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关键词： 唐蜀华   丹参   川芎   刺五加   胸痹   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学、分子对接,阐述丹参-川芎-刺五加治疗胸痹的作用机理.方法:利用TCMSP和Swiss TargetPrediction预测丹参、川芎、刺五加的有效成分及靶点.通过DrugBank、GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET收集疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点取交集得到治疗胸痹的潜在作用靶点;用Cytoscape 3.10构建药物-有效成分-靶点网络图;通过Metascape对潜在作用靶点进行KEGG通路富集分析.用Pymol、AutoDock软件对有效成分和核心靶点进行分子对接验证.结果:筛选出药物主要有效成分是木犀草素、丹参酮IIA、刺五加苷B1,核心作用靶点是TNF、AKT1、***通路富集分析得到脂质和动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化通路等189条通路;分子对接显示有效成分与核心靶点有较好的结合力.结论:丹参-川芎-刺五加通过抗炎、抗氧化、改善血管内皮功能、调节脂质代谢等作用防治胸痹病.

关键词： 黄芪-丹参   射血分数保留型心力衰竭   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-丹参治疗射血分数保留型心力衰竭(HFpEF)的主要化学成分及作用机制。方法:运用TCMSP数据库收集黄芪-丹参有效成分及靶点,Gene Cards、OMIM软件收集HFpEF疾病靶点,通过R语言筛选两者的交集靶点,STRING数据库对交集靶点进行分析,CytoScape软件构建靶点蛋白互作网络图,采用Metascape网页、R语言进行GO功能与KEGG通路富集分析,最后运用AutoDock Tools、Vinna软件进行分子对接。结果:筛选出黄芪-丹参治疗HFpEF的活性成分主要为槲皮素、山柰酚、木樨草素、7-O甲基异微凸剑叶莎醇、丹参酮IIA等化合物;JUN、STAT3、AKT1、RELA、MAPK1等为核心靶点;分子对接提示主要成分与核心靶点具有较低结合能,对接活性良好;GO功能分析显示,黄芪-丹参通过参与细胞增殖与凋亡的调控、炎性反应的调节、活性氧代谢、脂质调节、抑制蛋白质磷酸化等过程在内的多条生物学途径发挥治疗作用;关键通路主要集中于脂质与动脉粥样硬化、PI3K-Akt、TNF、HIF-1、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、IL-17等信号通路上。结论:黄芪-丹参治疗HFpEF可能与其调控细胞凋亡、调节免疫炎症反应、维持氧稳态等多种生物学过程有关,为后续深入研究其作用机制开拓了新思路。

关键词： 视网膜静脉阻塞   网络药理学   复方血栓通胶囊  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探究复方血栓通胶囊治疗视网膜静脉阻塞(retinal vein occlusion,RVO)的潜在作用靶点及机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取三七、黄芪、丹参、玄参的活性成分及相关靶点。运用GeneCards、在线孟德尔人类遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)以及DrugBank数据库获取RVO的相关作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件绘制“疾病-药物-活性成分-靶点”图,借助STRING数据库建立靶点蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),并挖掘其中潜在的蛋白质功能模块。最后通过Metascape平台进行基因本体论功能(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:筛选得到复方血栓通胶囊119个有效活性成分,有效靶点202个,RVO的疾病靶点1539个,最终获得复方血栓通胶囊治疗RVO有效靶点115个,通过PPI筛选出主要核心靶点10个,富集分析得到的有效靶点主要参与癌症相关通路,糖尿病并发症相关AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素17、肿瘤坏死因子、PI3K-Akt、MAPK等信号通路。结论:复方血栓通胶囊主要通过调节氧化应激、炎症因子、新血管生成、细胞凋亡等过程治疗RVO。

