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关键词： 地中海贫血   生血宁   胎儿血红蛋白   MAPK信号通路   网络药理学  

摘要： 目的:探究生血宁治疗β-地中海贫血的机制。方法:根据文献数据,利用相应数据库检索生血宁主要成分蚕砂活性成分及相关靶点、β-地中海贫血相关的疾病靶点。对药物治疗靶点及疾病靶点进行交集分析,得核心交集靶点。利用核心交集靶点信息进行蛋白互作网络分析、KEGG及GO富集分析。使用不同浓度(100,200,400,800μg·mL^(-1))生血宁培养K562细胞。CCK-8法检测细胞活力,联合使用Elisa、Western blot检测K562细胞胎儿血红蛋白表达水平,使用实时荧光定量分析法(RealTime PCR)检测^(G)γ、^(A)γmRNA表达情况。使用P38、ERK、JNK特异性抑制剂与生血宁联合处理K562细胞。Elisa检测细胞HbF含量,Western blot检测细胞HbF、P-P38/P38、P-ERK/ERK、P-JNK/JNK表达水平,q-PCR法检测^(G)γ、^(A)γmRNA表达情况。结果:网络药理学确定生血宁可以通过MAPK信号通路治疗β-地中海贫血。分子实验确定生血宁有效给药剂量为400μg·mL^(-1),有效给药时间为48 h。生血宁通过激活P38 MAPK信号通路,促进^(G)γ、^(A)γmRNA表达,细胞内HbF含量增加。与对照组相比,实验组HbF含量及^(G)γ、^(A)γ水平均显著升高。结论:生血宁通过P38 MAPK信号通路,激活γ-珠蛋白基因,促进胎儿血红蛋白合成。

关键词： 数据挖掘   肉芽肿性小叶性乳腺炎   网络药理学   分子对接   乳腺炎  

摘要： 目的:探究中医治疗肉芽肿性小叶性乳腺炎(Granulomatous Lobular Mastitis,GLM)的用药规律及潜在作用机制,以期为后续实验研究、临床应用提供参考。方法:检索中国知网、万方、维普数据库中收录的相关中文文献,建立处方数据库,运用Excel、SPSS、OriginPro、Cytoscape对处方数据库中相关中药进行频次统计、性味归经分析、关联规则及聚类分析。利用网络药理学方法检测核心药物的潜在作用靶点及通路,从TCMSP、Disgenet等数据库获取核心药物与疾病的相关靶点信息,筛选交集靶点利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,导入Cytoscape3.9.1绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图,通过网络拓扑分析得到核心靶点。最后分子对接验证核心成分与核心靶点。结果:共纳入63篇符合条件的相关文献,涉及162味中药,其中皂角刺、甘草、柴胡、蒲公英、当归等使用频次最高;药物性味以温、寒及苦、甘、辛为主,主要归肝经、肺经、胃经、脾经。关联规则分析共获得10个药对,9个药组,其中当归-黄芪出现频率最高;聚类分析得到7个聚类方。核心药物组合“当归、黄芪、皂角刺、金银花、蒲公英”与GLM的交集靶点16个,经拓扑分析得到9个关键靶点,包括白蛋白(Albumin,ALB)、信号转导及转录激活蛋白3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、血清白细胞介素-6等。运用DAVID平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析,主要涉及缺氧诱导因子1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路。分子对接结果显示核心成分与靶点对接良好,其中木犀草素与ALB结合性最好。结论:治疗GLM以补气养血、托疮生肌为主要治法。方药以补虚药为主,辅以清热药,核心药组通过调控HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路、TNF信号通路等发挥治疗作用。

