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关键词： 当归四逆汤   系统性硬化症   网络药理学   分子对接   水鬼蕉宾碱   芍药苷   酸枣仁皂苷A   血管内皮生长因子受体2   V-Ha-Ras肉瘤病毒癌基因同源物   血管内皮生长因子A  

摘要： 目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨当归四逆汤治疗系统性硬化症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索当归四逆汤中的活性成分并以Swiss Target Prediction数据库预测各活性成分的靶点,采用GeneCards数据库收集系统性硬化症疾病靶点,取其中共同靶点作为潜在的作用靶点并导入String数据库建立蛋白相互作用(PPI)网络,以Cytoscape软件进行网络拓扑分析。将PPI靶点导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析并以OmicShare平台将结果可视化。构建“通路–靶点”网络并筛选其中关键靶点,并采用CB-Dock平台将作用靶点与活性成分进行分子对接以筛选潜在药效成分。结果 收集得到141个当归四逆汤活性成分及1 047个相关靶点,系统性硬化症疾病靶点1 568个。筛选出潜在作用靶点266个,其中关键靶点6个,分别为蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子受体2(KDR)、V-Ha-Ras肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)、促分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、促分裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。主要涉及MAPK信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路、Rap1信号通路、黏着斑、脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路的调节。分子对接结果显示,水鬼蕉宾碱、芍药苷、酸枣仁皂苷A等活性成分为治疗中的潜在药效成分。结论 当归四逆汤以多组分、多靶点、多通路干预系统性硬化症,其机制涉及免疫、血管损伤和细胞外基质合成等的调节。

关键词： 益气活血通便方   慢传输型便秘   网络药理学   黄芪   红芪  

摘要： 目的:在黄芪、红芪本草药用历史对比总结基础上,利用网络药理学探究黄芪、红芪在益气活血通便方治疗慢传输型便秘中的作用机制差异,利用分子对接进行验证。方法:利用TCMSP和PharmMapper数据库筛选益气活血通便方中当归、黄芪、肉苁蓉、火麻仁、红芪的活性成分及靶点;通过GeneCards、DrugBank、OMIM等数据库筛选慢传输型便秘相关靶点,利用Venny 2.1.0工具作图比较益气活血通便方Ⅰ和组方Ⅱ治疗慢传输型便秘的靶点;通过STRING数据库构建活性成分和关键靶点PPI网络;利用Metascape平台进行GO和KEGG通路富集分析,比较网络药理学差异。构建益气活血通便方的成分-靶点-通路网络图,利用AutoDock软件进行分子对接。结果:得到组方Ⅰ60个活性成分,501个作用靶点;组方Ⅱ50个活性成分,622个作用靶点。得到疾病作用靶点1035个,组方Ⅰ和组方Ⅱ与慢传输型便秘交集靶点分别为161个和201个。GO富集分析得到益气活血通便方Ⅰ553条生物进程或通路,组方Ⅱ899条生物进程或通路。KEGG富集分析预测组方Ⅰ126条信号通路,组方Ⅱ144条信号通路。分子对接结果显示槲皮素、木犀草素、花生酸、山柰酚、3,9-二-O-甲基尼森香豌豆紫檀酚与EGFR、SRC、CASP3、HSP90AA1、ESR1有良好的结合活性。结论:益气活血通便方通过多点显效、协同增效治疗慢传输型便秘,红芪可发挥与黄芪相似的作用,但能否替代黄芪还有待于结合药效学实验、临床试验进一步深入研究。

