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关键词： 知柏地黄丸   乳腺癌   网络药理学   内分泌耐药   槲皮素   山柰酚  

摘要： 目的 运用网络药理学技术探究知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过TCMSP数据库、TCM-ID数据库和BATMAN-TCM数据库,筛选知柏地黄丸的有效活性成分和作用靶点,利用GeneCards数据库、OMIM数据库、TTD数据库和GEO数据库检索获得乳腺癌内分泌治疗耐药的相关靶基因,并与活性成分作用靶点取交集得到共同靶点;通过String 11.5数据库构建知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的蛋白质互作(PPI)网络,并借助Cytoscape 3.8.2软件的CytoNCA插件筛选核心靶点;通过Metascape基因功能注释分析工具对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用Cytoscape 3.8.2软件构建药物活性成分–靶点–通路相互作用网络,获取核心活性成分。结果 共筛选出知柏地黄丸活性成分80个,与疾病的交集靶点117个,主要涉及肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL6)、雌激素受体1(ESR1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。KEGG通路富集分析显示磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt、MAPK、核因子-κB(NF-κB)、雌激素等信号通路可能是知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的关键信号通路,由药物活性成分–靶点–通路网络得出槲皮素、山柰酚、脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等是发挥作用的核心活性成分。结论 知柏地黄丸中的槲皮素、山柰酚、脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等核心活性成分,能够作用于TP53、Akt1、TNF、IL-6、ESR1、MAPK1等多个关键靶点,调节PI3K-Akt、MAPK、NF-κB、雌激素等信号通路,发挥治疗乳腺癌内分泌耐药的作用。

关键词： 野蚕豆根   抗氧化活性   网络药理学   分子对接   体外实验   作用机制  

摘要： 利用网络药理学和体外实验探讨野蚕豆根抗氧化活性物质基础及作用机制。首先,采用DPPH法、ABTS法、清除羟自由基法对野蚕豆根进行体外抗氧化实验验证;通过TCMSP数据库和文献搜索筛选出野蚕豆根中的活性物质,同时收集其作用靶点;借助OMIM、GeneCards数据库获得氧化应激相关疾病靶点;将野蚕豆根成分靶点与氧化应激靶点取交集,通过STRING数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks,PPI);利用R语言对交集靶点进行基因本体(GO,Gene Ontology)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;借助AutoDock 1.5.7软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,通过Pymol进行可视化操作;利用蛋白质免疫印迹(Western blot)检测进行机制验证。结果显示,野蚕豆根提取物对DPPH自由基、ABTS自由基和羟基自由基有一定的清除能力,其半数抑制浓度(IC_(50))分别为0.166、0.054和0.180 mg/mL;从野蚕豆根中共筛选出22个活性成分,86个成分靶点以及84个交集靶点,其中包括STAT3、HSP90AA1、HDAC1等23个核心靶点;GO富集分析共得到了3386个条目,主要包括碳水化合物结合、核受体活性等分子功能。KEGG富集分析共得到了211个条目,主要包括PI3K-Akt信号通路、化学致癌-受体激活等通路;分子对接结果显示,野蚕豆根中活性成分与核心靶点间结合效应较强,结合能均小于-1.2 kcal/mol;Western blot结果表明,野蚕豆根提取物能明显上调p-PI3K蛋白及p-Akt蛋白的表达。本研究初步表明野蚕豆根提取物可通过激活PI3K-Akt信号通路从而发挥抗氧化作用,为后期野蚕豆根抗氧化活性的研究与应用提供理论依据及参考。