关键词： 网络药理学   肝损伤   靶点   通路   机制  

摘要： 目的:通过网络药理学的技术和方法,筛选何首乌相关化学成分映射肝损伤作用靶点,构建何首乌成分-靶点-肝损伤网络图,探讨何首乌致肝损伤的作用机制。方法:通过TCMID、TCMGenDIT数据库及综合已报道文献检索何首乌化学成分,从中药系统药理学分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库筛选并获取成分对应靶点;通过DrugBank、DisGeNET、GeneCards多数据库联合检索肝损伤靶点,整合分析交集靶点建立STRING蛋白交互关系,利用Cytoscape 3.7.1软件构建成分-靶点-肝损伤可视化网络;通过DAVID数据库对交集靶点基因功能(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选收集何首乌化学成分38个,成分靶点307个,肝损伤靶点6140个,成分与肝损伤交集靶点252个,GO生物功能富集分析共涉及838个,KEGG通路富集分析为111条,预测其涉及肝损伤作用机制通路主要包括cAMP信号通路、MAPK信号通路、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、HIF-1信号通路、药物代谢-细胞色素P450、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路、Wnt信号通路。结论:进一步阐释了何首乌多成分、多靶点、多通路共同作用的特点,为解析何首乌致肝损伤作用机制研究提供新思路和新方向。

关键词： 鲜地黄   功效考证   药效物质   临床应用  

摘要： 考据历代本草记载的鲜地黄功效,并通过检索知网、万方数据库、维普数据库来了解鲜地黄的现代临床应用情况和药效物质研究进展。结果发现,除中国药典2020年版记载的清热生津、凉血止血功效外,鲜地黄还可用于活血生新、散瘀止痛、养阴生津。鲜地黄及其相关复方广泛用于外伤出血、瘀血、痛经、产伤内损、伤寒心悸、中医神志病(狂症、百合病)、消渴、热毒疮疡、热病阴伤、瘟疫病等治疗。现代药理学研究显示,鲜地黄的主要活性成分有梓醇、麦角甾苷等,它们具有抗氧化、抗炎、神经保护、胰岛素抵抗改善作用。鲜地黄及其相关复方对慢性肝炎、鼻咽癌放疗相关的口腔黏膜不良反应、麦粒肿、霰粒肿、抑郁症、失眠、焦虑症等的临床治疗效果较好。

关键词： 鱼腥草   前列腺癌   网络药理学   分子对接技术   信号通路   HRAS  

摘要： 目的:探究鱼腥草抗前列腺癌的作用机制、关键靶点及关键活性成分。方法:采用网络药理学方法,通过中药系统药理学分析平台、UniProt数据平台、GeneCards数据库、OMIM数据库、Drug Bank数据库、微生信息数据处理平台、String数据库、Cytoscape3.9.1软件、DAVID数据库等,筛选出鱼腥草的活性成分、对应靶点及相关信号通路,并运用Autodock Vina软件、Pymol软件对关键活性成分及核心靶点进行分子对接。结果:鱼腥草治疗前列腺癌的共同靶点有98个,PPI网络分析显示EGFR、AKT1、ESR1、HRAS等为关键靶点,KEGG富集分析显示癌症通路、前列腺癌通路、PI3K-Akt信号通路是鱼腥草作用于前列腺癌的关键通路。分子对接结果显示,鱼腥草治疗前列腺癌的主要活性成分菠菜甾醇、山奈酚、鱼腥草素等与核心蛋白AKT1、ESR1等存在较好的结合性。结论:鱼腥草可能通过作用于PI3K-Akt信号通路,影响下游HRAS相关蛋白表达,影响前列腺癌生长的效果,为后续探究鱼腥草治疗前列腺癌提供研究思路。