关键词： 山奈酚-7-O-新橘皮糖苷   前列腺癌   网络药理学   增殖   迁移   细胞周期   Skp2-p27/p21  

摘要： 目的 探讨山奈酚-7-O-新橘皮糖苷(kaempferol-7-O-neohesperidoside, K7ON)抗前列腺癌细胞(prostate cancer, PCa)的作用及潜在分子机制。方法 采用CCK-8法检测K7ON对PCa细胞PC3、DU145、C4-2和LNCap增殖的影响;应用细胞划痕实验检测K7ON对DU145细胞迁移能力的影响;SuperPred等数据库获取K7ON和PCa的靶点;从Venny在线平台获取K7ON与PCa的共同靶点,应用String和Cytoscape构建蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络;通过DAVID数据库进行GO和KEGG功能富集分析,构建“药物-靶点-疾病-通路”网络模型。通过流式细胞术检测K7ON对PCa细胞周期的影响;采用Western blot法检测周期相关蛋白Skp2、p27和p21蛋白的表达;应用Sybyl X2.0将Skp2与K7ON进行分子对接。结果 K7ON可显著抑制PCa细胞的增殖和迁移能力。筛选出药物与疾病的交集靶点共34个,其中Skp2、p27等是K7ON治疗PCa的关键靶点,进一步的GO和KEGG功能功能富集表明其机制主要与细胞周期相关。流式细胞术结果表明,K7ON处理可使DU145细胞周期阻滞在S期。与对照组相比,Skp2蛋白表达水平明显下调,p27和p21的蛋白表达水平上调。分子对接结果显示K7ON与受体Skp2具有较好的结合能力。结论 K7ON可抑制PCa细胞的增殖和迁移,使细胞周期阻滞在S期,其机制可能与调控Skp2-p27/p21信号通路相关。

关键词： 中国药理学会   药物治疗学   弋矶山医院   皖南医学院   药效动力学   医院药学   药物基因组学   学术刊物  

摘要： 地址:安徽省芜湖市赭山西路2号皖南医学院弋矶山医院内邮编:241001电话:0553-5738350 CN34-1206/R,ISSN1009-2501 E-mail:cjcpt96@***网站:http://***《中国临床药理学与治疗学》为中国科学技术协会主管、中国药理学会主办的专业学术刊物。月刊,每期正文120页。读者对象主要为从事新药研发、临床药理学及药物治疗学研究的医疗、科研教学人员及研究生。主要栏目包括:专论、基础研究、临床药理学(包括药物基因组学及药物蛋白组学等)、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、药物治疗学、医院药学之窗、综述与讲座、读者·作者·编者等。

关键词： 补气养血通络组方   硼替佐米诱导的周围神经病变   网络药理学   靶点预测   信号通路  

摘要： 目的探讨补气养血通络组方治疗硼替佐米诱导的周围神经病变的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台,筛选出补气养血通络组方中黄芪、桂枝、白芍、生姜、大枣、鸡血藤、路路通、丹参的有效活性成分,并通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取硼替佐米诱导的周围神经病变(bortezomib-induced peripheral neuropathy,BIPN)的相关靶点基因,两者取交集得到药物潜在作用靶点基因。运用Cytoscape-3.8.0构建中药—活性成分—靶点—疾病网络关系。利用STRING数据库构建蛋白互作网络图,依托R 4.1.2进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。通过分子对接技术,对重要靶点及有效成分进行分析。结果共筛选出药物活性成分139种。药物潜在作用靶点基因255个,BIPN相关靶点基因815个,两者取交集获得共同靶点97个,其中前10位基因为TP53、AKT1、MAPK14、FOS、RELA、MYC、STAT3、CTNNB1、ESR1、MAPK1。KEGG通路富集分析主要涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、NF-κB信号通路等与治疗BIPN相关的信号通路。槲皮素与TP53和AKT1之间有良好的亲和力。结论补气养血通络组方含有多种活性成分,通过多途径、多靶点发挥治疗硼替佐米诱导的周围神经病变的作用。