关键词： 大青龙汤合五苓散   甲型流感病毒感染   网络药理学   信号通路   作用机制  

摘要： 本研究基于网络药理学的方法,探索大青龙汤合五苓散中化学成分防治甲型流感病毒感染(H1N1)的潜在作用机制。方法 使用TCMSP数据库检索大青龙汤中各中药组分的化学成分;利用Uniport数据库和SwissTargetPrediction数据库分别获取中药组分的化学成分靶蛋白对应基因作用靶点后取交集;通过Genecards数据获取H1N1的疾病靶点,得到的两部分靶点取交集后导入Cytoscape3.8.2构建“中药-化学成分-靶点”图,通过String网站绘制“中药-疾病”共同靶点的PPI网络,通过DAVID数据库对中药-疾病共同靶点进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果 通过筛选并去重后分析,得出大青龙汤合五苓散主要活性成分122个,作用靶点基因778个。GO和KEGG富集分析涉及病毒、细菌、寄生虫的感染、免疫、炎症反应等相关通路。结论 大青龙汤合五苓散可能通过调控多靶点、多通路,发挥抗病毒、抗炎、调节免疫、抗肿瘤增殖分化等作用,从而起到防治H1N1的作用。

关键词： 薰衣草   睡眠障碍   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接预测薰衣草治疗睡眠障碍(SD)的主要活性成分、作用靶点及潜在作用机制。方法:检索中国知网(CNKI)、Web of Science(WOS)数据库中关于薰衣草的相关文献,结合TCMSP数据库筛选主要活性成分,利用SwissTargetPrediction和PharmMapper 2个数据库获取活性成分的靶点,再利用GeneCards、OMIM、TTD和DrugBank 4个数据库检索疾病基因,并经Venn工具得到两者交集的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络,利用STRING 11.5数据库筛选置信度≥0.9的靶点,构建PPI网络。利用Enrichr数据库对交集基因进行GO富集分析及KEGG通路分析。利用AutoDockTools 1.5.7软件对活性成分与核心靶点进行分子对接,利用PyMOL 3.8软件进行可视化分析。结果:共获得13个活性成分和192个潜在作用靶点,活性成分为亚油酸乙酯、木犀草素、乙酸芳樟酯、熊果酸及芳樟醇,hub基因为STAT3、MMP9、PTPN11、MAPK1及IL2;作用机制主要涉及神经活性受体-配体相互结合、ERBB2转导、叶酸代谢等通路。活性化合物与目标蛋白的结合力较强。结论:本研究揭示了薰衣草治疗SD具有多成分、多途径、多靶点的作用特点,为薰衣草治疗SD物质基础和作用机制的进一步研究提供了科学依据。

关键词： 药效动力学   药物作用机制   处方分析   药理学教学   药物效应   中国医药科技   联合用药   药代动力学  

摘要： 书名:《常见病联合用药手册》作者:涂宏、刘丽英出版社:中国医药科技出版社ISBN:9787521424843药理学,是研究药物与机体间相互作用规律及其药物作用机制的一门科学,主要包括药效动力学和药代动力学两个方面。前者是阐明药物对机体的作用和作用原理,后者阐明药物在体内吸收、分布、生物转化和排泄等过程,及药物效应和血药浓度随时间消长的规律。

关键词： 药理学   药理学实验   实验报告   教学改革   科研思维   科研技能  

摘要： 药理学是一门对理论性和实践性均有很高要求的学科,药理学实验是对药理学理论的实践与补充。熟悉和掌握药理学实验课程内容对于本科生深入理解药理学知识、提高实践操作能力有很大帮助。实验报告是药理学实验教学的关键一环,也是检验教学质量的重要依据,可以考查学生对实验知识的整理总结,同时反映教师在教学过程中出现的问题。正确撰写实验报告不仅能够培养学生的科研思维,还可以增加学生对实验过程的反思和总结,起到“反哺”作用。笔者结合了自身的实践经验,整理了遵义医科大学《药理学实验》课程实验报告中常见的一些问题,并提出了一些解决方法,通过实践探索,期望为培养学生的科研思维和科研技能提供参考。