关键词： 毒蛇咬伤   火毒证   蛇伤膏   中药外敷   网络药理学  

摘要： 目的:观察蛇伤膏外敷治疗毒蛇咬伤火毒证患者的临床疗效,运用网络药理学方法及分子对接技术分析蛇伤膏治疗毒蛇咬伤潜在的作用机制。方法:选取安徽中医药大学第一附属医院入诊的毒蛇咬伤火毒证患者60例,随机分为对照组和试验组,每组30例。对照组采用常规中医适宜技术治疗,试验组在对照组治疗基础上采用蛇伤膏外敷治疗。观察两组患者临床疗效、症状与体征积分、疼痛与肿胀程度评分、中性粒细胞百分比(NEUT%)、凝血酶原时间(PT)、C反应蛋白(CRP)、白细胞介素-6(IL-6)水平;基于药物与疾病数据库筛选蛇伤膏-毒蛇咬伤靶点及共有靶点,利用DAVID平台进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape构建蛋白相互作用网络(PPI)并筛选关键基因与靶点,利用AutoDockPools1.5.7进行分子对接及PyMol可视化。结果:两组患者临床疗效有效率均为100%,试验组治愈率(67%,20/30例)高于对照组(27%,8/30例),差异有统计学意义(P<0.01);与治疗前比较,试验组治疗后症状与体征积分、疼痛与肿胀程度评分、NEUT、PT、CRP、IL-6水平均下降,差异有统计学意义(P<0.01);两组患者治疗后比较,试验组肿胀程度评分、NEUT均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),临床疗效、疼痛评分、肢体症状与体征评分、PT、CRP、IL-6指标均明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01);网络药理学分析显示,蛇伤膏-毒蛇咬伤的核心靶点为表皮生长因子(EGF)、表皮生长因子受体(EGFR)、纤连蛋白1(FN1)、白细胞介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、转化生长因子β1(TGF-β1)、肿瘤坏死因子(TNF),核心成分包括槲皮素、黄芩素、木犀草素、汉黄芩素等,主要涉及MAP激酶活性的正调节、细胞外空间、蛋白酶结合、AGE/RAGE通路、TNF等生物功能与信号通路,分子对接结果良好。结论:蛇伤膏治疗毒蛇咬伤火毒证效果显著;网络药理学初步探究了蛇伤膏通过多靶点、多通路途径治疗毒蛇咬伤,与临床相关指标具有联系性,为后续研究提供理论与依据。

关键词： 蒙药   额尔敦-乌日勒   网络药理学   帕金森病   作用机制   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学方法挖掘蒙药额尔敦-乌日勒治疗帕金森病的主要活性成分和药物靶点,揭示其潜在的可能作用机制,并运用分子对接研究药物与靶点蛋白结合能力。方法:依据中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSCP)挖掘额尔敦-乌日勒的活性成分及对应靶点,以药动参数生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、类药性(drug-likeness,DL)≥0.18:为条件进行筛选,运用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选出额尔敦-乌日勒活性成分治疗帕金森病的可能靶点,运用Cytoscape 3.9.1绘制Venn图,借助STRING数据库绘制蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图;应用微生信在线软件及Metascape数据库查找蒙药额尔敦-乌日勒潜在的活性成分及治疗帕金森病的潜在作用靶点,并将靶点进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并将药物小分子和靶点蛋白进行分子对接。结果:蒙药额尔敦-乌日勒中筛选出DL及OB值好的活性成分118种,预测治疗帕金森病的靶点207个,GO功能富集分析及KEGG富集分析显示,蒙药额尔敦-乌日勒治疗帕金森病的机制主要涉及RNA聚合酶启动子转录的正调控、正调控DNA模板转录和调控基因表达等生物过程,其涉及的通路包括AKT1、TP53、TNF、VEGFA、CASP3等。结论:蒙药额尔敦-乌日勒治疗帕金森病是多成分、多靶点、多通路的作用结果,为蒙药额尔敦-乌日勒治疗帕金森病的进一步研究提供了理论依据。