关键词： 青春期后痤疮   网络药理学   柴胡-黄芩   作用机制  

摘要： 目的:检索柴胡-黄芩的主要化学活性成分,运用网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗青春期后痤疮的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台检索“柴胡”“黄芩”的活性成分,并筛选出其活性成分所对应的作用靶点。运用GeneCards数据库平台检索与青春期后痤疮相关的作用靶点,构建共同靶点韦恩图。利用Cytoscape 3.9.1软件,绘制活性成分潜在靶点网络图,借助String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,获得蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络核心基因的邻接节点数目,再运用Cytoscape 3.9.1对PPI网络进行拓扑分析,最终获取核心基因。通过新生信平台进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测柴胡-黄芩治疗青春期后痤疮的作用机制。结果:分析得到柴胡有效活性成分13种、黄芩有效活性成分33种,涉及216个作用靶点。确定青春期后痤疮靶点1 899个,得到共同靶点基因86个,运用PPI分析确定肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、RelA(NF-κB亚型)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptors,EGFRs)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、IL-1β 6个靶点为柴胡-黄芩治疗青春期后痤疮的核心靶点。富集分析GO条目3 526项,KEGG信号通路230条,主要富集通路有AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等。结论:柴胡-黄芩可通过多靶点、多通路治疗青春期后痤疮,在发挥抗菌消炎作用的同时,还可减少痤疮后瘢痕的形成,为柴胡-黄芩在临床的应用提供理论参考和研究方向。

关键词： 桑叶   杜仲   传染性法氏囊病   网络药理学   分子对接   分子动力学模拟  

摘要： 【目的】本研究运用网络药理学、分子对接和分子动力学模拟方法研究桑叶和杜仲防治传染性法氏囊病(IBD)的作用机制,旨在为防治免疫抑制和传染性法氏囊病的新兽药研发提供思路。【方法】通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库收集桑叶和杜仲的活性成分和靶点,利用GeneCards和GEO数据库获得传染性法氏囊病相关靶点。基于Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-靶点网络图。将药物靶点与疾病靶点取交集后得到共同靶点,基于STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白相互作用(PPI)网络图。使用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用AutoDock 1.5.6和PyMOL软件进行分子对接,使用Gromacs 2020.6软件进行分子动力学模拟。【结果】筛选得到桑叶和杜仲53个有效活性成分,423个潜在作用靶点,5 949个传染性法氏囊病相关靶点,153个交集靶点。PPI显示,关键靶点主要包括白介素-6(IL6)、连环蛋白-β1(CTNNB1)、原癌基因酪氨酸-蛋白激酶(SRC)、IL1B、血管内皮生长因子(VEGFA)等。GO功能和KEGG信号通路富集分析结果显示,桑叶和杜仲可通过对IL18的反应、干扰素-γ(IFN-γ)受体结合、钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用等发挥防治传染性法氏囊病的作用。分子对接和分子动力学模拟结果均表明关键活性成分和关键靶点之间具有良好的亲和力,结合稳定。【结论】桑叶和杜仲可能通过槲皮素、去氢双丁香酚、二十碳-11,14,17-三烯酸甲酯、山柰酚、β-谷甾醇等重要活性成分作用于IL6、CTNNB1、SRC、IL1B、VEGFA等关键靶点,通过对IL18的反应、钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用等途径发挥对鸡传染性法氏囊病的防治作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   苇茎汤   慢性阻塞性肺疾病  

