用Metascape平台对潜在作用靶点进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。(2)将BALB/C小鼠适应性喂养1周后,随机分为空白组、NA模型组、射麻止喘液低剂量组(2.5 g·kg^(-1))、射麻止喘液高剂量组(10 g·kg^(-1))、地塞米松对照组(1 mg·kg^(-1));通过腹腔注射致敏剂[鸡卵清白蛋白(OVA)+弗氏完全佐剂(CFA)]并通过雾化吸入激发的方法复制NA小鼠模型,第0、7、14天分别腹腔注射OVA+CFA(20μg OVA+75μg CFA,0.3 m L)致敏,第21~30天采用5%OVA混悬液雾化激发(每次8 m L,每次雾化时间40 min,每天1次);雾化激发前1 h各组灌胃给药,地塞米松对照组腹腔注射给药,每天1次。采用HE染色法观察小鼠肺组织病理变化;ELISA法检测肺泡灌洗液中IL-8含量;RT-q PCR法检测肺组织中NLRP3、CXCR2 m RNA表达水平;免疫组化法检测肺组织中p-m TOR蛋白表达水平。结果(1)共筛选得到射麻止喘液活性成分作用靶点826个,NA疾病相关靶点154个,取交集后得到射麻止喘液治疗NA的51个潜在作用靶点(共有靶点)。通过“中药-活性成分-潜在作用靶点”网络分析得到槲皮素、木犀草素、山柰酚、豆甾醇、柚皮素等关键活性成分。通过对潜在作用靶点的PPI网络分析得到29个核心靶点,包括AKT1、IL6、TNF、EGFR、NLRP3、RELA、MIF、CXCR2、VEGFA等。GO功能富集分析得到882个生物学过程条目、33个细胞组分条目、61个分子功能条目;KEGG通路富集分析得到142条信号通路,主要涉及TNF信号通路、甲型流感信号通路、Toll样受体通路、MAPK信号通路、m TOR信号通路等。(2)动物实验结果:与空白组比较,NA模型组小鼠的气道黏膜损伤明显,结构紊乱,有大量炎性细胞浸润,黏膜充血、水肿,肺泡壁明显增厚,肺泡腔缩小;肺泡灌洗液中的炎症因子IL-8水平明显升高(P<0.05);小鼠肺组织NLRP3、CXCR2 m RNA表达显著上调(P<0.01),p-m TOR蛋白表达水平明显升高。与NA模型组比较,射麻止喘液低、高剂量组小鼠肺组织支气管上皮细胞结构排列可见少许紊乱,气管及血管周围有少量的炎性细胞浸润,支气管黏膜充血水肿明显减轻;小鼠肺组织CXCR2 m RNA表达显著下调(P<0.01),p-m TOR蛋白表达水平明显降低。射麻止喘液高剂量组小鼠肺泡灌洗液中的IL-8水平明显降低(P<0.05);射麻止喘液低剂量组小鼠肺组织NLRP3m RNA表达明显下调(P<0.05)。结论射麻止喘液对NA的治疗作用可能是通过槲皮素、木犀草素、山柰酚等关键活性成分,作用于NLRP3、CXCR2等核心靶点,调控TNF信号通路、MAPK信号通路、Toll样信号通路、m TOR等关键信号通路来实现的。

关键词： 参麻颈复颗粒   脑梗死   网络药理学  

摘要： 目的应用网络药理学的研究方法探索中药复方参麻颈复颗粒治疗脑梗死的物质基础及其作用机制。方法通过TCMSP数据库、ETCM数据库、中医药资料库检索参麻颈复颗粒中潜在活性成分及作用靶点;OMIM数据库检索脑梗死相关靶蛋白基因,采用交集法获得参麻颈复颗粒与脑梗死的共同靶点基因。运用Cytoscape构建“参麻颈复活性成分-靶点”网络,利用STRING数据库构建PPI网络,采用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果筛选出参麻颈复颗粒的183个潜在有效成分,在TCMSP数据库中筛选到1785个潜在靶点蛋白,其中与脑梗死有关的作用靶点30个,这些靶点基因主要参与炎症反应和细胞凋亡过程,涉及TNF信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路等。结论参麻颈复颗粒对脑梗死的治疗作用可能与调控炎症反应、改善受损神经功能、保护脑缺血再灌注损伤有关。

关键词： 白术   网络药理学   氧化应激   分子对接   活性成分   作用机制  

摘要： 试验基于网络药理学和分子对接技术,研究白术调节氧化应激的活性成分及作用机理。通过TCMSP数据库筛选白术的成分及作用靶点,从GeneCards和OMIM数据库获得氧化应激靶点。借助STRING 11.5平台和Cytoscape 3.7.2软件构建白术-成分-靶点网络和PPI网络,筛选核心靶点。应用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析。使用AutoDockTools软件进行分子对接,考察活性成分与核心靶点的结合效能。结果显示,筛选得到6个主要活性成分,分别为12-千里光酰基-8-反式白术三醇、14-乙酰基-12-千里光酰基-8-反式白术三醇、α-香树脂醇、β-谷甾醇、3β-乙酰氧白术酮和8β-乙氧基白术内酯Ⅲ,关键作用靶点133个。GO功能富集筛选出460条目,KEGG通路注释得到127条信号通路,包括肿瘤坏死因子(TNF)、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、白细胞介素-17(IL-17)及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K-Akt)等信号通路。分子对接结果显示,白术活性成分与核心靶点具有较好的结合活性,其中α-香树脂醇与白蛋白(ALB)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、醌氧化还原酶1(NQO1)及前列腺素合酶2(PTGS2)结合活性最好。研究表明,白术可能通过调控TNF、AGE-RAGE、IL-17及PI3K-Akt等信号通路及氧化应激相关靶点发挥抗氧化作用。

关键词： 黄柏   网络药理学   多糖   肝损伤   分子对接  

摘要： 目的 基于网络药理学分析黄柏治疗肝损伤的作用及分子机制,并通过小鼠体内实验验证相关预测靶点及黄柏提取物-黄柏多糖对免疫性肝损伤的保护作用。方法 利用TCMSP和Swiss target prediction数据库检索并筛选黄柏的有效成分及作用靶点,然后在GeneCards和OMIM网站获得疾病相关靶点,取化合物与疾病交集靶点做蛋白互作分析、GO生物功能和KEGG信号途径富集分析,接着对化合物及关键靶点蛋白进行分子对接,最后建立刀豆蛋白A(Con A)诱导的小鼠肝损伤模型探讨黄柏提取物治疗肝损伤的作用机制。结果 黄柏中共筛选出37个有效成分,其治疗关键靶点为肿瘤坏死因子α(TNF-α)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)和半胱天蛋白酶3(CASP3)等,富集分析显示黄柏可能通过MAPK级联反应的正向调控、氧化应激反应等分子机制及调控PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化等通路发挥对肝脏的保护作用。动物实验发现黄柏多糖灌胃处理可提高肝组织中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)活性,降低血清碱性磷酸酶(ALP)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)及肝组织丙二醛(MDA)水平,调控血清炎症因子白细胞介素(IL)-6、IL-1β、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、转化生长因子β1(TGF-β1)的表达,并降低肝组织中TNF-α mRNA表达。结论 黄柏可通过作用于TNF-α、AKT1、STAT3、EGFR和CASP3等靶点,干预脂质和动脉粥样硬化通路来减轻氧化应激反应和炎症反应,达到保肝作用。