关键词： 当归—熟地黄   女性不孕症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:本研究旨在通过网络药理学和分子对接技术,探索"当归—熟地黄"(Angelicae Sinensis Radix-Rehmanniae Radix Praeparata,ASR-RRP)在治疗女性不孕症(Female infertility,FI)中的活性成分和作用机制.方法:通过检索TCMSP数据库获取ASR-RRP的活性成分;利用SwissTargetPrediction数据库预测活性成分相关靶点;检索GeneCards数据库获取女性不孕症相关靶点;利用Venny2.1平台提取ASR-RRP治疗FI的作用靶点;利用STRING网络平台和Cytoscape软件进行蛋白质相互作用(PPI)网络和核心靶点分析;运用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;采用分子对接方法确认ASR-RRP活性成分与靶点之间的高亲和力.结果:ASR-RRP用于治疗FI的潜在靶点有114个;GO分析表明,关键靶点主要涉及到正向调节RNA聚合酶II启动子转录、对药物的反应和信号转导等生物过程;KEGG分析显示,关键靶点主要富集在代谢通路、MAPK信号通路和cAMP信号通路;分子对接结果提示MAPK3和大豆甾醇、MAPK3和大豆甾醇-β-D-葡萄糖苷、TNF和大豆甾醇、ALB和大豆甾醇之间具有较强的结合能力.结论:ASR-RRP的核心活性成分包括腺苷、肉冠烯酸、大豆甾醇和大豆甾醇-β-D-葡萄糖苷.这些成分通过调节INS、MAPK3、PPARG、TNF和GAPDH等分子靶点,以及MAPK和cAMP等信号通路,发挥抗炎、抗氧化和激素调节作用,从而对FI产生治疗作用.

关键词： 藤梨根   结直肠癌   中药药理   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学的研究方法探讨中药藤梨根治疗结直肠癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及中医药整合药理学研究平台(TCMIP)获取藤梨根的主要活性成分和药物作用靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取结直肠癌的疾病靶点,再通过R语言及VennDiagram作图数据包映射筛选得出药物与疾病的交集靶点,即为藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件、String数据库分别构建藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点的“药物-成分-疾病-靶点”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图。最后通过David数据库对潜在治疗靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并将富集结果可视化。结果筛选到藤梨根药物主要活性成分6个,药物作用靶点154个,结直肠癌相关疾病靶点10622个,两者取交集得到藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点145个;藤梨根的6种活性成分芦荟大黄素(aloe-emodin)、ent-表儿茶素(ent-Epicatechin)、(+)-儿茶素[(+)-catechin]、槲皮素(quercetin)、谷甾醇(sitosterol)及β-谷甾醇(beta-sitosterol)均为治疗结直肠癌的关键核心成分,关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、JUN、胱天蛋白酶3(CASP3)、IL-1β、表皮生长因子受体(EGFR)、ESR1等;GO功能富集分析结果共得到生物过程(BP)条目141个,主要涉及DNA结合转录因子活性、转录因子活性、细胞因子活性、血红素结合抗氧化活性等生物过程,KEGG通路富集分析结果显示主要涉及晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。结论基于网络药理学的角度初步探讨并验证了藤梨根治疗结直肠癌的多成分、多靶点、多通路的整体调节作用特点,预测了藤梨根治疗结直肠癌的潜在作用机制,为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。

关键词： 芪芝口服液   免疫功能   网络药理学   分子对接   家禽  

摘要： 试验旨在探究芪芝口服液提高家禽免疫功能的作用机制。采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集该复方中黄芪和灵芝2味药材的活性成分及其作用靶点,并与OMIM、TTD和GeneCards数据库收集免疫的靶点进行交集,获得芪芝口服液作用于家禽免疫的潜在靶点。运用Cytoscape 3.9.1软件构建中药-成分-靶点-通路-疾病网络图和蛋白质相互作用(PPI)网络,并对靶点进行GO富集和KEGG通路分析。使用分子对接技术进行活性成分和核心靶点的分子对接验证。结果显示,芪芝口服液30个成分对应66个靶点,家禽免疫329个靶点,其中交集靶点17个,PPI核心靶点包括核因子κB抑制因子α(NFKBIA)、白细胞介素-6(IL-6)和干扰素-γ(IFNG)等。GO功能富集共有38条结果,包括33个生物过程条目、4个分子功能条目和1个细胞成分条目;KEGG通路分析显示交集基因主要富集于C型凝集素受体信号通路、FoxO信号通路和Toll样受体等信号通路。分子对接结果显示,关键成分与核心蛋白靶点有较好的结合活性,证明了网络药理学预测结果的可靠性。研究表明,芪芝口服液可通过多成分、多靶点、多通路提升家禽的免疫功能。