摘要： 目的 运用网络药理学方法探究苇茎汤治疗慢性阻塞性肺疾病的有效成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在分子作用机制.方法 使用TCMSP数据库筛选千金苇茎汤药物活性成分,使用Uniprot、TCMSP、pharm Mappar数据库查找药物活性成分及作用靶点,运用Cytoscage构建"中药-活性成分-靶点"网络图.在DrugBank、GeneCards、TTD等数据库中搜索慢性阻塞性肺疾病的疾病靶点,将苇茎汤药物活性靶点与慢性阻塞性肺疾病的疾病靶点取交集,并制作韦恩图.使用STRING数据库并借助Cytoscage软件构建蛋白质相互作用网络(PPI),MCODE插件分析千金苇茎汤治疗慢性阻塞性肺疾病关键靶点;借助Metascape在线工具对共有靶点进行GO和KEGG通路富集分析.使用在线微生信平台绘制GO富集气泡图及KEGG富集条形图.结果 苇茎汤共有31个活性成分,获得131个药物靶点.搜索出慢性阻塞性肺疾病靶点1137个,将药物-疾病靶点取交集,共有46个交集靶点,其中ALB、MAPK1、ESR1、JUN、PTGS2、CASP3、MAPK14、SRC等为核心交集靶点.GO富集分析结果为:细胞对有机氮化合物的反应、G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、乙酰胆碱受体、膜微区、质膜筏等.KEGG主要涉及IL-17信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、细胞凋亡等.分子对接结果显示常春藤皂苷元与ESR1结合能最低,其次为豆甾醇与ESR1,豆甾醇与SRC,豆甾醇与PTGS2结合活性较强.结论 苇茎汤可以通过多成分、多靶点、多途径治疗慢性阻塞性肺疾病,为中医药治疗COPD的实验研究提供了参考.

关键词： 白藜芦醇   非小细胞肺癌   网络药理学   癌症基因组图谱   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接技术识别分析白藜芦醇抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在靶点和作用机制,并结合临床数据以及分子生物学实验进行初步验证。方法:通过Swiss Target Prediction数据库和Target net数据库筛选白藜芦醇靶点,通过数据库Genecards、OMIM、TTD收集NSCLC靶点,利用Venny 2.1.0平台获得药物和疾病靶点的交集;应用Cytoscape 3.7.2软件与String数据库生成靶标蛋白互作网络(PPI),并进行拓扑分析;利用Metascape数据库对交集靶标进行基因本体(GO)功能富集与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,得到交集靶标的基因图谱;利用Autodock Vina软件对排名前三位的核心靶基因与白藜芦醇进行分子对接验证;通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获得临床病例样本,分析相关靶基因在NSCLC患者(n=1017)和健康人群(n=627)的表达情况;细胞水平采用Western Blot检测不同浓度(30、50μmol/L)白藜芦醇对人肺腺癌A549细胞SRC、EGFR及PI3K/AKT信号通路蛋白表达的影响。结果:筛选得到的潜在靶点共有40个,经过拓扑分析得到关键靶点8个,其中EGFR、SRC、ESR1等靶点与NSCLC密切相关;白藜芦醇抗NSCLC主要涉及肿瘤蛋白多糖、雌激素信号通路、PI3K/AKT等多条信号通路;分子对接显示,白藜芦醇与关键靶点具有稳定的结合能力;临床样本结果显示,靶基因EGFR、SRC、ESR1、HSP90AA1以及MMP9的表达在NSCLC中上调;TNF、CDC42以及RELA的表达在NSCLC中下调;细胞实验结果表明,白藜芦醇药物干预以剂量依赖的方式抑制了人肺腺癌A549细胞中SRC、EGFR、p-PI3K和p-AKT的蛋白表达。结论:揭示了白藜芦醇在治疗NSCLC的过程中涉及多个作用靶点及多条信号通路,明确了白藜芦醇可通过抑制PI3K/AKT信号通路发挥其抗癌效应。

关键词： 立德树人   课程思政   药理学   思政元素   教学改革  

摘要： “立德树人”是高校人才培养的根本任务,贯穿在教育教学过程中,融入在教学的各个领域。课程思政是当前各个高校在专业课学习过程中将思政教育与课程教学相结合的一种新的理念,以期在专业课教学过程中实现立德树人根本目标。药理学是医学高等院校各专业的专业基础课,其蕴含丰富的思政元素。文章对药理学课程的特点、开展课程思政的必要性,以及药理学课程思政建设在教学内容和教学方式方面所做的改革进行归纳总结,以期为药理学和其他相关课程的课程思政教学改革提供参考。