关键词： 亚急性甲状腺炎   夏枯草   玄参   网络药理学   分子对接  

摘要： 基于网络药理学及分子对接技术,探讨夏枯草-玄参治疗亚急性甲状腺炎(SAT)的活性成分及其潜在的分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台与Uniprot 数据库筛选夏枯草-玄参的活性成分及其相关靶点蛋白并对基因名称进行标准化;通过GeneCard 数据库、DisGeNET数据库、OMIM数据库、MalaCards等数据库,查找亚急性甲状腺炎(SAT)相关靶点;将交集靶点输入STRING数据库构建PPI可视化网络图,对其进行拓扑结构分析及核心靶点筛选;采用GO及KEGG对相关靶点及通路进行富集化分析;利用Cytoscape3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络后;采用AutodockTools1.5.6、Pymol进行分子对接及可视化。结果 筛选得到槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷固醇和豆甾醇等为夏枯草-玄参的主要活性成分;GO富集分析得出2638个条目、生物过程2401条、细胞组成71个、分子功能166个;KEGG分析涉及167条信号通路。分子对接显示SAT的五个主要活性成分与AKT1、TP53、TNF、CASP3、IL6受体蛋白和配体之间结合良好。结论 夏枯草- 玄参可能通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗亚急性甲状腺炎的作用。

关键词： 网络药理学   血府逐瘀汤   甲状腺功能减退症  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨血府逐瘀汤治疗甲状腺功能减退症的作用机制。方法:运用中医药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)平台筛选出血府逐瘀汤组成药物的活性成分,利用有机小分子生物活性数据库(PubChem)查找活性成分的化学结构,根据化学结构在SwissTargetPrediction数据库预测活性成分的潜在靶点。在Genecards数据库及Disgenet数据库中检索甲状腺功能减退症的相关靶点。利用韦恩图获得药物靶点及疾病靶点的交集靶点基因。利用STRING数据库对药物与疾病交集靶点进行蛋白质相互作用网络构建,获得血府逐瘀汤治疗甲状腺功能减退症的关键靶点。利用David数据库对交集靶点进行基因组百科全书(KEGG)信号通路与基因本体论(GO)功能富集分析。结果:得到药物有效成分208个,药物靶点1066个,甲状腺功能减退症靶点1386个,最终取交集靶点195个,KEGG信号通路20条。血府逐瘀汤治疗甲状腺功能减退症的关键靶点为STAT3、EP300、AKT1、MAPK1。关键的信号通路包括:肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。结论:本研究初步揭示了血府逐瘀汤多成分、多靶点、多途径治疗甲状腺功能减退症的机制,为血府逐瘀汤的临床开发利用提供了依据。

关键词： 牛膝   糖尿病肾病   网络药理学  

摘要： 目的:探讨牛膝治疗糖尿病肾病的内在机理.方法:通过搜索TCMSP、GeneCards、DisGeNET、String、DAVID、UniProt数据库,开展网络药理学分析.结果:获得牛膝有效成分9种,筛选出牛膝与DN相关的潜在靶点77个.蛋白质相互作用网络表明牛膝可能通过TNF、IL6、VEGFA和AKT1等关键靶点对糖尿病肾病起到关键作用.G0富集分析得出分子功能555条、生物过程46条、和细胞组成92条.KEGG信号通路共157条,富集靶点数和显著性均较高的是AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等.结论:本研究发现牛膝治疗DN的机制可能是通过多种成分多靶点相互调节.

关键词： 骨骼肌减少症   生物信息学   网络药理学   信号通路   分子对接   黄芪  

摘要： 目的:使用网络药理学方法分析黄芪治疗骨骼肌减少症的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选黄芪的活性成分并预测其作用靶点;筛选GEO与人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)中有关骨骼肌减少症的相关基因并进行合并;使用STRING在线数据库将疾病与药物交集靶点进行蛋白相互作用分析,并使用Cytoscape 3.7.2软件对蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)进行拓扑学分析,确定核心靶点;使用Cytoscape软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络,使用AutoDockTools等软件对药物关键分子与疾病关键蛋白进行分子对接验证;最后利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)分析,探究黄芪治疗骨骼肌减少症的生物功能,通过京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析探究黄芪治疗骨骼肌减少症的主要信号通路。结果:共得到黄芪有效活性成分作用靶点155个,骨骼肌减少症相关基因靶点1057个,药物-疾病交集靶基因36个,主要包括Akt1、p53、VEGFA、TNF、ESR1等“;药物-活性成分-靶点-疾病”调控网络显示槲皮素、华良姜素、联苯双酯、7-O-methylisomucronulatol、异鼠李素等药物活性成分在治疗骨骼肌减少症中发挥作用;分子对接验证实现了5种主要活性成分与5种关键靶点蛋白的对接,结果发现其均具有较强的结合活性;GO分析结果显示,黄芪治疗骨骼肌减少症主要与调控炎症反应及凋亡过程的正调控、细胞对缺氧的反应、细胞衰老等生物学过程有关,并影响蛋白质结合、转运活性、过氧化物酶体增殖物激活受体结合、肌动蛋白结合、生长因子活性、蛋白磷酸酶抑制剂活性等分子功能;KEGG分析显示靶点基因主要富集在癌症、肿瘤坏死因子、低氧诱导因子-1、细胞凋亡等通路。结论:黄芪可能通过同时调控多个靶点基因及相关信号通路,发挥诱导细胞衰老和凋亡、改善局部微循环、降低细胞外基质降解速度、减轻慢性炎症及氧化应激损伤等作用,以延缓骨骼肌萎缩。