关键词： 网络药理学   分子对接   白芍-麦冬   干燥综合征  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接探究白芍-麦冬药对治疗干燥综合征(sjogren syndrome,SS)的作用机制。方法通过BATMAN、Gene Cards、OMIM、Drug Bank、TTD、DISGENET数据库和Cytoscape软件发现并探究相关治疗靶点作用关系。通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图。通过DAVID平台进行GO与KEGG富集分析。使用AutoDock Tools1.5.7软件进行分子对接。结果白芍-麦冬有57个有效活性成分,362个作用靶点,SS有1219个疾病相关靶点。主要有效成分为豆甾醇、没食子酸、β-谷甾醇,核心靶点AKT1、IL1B、CAT、IGF1。GO分析中,GO生物过程(biological process,BP)主要包括基因表达的负调控、脂多糖的反应、RNA聚合酶II启动子转录的正向调节等;GO细胞组分(cellular components,CC)主要包括细胞表面、细胞外区域、细胞外体等;GO分子功能(molecular function,MF)主要包括血红素结合、类固醇结合、RNA聚合酶II转录因子活性等。KEGG富集分析中主要包括MAPK信号通路、TNF信号通路、cAMP信号传导途径等;分子对接实验表明其主要活性成分与核心靶点之间存在良好的结合活性。结论白芍-麦冬药对通过多靶点、多通路发挥治疗SS的作用。

关键词： 网络药理学   清热化痰通腑方   缺血性脑卒中  

摘要： 目的:基于网络药理学与动物实验验证探讨清热化痰通腑方(HTF)治疗缺血性脑卒中(IS)的潜在作用机制。方法:通过TCMSP、BATMAN筛选HTF的活性成分,预测活性成分的潜在靶点;GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank筛选疾病相关靶点;String数据库获得蛋白互作关系;Metascape对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。构建动物模型进行实验验证,采用神经功能评分、2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)染色、苏木精—伊红(HE)染色、尼氏(Nissl)染色、脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法(TUNEL)染色以及免疫组化等方法验证网络药理学富集结果。结果:通过网络药理学分析,预测到主要的活性成分为芹菜素、槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等;作用于丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、转化相关蛋白53(TP53)等潜在靶点,涉及到的关键通路有脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号传导途径等。实验结果显示HTF能显著降低脑缺血再灌注大鼠神经功能评分与脑梗死率(P<0.05),能提高神经元存活率(P<0.05),显著降低细胞凋亡率(P<0.05)。结论:基于网络药理学与动物实验验证,发现HTF通过多成分作用于多靶点,从抗炎、抗凋亡等多种途径发挥治疗IS的作用。

关键词： 桑椹   炎症   免疫   肝纤维化   网络药理学   四氯化碳  

摘要： 目的利用网络药理学方法研究桑椹抗肝纤维化的主要活性成分、靶点和通路,分析其抗肝纤维化作用机制,并通过动物实验验证。方法从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中获取桑椹的主要活性成分及相对应的作用靶点;在OMIM数据库和GeneCards数据库中进行与炎症相关的疾病靶点预测,得到炎症相关基因靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件构建桑椹与炎症相关疾病的成分-靶点-通路网络图;使用String数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。将50只昆明种小鼠随机分为正常组,模型组和桑椹总黄酮低、中、高剂量(75、150、300 mg·kg^(-1))组。采用四氯化碳诱导小鼠肝纤维化模型,给予桑椹总黄酮干预,检测小鼠血清生化指标和炎症指标,观察肝组织病理学变化,免疫组化法检测肝组织中基质金属蛋白酶9(MMP9)的蛋白表达。结果桑椹抗炎有关的主要活性成分有花青素、槲皮素、桑色素和β-胡萝卜素,抗炎的潜在靶点有80个,PPI网络主要包括白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶B(AKT)1、白蛋白(ALB)、血管内皮生长因子(VEGFA)、MMP9等核心靶点。涉及到的通路主要有流体剪切应力与动脉粥样硬化、癌症通路、脂质与动脉粥样硬化和Janus激酶(JAK)-信号传导及转录激活蛋白(STAT)通路等。动物实验结果显示,与正常组相比,模型组小鼠血清中丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)水平及肝组织中炎症指标IL-6、TNF-α含量以及MMP9蛋白表达均显著升高(P<0.01)。与模型组相比,桑椹总黄酮各剂量组血清中ALT、AST水平显著降低,肝组织中IL-6和TNF-α含量及MMP9蛋白表达显著降低(P<0.05),肝损伤的病变程度减轻。结论桑椹通过花青素、槲皮素等活性成分作用于IL-6、TNF-α、MMP9等靶点发挥抗肝纤维化作用,主要与磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/AKT、JAK-STAT等信号通路有关,其保肝机制可能与减轻炎症反应、下调MMP9蛋白表达有关。