关键词： 混合式教学模式   药理学   应用策略  

摘要： 药理学属于药学专业重要专业课程,是医学与药学间一门重要的桥梁学科。其主要对药物作用规律、作用机理、临床应用等内容进行研究,内容复杂且枯燥,多数学生表示该课程学习难度较大。因此,如何调动学生积极性,提高学生对药理学的兴趣成为教学的重点。随着网络技术的发展,数字化、信息化技术被用于各个领域,将其与线下传统教学活动相结合,不仅丰富了教学形式及内容,同时可以调动学生的学习积极性,提高教学的兼容性与灵活性,从而提高教学质量。

关键词： 网络药理学   分子对接   补气通络颗粒   心血管疾病   作用机理  

摘要： 目的筛选补气通络颗粒抗心血管疾病(CVD)的药效成分及作用机制。方法采用网络药理学方法对补气通络颗粒的化学成分进行ADME活性筛选、靶点预测、网络构建、蛋白互作(PPI)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)分析,利用分子对接(Sybyl-X软件)技术验证筛选出潜在活性成分和关键靶点。结果补气通络颗粒中已鉴定的72个化合物中15个具有良好的ADME性质,这些潜在的活性成分中,共10个成分及其对应的26个靶标与补气通络颗粒抗CVD的活性密切相关。通过构建“活性成分-靶点”网络及对网络进行分析,共获得4个关键化合物和3个关键靶标。此外,在对靶点进行KEGG通路分析时,共获得7条与抗CVD相关的通路。GO富集分析结果显示,改善血液循环是补气通络颗粒抗CVD的主要作用机制之一。分子对接实验表明筛选的关键靶蛋白和对应的活性成分对接良好。结论补气通络颗粒可通过多成分、多靶点及多通路的机制发挥其抗CVD活性。

关键词： 药理学   思维导图   应用与实践  

摘要： 本文探讨了在药理学教学中应用思维导图的有效性与实践方法.通过分析思维导图在提升学生学习效率、增强记忆力和理解能力方面的作用,总结出思维导图作为一种视觉化学习工具,不仅提高了学生的学习兴趣,还有助于复杂药理学知识的系统性理解和长期记忆,对于学生后续的学习和发展有着十分重要的意义.

关键词： 自身免疫性甲状腺疾病   网络药理学   信号通路   桥本甲状腺炎  

摘要： 自身免疫性甲状腺疾病是一种常见的自身免疫性疾病,发病率呈上升趋势,但其发病机制仍未明晰,临床在改善患者临床症状及提高生活质量方面仍有欠缺,网络药理学通过分析药物、靶点及疾病之间“多成分、多靶点、多途径”协同作用关系,目前已被应用于对自身免疫性甲状腺疾病的治疗指导。通过对相关文献进行分析,总结当前利用网络药理学方法进行中医药治疗自身免疫性甲状腺疾病的研究,阐明单药或者中药复方中的活性成分、作用靶点、生物过程及通路分析,为临床提供参考。此外,总结网络药理学的不足,以期中医药可以通过此法得到更好的发展。